MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic plasmid pRPR

Total Repeats: 392

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012732	GGT	2	6	43	48	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012732	GGC	2	6	64	69	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012732	TTG	2	6	92	97	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012732	CTT	2	6	173	178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012732	TAG	2	6	268	273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012732	ATT	2	6	326	331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012732	AGT	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012732	TAC	3	9	353	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012732	TAA	2	6	572	577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012732	TTA	2	6	604	609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651160
11	NC_012732	TAA	2	6	629	634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651160
12	NC_012732	ATT	2	6	637	642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651160
13	NC_012732	TAT	2	6	671	676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651160
14	NC_012732	AAT	2	6	679	684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651160
15	NC_012732	TAA	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651160
16	NC_012732	AGG	2	6	723	728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238651160
17	NC_012732	ACT	3	9	739	747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651160
18	NC_012732	CTA	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651160
19	NC_012732	CAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651160
20	NC_012732	CTG	2	6	821	826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238651160
21	NC_012732	TAG	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651160
22	NC_012732	ATA	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651160
23	NC_012732	GAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651160
24	NC_012732	CAC	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238651160
25	NC_012732	TAG	2	6	1049	1054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651160
26	NC_012732	TTG	2	6	1215	1220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238651160
27	NC_012732	TTA	2	6	1221	1226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651160
28	NC_012732	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651160
29	NC_012732	TAA	2	6	1313	1318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651160
30	NC_012732	GTA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651161
31	NC_012732	TAG	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651161
32	NC_012732	ACT	2	6	1449	1454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651161
33	NC_012732	ATA	2	6	1504	1509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651161
34	NC_012732	AGC	2	6	1630	1635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238651162
35	NC_012732	CTA	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651162
36	NC_012732	TAA	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651162
37	NC_012732	TGC	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238651162
38	NC_012732	ATA	2	6	1779	1784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651162
39	NC_012732	CAA	2	6	1910	1915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651162
40	NC_012732	AGC	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238651162
41	NC_012732	TAT	2	6	1948	1953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651162
42	NC_012732	TAA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012732	CAT	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012732	AGA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012732	AAT	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012732	GAT	2	6	2200	2205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012732	TAA	2	6	2350	2355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012732	CAA	2	6	2358	2363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012732	CAA	2	6	2378	2383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012732	TTC	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012732	AGG	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012732	ATG	2	6	2563	2568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012732	ATT	2	6	2668	2673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012732	GAT	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012732	TAA	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012732	ACC	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_012732	AAT	2	6	2767	2772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
58	NC_012732	ACA	3	9	2836	2844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651163
59	NC_012732	TGA	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651163
60	NC_012732	ACT	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
61	NC_012732	TTA	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651163
62	NC_012732	ATA	2	6	2954	2959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
63	NC_012732	AAG	2	6	3002	3007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651163
64	NC_012732	TTC	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238651163
65	NC_012732	TTG	2	6	3048	3053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238651163
66	NC_012732	GTA	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651163
67	NC_012732	ATC	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
68	NC_012732	TGA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651163
69	NC_012732	CTA	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
70	NC_012732	TCT	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238651163
71	NC_012732	TAT	2	6	3391	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651163
72	NC_012732	TAA	2	6	3459	3464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
73	NC_012732	ATA	2	6	3471	3476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
74	NC_012732	GAT	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651163
75	NC_012732	TAA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
76	NC_012732	CAA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651163
77	NC_012732	AGA	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651163
78	NC_012732	AGA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651163
79	NC_012732	ATA	3	9	3837	3845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
80	NC_012732	ATA	3	9	3851	3859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
81	NC_012732	TAA	2	6	3868	3873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
82	NC_012732	GAA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651163
83	NC_012732	AAT	2	6	4057	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
84	NC_012732	ATA	2	6	4089	4094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
85	NC_012732	AAT	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
86	NC_012732	CAT	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
87	NC_012732	TAC	2	6	4290	4295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
88	NC_012732	ATA	2	6	4602	4607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651163
89	NC_012732	TAT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651163
90	NC_012732	AGG	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238651163
91	NC_012732	ATG	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651163
92	NC_012732	TCA	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
93	NC_012732	AGA	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651163
94	NC_012732	CAA	2	6	4992	4997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651163
95	NC_012732	ACT	2	6	5025	5030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651163
