MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic plasmid pRPR

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012732	CTTG	2	8	277	284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012732	AGTA	2	8	439	446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012732	TACT	2	8	467	474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012732	CGGA	2	8	2119	2126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012732	AGTA	2	8	2209	2216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012732	TACT	2	8	2237	2244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012732	TAAA	2	8	2555	2562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012732	AATT	2	8	2750	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012732	AAGA	2	8	5297	5304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012732	CAAA	2	8	5324	5331	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012732	AATT	2	8	5629	5636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012732	CAAA	2	8	5654	5661	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012732	GAAA	2	8	6038	6045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012732	CCTG	2	8	6153	6160	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012732	TTAT	2	8	6321	6328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012732	ATTT	2	8	6378	6385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012732	ATTA	2	8	6517	6524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012732	TGTT	2	8	10390	10397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012732	AAAC	2	8	11585	11592	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012732	TAAT	2	8	11659	11666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012732	AGTT	2	8	12408	12415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012732	ATAA	2	8	14366	14373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012732	GAAA	2	8	14497	14504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012732	AGCT	2	8	14919	14926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012732	TGTT	2	8	15045	15052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012732	TCCT	2	8	15482	15489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012732	TTTA	2	8	16395	16402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012732	ATCC	2	8	16917	16924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012732	CCTT	2	8	16958	16965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012732	ATTT	2	8	19276	19283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012732	AAAC	2	8	19442	19449	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012732	GCAC	2	8	19472	19479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012732	ATTA	2	8	19716	19723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012732	CTTT	2	8	20556	20563	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012732	TCAT	2	8	20852	20859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012732	CTTT	2	8	20918	20925	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012732	TGTT	2	8	21082	21089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012732	TGCT	2	8	21976	21983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012732	CTTT	2	8	22113	22120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012732	TTTG	2	8	22630	22637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012732	CTTT	2	8	26273	26280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012732	CTTT	2	8	26282	26289	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012732	TTTC	2	8	26312	26319	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.