MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic plasmid pRPR

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012732	GT	3	6	790	795	0 %	50 %	50 %	0 %	238651160
2	NC_012732	TA	3	6	868	873	50 %	50 %	0 %	0 %	238651160
3	NC_012732	AG	3	6	970	975	50 %	0 %	50 %	0 %	238651160
4	NC_012732	TA	3	6	1108	1113	50 %	50 %	0 %	0 %	238651160
5	NC_012732	AG	3	6	1510	1515	50 %	0 %	50 %	0 %	238651161
6	NC_012732	AT	3	6	1576	1581	50 %	50 %	0 %	0 %	238651161
7	NC_012732	CA	3	6	1601	1606	50 %	0 %	0 %	50 %	238651162
8	NC_012732	AG	3	6	1829	1834	50 %	0 %	50 %	0 %	238651162
9	NC_012732	AT	3	6	1984	1989	50 %	50 %	0 %	0 %	238651162
10	NC_012732	AC	3	6	3365	3370	50 %	0 %	0 %	50 %	238651163
11	NC_012732	AT	3	6	3715	3720	50 %	50 %	0 %	0 %	238651163
12	NC_012732	CA	3	6	4406	4411	50 %	0 %	0 %	50 %	238651163
13	NC_012732	AG	3	6	5070	5075	50 %	0 %	50 %	0 %	238651163
14	NC_012732	AG	3	6	5173	5178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012732	TA	3	6	5710	5715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012732	AG	3	6	5765	5770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012732	TA	3	6	7137	7142	50 %	50 %	0 %	0 %	238651164
18	NC_012732	TG	3	6	7353	7358	0 %	50 %	50 %	0 %	238651164
19	NC_012732	AT	3	6	8454	8459	50 %	50 %	0 %	0 %	238651166
20	NC_012732	TC	3	6	8942	8947	0 %	50 %	0 %	50 %	238651166
21	NC_012732	AG	3	6	9365	9370	50 %	0 %	50 %	0 %	238651166
22	NC_012732	GT	3	6	10204	10209	0 %	50 %	50 %	0 %	238651167
23	NC_012732	AG	3	6	10483	10488	50 %	0 %	50 %	0 %	238651168
24	NC_012732	AG	3	6	11829	11834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012732	AC	3	6	11982	11987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012732	TC	3	6	12239	12244	0 %	50 %	0 %	50 %	238651169
27	NC_012732	TA	3	6	12887	12892	50 %	50 %	0 %	0 %	238651170
28	NC_012732	CT	3	6	13857	13862	0 %	50 %	0 %	50 %	238651170
29	NC_012732	TA	3	6	14417	14422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012732	TA	3	6	15347	15352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012732	AT	3	6	15450	15455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012732	TA	3	6	15780	15785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012732	TA	3	6	17089	17094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012732	TC	3	6	17378	17383	0 %	50 %	0 %	50 %	238651173
35	NC_012732	TC	3	6	17607	17612	0 %	50 %	0 %	50 %	238651173
36	NC_012732	CA	3	6	18436	18441	50 %	0 %	0 %	50 %	238651174
37	NC_012732	TA	3	6	18652	18657	50 %	50 %	0 %	0 %	238651174
38	NC_012732	AT	3	6	19696	19701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012732	TA	3	6	19797	19802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012732	AT	3	6	20774	20779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012732	TA	3	6	21263	21268	50 %	50 %	0 %	0 %	238651175
42	NC_012732	AT	3	6	21320	21325	50 %	50 %	0 %	0 %	238651175
43	NC_012732	AT	3	6	21419	21424	50 %	50 %	0 %	0 %	238651175
44	NC_012732	CA	3	6	22425	22430	50 %	0 %	0 %	50 %	238651176
45	NC_012732	TA	3	6	22714	22719	50 %	50 %	0 %	0 %	238651177
46	NC_012732	AT	3	6	22916	22921	50 %	50 %	0 %	0 %	238651177
47	NC_012732	CT	3	6	23539	23544	0 %	50 %	0 %	50 %	238651178
48	NC_012732	AT	3	6	23761	23766	50 %	50 %	0 %	0 %	238651178
49	NC_012732	TC	3	6	23825	23830	0 %	50 %	0 %	50 %	238651178
50	NC_012732	CT	3	6	24093	24098	0 %	50 %	0 %	50 %	238651178
51	NC_012732	TA	3	6	24137	24142	50 %	50 %	0 %	0 %	238651178
52	NC_012732	TA	3	6	24159	24164	50 %	50 %	0 %	0 %	238651178
53	NC_012732	TG	3	6	24449	24454	0 %	50 %	50 %	0 %	238651178
54	NC_012732	CT	3	6	24526	24531	0 %	50 %	0 %	50 %	238651178
55	NC_012732	TG	3	6	24585	24590	0 %	50 %	50 %	0 %	238651178
56	NC_012732	TC	3	6	24711	24716	0 %	50 %	0 %	50 %	238651178
57	NC_012732	CT	3	6	24924	24929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012732	AT	3	6	25545	25550	50 %	50 %	0 %	0 %	238651179
59	NC_012732	AT	3	6	25890	25895	50 %	50 %	0 %	0 %	238651179
60	NC_012732	AT	3	6	26017	26022	50 %	50 %	0 %	0 %	238651179
61	NC_012732	AT	3	6	26027	26032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.