MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic

Total Repeats: 357

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012730	AAAGTA	2	12	1190	1201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650215
2	NC_012730	CAAAAC	2	12	5032	5043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650218
3	NC_012730	CAAAAT	2	12	5885	5896	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238650218
4	NC_012730	ACCGTA	2	12	7485	7496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238650221
5	NC_012730	TTTGCG	2	12	12708	12719	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	238651133
6	NC_012730	AAATAT	2	12	14957	14968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650225
7	NC_012730	CGCTAC	2	12	20554	20565	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238650228
8	NC_012730	CGGTGA	2	12	21100	21111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238650228
9	NC_012730	AATTTA	2	12	24073	24084	50 %	50 %	0 %	0 %	238650233
10	NC_012730	CCGATA	2	12	24427	24438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238650233
11	NC_012730	GCATAT	2	12	28371	28382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650235
12	NC_012730	AAATCT	2	12	30552	30563	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650237
13	NC_012730	ATAAAA	2	12	33861	33872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	238650238
14	NC_012730	TTATAT	2	12	36393	36404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650239
15	NC_012730	ATTATA	2	12	37466	37477	50 %	50 %	0 %	0 %	238650240
16	NC_012730	TAAAAT	2	12	40058	40069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650244
17	NC_012730	AAATTA	2	12	41482	41493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650246
18	NC_012730	TGTCCT	2	12	45057	45068	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238650248
19	NC_012730	TTTTAT	2	12	46623	46634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238650249
20	NC_012730	GATAAA	2	12	51605	51616	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650252
21	NC_012730	TGACGG	2	12	55887	55898	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238650257
22	NC_012730	TAGCGG	2	12	67777	67788	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238650263
23	NC_012730	TAAGCT	2	12	73535	73546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650267
24	NC_012730	ATAAAA	2	12	75328	75339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	238650269
25	NC_012730	ATTATC	2	12	76604	76615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650271
26	NC_012730	CTGAAA	2	12	76987	76998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650271
27	NC_012730	GTGAAT	2	12	81110	81121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650273
28	NC_012730	AGCAGG	2	12	83660	83671	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	238650274
29	NC_012730	CTGATA	2	12	88807	88818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650278
30	NC_012730	TTTGCA	2	12	90806	90817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238650281
31	NC_012730	ATTTTT	2	12	95220	95231	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238650286
32	NC_012730	CACCAT	2	12	95723	95734	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	238650287
33	NC_012730	AAGATT	2	12	99371	99382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238650288
34	NC_012730	TATCAT	2	12	102773	102784	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650290
35	NC_012730	AAATTT	2	12	107144	107155	50 %	50 %	0 %	0 %	238650295
36	NC_012730	CGTAAT	2	12	107316	107327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650295
37	NC_012730	GGTAAA	2	12	109557	109568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238650296
38	NC_012730	AAGCAA	2	12	111563	111574	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238650299
39	NC_012730	TGCTAC	2	12	115479	115490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238650301
40	NC_012730	TAAAGC	2	12	120507	120518	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650304
41	NC_012730	GATTAT	2	12	128054	128065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650310
42	NC_012730	AGAACA	2	12	128164	128175	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238650310
43	NC_012730	ATGCCG	2	12	129039	129050	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238650310
44	NC_012730	CGGTAG	2	12	130763	130774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238650311
45	NC_012730	ATTGAT	2	12	130821	130832	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650311
46	NC_012730	CTTTTT	2	12	137243	137254	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238650317
47	NC_012730	TCAATA	2	12	138010	138021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650317
48	NC_012730	TTAGTT	2	12	143575	143586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238650320
49	NC_012730	ACTTTT	2	12	144864	144875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238650323
50	NC_012730	AATCAT	2	12	146357	146368	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650325
51	NC_012730	CAAGAT	2	12	146972	146983	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650325
52	NC_012730	AGAAAA	2	12	154939	154950	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	238650329
