MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic

Total Repeats: 1120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012730	TTTTA	2	10	2498	2507	20 %	80 %	0 %	0 %	238650217
2	NC_012730	ATTTA	2	10	2851	2860	40 %	60 %	0 %	0 %	238650217
3	NC_012730	GGTCA	2	10	4098	4107	20 %	20 %	40 %	20 %	238650218
4	NC_012730	TAAAT	2	10	4807	4816	60 %	40 %	0 %	0 %	238650218
5	NC_012730	GTAGT	2	10	5133	5142	20 %	40 %	40 %	0 %	238650218
6	NC_012730	TAATA	2	10	5993	6002	60 %	40 %	0 %	0 %	238650218
7	NC_012730	ACTTT	2	10	6792	6801	20 %	60 %	0 %	20 %	238650220
8	NC_012730	AATAC	2	10	7333	7342	60 %	20 %	0 %	20 %	238650220
9	NC_012730	ATCCA	2	10	7830	7839	40 %	20 %	0 %	40 %	238650221
10	NC_012730	AATTA	2	10	9406	9415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012730	TACCC	2	10	12142	12151	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_012730	TACCG	2	10	13503	13512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012730	TATAA	2	10	13857	13866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012730	GCTTT	2	10	14441	14450	0 %	60 %	20 %	20 %	238650225
15	NC_012730	TTTGA	2	10	16038	16047	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012730	TTTTC	2	10	16817	16826	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012730	TAGTT	2	10	17423	17432	20 %	60 %	20 %	0 %	238650226
18	NC_012730	CATAT	2	10	17966	17975	40 %	40 %	0 %	20 %	238650226
19	NC_012730	ATTAG	2	10	18105	18114	40 %	40 %	20 %	0 %	238650226
20	NC_012730	TTATT	2	10	20033	20042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012730	TTTCA	2	10	20476	20485	20 %	60 %	0 %	20 %	238650228
22	NC_012730	ACATT	2	10	20747	20756	40 %	40 %	0 %	20 %	238650228
23	NC_012730	ATTTC	2	10	21799	21808	20 %	60 %	0 %	20 %	238650229
24	NC_012730	TTATT	2	10	22121	22130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012730	AATCA	2	10	22831	22840	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012730	TTTTA	2	10	26790	26799	20 %	80 %	0 %	0 %	238650234
27	NC_012730	AATTA	2	10	31993	32002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012730	CAAAA	2	10	35105	35114	80 %	0 %	0 %	20 %	238650239
29	NC_012730	GCTCC	2	10	35278	35287	0 %	20 %	20 %	60 %	238650239
30	NC_012730	ATGTT	2	10	36464	36473	20 %	60 %	20 %	0 %	238650239
31	NC_012730	TAAAA	2	10	40442	40451	80 %	20 %	0 %	0 %	238650245
32	NC_012730	TATTT	2	10	41167	41176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012730	TATAA	2	10	41270	41279	60 %	40 %	0 %	0 %	238650246
34	NC_012730	GAAAT	2	10	42151	42160	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012730	ATTTT	2	10	42204	42213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012730	AATTA	2	10	43385	43394	60 %	40 %	0 %	0 %	238650248
37	NC_012730	GCATT	2	10	44419	44428	20 %	40 %	20 %	20 %	238650248
38	NC_012730	TTTCT	2	10	45757	45766	0 %	80 %	0 %	20 %	238650248
39	NC_012730	TTAAA	2	10	46266	46275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012730	ACATA	2	10	46324	46333	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012730	AAATA	2	10	46905	46914	80 %	20 %	0 %	0 %	238650249
42	NC_012730	TGCAA	2	10	47263	47272	40 %	20 %	20 %	20 %	238650249
43	NC_012730	GTAAC	2	10	48352	48361	40 %	20 %	20 %	20 %	238650250
44	NC_012730	ATTTA	2	10	49040	49049	40 %	60 %	0 %	0 %	238650250
45	NC_012730	AGTGC	2	10	49175	49184	20 %	20 %	40 %	20 %	238650251
46	NC_012730	GCAAG	2	10	49595	49604	40 %	0 %	40 %	20 %	238650252
47	NC_012730	AAGTA	2	10	49978	49987	60 %	20 %	20 %	0 %	238650252
48	NC_012730	ACGGT	2	10	51303	51312	20 %	20 %	40 %	20 %	238650252
49	NC_012730	ACGGT	2	10	51405	51414	20 %	20 %	40 %	20 %	238650252
50	NC_012730	GCAAA	2	10	51576	51585	60 %	0 %	20 %	20 %	238650252
51	NC_012730	ATATT	2	10	53115	53124	40 %	60 %	0 %	0 %	238650254
52	NC_012730	TAATA	2	10	53708	53717	60 %	40 %	0 %	0 %	238650255
53	NC_012730	GTAAT	2	10	54007	54016	40 %	40 %	20 %	0 %	238650255
54	NC_012730	TAAAA	2	10	56040	56049	80 %	20 %	0 %	0 %	238650257
55	NC_012730	ATTAA	2	10	56595	56604	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012730	ATTAT	2	10	57263	57272	40 %	60 %	0 %	0 %	238650259
