MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic

Total Repeats: 13756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012730	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650214
2	NC_012730	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650214
3	NC_012730	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650214
4	NC_012730	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650214
5	NC_012730	AAT	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650214
6	NC_012730	ATG	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650214
7	NC_012730	ATA	2	6	436	441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650214
8	NC_012730	GTA	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650214
9	NC_012730	TTA	2	6	590	595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650214
10	NC_012730	CAG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650214
11	NC_012730	TAA	2	6	779	784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650214
12	NC_012730	ATA	2	6	815	820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650214
13	NC_012730	ATA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650215
14	NC_012730	TGA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650215
15	NC_012730	GTA	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650215
16	NC_012730	CAA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650215
17	NC_012730	TAA	2	6	1345	1350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650215
18	NC_012730	TCT	2	6	1465	1470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650216
19	NC_012730	ATA	3	9	1729	1737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650216
20	NC_012730	GTA	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650216
21	NC_012730	TGA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650216
22	NC_012730	GAA	2	6	1952	1957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650216
23	NC_012730	AAT	2	6	1982	1987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650216
24	NC_012730	AAG	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650216
25	NC_012730	TTA	2	6	2037	2042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650216
26	NC_012730	CAA	3	9	2100	2108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650216
27	NC_012730	GGT	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238650217
28	NC_012730	AGC	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650217
29	NC_012730	ATA	2	6	2397	2402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650217
30	NC_012730	ATA	2	6	2535	2540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650217
31	NC_012730	TAA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650217
32	NC_012730	ATG	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650217
33	NC_012730	TAT	2	6	2816	2821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650217
34	NC_012730	TTA	2	6	2830	2835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650217
35	NC_012730	CTC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238650218
36	NC_012730	ATT	2	6	3038	3043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
37	NC_012730	ATT	2	6	3051	3056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
38	NC_012730	ATT	2	6	3164	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
39	NC_012730	AGA	2	6	3337	3342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
40	NC_012730	AGA	2	6	3352	3357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
41	NC_012730	AGC	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650218
42	NC_012730	TGC	2	6	3379	3384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650218
43	NC_012730	ATT	2	6	3570	3575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
44	NC_012730	GAG	2	6	3647	3652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238650218
45	NC_012730	TAT	2	6	3808	3813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
46	NC_012730	GCA	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650218
47	NC_012730	AGA	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
48	NC_012730	CTA	2	6	4029	4034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650218
49	NC_012730	TAT	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
50	NC_012730	TTA	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
51	NC_012730	TGT	2	6	4111	4116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650218
52	NC_012730	ATA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
53	NC_012730	GGC	2	6	4556	4561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238650218
54	NC_012730	GCA	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650218
55	NC_012730	GGA	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238650218
56	NC_012730	GAA	2	6	4679	4684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
57	NC_012730	AAG	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
58	NC_012730	AAT	2	6	4721	4726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
59	NC_012730	GAA	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
60	NC_012730	TAA	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
61	NC_012730	CTA	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650218
62	NC_012730	GAG	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238650218
63	NC_012730	AAG	2	6	5163	5168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
64	NC_012730	ATA	2	6	5199	5204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
65	NC_012730	ATT	2	6	5250	5255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
66	NC_012730	TAA	2	6	5272	5277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
67	NC_012730	GAT	2	6	5291	5296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650218
68	NC_012730	TGC	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650218
69	NC_012730	ATT	2	6	5373	5378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
70	NC_012730	TGC	2	6	5386	5391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650218
71	NC_012730	CTA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650218
72	NC_012730	AGT	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650218
73	NC_012730	TCG	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650218
74	NC_012730	TTG	2	6	5580	5585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650218
75	NC_012730	TTA	2	6	5609	5614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650218
76	NC_012730	ATA	2	6	5631	5636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
77	NC_012730	TAA	2	6	5700	5705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
