MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 2299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012726	GTCAC	2	10	358	367	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012726	GATAA	2	10	1241	1250	60 %	20 %	20 %	0 %	238618481
3	NC_012726	AGAGG	2	10	1311	1320	40 %	0 %	60 %	0 %	238618481
4	NC_012726	TCCTT	2	10	3846	3855	0 %	60 %	0 %	40 %	238618485
5	NC_012726	CGTTA	2	10	4089	4098	20 %	40 %	20 %	20 %	238618485
6	NC_012726	CTGTG	2	10	4520	4529	0 %	40 %	40 %	20 %	238618486
7	NC_012726	GTAAT	2	10	4666	4675	40 %	40 %	20 %	0 %	238618486
8	NC_012726	GTTTT	2	10	4740	4749	0 %	80 %	20 %	0 %	238618486
9	NC_012726	CTAAA	2	10	5083	5092	60 %	20 %	0 %	20 %	238618487
10	NC_012726	CTTAT	2	10	5289	5298	20 %	60 %	0 %	20 %	238618487
11	NC_012726	TTAAA	2	10	5884	5893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012726	ATGTT	2	10	6113	6122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012726	TTTTC	2	10	6768	6777	0 %	80 %	0 %	20 %	238618488
14	NC_012726	TAATT	2	10	6855	6864	40 %	60 %	0 %	0 %	238618488
15	NC_012726	TCTTA	2	10	7163	7172	20 %	60 %	0 %	20 %	238618489
16	NC_012726	ATATA	2	10	8218	8227	60 %	40 %	0 %	0 %	238618491
17	NC_012726	GAAAT	2	10	9804	9813	60 %	20 %	20 %	0 %	238618492
18	NC_012726	TTATA	2	10	10159	10168	40 %	60 %	0 %	0 %	238618493
19	NC_012726	TCTTT	2	10	13136	13145	0 %	80 %	0 %	20 %	238618495
20	NC_012726	TACAC	2	10	13647	13656	40 %	20 %	0 %	40 %	238618495
21	NC_012726	CCATG	2	10	17216	17225	20 %	20 %	20 %	40 %	238618498
22	NC_012726	TTTCC	2	10	17320	17329	0 %	60 %	0 %	40 %	238618498
23	NC_012726	TAATT	2	10	17539	17548	40 %	60 %	0 %	0 %	238618498
24	NC_012726	TGGCT	2	10	21176	21185	0 %	40 %	40 %	20 %	238618501
25	NC_012726	TGAGT	2	10	21707	21716	20 %	40 %	40 %	0 %	238618502
26	NC_012726	AAGAG	2	10	24154	24163	60 %	0 %	40 %	0 %	238618505
27	NC_012726	CTATG	2	10	25262	25271	20 %	40 %	20 %	20 %	238618507
28	NC_012726	GAAGA	2	10	26564	26573	60 %	0 %	40 %	0 %	238618508
29	NC_012726	TATTT	2	10	26920	26929	20 %	80 %	0 %	0 %	238618508
30	NC_012726	AAAAT	2	10	27152	27161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012726	CTTTT	2	10	27640	27649	0 %	80 %	0 %	20 %	238618509
32	NC_012726	AGTTA	2	10	28363	28372	40 %	40 %	20 %	0 %	238618510
33	NC_012726	TATCA	2	10	30077	30086	40 %	40 %	0 %	20 %	238618512
34	NC_012726	TTTCC	2	10	30925	30934	0 %	60 %	0 %	40 %	238618512
35	NC_012726	ATATG	2	10	31945	31954	40 %	40 %	20 %	0 %	238618513
36	NC_012726	TGTGG	2	10	32254	32263	0 %	40 %	60 %	0 %	238618514
37	NC_012726	CTTCT	2	10	33580	33589	0 %	60 %	0 %	40 %	238618515
38	NC_012726	GAAGG	2	10	35052	35061	40 %	0 %	60 %	0 %	238618517
39	NC_012726	ATTTT	2	10	36167	36176	20 %	80 %	0 %	0 %	238618519
40	NC_012726	CATAC	2	10	37263	37272	40 %	20 %	0 %	40 %	238618522
41	NC_012726	ATTAG	2	10	38401	38410	40 %	40 %	20 %	0 %	238618524
42	NC_012726	CTTTT	2	10	38428	38437	0 %	80 %	0 %	20 %	238618524
43	NC_012726	TGGTG	2	10	39035	39044	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012726	TTTTA	2	10	39220	39229	20 %	80 %	0 %	0 %	238618525
45	NC_012726	ATTAT	2	10	39397	39406	40 %	60 %	0 %	0 %	238618525
46	NC_012726	AAGGA	2	10	41223	41232	60 %	0 %	40 %	0 %	238618527
47	NC_012726	ATTTG	2	10	42397	42406	20 %	60 %	20 %	0 %	238618529
