MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044 chromosome

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012731	CAGAGA	2	12	149155	149166	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012731	AGGCTG	2	12	226955	226966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012731	GGCGAC	2	12	287900	287911	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012731	GGTCTT	2	12	337175	337186	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012731	CGACGT	2	12	337223	337234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012731	AGGATG	2	12	394384	394395	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012731	CGGACT	2	12	396920	396931	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012731	TGATAG	2	12	458685	458696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012731	CCCTCA	2	12	509488	509499	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_012731	GTATTT	2	12	551720	551731	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012731	TCCCTC	2	12	556784	556795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012731	AGGGTG	2	12	556808	556819	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012731	TATTGA	2	12	582891	582902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012731	GTTATT	2	12	583671	583682	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012731	CCCGCG	2	12	645252	645263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_012731	TCCTTA	2	12	647163	647174	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012731	TATTCA	2	12	648267	648278	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012731	AATGAT	2	12	763527	763538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012731	GCTGAT	2	12	808916	808927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012731	GCCCTG	2	12	855004	855015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012731	AGCGCG	2	12	866737	866748	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012731	TTTTTA	2	12	881142	881153	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012731	AAATAT	2	12	940287	940298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012731	ATATCG	2	12	1104746	1104757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012731	CGTAGG	2	12	1113272	1113283	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012731	AGCGCC	2	12	1141390	1141401	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012731	GCGCTC	2	12	1153624	1153635	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012731	TTCCTG	2	12	1180519	1180530	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012731	AAGACA	2	12	1261560	1261571	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012731	GGCGAT	2	12	1342124	1342135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012731	TTATTT	2	12	1354617	1354628	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012731	TCCCTC	2	12	1419715	1419726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_012731	AGGGTG	2	12	1440320	1440331	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012731	GGCCAA	2	12	1457832	1457843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012731	GGATTT	2	12	1471248	1471259	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012731	ACGTTA	2	12	1476213	1476224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012731	ACAAAA	2	12	1486297	1486308	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012731	TGCAAA	2	12	1491416	1491427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012731	TTATCG	2	12	1499720	1499731	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012731	CTCCCT	2	12	1517931	1517942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012731	GAAAAA	2	12	1590372	1590383	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012731	TTTTAA	2	12	1658698	1658709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012731	TGAAAA	2	12	1665087	1665098	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012731	GACGTG	2	12	1785794	1785805	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012731	ATCTCC	2	12	1810616	1810627	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012731	CTTCAC	2	12	1926928	1926939	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012731	AGGGAG	2	12	1960579	1960590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012731	ATCGTC	2	12	2055389	2055400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012731	CTTTTC	2	12	2087344	2087355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012731	AGACCA	2	12	2096932	2096943	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012731	GATGCC	2	12	2153948	2153959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012731	TGGTTG	2	12	2156377	2156388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012731	GGGAAA	2	12	2180752	2180763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012731	GGCGCG	2	12	2188585	2188596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012731	AAGGAG	2	12	2227778	2227789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012731	ACGGCG	2	12	2245290	2245301	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012731	CAGCCC	2	12	2352424	2352435	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012731	TGGCGC	2	12	2354961	2354972	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012731	GATCAA	2	12	2463987	2463998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012731	CAGGAT	2	12	2486386	2486397	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012731	ATCTTT	2	12	2511960	2511971	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012731	AGTGCT	2	12	2554311	2554322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012731	GAGTAG	2	12	2625658	2625669	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012731	AAACAA	2	12	2630366	2630377	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012731	ATCTGT	2	12	2636483	2636494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012731	AATCTC	2	12	2739810	2739821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012731	ACATAA	2	12	2744122	2744133	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012731	GCTAAG	2	12	2744517	2744528	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012731	AACATT	2	12	2765477	2765488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012731	TTTCCC	2	12	2777015	2777026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012731	CTGGCG	2	12	2831424	2831435	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012731	