57	NC_012730	CCTCC	2	10	57390	57399	0 %	20 %	0 %	80 %	238650259
58	NC_012730	AGATA	2	10	57883	57892	60 %	20 %	20 %	0 %	238650259
59	NC_012730	AAACT	2	10	58427	58436	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012730	AATTA	2	10	58859	58868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012730	TTTAA	2	10	60096	60105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012730	ATTTA	2	10	60386	60395	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012730	AATTA	2	10	61838	61847	60 %	40 %	0 %	0 %	238651134
64	NC_012730	TTTAA	2	10	61887	61896	40 %	60 %	0 %	0 %	238651134
65	NC_012730	TTTTC	2	10	62473	62482	0 %	80 %	0 %	20 %	238651134
66	NC_012730	AGTTA	2	10	64094	64103	40 %	40 %	20 %	0 %	238650260
67	NC_012730	TTGAC	2	10	67064	67073	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012730	GTCTT	2	10	69212	69221	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_012730	CCCAT	2	10	69389	69398	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_012730	CTATT	2	10	71542	71551	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012730	ATTTT	2	10	72269	72278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012730	ACAAA	2	10	72443	72452	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012730	CCGGT	2	10	72691	72700	0 %	20 %	40 %	40 %	238650267
74	NC_012730	AAATA	2	10	73178	73187	80 %	20 %	0 %	0 %	238650267
75	NC_012730	TCCCA	2	10	75785	75794	20 %	20 %	0 %	60 %	238650269
76	NC_012730	GAATT	2	10	77716	77725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012730	AACTG	2	10	78627	78636	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012730	TTACT	2	10	80716	80725	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012730	TTAAT	2	10	80736	80745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012730	TGAGG	2	10	89130	89139	20 %	20 %	60 %	0 %	238650278
81	NC_012730	CTTGC	2	10	89724	89733	0 %	40 %	20 %	40 %	238650279
82	NC_012730	ATACC	2	10	90837	90846	40 %	20 %	0 %	40 %	238650281
83	NC_012730	TTCTA	2	10	90994	91003	20 %	60 %	0 %	20 %	238650281
84	NC_012730	TTATA	2	10	92464	92473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012730	AATTA	2	10	93229	93238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012730	TACAA	2	10	94437	94446	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012730	TTATT	2	10	94640	94649	20 %	80 %	0 %	0 %	238650286
88	NC_012730	ATAGA	2	10	95639	95648	60 %	20 %	20 %	0 %	238650287
89	NC_012730	GTAAA	2	10	95791	95800	60 %	20 %	20 %	0 %	238650287
90	NC_012730	AATAG	2	10	96205	96214	60 %	20 %	20 %	0 %	238650287
91	NC_012730	GCTTG	2	10	97575	97584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_012730	TTTTC	2	10	98428	98437	0 %	80 %	0 %	20 %	238650288
93	NC_012730	TATCA	2	10	99290	99299	40 %	40 %	0 %	20 %	238650288
94	NC_012730	TAGAA	2	10	99930	99939	60 %	20 %	20 %	0 %	238650289
95	NC_012730	TAAAT	2	10	101416	101425	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012730	AAAAT	2	10	101658	101667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012730	ATATA	2	10	101953	101962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012730	GCTCC	2	10	102874	102883	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_012730	ACTAA	2	10	104242	104251	60 %	20 %	0 %	20 %	238650293
100	NC_012730	TTTAT	2	10	104700	104709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012730	ATTAT	2	10	105145	105154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012730	ATGGA	2	10	106096	106105	40 %	20 %	40 %	0 %	238650294
103	NC_012730	TAAAT	2	10	110159	110168	60 %	40 %	0 %	0 %	238650298
104	NC_012730	TAGTA	2	10	110381	110390	40 %	40 %	20 %	0 %	238650298
105	NC_012730	AAATA	2	10	111185	111194	80 %	20 %	0 %	0 %	238650298
106	NC_012730	TAAAA	2	10	111359	111368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012730	CCAAA	2	10	113956	113965	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_012730	CCTGT	2	10	114110	114119	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_012730	ATCTT	2	10	114284	114293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012730	TATAA	2	10	115346	115355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012730	TAGTT	2	10	115945	115954	20 %	60 %	20 %	0 %	238650301