53	NC_012730	TTTAAA	2	12	158315	158326	50 %	50 %	0 %	0 %	238650332
54	NC_012730	CTAATT	2	12	158364	158375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650332
55	NC_012730	CTATAT	2	12	158979	158990	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650332
56	NC_012730	TTTTTC	2	12	162353	162364	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238650335
57	NC_012730	CATATA	2	12	176070	176081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650344
58	NC_012730	TGAAAC	2	12	189881	189892	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650350
59	NC_012730	AAATAT	2	12	193169	193180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650354
60	NC_012730	TCGGCA	2	12	193668	193679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238650354
61	NC_012730	CTAAAG	2	12	194158	194169	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650354
62	NC_012730	TCATTT	2	12	196128	196139	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238650355
63	NC_012730	GTTAGG	2	12	198587	198598	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	238650356
64	NC_012730	GGGCTT	2	12	203827	203838	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	238650362
65	NC_012730	ATTGAT	2	12	205463	205474	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650363
66	NC_012730	TTACCG	2	12	216014	216025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238650369
67	NC_012730	AGACCT	2	12	216326	216337	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238650369
68	NC_012730	TAGCTA	2	12	217368	217379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650369
69	NC_012730	ATCAAC	2	12	217381	217392	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	238650369
70	NC_012730	AGCATT	2	12	218383	218394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650369
71	NC_012730	CAAATT	2	12	223659	223670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650373
72	NC_012730	AAACCA	2	12	223990	224001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650374
73	NC_012730	AATCAA	2	12	230431	230442	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238650379
74	NC_012730	AACAAT	2	12	235519	235530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238650381
75	NC_012730	ATTTTG	2	12	239746	239757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238650387
76	NC_012730	CCGGTA	2	12	241615	241626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238650390
77	NC_012730	TTATAT	2	12	244619	244630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650391
78	NC_012730	TCAAGA	2	12	256120	256131	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650395
79	NC_012730	AAACTT	2	12	258722	258733	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650398
80	NC_012730	TTTTAA	2	12	259462	259473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650399
81	NC_012730	TTTTCC	2	12	265314	265325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650404
82	NC_012730	ATATTA	2	12	269997	270008	50 %	50 %	0 %	0 %	238650409
83	NC_012730	ATCTTG	2	12	270053	270064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238650409
84	NC_012730	GAGGCA	2	12	270985	270996	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	238650410
85	NC_012730	AGCTCT	2	12	271348	271359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238650410
86	NC_012730	GTAAAA	2	12	271603	271614	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650410
87	NC_012730	TACTTC	2	12	273308	273319	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238650411
88	NC_012730	TATCAT	2	12	274521	274532	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650412
89	NC_012730	CATCTT	2	12	276404	276415	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238650414
90	NC_012730	TCTAAT	2	12	279316	279327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650418
91	NC_012730	GAACAA	2	12	279688	279699	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238650418
92	NC_012730	CATTGC	2	12	283558	283569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238650420
93	NC_012730	TATCCC	2	12	284567	284578	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	238650420
94	NC_012730	CTTTTC	2	12	285807	285818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650421
95	NC_012730	TTAGTA	2	12	286187	286198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650421
96	NC_012730	GCAAAA	2	12	289173	289184	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238650424
97	NC_012730	TTCAGG	2	12	294779	294790	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238650430
98	NC_012730	AACGAC	2	12	297370	297381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	238650431
99	NC_012730	TACCGC	2	12	309919	309930	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238650438
100	NC_012730	TACCCT	2	12	310537	310548	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	238650438
101	NC_012730	CAAAAA	2	12	338920	338931	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	238650459
102	NC_012730	AAAGAA	2	12	339391	339402	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	238650459
103	NC_012730	TGAGAT	2	12	340784	340795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650460