48	NC_012726	CAAGA	2	10	45014	45023	60 %	0 %	20 %	20 %	238618533
49	NC_012726	TGAAT	2	10	45037	45046	40 %	40 %	20 %	0 %	238618533
50	NC_012726	TCTTT	2	10	46822	46831	0 %	80 %	0 %	20 %	238618535
51	NC_012726	TTTCT	2	10	47069	47078	0 %	80 %	0 %	20 %	238618535
52	NC_012726	TATAG	2	10	47856	47865	40 %	40 %	20 %	0 %	238618535
53	NC_012726	AAAGT	2	10	49839	49848	60 %	20 %	20 %	0 %	238618538
54	NC_012726	GATAA	2	10	51819	51828	60 %	20 %	20 %	0 %	238618540
55	NC_012726	TCTTT	2	10	53448	53457	0 %	80 %	0 %	20 %	238618542
56	NC_012726	TTCAT	2	10	53852	53861	20 %	60 %	0 %	20 %	238618542
57	NC_012726	ATTTA	2	10	54766	54775	40 %	60 %	0 %	0 %	238618542
58	NC_012726	TTTCT	2	10	54818	54827	0 %	80 %	0 %	20 %	238618542
59	NC_012726	TACCT	2	10	57248	57257	20 %	40 %	0 %	40 %	238618544
60	NC_012726	CTGTA	2	10	57507	57516	20 %	40 %	20 %	20 %	238618544
61	NC_012726	ATTTA	2	10	57761	57770	40 %	60 %	0 %	0 %	238618544
62	NC_012726	CATTT	2	10	58423	58432	20 %	60 %	0 %	20 %	238618545
63	NC_012726	TAAAT	2	10	60305	60314	60 %	40 %	0 %	0 %	238618546
64	NC_012726	TAATT	2	10	61019	61028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012726	CAACA	2	10	61122	61131	60 %	0 %	0 %	40 %	238618548
66	NC_012726	AGCTA	2	10	62906	62915	40 %	20 %	20 %	20 %	238618549
67	NC_012726	ATCCC	2	10	64967	64976	20 %	20 %	0 %	60 %	238618551
68	NC_012726	TTAAT	2	10	65347	65356	40 %	60 %	0 %	0 %	238618551
69	NC_012726	AAGCC	2	10	66603	66612	40 %	0 %	20 %	40 %	238618553
70	NC_012726	GTTTT	2	10	72057	72066	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012726	AGGAT	2	10	72639	72648	40 %	20 %	40 %	0 %	238618563
72	NC_012726	ATTGA	2	10	73338	73347	40 %	40 %	20 %	0 %	238618564
73	NC_012726	GGAAT	2	10	75099	75108	40 %	20 %	40 %	0 %	238618566
74	NC_012726	ACTTT	2	10	76600	76609	20 %	60 %	0 %	20 %	238618568
75	NC_012726	CTTAT	2	10	78073	78082	20 %	60 %	0 %	20 %	238618570
76	NC_012726	TCTTT	2	10	78617	78626	0 %	80 %	0 %	20 %	238618570
77	NC_012726	ATGTG	2	10	79057	79066	20 %	40 %	40 %	0 %	238618570
78	NC_012726	TTGAG	2	10	79096	79105	20 %	40 %	40 %	0 %	238618570
79	NC_012726	CTCTT	2	10	80005	80014	0 %	60 %	0 %	40 %	238618571
80	NC_012726	TCAGC	2	10	80706	80715	20 %	20 %	20 %	40 %	238618572
81	NC_012726	ATATG	2	10	82187	82196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012726	ATTTT	2	10	84335	84344	20 %	80 %	0 %	0 %	238618575
83	NC_012726	AGATT	2	10	89016	89025	40 %	40 %	20 %	0 %	238618580
84	NC_012726	TAGCA	2	10	89421	89430	40 %	20 %	20 %	20 %	238618581
85	NC_012726	ATATT	2	10	89912	89921	40 %	60 %	0 %	0 %	238618581
86	NC_012726	TTTAA	2	10	91938	91947	40 %	60 %	0 %	0 %	238618582
87	NC_012726	AAAAT	2	10	92163	92172	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012726	ACTCC	2	10	92702	92711	20 %	20 %	0 %	60 %	238618583
89	NC_012726	CCTTA	2	10	92797	92806	20 %	40 %	0 %	40 %	238618583
90	NC_012726	AGAGT	2	10	92882	92891	40 %	20 %	40 %	0 %	238618583
91	NC_012726	CTAAT	2	10	93810	93819	40 %	40 %	0 %	20 %	238618585
92	NC_012726	AATTA	2	10	94105	94114	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012726	CTTTA	2	10	94141	94150	20 %	60 %	0 %	20 %	238618586
94	NC_012726	TTAAG	2	10	95548	95557	40 %	40 %	20 %	0 %	238618588
