MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic plasmid pRPR

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012732	CTTG	2	8	277	284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012732	AGTA	2	8	439	446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012732	TACT	2	8	467	474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012732	TTTA	2	8	616	623	25 %	75 %	0 %	0 %	238651160
5	NC_012732	TTTA	2	8	1475	1482	25 %	75 %	0 %	0 %	238651161
6	NC_012732	TCAG	2	8	1533	1540	25 %	25 %	25 %	25 %	238651161
7	NC_012732	CGGA	2	8	2119	2126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012732	AGTA	2	8	2209	2216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012732	TACT	2	8	2237	2244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012732	TAAA	2	8	2555	2562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012732	AATT	2	8	2750	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012732	TAAG	2	8	3477	3484	50 %	25 %	25 %	0 %	238651163
13	NC_012732	AAAG	2	8	3860	3867	75 %	0 %	25 %	0 %	238651163
14	NC_012732	GAAA	2	8	4447	4454	75 %	0 %	25 %	0 %	238651163
15	NC_012732	AAGA	2	8	4522	4529	75 %	0 %	25 %	0 %	238651163
16	NC_012732	AGCG	2	8	4646	4653	25 %	0 %	50 %	25 %	238651163
17	NC_012732	AAGA	2	8	5297	5304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012732	CAAA	2	8	5324	5331	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012732	AATT	2	8	5629	5636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012732	CAAA	2	8	5654	5661	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012732	GAAA	2	8	6038	6045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012732	CCTG	2	8	6153	6160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012732	TTAT	2	8	6321	6328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012732	ATTT	2	8	6378	6385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012732	ATTA	2	8	6517	6524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012732	TATT	2	8	7098	7105	25 %	75 %	0 %	0 %	238651164
27	NC_012732	CAAA	2	8	7340	7347	75 %	0 %	0 %	25 %	238651164
28	NC_012732	CCAA	2	8	7921	7928	50 %	0 %	0 %	50 %	238651165
29	NC_012732	GCTC	2	8	8100	8107	0 %	25 %	25 %	50 %	238651165
30	NC_012732	GCAG	2	8	8206	8213	25 %	0 %	50 %	25 %	238651165
31	NC_012732	TGCT	2	8	8243	8250	0 %	50 %	25 %	25 %	238651165
32	NC_012732	GATA	2	8	8604	8611	50 %	25 %	25 %	0 %	238651166
33	NC_012732	CCAA	2	8	8750	8757	50 %	0 %	0 %	50 %	238651166
34	NC_012732	ATGA	2	8	8830	8837	50 %	25 %	25 %	0 %	238651166
35	NC_012732	CAGA	2	8	9052	9059	50 %	0 %	25 %	25 %	238651166
36	NC_012732	ATGT	2	8	9372	9379	25 %	50 %	25 %	0 %	238651166
37	NC_012732	TACT	2	8	9729	9736	25 %	50 %	0 %	25 %	238651167
38	NC_012732	GACA	2	8	9807	9814	50 %	0 %	25 %	25 %	238651167
39	NC_012732	CAGA	2	8	10336	10343	50 %	0 %	25 %	25 %	238651167
40	NC_012732	TGTT	2	8	10390	10397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012732	TTTC	2	8	10618	10625	0 %	75 %	0 %	25 %	238651168
42	NC_012732	TCTT	2	8	10679	10686	0 %	75 %	0 %	25 %	238651168
43	NC_012732	GCAC	2	8	10728	10735	25 %	0 %	25 %	50 %	238651168
44	NC_012732	ATCC	2	8	10761	10768	25 %	25 %	0 %	50 %	238651168
45	NC_012732	CCAC	2	8	10856	10863	25 %	0 %	0 %	75 %	238651168
46	NC_012732	AAAC	2	8	11585	11592	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012732	TAAT	2	8	11659	11666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012732	CTGT	2	8	12096	12103	0 %	50 %	25 %	25 %	238651169
49	NC_012732	AGTT	2	8	12408	12415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012732	TTGC	2	8	12687	12694	0 %	50 %	25 %	25 %	238651170
51	NC_012732	ATTT	2	8	13168	13175	25 %	75 %	0 %	0 %	238651170
52	NC_012732	GTTA	2	8	13284	13291	25 %	50 %	25 %	0 %	238651170
53	NC_012732	TAAA	2	8	13306	13313	75 %	25 %	0 %	0 %	238651170
54	NC_012732	AAGA	2	8	14256	14263	75 %	0 %	25 %	0 %	238651170
55	NC_012732	ATAA	2	8	14366	14373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012732	GAAA	2	8	14497	14504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012732	AGCT	2	8	14919	14926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012732	TGTT	2	8	15045	15052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012732	TCCT	2	8	15482	15489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012732	TATT	2	8	15926	15933	25 %	75 %	0 %	0 %	238651171
61	NC_012732	TATC	2	8	16012	16019	25 %	50 %	0 %	25 %	238651171
62	NC_012732	ACAA	2	8	16060	16067	75 %	0 %	0 %	25 %	238651171
63	NC_012732	TAAA	2	8	16192	16199	75 %	25 %	0 %	0 %	238651171
64	NC_012732	TTTA	2	8	16395	16402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012732	AAAT	2	8	16448	16455	75 %	25 %	0 %	0 %	238651172
66	NC_012732	TCCT	2	8	16541	16548	0 %	50 %	0 %	50 %	238651172
67	NC_012732	AAAG	2	8	16709	16716	75 %	0 %	25 %	0 %	238651172
68	NC_012732	TTCT	2	8	16751	16758	0 %	75 %	0 %	25 %	238651172
69	NC_012732	ATCC	2	8	16917	16924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012732	CCTT	2	8	16958	16965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012732	TTTG	2	8	18447	18454	0 %	75 %	25 %	0 %	238651174
72	NC_012732	AATA	2	8	18689	18696	75 %	25 %	0 %	0 %	238651174
73	NC_012732	ATTT	2	8	19276	19283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012732	AAAC	2	8	19442	19449	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012732	GCAC	2	8	19472	19479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012732	ATTA	2	8	19716	19723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012732	CTTT	2	8	20556	20563	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012732	TCAT	2	8	20852	20859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012732	CTTT	2	8	20918	20925	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012732	TGTT	2	8	21082	21089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012732	AAAG	2	8	21307	21314	75 %	0 %	25 %	0 %	238651175
82	NC_012732	GTTT	2	8	21489	21496	0 %	75 %	25 %	0 %	238651175
83	NC_012732	TGCT	2	8	21976	21983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012732	CTTT	2	8	22113	22120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012732	GTTA	2	8	22267	22274	25 %	50 %	25 %	0 %	238651176
86	NC_012732	TTTA	2	8	22454	22461	25 %	75 %	0 %	0 %	238651176
87	NC_012732	TTTG	2	8	22630	22637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012732	CTAC	2	8	23470	23477	25 %	25 %	0 %	50 %	238651178
89	NC_012732	CTTG	2	8	24419	24426	0 %	50 %	25 %	25 %	238651178
90	NC_012732	TAAT	2	8	25034	25041	50 %	50 %	0 %	0 %	238651179
91	NC_012732	TGCT	2	8	25552	25559	0 %	50 %	25 %	25 %	238651179
92	NC_012732	AATA	2	8	25767	25774	75 %	25 %	0 %	0 %	238651179
93	NC_012732	TACA	2	8	25845	25852	50 %	25 %	0 %	25 %	238651179
94	NC_012732	CTTT	2	8	26273	26280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012732	CTTT	2	8	26282	26289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012732	TTTC	2	8	26312	26319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.