96	NC_012732	ATA	2	6	5149	5154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012732	CTA	2	6	5166	5171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012732	ACA	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012732	ATT	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012732	AAG	2	6	5332	5337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012732	TAA	2	6	5446	5451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012732	TTG	2	6	5719	5724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012732	TGA	2	6	5783	5788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012732	TTA	2	6	5830	5835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012732	TAT	2	6	5885	5890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012732	AAG	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012732	AAG	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012732	AAG	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012732	ATA	2	6	6252	6257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012732	AGA	2	6	6364	6369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012732	TAA	2	6	6561	6566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651164
112	NC_012732	ATC	2	6	6613	6618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651164
113	NC_012732	TAG	2	6	6640	6645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651164
114	NC_012732	TTA	2	6	6652	6657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651164
115	NC_012732	TGG	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238651164
116	NC_012732	GAA	2	6	6714	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651164
117	NC_012732	AAT	2	6	6724	6729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651164
118	NC_012732	AAG	2	6	6824	6829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651164
119	NC_012732	GGA	2	6	6851	6856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238651164
120	NC_012732	CGT	2	6	6980	6985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238651164
121	NC_012732	GCA	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238651164
122	NC_012732	TAT	2	6	7052	7057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651164
123	NC_012732	CTG	3	9	7161	7169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238651164
124	NC_012732	CAT	2	6	7271	7276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651164
125	NC_012732	GTT	2	6	7285	7290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238651164
126	NC_012732	TAC	2	6	7315	7320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651164
127	NC_012732	TAA	2	6	7366	7371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651164
128	NC_012732	TGA	2	6	7429	7434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651164
129	NC_012732	AAT	2	6	7472	7477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651164
130	NC_012732	TAG	2	6	7537	7542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651164
131	NC_012732	AAT	2	6	7562	7567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651164
132	NC_012732	GAC	2	6	7888	7893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238651165
133	NC_012732	CGA	2	6	7903	7908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238651165
134	NC_012732	TGT	2	6	7950	7955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238651165
135	NC_012732	CGA	2	6	8269	8274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238651165
136	NC_012732	CCT	2	6	8391	8396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238651166
137	NC_012732	TCA	2	6	8505	8510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651166
138	NC_012732	GGT	2	6	8517	8522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238651166
139	NC_012732	TGC	2	6	8555	8560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238651166
140	NC_012732	GTA	2	6	8620	8625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238651166
141	NC_012732	GCA	2	6	8742	8747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238651166
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143	NC_012732	TAC	2	6	9060	9065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651166
144	NC_012732	CTC	2	6	9070	9075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238651166
145	NC_012732	GAA	2	6	9286	9291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238651166
146	NC_012732	CAA	2	6	9324	9329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238651166
147	NC_012732	ATT	2	6	9459	9464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012732	CCA	2	6	9502	9507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_012732	TCA	2	6	9514	9519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_012732	TTC	2	6	9542	9547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_012732	TGA	2	6	9576	9581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012732	CAC	2	6	9582	9587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_012732	GCC	2	6	9623	9628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238651167
154	NC_012732	ATC	2	6	9737	9742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651167
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156	NC_012732	AGC	2	6	9875	9880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238651167
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159	NC_012732	TTC	2	6	9975	9980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238651167
160	NC_012732	TCA	2	6	10051	10056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651167
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162	NC_012732	GTT	2	6	10141	10146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238651167
163	NC_012732	TTG	2	6	10520	10525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238651168
164	NC_012732	CAC	2	6	10557	10562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238651168
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178	NC_012732	ATC	2	6	11496	11501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_012732	TAT	2	6	11618	11623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_012732	TAA	2	6	11807	11812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012732	AAT	2	6	11867	11872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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229	NC_012732	ATT	2	6	14674	14679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_012732	ATT	3	9	14698	14706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_012732	TAA	2	6	14842	14847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_012732	AGT	2	6	14881	14886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
234	NC_012732	CTA	2	6	14954	14959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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236	NC_012732	TCT	2	6	15062	15067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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239	NC_012732	TCA	2	6	15283	15288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
240	NC_012732	TCA	2	6	15298	15303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_012732	TTA	2	6	15334	15339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_012732	AAT	2	6	16352	16357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_012732	ATT	2	6	16371	16376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_012732	TTA	2	6	16383	16388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_012732	AGG	2	6	16411	16416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_012732	TAA	2	6	16505	16510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651172
266	NC_012732	CTT	2	6	16511	16516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238651172
267	NC_012732	CTT	2	6	16528	16533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238651172
268	NC_012732	ATA	2	6	16642	16647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651172
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270	NC_012732	TAA	2	6	16898	16903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_012732	TAG	2	6	16910	16915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012732	TAA	2	6	17047	17052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_012732	TTA	2	6	17067	17072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_012732	GGT	2	6	26398	26403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.