104	NC_012730	TCGTAC	2	12	344660	344671	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238650462
105	NC_012730	TGCTTT	2	12	348704	348715	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	238650466
106	NC_012730	AAGGGC	2	12	356786	356797	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	238650473
107	NC_012730	AAGAAT	2	12	359856	359867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650476
108	NC_012730	TAGCTG	2	12	360762	360773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238650478
109	NC_012730	AATTTA	2	12	363473	363484	50 %	50 %	0 %	0 %	238650480
110	NC_012730	TTAATT	2	12	363736	363747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650480
111	NC_012730	AGTTTA	2	12	367022	367033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650482
112	NC_012730	TTATCG	2	12	371779	371790	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238650486
113	NC_012730	CACGCT	2	12	374983	374994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238650488
114	NC_012730	GATTTA	2	12	389709	389720	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650500
115	NC_012730	CGTAAA	2	12	390309	390320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650500
116	NC_012730	ATTGCT	2	12	395457	395468	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238650503
117	NC_012730	ATTTAT	2	12	396044	396055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650504
118	NC_012730	ATAAGG	2	12	396243	396254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238650504
119	NC_012730	ATCAGA	2	12	400092	400103	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650508
120	NC_012730	TAATAT	2	12	409270	409281	50 %	50 %	0 %	0 %	238650514
121	NC_012730	CAGCAA	2	12	409939	409950	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	238650515
122	NC_012730	ATAGTG	2	12	410270	410281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650515
123	NC_012730	AAAAAG	2	12	411098	411109	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	238650515
124	NC_012730	TACCCT	2	12	416521	416532	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	238650520
125	NC_012730	ATCCTG	2	12	416543	416554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238650520
126	NC_012730	AAAGCT	2	12	416962	416973	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650520
127	NC_012730	GTAATA	2	12	417601	417612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238650520
128	NC_012730	TTCCTA	2	12	418901	418912	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238650521
129	NC_012730	AGTAAA	2	12	426358	426369	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650528
130	NC_012730	CGTGAT	2	12	429256	429267	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238650530
131	NC_012730	TTGATT	2	12	431752	431763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238650531
132	NC_012730	TTTTTA	2	12	438210	438221	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238650535
133	NC_012730	CCTATA	2	12	443056	443067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650541
134	NC_012730	ACCTAT	2	12	443289	443300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650541
135	NC_012730	ACCGCT	2	12	444637	444648	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238650542
136	NC_012730	TAGCGG	2	12	459147	459158	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238650549
137	NC_012730	CTCAAT	2	12	462457	462468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650552
138	NC_012730	TTTATT	2	12	464648	464659	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238650556
139	NC_012730	TAAAAT	2	12	468636	468647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650559
140	NC_012730	CTTTGT	2	12	475858	475869	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	238650569
141	NC_012730	TTGCTA	2	12	477948	477959	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238650570
142	NC_012730	AAGATA	2	12	478113	478124	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650570
143	NC_012730	CTTTAG	2	12	478275	478286	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238650570
144	NC_012730	TTTAGT	2	12	478934	478945	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238650570
145	NC_012730	TAATGC	2	12	482639	482650	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650572
146	NC_012730	AAAGAT	2	12	483462	483473	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650572
147	NC_012730	TAAAGA	2	12	483686	483697	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650572
148	NC_012730	TAAAAC	2	12	501365	501376	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238650580
149	NC_012730	CTAGAG	2	12	505070	505081	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238650583
150	NC_012730	AGAACA	2	12	514136	514147	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238650589
151	NC_012730	TTAGGT	2	12	515775	515786	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	238650590
152	NC_012730	CTTATG	2	12	517823	517834	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238650592
153	NC_012730	CAGGTA	2	12	520454	520465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238650595
154	NC_012730	AATTCT	2	12	522894	522905	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650597
