MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic plasmid pRPR

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012732	TTTA	2	8	616	623	25 %	75 %	0 %	0 %	238651160
2	NC_012732	TTTA	2	8	1475	1482	25 %	75 %	0 %	0 %	238651161
3	NC_012732	TCAG	2	8	1533	1540	25 %	25 %	25 %	25 %	238651161
4	NC_012732	TAAG	2	8	3477	3484	50 %	25 %	25 %	0 %	238651163
5	NC_012732	AAAG	2	8	3860	3867	75 %	0 %	25 %	0 %	238651163
6	NC_012732	GAAA	2	8	4447	4454	75 %	0 %	25 %	0 %	238651163
7	NC_012732	AAGA	2	8	4522	4529	75 %	0 %	25 %	0 %	238651163
8	NC_012732	AGCG	2	8	4646	4653	25 %	0 %	50 %	25 %	238651163
9	NC_012732	TATT	2	8	7098	7105	25 %	75 %	0 %	0 %	238651164
10	NC_012732	CAAA	2	8	7340	7347	75 %	0 %	0 %	25 %	238651164
11	NC_012732	CCAA	2	8	7921	7928	50 %	0 %	0 %	50 %	238651165
12	NC_012732	GCTC	2	8	8100	8107	0 %	25 %	25 %	50 %	238651165
13	NC_012732	GCAG	2	8	8206	8213	25 %	0 %	50 %	25 %	238651165
14	NC_012732	TGCT	2	8	8243	8250	0 %	50 %	25 %	25 %	238651165
15	NC_012732	GATA	2	8	8604	8611	50 %	25 %	25 %	0 %	238651166
16	NC_012732	CCAA	2	8	8750	8757	50 %	0 %	0 %	50 %	238651166
17	NC_012732	ATGA	2	8	8830	8837	50 %	25 %	25 %	0 %	238651166
18	NC_012732	CAGA	2	8	9052	9059	50 %	0 %	25 %	25 %	238651166
19	NC_012732	ATGT	2	8	9372	9379	25 %	50 %	25 %	0 %	238651166
20	NC_012732	TACT	2	8	9729	9736	25 %	50 %	0 %	25 %	238651167
21	NC_012732	GACA	2	8	9807	9814	50 %	0 %	25 %	25 %	238651167
22	NC_012732	CAGA	2	8	10336	10343	50 %	0 %	25 %	25 %	238651167
23	NC_012732	TTTC	2	8	10618	10625	0 %	75 %	0 %	25 %	238651168
24	NC_012732	TCTT	2	8	10679	10686	0 %	75 %	0 %	25 %	238651168
25	NC_012732	GCAC	2	8	10728	10735	25 %	0 %	25 %	50 %	238651168
26	NC_012732	ATCC	2	8	10761	10768	25 %	25 %	0 %	50 %	238651168
27	NC_012732	CCAC	2	8	10856	10863	25 %	0 %	0 %	75 %	238651168
28	NC_012732	CTGT	2	8	12096	12103	0 %	50 %	25 %	25 %	238651169
29	NC_012732	TTGC	2	8	12687	12694	0 %	50 %	25 %	25 %	238651170
30	NC_012732	ATTT	2	8	13168	13175	25 %	75 %	0 %	0 %	238651170
31	NC_012732	GTTA	2	8	13284	13291	25 %	50 %	25 %	0 %	238651170
32	NC_012732	TAAA	2	8	13306	13313	75 %	25 %	0 %	0 %	238651170
33	NC_012732	AAGA	2	8	14256	14263	75 %	0 %	25 %	0 %	238651170
34	NC_012732	TATT	2	8	15926	15933	25 %	75 %	0 %	0 %	238651171
35	NC_012732	TATC	2	8	16012	16019	25 %	50 %	0 %	25 %	238651171
36	NC_012732	ACAA	2	8	16060	16067	75 %	0 %	0 %	25 %	238651171
37	NC_012732	TAAA	2	8	16192	16199	75 %	25 %	0 %	0 %	238651171
38	NC_012732	AAAT	2	8	16448	16455	75 %	25 %	0 %	0 %	238651172
39	NC_012732	TCCT	2	8	16541	16548	0 %	50 %	0 %	50 %	238651172
40	NC_012732	AAAG	2	8	16709	16716	75 %	0 %	25 %	0 %	238651172
41	NC_012732	TTCT	2	8	16751	16758	0 %	75 %	0 %	25 %	238651172
42	NC_012732	TTTG	2	8	18447	18454	0 %	75 %	25 %	0 %	238651174
43	NC_012732	AATA	2	8	18689	18696	75 %	25 %	0 %	0 %	238651174
44	NC_012732	AAAG	2	8	21307	21314	75 %	0 %	25 %	0 %	238651175
45	NC_012732	GTTT	2	8	21489	21496	0 %	75 %	25 %	0 %	238651175
46	NC_012732	GTTA	2	8	22267	22274	25 %	50 %	25 %	0 %	238651176
47	NC_012732	TTTA	2	8	22454	22461	25 %	75 %	0 %	0 %	238651176
48	NC_012732	CTAC	2	8	23470	23477	25 %	25 %	0 %	50 %	238651178
49	NC_012732	CTTG	2	8	24419	24426	0 %	50 %	25 %	25 %	238651178
50	NC_012732	TAAT	2	8	25034	25041	50 %	50 %	0 %	0 %	238651179
51	NC_012732	TGCT	2	8	25552	25559	0 %	50 %	25 %	25 %	238651179
52	NC_012732	AATA	2	8	25767	25774	75 %	25 %	0 %	0 %	238651179
53	NC_012732	TACA	2	8	25845	25852	50 %	25 %	0 %	25 %	238651179

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.