78	NC_012730	ATA	2	6	5723	5728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
79	NC_012730	GAA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650218
80	NC_012730	ATA	2	6	5777	5782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650218
81	NC_012730	ATG	2	6	5810	5815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650218
82	NC_012730	CTT	2	6	6065	6070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650219
83	NC_012730	TCA	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650219
84	NC_012730	ATA	2	6	6092	6097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650219
85	NC_012730	GAT	2	6	6201	6206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650219
86	NC_012730	AAC	3	9	6226	6234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650219
87	NC_012730	CAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650219
88	NC_012730	CTA	3	9	6650	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650220
89	NC_012730	ATT	2	6	6697	6702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650220
90	NC_012730	TTC	2	6	6763	6768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650220
91	NC_012730	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650220
92	NC_012730	CCG	2	6	6962	6967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238650220
93	NC_012730	ATT	2	6	6968	6973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650220
94	NC_012730	TAC	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650220
95	NC_012730	ATT	2	6	7030	7035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650220
96	NC_012730	ATT	3	9	7081	7089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650220
97	NC_012730	TCA	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650220
98	NC_012730	CCG	2	6	7109	7114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238650220
99	NC_012730	TAT	2	6	7155	7160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650220
100	NC_012730	TAC	2	6	7279	7284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650220
101	NC_012730	GTT	2	6	7357	7362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650220
102	NC_012730	GTA	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650220
103	NC_012730	CTT	2	6	7612	7617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650221
104	NC_012730	TAG	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650221
105	NC_012730	AGC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650221
106	NC_012730	CTA	2	6	7801	7806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650221
107	NC_012730	ATA	3	9	8103	8111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650222
108	NC_012730	ATA	2	6	8130	8135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650222
109	NC_012730	GCC	2	6	8150	8155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238650222
110	NC_012730	ATA	2	6	8313	8318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650222
111	NC_012730	TAG	2	6	8416	8421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650222
112	NC_012730	ATT	2	6	8441	8446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650222
113	NC_012730	ACG	2	6	8547	8552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650222
114	NC_012730	TCG	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650222
115	NC_012730	TGT	2	6	8586	8591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650222
116	NC_012730	CTC	2	6	8620	8625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238650222
117	NC_012730	TAT	2	6	8656	8661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650222
118	NC_012730	TAA	2	6	8668	8673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650222
119	NC_012730	CAA	2	6	8737	8742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650222
120	NC_012730	ATT	2	6	8754	8759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650222
121	NC_012730	TAG	2	6	8761	8766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650222
122	NC_012730	TAA	2	6	8837	8842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650222
123	NC_012730	AGC	3	9	8891	8899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650222
124	NC_012730	AGG	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238650222
125	NC_012730	TAC	2	6	9088	9093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650222
126	NC_012730	TGA	2	6	9971	9976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650223
127	NC_012730	AGT	2	6	10052	10057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650223
128	NC_012730	TGG	2	6	10073	10078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238650223
129	NC_012730	AAT	2	6	10086	10091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650223
130	NC_012730	TGA	2	6	10109	10114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650223
131	NC_012730	GCA	2	6	10122	10127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650223
132	NC_012730	ATA	2	6	10147	10152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650223
133	NC_012730	TAC	3	9	10241	10249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650223
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136	NC_012730	TGA	2	6	10340	10345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650223
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139	NC_012730	TAA	2	6	10399	10404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650223
140	NC_012730	TGA	2	6	10435	10440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650223
141	NC_012730	TAA	2	6	11136	11141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650224
142	NC_012730	GTT	2	6	11230	11235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650224
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254	NC_012730	CTT	2	6	21324	21329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650228
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256	NC_012730	ATC	2	6	21582	21587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650229
257	NC_012730	GAA	2	6	21682	21687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650229
258	NC_012730	GAT	2	6	21818	21823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650229
259	NC_012730	ACG	2	6	21981	21986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650229
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272	NC_012730	TAT	2	6	24167	24172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650233
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287	NC_012730	ATA	2	6	26885	26890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650234
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