155	NC_012730	TTTCTT	2	12	523258	523269	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238650597
156	NC_012730	TAGTGG	2	12	523860	523871	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	238650598
157	NC_012730	CAAGTC	2	12	526918	526929	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238650599
158	NC_012730	CTAAAT	2	12	532130	532141	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650603
159	NC_012730	ATTTAT	2	12	533644	533655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650604
160	NC_012730	AGCAAG	2	12	534997	535008	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238650605
161	NC_012730	GCGTTT	2	12	537775	537786	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	238650605
162	NC_012730	GATTTA	2	12	539372	539383	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650605
163	NC_012730	TGATAA	3	18	547818	547835	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238650616
164	NC_012730	AGCTAC	2	12	551235	551246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238650619
165	NC_012730	TAAAAG	2	12	556110	556121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650627
166	NC_012730	AAAAAC	2	12	558275	558286	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	238650629
167	NC_012730	ATTGAA	2	12	558987	558998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238650629
168	NC_012730	GCAAGA	2	12	560951	560962	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238650630
169	NC_012730	ATATTT	2	12	581518	581529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650637
170	NC_012730	AGCTTC	2	12	584966	584977	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238650638
171	NC_012730	AAGCTA	2	12	585223	585234	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650638
172	NC_012730	ACGAAA	2	12	590745	590756	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238650643
173	NC_012730	AGCAGT	2	12	597316	597327	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238650646
174	NC_012730	TAGGAG	2	12	599216	599227	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	238650648
175	NC_012730	AAAGCA	2	12	600415	600426	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238650650
176	NC_012730	TATATC	2	12	602868	602879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650652
177	NC_012730	ATTCAT	2	12	603484	603495	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650652
178	NC_012730	TGCTTT	2	12	609474	609485	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	238650657
179	NC_012730	CTGAAG	2	12	612210	612221	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238650660
180	NC_012730	GAAAAA	2	12	629139	629150	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	238650671
181	NC_012730	ATAGGA	2	12	633927	633938	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238650673
182	NC_012730	TAGAAG	2	12	635595	635606	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238650675
183	NC_012730	TGACGC	2	12	635890	635901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238650675
184	NC_012730	CATTAG	2	12	648538	648549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650677
185	NC_012730	ATTCTT	2	12	652098	652109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238650679
186	NC_012730	ATTTTT	2	12	653908	653919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238650679
187	NC_012730	AACATC	2	12	656385	656396	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	238650682
188	NC_012730	CATGGA	2	12	657407	657418	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238650683
189	NC_012730	CAATAG	2	12	664374	664385	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650685
190	NC_012730	TTTTAA	2	12	666222	666233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650685
191	NC_012730	TCTGCT	2	12	668134	668145	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238650686
192	NC_012730	TAGAAC	2	12	670157	670168	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650689
193	NC_012730	TAAAAA	2	12	671372	671383	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	238650691
194	NC_012730	GTTCTT	2	12	673848	673859	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	238650692
195	NC_012730	GCTCTA	2	12	677374	677385	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238650696
196	NC_012730	TTTTAC	2	12	680165	680176	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238650700
197	NC_012730	CCTCAA	2	12	681962	681973	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	238650701
198	NC_012730	GCTTGA	2	12	682530	682541	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238650702
199	NC_012730	TTTCTT	2	12	682546	682557	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238650702
200	NC_012730	AATTGA	2	12	683187	683198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238650702
201	NC_012730	ATGAAG	2	12	684962	684973	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238650704
202	NC_012730	CTCAAT	2	12	685188	685199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650704
203	NC_012730	TGATAT	2	12	685538	685549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650705
204	NC_012730	AATAAA	2	12	687424	687435	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	238650708