TGCCTC	2	12	2849659	2849670	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012731	TATGTT	2	12	2870234	2870245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012731	AAAAAG	2	12	2904676	2904687	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012731	CAGCGC	2	12	2906086	2906097	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012731	TTTAAT	2	12	2940095	2940106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012731	GCATCA	2	12	3011637	3011648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012731	CGTCAT	2	12	3017238	3017249	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012731	CTGCCG	2	12	3019620	3019631	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012731	ATCGTT	2	12	3080966	3080977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012731	TGGCTC	2	12	3125444	3125455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012731	GGGTAT	2	12	3156581	3156592	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012731	TTAAGT	2	12	3173859	3173870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012731	TTATAA	2	12	3174066	3174077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012731	GAATAA	2	12	3287882	3287893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012731	AGATAA	2	12	3304389	3304400	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012731	CGCTTG	2	12	3316506	3316517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012731	CGTTTT	2	12	3331505	3331516	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012731	AAAATA	2	12	3346710	3346721	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012731	CGATCC	2	12	3379412	3379423	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012731	GACGCT	2	12	3385178	3385189	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012731	CATATG	2	12	3432414	3432425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_012731	TCCGGC	2	12	3463731	3463742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012731	CAGATA	2	12	3471587	3471598	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_012731	GATTCG	2	12	3488990	3489001	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012731	GAAAGT	2	12	3647588	3647599	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012731	TCTCGT	2	12	3667194	3667205	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012731	GCAAAA	2	12	3695759	3695770	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012731	CATTAA	2	12	3753764	3753775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012731	GGGGAG	2	12	3755926	3755937	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012731	AGAAAA	2	12	3777457	3777468	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012731	TCATTG	2	12	3805279	3805290	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_012731	AAAAAC	2	12	3824526	3824537	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012731	CAAGTG	2	12	3833547	3833558	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012731	AGCCAC	2	12	3858985	3858996	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012731	CAAAAA	2	12	4000342	4000353	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012731	ATTTTT	2	12	4054994	4055005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012731	CAGTCG	2	12	4060854	4060865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012731	GCAGCC	2	12	4064036	4064047	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012731	GCTGGC	2	12	4091718	4091729	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012731	GGTTTA	2	12	4093677	4093688	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012731	GCTGGC	2	12	4093949	4093960	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012731	TCGACA	2	12	4154537	4154548	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012731	GTAAGC	2	12	4225289	4225300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012731	CGAGTT	2	12	4345076	4345087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012731	TTGCTA	2	12	4365991	4366002	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012731	CGCTCG	2	12	4378313	4378324	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012731	ATCGCT	2	12	4380329	4380340	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012731	TTCACT	2	12	4419912	4419923	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012731	ATTAAC	2	12	4430804	4430815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_012731	CTGTAT	2	12	4443852	4443863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_012731	AGTCCG	2	12	4479679	4479690	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012731	AGTCCG	2	12	4479842	4479853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012731	ATTTTA	2	12	4481117	4481128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012731	AGTTGT	2	12	4547624	4547635	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012731	CGATCC	2	12	4571315	4571326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012731	AATGAT	2	12	4577551	4577562	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012731	CCCTCT	2	12	4579947	4579958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_012731	AACGGG	2	12	4605528	4605539	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_012731	TGAGCG	2	12	4607003	4607014	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_012731	TTTAAA	2	12	4660811	4660822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012731	ACAAAA	2	12	4662196	4662207	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_012731	CTGTGC	2	12	4697614	4697625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012731	GCTGCC	2	12	4715653	4715664	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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136	NC_012731	ATTTTT	2	12	4766644	4766655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012731	CTCTTC	2	12	4799633	4799644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012731	GTTTTT	2	12	4803411	4803422	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_012731	CCTGCG	2	12	4918924	4918935	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012731	CTGTGG	2	12	4948315	4948326	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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145	NC_012731	TTCCTG	2	12	5072452	5072463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_012731	GTTTTT	2	12	5200841	5200852	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.