112	NC_012730	CTTTT	2	10	116913	116922	0 %	80 %	0 %	20 %	238650302
113	NC_012730	AATTA	2	10	118155	118164	60 %	40 %	0 %	0 %	238650302
114	NC_012730	AAATT	2	10	120750	120759	60 %	40 %	0 %	0 %	238650305
115	NC_012730	TAATT	2	10	122975	122984	40 %	60 %	0 %	0 %	238650306
116	NC_012730	TAATT	2	10	123206	123215	40 %	60 %	0 %	0 %	238650306
117	NC_012730	GTATA	2	10	126719	126728	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012730	ATCAA	2	10	128258	128267	60 %	20 %	0 %	20 %	238650310
119	NC_012730	ACGCT	2	10	129435	129444	20 %	20 %	20 %	40 %	238650310
120	NC_012730	TAAGT	2	10	129469	129478	40 %	40 %	20 %	0 %	238650310
121	NC_012730	AAAGA	2	10	130433	130442	80 %	0 %	20 %	0 %	238650310
122	NC_012730	GACTA	2	10	134004	134013	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_012730	TTAAT	2	10	134220	134229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012730	TAATA	2	10	134329	134338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012730	ATTTA	2	10	135725	135734	40 %	60 %	0 %	0 %	238650316
126	NC_012730	CTTTT	2	10	138648	138657	0 %	80 %	0 %	20 %	238650317
127	NC_012730	TATTC	2	10	140646	140655	20 %	60 %	0 %	20 %	238650318
128	NC_012730	ATATT	2	10	140952	140961	40 %	60 %	0 %	0 %	238650318
129	NC_012730	TACTT	2	10	143886	143895	20 %	60 %	0 %	20 %	238650320
130	NC_012730	CTTCT	2	10	144293	144302	0 %	60 %	0 %	40 %	238650322
131	NC_012730	CAATT	2	10	145922	145931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012730	ATTTT	2	10	147454	147463	20 %	80 %	0 %	0 %	238650325
133	NC_012730	TCATT	2	10	147816	147825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012730	TTGCT	2	10	148414	148423	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_012730	ATTTT	2	10	149214	149223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012730	GGTAA	2	10	150505	150514	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012730	AGAAT	2	10	151720	151729	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012730	GAATT	2	10	152087	152096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012730	CGCTC	2	10	153510	153519	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_012730	GGCTC	2	10	154047	154056	0 %	20 %	40 %	40 %	238650328
141	NC_012730	AGCAG	2	10	154472	154481	40 %	0 %	40 %	20 %	238650328
142	NC_012730	TTAAT	2	10	154615	154624	40 %	60 %	0 %	0 %	238650328
143	NC_012730	TAAAA	2	10	156721	156730	80 %	20 %	0 %	0 %	238650330
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148	NC_012730	ATGCT	2	10	166589	166598	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_012730	ATATT	2	10	169916	169925	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_012730	ATTTT	2	10	177282	177291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012730	TTAAT	2	10	178982	178991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_012730	TTTTA	2	10	185115	185124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_012730	TATCT	2	10	295567	295576	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_012730	TTGCA	2	10	301501	301510	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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263	NC_012730	CTTCG	2	10	302648	302657	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
264	NC_012730	CTCCG	2	10	305944	305953	0 %	20 %	20 %	60 %	238650435
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267	NC_012730	TAAAA	2	10	308482	308491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_012730	GCCTT	2	10	311542	311551	0 %	40 %	20 %	40 %	238650438
271	NC_012730	AAGAT	2	10	312290	312299	60 %	20 %	20 %	0 %	238650438
272	NC_012730	TCATC	2	10	312304	312313	20 %	40 %	0 %	40 %	238650438
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274	NC_012730	GTTTT	2	10	315140	315149	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
275	NC_012730	GCTAA	2	10	317560	317569	40 %	20 %	20 %	20 %	238650441
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277	NC_012730	TCTTT	2	10	318253	318262	0 %	80 %	0 %	20 %	238650442
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