205	NC_012730	CTTTTA	2	12	688464	688475	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238650709
206	NC_012730	CAAAAG	2	12	689789	689800	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238650710
207	NC_012730	AAAATC	2	12	692348	692359	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238650712
208	NC_012730	GATAAA	2	12	692642	692653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650713
209	NC_012730	AATGAT	2	12	696644	696655	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238650717
210	NC_012730	TTGATA	2	12	697304	697315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650718
211	NC_012730	AATATA	2	12	697934	697945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650718
212	NC_012730	CATAAT	2	12	700995	701006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650719
213	NC_012730	GATAAA	2	12	702133	702144	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650720
214	NC_012730	CAGTTT	2	12	706280	706291	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238650723
215	NC_012730	TAATGA	2	12	717744	717755	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238650730
216	NC_012730	ATAAGA	2	12	719813	719824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650731
217	NC_012730	TTAGTA	2	12	721973	721984	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650734
218	NC_012730	ATGCTT	2	12	723894	723905	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238650737
219	NC_012730	ATATTG	2	12	728965	728976	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650741
220	NC_012730	TTAATA	2	12	733259	733270	50 %	50 %	0 %	0 %	238650743
221	NC_012730	TTTCCG	2	12	737758	737769	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238650746
222	NC_012730	AAATAA	2	12	740018	740029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	238650749
223	NC_012730	TTGTTT	2	12	744215	744226	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	238650753
224	NC_012730	AGTGCA	2	12	755953	755964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238650758
225	NC_012730	AAAAAT	2	12	759816	759827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	238650761
226	NC_012730	TAATTT	2	12	761594	761605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650762
227	NC_012730	ATATCG	2	12	765297	765308	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650764
228	NC_012730	TGGAAA	2	12	765541	765552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238650765
229	NC_012730	CAATAA	2	12	766334	766345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238650766
230	NC_012730	GAAATT	2	12	767726	767737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238650768
231	NC_012730	TGTTGG	2	12	771436	771447	0 %	50 %	50 %	0 %	238650770
232	NC_012730	ATGAGA	2	12	771891	771902	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238650770
233	NC_012730	ATAAAA	2	12	772238	772249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	238650770
234	NC_012730	ATTAAT	2	12	772685	772696	50 %	50 %	0 %	0 %	238650771
235	NC_012730	TAAAGA	2	12	780593	780604	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650776
236	NC_012730	TTTTTA	2	12	786002	786013	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238650783
237	NC_012730	TAATTT	2	12	791251	791262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650785
238	NC_012730	CGGCAT	2	12	795709	795720	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238650788
239	NC_012730	GCCGCA	2	12	797354	797365	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238650789
240	NC_012730	TTAAAT	2	12	798524	798535	50 %	50 %	0 %	0 %	238650791
241	NC_012730	ATATTA	2	12	815736	815747	50 %	50 %	0 %	0 %	238650797
242	NC_012730	CCTTTA	2	12	816354	816365	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238650797
243	NC_012730	ATTTAT	2	12	821441	821452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650799
244	NC_012730	GAAAAA	2	12	828119	828130	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	238650803
245	NC_012730	ACCTCC	2	12	830983	830994	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	238650804
246	NC_012730	TTTAAT	2	12	833315	833326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650805
247	NC_012730	TTTATC	2	12	837806	837817	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238650812
248	NC_012730	GTTTAT	2	12	838931	838942	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238650812
249	NC_012730	ATTTAT	2	12	840375	840386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650813
250	NC_012730	TCTTAC	2	12	844784	844795	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238650817
251	NC_012730	TACCCG	2	12	849231	849242	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238650819
252	NC_012730	AGCAGG	2	12	850790	850801	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	238650821
253	NC_012730	ATCCGA	2	12	852254	852265	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238650822
254	NC_012730	CAATAA	2	12	855039	855050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238650824
255	NC_012730	CTAACT	2	12	856081	856092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650825
256	NC_012730	ATTTAT	2	12	856454	856465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650825
