MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic plasmid pRPR

Total Repeats: 12

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012732	TAAAT	2	10	1846	1855	60 %	40 %	0 %	0 %	238651162
2	NC_012732	ATAAA	2	10	4107	4116	80 %	20 %	0 %	0 %	238651163
3	NC_012732	GATAT	2	10	5085	5094	40 %	40 %	20 %	0 %	238651163
4	NC_012732	CATCC	2	10	7840	7849	20 %	20 %	0 %	60 %	238651165
5	NC_012732	CGGAA	2	10	10814	10823	40 %	0 %	40 %	20 %	238651168
6	NC_012732	TAACA	2	10	13118	13127	60 %	20 %	0 %	20 %	238651170
7	NC_012732	ACGTT	2	10	13137	13146	20 %	40 %	20 %	20 %	238651170
8	NC_012732	TTATG	2	10	16208	16217	20 %	60 %	20 %	0 %	238651171
9	NC_012732	TATCT	2	10	16823	16832	20 %	60 %	0 %	20 %	238651172
10	NC_012732	ATTAT	2	10	17574	17583	40 %	60 %	0 %	0 %	238651173
11	NC_012732	TTAAA	2	10	23149	23158	60 %	40 %	0 %	0 %	238651177
12	NC_012732	GTCTT	2	10	25811	25820	0 %	60 %	20 %	20 %	238651179

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.