95	NC_012726	ACGAT	2	10	95692	95701	40 %	20 %	20 %	20 %	238618588
96	NC_012726	AACGT	2	10	95742	95751	40 %	20 %	20 %	20 %	238618588
97	NC_012726	AGTCT	2	10	97268	97277	20 %	40 %	20 %	20 %	238618590
98	NC_012726	AGTTA	2	10	98075	98084	40 %	40 %	20 %	0 %	238618591
99	NC_012726	TCCAT	2	10	98308	98317	20 %	40 %	0 %	40 %	238618591
100	NC_012726	CTATC	2	10	98683	98692	20 %	40 %	0 %	40 %	238618592
101	NC_012726	TTTAG	2	10	99105	99114	20 %	60 %	20 %	0 %	238618592
102	NC_012726	TTTCT	2	10	99264	99273	0 %	80 %	0 %	20 %	238618592
103	NC_012726	CCAAT	2	10	100745	100754	40 %	20 %	0 %	40 %	238618594
104	NC_012726	TAAGT	2	10	100981	100990	40 %	40 %	20 %	0 %	238618594
105	NC_012726	TTATC	2	10	101943	101952	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_012726	AGTTA	2	10	103819	103828	40 %	40 %	20 %	0 %	238618596
107	NC_012726	TATAA	2	10	103910	103919	60 %	40 %	0 %	0 %	238618596
108	NC_012726	ATATC	2	10	104466	104475	40 %	40 %	0 %	20 %	238618597
109	NC_012726	TAAGA	2	10	105862	105871	60 %	20 %	20 %	0 %	238618598
110	NC_012726	TTATC	2	10	105892	105901	20 %	60 %	0 %	20 %	238618598
111	NC_012726	GTTGA	2	10	108231	108240	20 %	40 %	40 %	0 %	238618600
112	NC_012726	TGATA	2	10	109194	109203	40 %	40 %	20 %	0 %	238618602
113	NC_012726	AAATG	2	10	110261	110270	60 %	20 %	20 %	0 %	238618603
114	NC_012726	CTTTT	2	10	110548	110557	0 %	80 %	0 %	20 %	238618603
115	NC_012726	ATATT	2	10	110770	110779	40 %	60 %	0 %	0 %	238618604
116	NC_012726	TTTCC	2	10	111577	111586	0 %	60 %	0 %	40 %	238618605
117	NC_012726	GCTTT	2	10	112404	112413	0 %	60 %	20 %	20 %	238618605
118	NC_012726	CTATG	2	10	112651	112660	20 %	40 %	20 %	20 %	238618605
119	NC_012726	TTGTT	2	10	112797	112806	0 %	80 %	20 %	0 %	238618606
120	NC_012726	ATTTT	2	10	113263	113272	20 %	80 %	0 %	0 %	238618607
121	NC_012726	AGTGC	2	10	113716	113725	20 %	20 %	40 %	20 %	238618607
122	NC_012726	ACATT	2	10	114135	114144	40 %	40 %	0 %	20 %	238618608
123	NC_012726	TACAT	2	10	114294	114303	40 %	40 %	0 %	20 %	238618608
124	NC_012726	CATGC	2	10	115223	115232	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_012726	TTTCC	2	10	118751	118760	0 %	60 %	0 %	40 %	238618613
126	NC_012726	AAATT	2	10	120372	120381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012726	ATTAT	2	10	120711	120720	40 %	60 %	0 %	0 %	238618616
128	NC_012726	CCTAG	2	10	124717	124726	20 %	20 %	20 %	40 %	238618621
129	NC_012726	TTGGT	2	10	126438	126447	0 %	60 %	40 %	0 %	238618621
130	NC_012726	ACTTT	2	10	127805	127814	20 %	60 %	0 %	20 %	238618625
131	NC_012726	AATTC	2	10	128266	128275	40 %	40 %	0 %	20 %	238618627
132	NC_012726	CAAAT	2	10	130073	130082	60 %	20 %	0 %	20 %	238618631
133	NC_012726	GCAAA	2	10	131731	131740	60 %	0 %	20 %	20 %	238618632
134	NC_012726	GATTA	2	10	132655	132664	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012726	GTAGT	2	10	133058	133067	20 %	40 %	40 %	0 %	238618633
136	NC_012726	TGGGT	2	10	133247	133256	0 %	40 %	60 %	0 %	238618633
137	NC_012726	TAGAA	2	10	134374	134383	60 %	20 %	20 %	0 %	238618634
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403	NC_012726	TATAA	2	10	457841	457850	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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