257	NC_012730	TTCATT	2	12	860304	860315	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238650827
258	NC_012730	TAACAT	2	12	860518	860529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650827
259	NC_012730	ATCTGA	2	12	865251	865262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650829
260	NC_012730	ATGCCG	2	12	865495	865506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238650829
261	NC_012730	TGATTA	2	12	868809	868820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650832
262	NC_012730	CACCTA	2	12	876101	876112	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	238650836
263	NC_012730	TACTTT	2	12	878180	878191	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238650839
264	NC_012730	TGCAGG	2	12	880595	880606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238650842
265	NC_012730	GCTTTT	2	12	893198	893209	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	238650847
266	NC_012730	GAATGA	2	12	914169	914180	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238650860
267	NC_012730	TATCAA	2	12	919954	919965	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650862
268	NC_012730	TTGCTC	2	12	923438	923449	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238650867
269	NC_012730	TTAGTA	2	12	938258	938269	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650873
270	NC_012730	TTTTAT	2	12	938550	938561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238650873
271	NC_012730	AGTAAA	2	12	942639	942650	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238650878
272	NC_012730	ATTCTA	2	12	944294	944305	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650880
273	NC_012730	ATCGGA	2	12	944710	944721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238650881
274	NC_012730	GTTTAT	2	12	947578	947589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238650884
275	NC_012730	GGGCTT	2	12	948722	948733	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	238650884
276	NC_012730	CTTAAC	2	12	949140	949151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650885
277	NC_012730	ATAGGA	2	12	953722	953733	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238650890
278	NC_012730	TCTTAA	2	12	959269	959280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238650893
279	NC_012730	ATCCGA	2	12	960022	960033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238650894
280	NC_012730	TGCTTT	2	12	960409	960420	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	238650894
281	NC_012730	TAACAA	2	12	962868	962879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238650896
282	NC_012730	ACTATC	2	12	969063	969074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650898
283	NC_012730	ATAAGC	2	12	975695	975706	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238650904
284	NC_012730	TGCTAT	2	12	978487	978498	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238650907
285	NC_012730	ACAATC	2	12	986015	986026	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	238650913
286	NC_012730	CATAAA	2	12	991840	991851	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238650918
287	NC_012730	TTATAA	2	12	992605	992616	50 %	50 %	0 %	0 %	238650919
288	NC_012730	CAAAAG	2	12	992784	992795	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238650919
289	NC_012730	TTATCT	2	12	993759	993770	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238650921
290	NC_012730	TTCTTT	2	12	997047	997058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238650925
291	NC_012730	ACGCTG	2	12	999855	999866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238650926
292	NC_012730	ATCCCG	2	12	1013250	1013261	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238650934
293	NC_012730	ATCAAA	2	12	1024274	1024285	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238650937
294	NC_012730	CGGTGA	2	12	1027819	1027830	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238650939
295	NC_012730	TAAAAA	2	12	1030117	1030128	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	238650940
296	NC_012730	CATAAT	2	12	1035272	1035283	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238650942
297	NC_012730	ATTTCT	2	12	1040445	1040456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238650951
298	NC_012730	AGGTAT	2	12	1042262	1042273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650952
299	NC_012730	TTCCTT	2	12	1044033	1044044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650957
300	NC_012730	TTAAAT	2	12	1044201	1044212	50 %	50 %	0 %	0 %	238650957
301	NC_012730	ACCTTT	2	12	1047168	1047179	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238650965
302	NC_012730	ATTAAT	2	12	1047887	1047898	50 %	50 %	0 %	0 %	238650966
303	NC_012730	TTAGCA	2	12	1051051	1051062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238650972
304	NC_012730	TTTTGC	2	12	1052997	1053008	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	238650975
305	NC_012730	CTCAAA	2	12	1054895	1054906	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	238650978
306	NC_012730	AAATTT	2	12	1056799	1056810	50 %	50 %	0 %	0 %	238650980
307	NC_012730	TTTTGA	2	12	1073961	1073972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238650994
