MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012730	CTTTAA	2	12	13076	13087	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012730	TTCTTG	2	12	16885	16896	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012730	AGGATA	2	12	16912	16923	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012730	TATATT	2	12	23766	23777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012730	GTTTTA	2	12	25123	25134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012730	AGAAGC	2	12	26047	26058	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012730	TTTAAA	2	12	38488	38499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012730	ATTTAG	2	12	60496	60507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012730	TAGCTT	2	12	69356	69367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012730	ACTATA	2	12	70549	70560	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012730	ATTAGC	2	12	78304	78315	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012730	ATTAAT	2	12	80281	80292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012730	AAATTA	2	12	84549	84560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012730	TTTTGT	2	12	93178	93189	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012730	CTATAT	2	12	97048	97059	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012730	GCAACA	2	12	101324	101335	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012730	GCACAA	2	12	101774	101785	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012730	AAATAA	2	12	105743	105754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012730	TTATAG	2	12	108845	108856	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012730	TAATAT	2	12	109040	109051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012730	TTTTAT	2	12	113824	113835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012730	ATATTT	2	12	115444	115455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012730	CTACTC	2	12	125847	125858	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012730	TATTTT	2	12	131354	131365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012730	TTGAAG	2	12	151155	151166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012730	AAAGAC	2	12	151666	151677	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012730	CATTTT	2	12	152323	152334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012730	AGAACA	2	12	159562	159573	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012730	AGAAAA	2	12	168418	168429	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012730	CAAATA	2	12	169215	169226	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012730	TAAAGT	2	12	169378	169389	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012730	TTTAGG	2	12	170768	170779	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012730	TTTTTG	2	12	181182	181193	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012730	AAGAAA	2	12	182136	182147	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012730	TAAATA	2	12	197440	197451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012730	AATTTA	2	12	212549	212560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012730	GTTTTT	2	12	230310	230321	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012730	TTAATA	2	12	231882	231893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012730	CAAGAA	2	12	231984	231995	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012730	TACACC	2	12	235687	235698	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012730	CTTTAT	2	12	235782	235793	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012730	TTAAAT	2	12	244412	244423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012730	TTAGTT	2	12	247466	247477	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012730	TAGTGA	2	12	248264	248275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012730	AAAGAT	2	12	280147	280158	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012730	TTAATA	2	12	290454	290465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012730	ACAATA	2	12	293062	293073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012730	ATTTTT	2	12	298562	298573	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012730	TTCAGG	2	12	303252	303263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012730	TAATTT	2	12	304877	304888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012730	TTGCAA	2	12	313695	313706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012730	ATCGTC	2	12	317718	317729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012730	GAGTAA	2	12	324268	324279	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012730	TTTATT	2	12	327737	327748	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012730	TAAAAA	2	12	327826	327837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012730	ATAAAT	2	12	329334	329345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012730	ATATTT	2	12	332016	332027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012730	ATACAC	2	12	332141	332152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012730	AATATT	2	12	362554	362565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012730	TAGTAT	2	12	366650	366661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012730	TAACAA	2	12	385723	385734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012730	GCTATA	2	12	386227	386238	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012730	ATAAAA	2	12	408419	408430	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012730	ATTTAT	2	12	408452	408463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012730	GAAAGA	2	12	414959	414970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012730	AAGGAC	2	12	428286	428297	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012730	TTTTAA	2	12	433117	433128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012730	TAAAAA	2	12	435849	435860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012730	AAACTG	2	12	498509	498520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012730	CTAGAT	2	12	499035	499046	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012730	TTGCTT	2	12	507799	507810	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012730	ACTAGA	2	12	509009	509020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012730	ATGCAT	2	12	529682	529693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012730	TAAGCT	2	12	531456	531467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012730	GTAAAA	2	12	543649	543660	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012730	TTAAAA	2	12	549204	549215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012730	TACAGA	2	12	550511	550522	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012730	ACAAAA	2	12	559622	559633	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012730	AGCTAA	2	12	564460	564471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012730	TATTTT	2	12	596656	596667	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012730	TTAATA	2	12	603564	603575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012730	TGATGT	2	12	611075	611086	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012730	ATAGTC	2	12	611340	611351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_012730	TCTCTA	2	12	617393	617404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012730	ATGACG	2	12	635161	635172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012730	ACCTCC	2	12	639480	639491	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_012730	GATTTA	2	12	639547	639558	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012730	TGTTTA	2	12	643798	643809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012730	ATCGCT	2	12	644457	644468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012730	GTTTAT	2	12	644856	644867	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012730	TAAATT	2	12	645672	645683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012730	TAATTA	2	12	646096	646107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012730	GACAAC	2	12	649650	649661	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012730	AGCTAG	2	12	650168	650179	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_012730	TAAATT	2	12	675049	675060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012730	TTTAAA	2	12	703435	703446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012730	ATATAA	2	12	710099	710110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012730	TTTCAT	2	12	713986	713997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012730	TATTGT	2	12	720701	720712	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012730	TAAAAT	2	12	722368	722379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012730	AAATTA	2	12	722391	722402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012730	ATCTTT	2	12	730563	730574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_012730	GATTCA	2	12	754677	754688	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012730	TAGAAA	2	12	758759	758770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012730	CTATTT	2	12	787695	787706	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012730	ATACCG	2	12	802536	802547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012730	TACTAT	2	12	809297	809308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012730	TCTTGA	2	12	810129	810140	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_012730	ATTAGG	2	12	861252	861263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012730	ATTAAA	2	12	863857	863868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012730	TGGGGC	2	12	867297	867308	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_012730	AAATGA	2	12	874183	874194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012730	TTTATA	2	12	885177	885188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012730	CAAATG	2	12	889361	889372	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012730	TTAAAT	2	12	889426	889437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012730	CGGAGT	2	12	890058	890069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012730	GTTAGT	2	12	891090	891101	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012730	TCAATG	2	12	892670	892681	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_012730	TGTCGG	2	12	892821	892832	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012730	TTAAGT	2	12	896740	896751	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012730	CCAGGA	2	12	901768	901779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012730	GGAACA	2	12	902873	902884	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_012730	ACAGGC	2	12	906491	906502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012730	AAGATA	2	12	915730	915741	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012730	TTTGTA	2	12	918454	918465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012730	CCATCA	2	12	926145	926156	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012730	GTAAGC	2	12	926565	926576	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_012730	ATTTAT	2	12	928495	928506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012730	AAGATA	2	12	929777	929788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012730	ATAAAA	2	12	930271	930282	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012730	TATTTT	2	12	936277	936288	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012730	TGAAAA	2	12	940519	940530	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.