MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 25691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012751	TTA	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897252
2	NC_012751	TTC	2	6	55	60	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897252
3	NC_012751	AAT	2	6	247	252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897252
4	NC_012751	ATT	2	6	556	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012751	ATT	2	6	698	703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012751	TAA	2	6	768	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012751	ATT	2	6	799	804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012751	CTT	2	6	853	858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897253
9	NC_012751	ATA	2	6	938	943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897253
10	NC_012751	TCC	2	6	945	950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238897253
11	NC_012751	TTA	2	6	957	962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897253
12	NC_012751	ATG	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897253
13	NC_012751	TTG	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897253
14	NC_012751	ATT	2	6	1077	1082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897253
15	NC_012751	AAG	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897253
16	NC_012751	GAC	2	6	1219	1224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897253
17	NC_012751	TTA	2	6	1525	1530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897253
18	NC_012751	AAG	2	6	1541	1546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897253
19	NC_012751	GTG	2	6	1607	1612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238897253
20	NC_012751	TAG	2	6	1631	1636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897253
21	NC_012751	TTA	2	6	1761	1766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012751	TGA	2	6	1817	1822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897254
23	NC_012751	TTA	2	6	1867	1872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897254
24	NC_012751	TTA	2	6	1911	1916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897254
25	NC_012751	ATT	2	6	2006	2011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897254
26	NC_012751	TAT	2	6	2339	2344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897254
27	NC_012751	TTC	2	6	2351	2356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897254
28	NC_012751	CAT	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897254
29	NC_012751	TTC	2	6	2515	2520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897254
30	NC_012751	AGG	2	6	2604	2609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238897255
31	NC_012751	AGC	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897255
32	NC_012751	TTA	2	6	2756	2761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897255
33	NC_012751	TTA	2	6	2785	2790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897255
34	NC_012751	TGT	2	6	2829	2834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897255
35	NC_012751	TTG	2	6	3053	3058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897255
36	NC_012751	ATT	2	6	3185	3190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897255
37	NC_012751	AAT	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012751	TGT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012751	TGA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012751	TAT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012751	CTA	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012751	TAA	2	6	3739	3744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012751	CCT	2	6	3758	3763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012751	CTG	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012751	ATG	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012751	ATA	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012751	TTA	2	6	4481	4486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012751	GCT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012751	ATC	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897256
50	NC_012751	AAT	2	6	4744	4749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897256
51	NC_012751	GTA	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897256
52	NC_012751	CCT	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238897256
53	NC_012751	TAA	2	6	4991	4996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897256
54	NC_012751	ATT	2	6	4997	5002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897256
55	NC_012751	CCT	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_012751	CAT	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012751	TTC	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012751	ATT	2	6	5170	5175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012751	GCT	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897257
60	NC_012751	AGA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897257
61	NC_012751	TAA	3	9	5398	5406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897257
62	NC_012751	TCT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897257
63	NC_012751	AGA	3	9	5926	5934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897258
64	NC_012751	TAA	2	6	6010	6015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897258
65	NC_012751	TGA	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897258
66	NC_012751	ATT	2	6	6046	6051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897258
67	NC_012751	TAC	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897258
68	NC_012751	TAA	2	6	6090	6095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897258
69	NC_012751	CAT	2	6	6130	6135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897258
70	NC_012751	TAT	2	6	6176	6181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012751	ACA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012751	AAT	2	6	6234	6239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012751	TAC	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012751	ATT	3	9	6386	6394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012751	ATT	2	6	6472	6477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012751	AAT	2	6	6478	6483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012751	TTA	2	6	6500	6505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012751	TAA	2	6	6507	6512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012751	ATT	2	6	6567	6572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012751	ATA	2	6	6577	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012751	ATA	2	6	6624	6629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012751	CAA	2	6	6686	6691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012751	TTG	2	6	6830	6835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897259
84	NC_012751	AAT	2	6	6942	6947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897259
85	NC_012751	CAT	2	6	7034	7039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897259
86	NC_012751	CTG	2	6	7145	7150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897259
87	NC_012751	TAA	2	6	7160	7165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897259
88	NC_012751	TTC	2	6	7197	7202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897259
89	NC_012751	TCT	2	6	7291	7296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897259
90	NC_012751	CTT	2	6	7337	7342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897259
91	NC_012751	TAC	2	6	7398	7403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897259
92	NC_012751	CAT	2	6	7497	7502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897259
93	NC_012751	ACC	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238897259
94	NC_012751	CTC	2	6	7679	7684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238897259
95	NC_012751	CAT	2	6	7698	7703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897259
96	NC_012751	CAT	2	6	7734	7739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897259
97	NC_012751	ATC	2	6	8022	8027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897259
98	NC_012751	TCA	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897259
99	NC_012751	TTC	2	6	8151	8156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897259
100	NC_012751	TAA	2	6	8244	8249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897259
101	NC_012751	CGA	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897259
102	NC_012751	ATC	2	6	8445	8450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897260
103	NC_012751	ATT	2	6	8506	8511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897260
104	NC_012751	TGG	2	6	8630	8635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238897260
105	NC_012751	CAG	2	6	8654	8659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897260
106	NC_012751	TGT	2	6	8747	8752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897260
107	NC_012751	AAG	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897260
108	NC_012751	AAT	2	6	8937	8942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897260
109	NC_012751	ACC	2	6	9021	9026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238897260
110	NC_012751	CGA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897260
111	NC_012751	CAA	2	6	9233	9238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238897260
112	NC_012751	GTT	2	6	9305	9310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897260
113	NC_012751	ATG	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012751	TAA	2	6	9606	9611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012751	ATG	2	6	9628	9633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012751	ATG	2	6	9710	9715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897262
117	NC_012751	CTG	2	6	9726	9731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897262
118	NC_012751	AGT	2	6	9788	9793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897262
119	NC_012751	TCA	2	6	9805	9810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897262
120	NC_012751	TGT	2	6	9822	9827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897262
121	NC_012751	ATT	2	6	10014	10019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897262
122	NC_012751	ACA	2	6	10024	10029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238897262
123	NC_012751	ATA	2	6	10188	10193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897262
124	NC_012751	ATC	2	6	10284	10289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897262
125	NC_012751	TCT	2	6	10466	10471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897262
126	NC_012751	CAT	2	6	10648	10653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897262
127	NC_012751	TCG	2	6	10654	10659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897262
128	NC_012751	TTA	2	6	10712	10717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897262
129	NC_012751	CAT	2	6	10763	10768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897262
130	NC_012751	TGA	2	6	10773	10778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897262
131	NC_012751	AGA	3	9	10798	10806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897262
132	NC_012751	TCA	2	6	10987	10992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897262
133	NC_012751	AAC	2	6	11004	11009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238897262
134	NC_012751	TCA	2	6	11071	11076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897262
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262	NC_012751	CGT	2	6	19741	19746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897270
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277	NC_012751	TTA	2	6	20489	20494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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