MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 3200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012751	AT	3	6	684	689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012751	GA	3	6	1490	1495	50 %	0 %	50 %	0 %	238897253
3	NC_012751	AG	3	6	1635	1640	50 %	0 %	50 %	0 %	238897253
4	NC_012751	AT	3	6	1838	1843	50 %	50 %	0 %	0 %	238897254
5	NC_012751	AT	3	6	2330	2335	50 %	50 %	0 %	0 %	238897254
6	NC_012751	TA	3	6	2458	2463	50 %	50 %	0 %	0 %	238897254
7	NC_012751	AT	4	8	5246	5253	50 %	50 %	0 %	0 %	238897257
8	NC_012751	TA	3	6	6379	6384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012751	TA	3	6	6431	6436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012751	TA	3	6	6591	6596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012751	AT	3	6	8453	8458	50 %	50 %	0 %	0 %	238897260
12	NC_012751	AC	3	6	9641	9646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012751	AG	3	6	10825	10830	50 %	0 %	50 %	0 %	238897262
14	NC_012751	AT	3	6	12348	12353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012751	AT	3	6	12825	12830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012751	TA	3	6	13044	13049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012751	TC	3	6	13313	13318	0 %	50 %	0 %	50 %	238897264
18	NC_012751	CA	3	6	13624	13629	50 %	0 %	0 %	50 %	238897264
19	NC_012751	AC	3	6	13748	13753	50 %	0 %	0 %	50 %	238897264
20	NC_012751	GA	3	6	15462	15467	50 %	0 %	50 %	0 %	238897265
21	NC_012751	TA	3	6	15636	15641	50 %	50 %	0 %	0 %	238897265
22	NC_012751	AC	3	6	15770	15775	50 %	0 %	0 %	50 %	238897265
23	NC_012751	AT	3	6	17092	17097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012751	TA	3	6	18220	18225	50 %	50 %	0 %	0 %	238897268
25	NC_012751	GC	3	6	19902	19907	0 %	0 %	50 %	50 %	238897270
26	NC_012751	AT	3	6	20264	20269	50 %	50 %	0 %	0 %	238897270
27	NC_012751	CT	3	6	20518	20523	0 %	50 %	0 %	50 %	238897271
28	NC_012751	TA	3	6	20822	20827	50 %	50 %	0 %	0 %	238897271
29	NC_012751	AG	3	6	21129	21134	50 %	0 %	50 %	0 %	238897271
30	NC_012751	CA	3	6	21382	21387	50 %	0 %	0 %	50 %	238897271
31	NC_012751	CA	3	6	21719	21724	50 %	0 %	0 %	50 %	238897272
32	NC_012751	CA	3	6	22445	22450	50 %	0 %	0 %	50 %	238897272
33	NC_012751	TA	3	6	22790	22795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012751	TC	3	6	23659	23664	0 %	50 %	0 %	50 %	238897273
35	NC_012751	TA	3	6	24997	25002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012751	TG	3	6	26163	26168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012751	TG	3	6	27057	27062	0 %	50 %	50 %	0 %	238897275
38	NC_012751	CT	3	6	28837	28842	0 %	50 %	0 %	50 %	238897276
39	NC_012751	CT	3	6	29002	29007	0 %	50 %	0 %	50 %	238897276
40	NC_012751	TA	3	6	29058	29063	50 %	50 %	0 %	0 %	238897276
41	NC_012751	GT	3	6	30232	30237	0 %	50 %	50 %	0 %	238897278
42	NC_012751	TA	3	6	32146	32151	50 %	50 %	0 %	0 %	238897279
43	NC_012751	TC	3	6	36096	36101	0 %	50 %	0 %	50 %	238897280
44	NC_012751	GT	3	6	36523	36528	0 %	50 %	50 %	0 %	238897280
45	NC_012751	AT	3	6	36703	36708	50 %	50 %	0 %	0 %	238897280
46	NC_012751	AG	3	6	37196	37201	50 %	0 %	50 %	0 %	238897280
47	NC_012751	AG	3	6	37422	37427	50 %	0 %	50 %	0 %	238897280
48	NC_012751	TA	3	6	37701	37706	50 %	50 %	0 %	0 %	238897280
49	NC_012751	AC	3	6	39273	39278	50 %	0 %	0 %	50 %	238897281
50	NC_012751	CT	3	6	39335	39340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012751	TG	3	6	39908	39913	0 %	50 %	50 %	0 %	238897283
52	NC_012751	GT	3	6	41179	41184	0 %	50 %	50 %	0 %	238897286
53	NC_012751	AG	3	6	43666	43671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012751	TA	3	6	47037	47042	50 %	50 %	0 %	0 %	238897290
55	NC_012751	GA	3	6	47666	47671	50 %	0 %	50 %	0 %	238897290
56	NC_012751	GT	3	6	48611	48616	0 %	50 %	50 %	0 %	238897292
57	NC_012751	GA	3	6	49079	49084	50 %	0 %	50 %	0 %	238897293
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61	NC_012751	CA	3	6	56135	56140	50 %	0 %	0 %	50 %	238897299
62	NC_012751	CA	3	6	57134	57139	50 %	0 %	0 %	50 %	238897301
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65	NC_012751	TA	3	6	59184	59189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_012751	TG	3	6	59955	59960	0 %	50 %	50 %	0 %	238897304
68	NC_012751	TA	3	6	60843	60848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012751	GA	3	6	62148	62153	50 %	0 %	50 %	0 %	238897306
70	NC_012751	GA	3	6	62872	62877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012751	CG	3	6	63187	63192	0 %	0 %	50 %	50 %	238897307
72	NC_012751	AT	3	6	63591	63596	50 %	50 %	0 %	0 %	238897307
73	NC_012751	CT	3	6	63868	63873	0 %	50 %	0 %	50 %	238897308
74	NC_012751	CT	3	6	64998	65003	0 %	50 %	0 %	50 %	238897309
75	NC_012751	CA	3	6	65523	65528	50 %	0 %	0 %	50 %	238897309
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91	NC_012751	TG	3	6	76372	76377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012751	TA	3	6	76846	76851	50 %	50 %	0 %	0 %	238897322
93	NC_012751	TA	3	6	79592	79597	50 %	50 %	0 %	0 %	238897326
94	NC_012751	TA	3	6	80018	80023	50 %	50 %	0 %	0 %	238897326
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104	NC_012751	GA	3	6	89501	89506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_012751	AT	3	6	94249	94254	50 %	50 %	0 %	0 %	238897336
111	NC_012751	GC	3	6	94643	94648	0 %	0 %	50 %	50 %	238897336
112	NC_012751	CA	3	6	95217	95222	50 %	0 %	0 %	50 %	238897337
113	NC_012751	TC	3	6	95916	95921	0 %	50 %	0 %	50 %	238897338
114	NC_012751	GA	3	6	95940	95945	50 %	0 %	50 %	0 %	238897338
115	NC_012751	CA	3	6	96175	96180	50 %	0 %	0 %	50 %	238897338
116	NC_012751	TC	4	8	96759	96766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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121	NC_012751	AT	3	6	101877	101882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012751	GA	3	6	102002	102007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_012751	GA	3	6	105931	105936	50 %	0 %	50 %	0 %	238897349
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