MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic plasmid pRPR

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012732	TAAAT	2	10	1846	1855	60 %	40 %	0 %	0 %	238651162
2	NC_012732	ATAAA	2	10	4107	4116	80 %	20 %	0 %	0 %	238651163
3	NC_012732	GATAT	2	10	5085	5094	40 %	40 %	20 %	0 %	238651163
4	NC_012732	TGATT	2	10	6454	6463	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012732	CATCC	2	10	7840	7849	20 %	20 %	0 %	60 %	238651165
6	NC_012732	CGGAA	2	10	10814	10823	40 %	0 %	40 %	20 %	238651168
7	NC_012732	AATTC	2	10	11930	11939	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012732	TTGTA	2	10	11947	11956	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012732	TAACA	2	10	13118	13127	60 %	20 %	0 %	20 %	238651170
10	NC_012732	ACGTT	2	10	13137	13146	20 %	40 %	20 %	20 %	238651170
11	NC_012732	CTAAT	2	10	15416	15425	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012732	TGCTA	2	10	15560	15569	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012732	TTCTA	2	10	15715	15724	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_012732	TTATG	2	10	16208	16217	20 %	60 %	20 %	0 %	238651171
15	NC_012732	TATCT	2	10	16823	16832	20 %	60 %	0 %	20 %	238651172
16	NC_012732	ATTAT	2	10	17574	17583	40 %	60 %	0 %	0 %	238651173
17	NC_012732	TTGCC	2	10	19504	19513	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_012732	ATTTT	2	10	19748	19757	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012732	TTATA	2	10	19783	19792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012732	GTCAG	2	10	19904	19913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012732	TTAAA	2	10	23149	23158	60 %	40 %	0 %	0 %	238651177
22	NC_012732	TAATA	2	10	23268	23277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012732	GTCTT	2	10	25811	25820	0 %	60 %	20 %	20 %	238651179

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.