308	NC_012730	AATTGA	2	12	1074240	1074251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238650994
309	NC_012730	TATAGT	2	12	1074465	1074476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238650994
310	NC_012730	TTAAAG	2	12	1080918	1080929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238650996
311	NC_012730	ACCGCT	2	12	1080982	1080993	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238650996
312	NC_012730	AGTCGG	2	12	1081717	1081728	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238650997
313	NC_012730	ATGATT	2	12	1091259	1091270	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238651002
314	NC_012730	TTTCTT	2	12	1123403	1123414	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238651022
315	NC_012730	TTTTCT	2	12	1123423	1123434	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238651022
316	NC_012730	AAATTA	2	12	1124583	1124594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651024
317	NC_012730	AGTTAA	2	12	1126527	1126538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238651137
318	NC_012730	TCATAA	2	12	1128521	1128532	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238651025
319	NC_012730	TAATAT	2	12	1128626	1128637	50 %	50 %	0 %	0 %	238651025
320	NC_012730	TAAATT	2	12	1130221	1130232	50 %	50 %	0 %	0 %	238651027
321	NC_012730	ATTTAG	2	12	1136259	1136270	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238651028
322	NC_012730	ACTGAA	2	12	1150082	1150093	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238651041
323	NC_012730	TAAATT	2	12	1153458	1153469	50 %	50 %	0 %	0 %	238651044
324	NC_012730	GCAAAT	2	12	1156592	1156603	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238651046
325	NC_012730	AAATAA	2	12	1160567	1160578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	238651050
326	NC_012730	ATTTTT	2	12	1170831	1170842	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238651057
327	NC_012730	TTGCTA	2	12	1174002	1174013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238651059
328	NC_012730	ACATTT	2	12	1175329	1175340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238651060
329	NC_012730	TGAAGC	2	12	1179201	1179212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238651063
330	NC_012730	CGCTAC	2	12	1179225	1179236	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238651063
331	NC_012730	GGCAAA	2	12	1181583	1181594	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238651065
332	NC_012730	CAAATG	2	12	1184635	1184646	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238651066
333	NC_012730	TGGTTT	2	12	1209132	1209143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238651074
334	NC_012730	CTAAAA	2	12	1210767	1210778	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238651074
335	NC_012730	TGATAA	2	12	1212650	1212661	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238651076
336	NC_012730	AATTAA	2	12	1213056	1213067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651076
337	NC_012730	GCATTG	2	12	1218296	1218307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238651080
338	NC_012730	AATTTC	2	12	1219986	1219997	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238651081
339	NC_012730	TTAGCT	2	12	1231625	1231636	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238651089
340	NC_012730	ATTGCT	2	12	1238272	1238283	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238651093
341	NC_012730	ATATTT	2	12	1246809	1246820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238651101
342	NC_012730	TAATAT	2	12	1246920	1246931	50 %	50 %	0 %	0 %	238651101
343	NC_012730	GAAGTA	2	12	1249740	1249751	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238651102
344	NC_012730	TATTGC	2	12	1253750	1253761	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238651104
345	NC_012730	ATTTAA	2	12	1254185	1254196	50 %	50 %	0 %	0 %	238651105
346	NC_012730	TTACTA	2	12	1255437	1255448	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238651105
347	NC_012730	AGAACT	2	12	1256950	1256961	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238651107
348	NC_012730	TATGAT	2	12	1258995	1259006	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238651108
349	NC_012730	ATCTAT	2	12	1267768	1267779	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238651117
350	NC_012730	ATCTGC	2	12	1268985	1268996	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238651118
351	NC_012730	CTACAT	2	12	1270229	1270240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238651119
352	NC_012730	TAAATA	2	12	1274652	1274663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238651121
353	NC_012730	ATTTTT	2	12	1277085	1277096	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238651125
354	NC_012730	ATACCG	2	12	1278971	1278982	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238651126
355	NC_012730	TCAATT	2	12	1281748	1281759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238651127
356	NC_012730	AATATC	2	12	1286639	1286650	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238651131
357	NC_012730	TTTTCC	2	12	1287639	1287650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238651132

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.