MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 6727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012726	TTTC	2	8	135	142	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012726	TATT	2	8	528	535	25 %	75 %	0 %	0 %	238618480
3	NC_012726	TTAC	2	8	703	710	25 %	50 %	0 %	25 %	238618480
4	NC_012726	GTAA	2	8	1052	1059	50 %	25 %	25 %	0 %	238618481
5	NC_012726	AGCT	2	8	1620	1627	25 %	25 %	25 %	25 %	238618481
6	NC_012726	CCTT	2	8	1714	1721	0 %	50 %	0 %	50 %	238618481
7	NC_012726	CAAA	2	8	1810	1817	75 %	0 %	0 %	25 %	238618481
8	NC_012726	TAAA	2	8	2369	2376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012726	TAGG	2	8	2566	2573	25 %	25 %	50 %	0 %	238618483
10	NC_012726	CTTT	2	8	2664	2671	0 %	75 %	0 %	25 %	238618483
11	NC_012726	TGAT	2	8	2989	2996	25 %	50 %	25 %	0 %	238618483
12	NC_012726	GGTT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	50 %	0 %	238618484
13	NC_012726	CAAT	2	8	3389	3396	50 %	25 %	0 %	25 %	238618484
14	NC_012726	AGAA	2	8	3658	3665	75 %	0 %	25 %	0 %	238618485
15	NC_012726	TTTA	2	8	3699	3706	25 %	75 %	0 %	0 %	238618485
16	NC_012726	ACTA	2	8	3924	3931	50 %	25 %	0 %	25 %	238618485
17	NC_012726	CATT	2	8	4224	4231	25 %	50 %	0 %	25 %	238618485
18	NC_012726	TACG	2	8	4988	4995	25 %	25 %	25 %	25 %	238618487
19	NC_012726	TAAA	2	8	5366	5373	75 %	25 %	0 %	0 %	238618487
20	NC_012726	GTTC	2	8	6203	6210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012726	ATCT	2	8	6873	6880	25 %	50 %	0 %	25 %	238618488
22	NC_012726	TCAC	2	8	7339	7346	25 %	25 %	0 %	50 %	238618490
23	NC_012726	ATAC	2	8	7784	7791	50 %	25 %	0 %	25 %	238618491
24	NC_012726	AGTT	2	8	8319	8326	25 %	50 %	25 %	0 %	238618491
25	NC_012726	TCCC	2	8	8556	8563	0 %	25 %	0 %	75 %	238618491
26	NC_012726	TCAT	2	8	8824	8831	25 %	50 %	0 %	25 %	238618491
27	NC_012726	AAGC	2	8	9614	9621	50 %	0 %	25 %	25 %	238618492
28	NC_012726	CATC	2	8	9904	9911	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012726	ATTT	2	8	10016	10023	25 %	75 %	0 %	0 %	238618493
30	NC_012726	GAGT	2	8	10193	10200	25 %	25 %	50 %	0 %	238618493
31	NC_012726	ATCC	2	8	10293	10300	25 %	25 %	0 %	50 %	238618493
32	NC_012726	CTAG	2	8	10773	10780	25 %	25 %	25 %	25 %	238618493
33	NC_012726	AGTT	2	8	10918	10925	25 %	50 %	25 %	0 %	238618493
34	NC_012726	ATTT	2	8	11323	11330	25 %	75 %	0 %	0 %	238618494
35	NC_012726	ATTT	2	8	11505	11512	25 %	75 %	0 %	0 %	238618494
36	NC_012726	CTTA	2	8	11840	11847	25 %	50 %	0 %	25 %	238618495
37	NC_012726	AGTA	3	12	11975	11986	50 %	25 %	25 %	0 %	238618495
38	NC_012726	ATTT	2	8	12443	12450	25 %	75 %	0 %	0 %	238618495
39	NC_012726	TTTA	2	8	12467	12474	25 %	75 %	0 %	0 %	238618495
40	NC_012726	AAGT	2	8	12789	12796	50 %	25 %	25 %	0 %	238618495
41	NC_012726	CTTT	2	8	13260	13267	0 %	75 %	0 %	25 %	238618495
42	NC_012726	CTAT	2	8	13389	13396	25 %	50 %	0 %	25 %	238618495
43	NC_012726	TCTA	2	8	13979	13986	25 %	50 %	0 %	25 %	238618495
44	NC_012726	GCAT	2	8	14116	14123	25 %	25 %	25 %	25 %	238618495
45	NC_012726	TTCT	2	8	14179	14186	0 %	75 %	0 %	25 %	238618495
46	NC_012726	TACT	2	8	16534	16541	25 %	50 %	0 %	25 %	238618497
47	NC_012726	TCGC	2	8	16925	16932	0 %	25 %	25 %	50 %	238618497
48	NC_012726	ATTA	2	8	17049	17056	50 %	50 %	0 %	0 %	238618498
49	NC_012726	TCTA	2	8	17061	17068	25 %	50 %	0 %	25 %	238618498
50	NC_012726	TCTA	2	8	17106	17113	25 %	50 %	0 %	25 %	238618498
51	NC_012726	TTTC	2	8	17173	17180	0 %	75 %	0 %	25 %	238618498
52	NC_012726	GGTT	2	8	17953	17960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012726	CATA	2	8	17965	17972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012726	GTTT	2	8	18654	18661	0 %	75 %	25 %	0 %	238618499
55	NC_012726	GAAT	2	8	18764	18771	50 %	25 %	25 %	0 %	238618500
56	NC_012726	ACTT	2	8	19126	19133	25 %	50 %	0 %	25 %	238618500
57	NC_012726	ATGG	2	8	19669	19676	25 %	25 %	50 %	0 %	238618500
58	NC_012726	TACA	2	8	19983	19990	50 %	25 %	0 %	25 %	238618500
59	NC_012726	GGAC	2	8	20469	20476	25 %	0 %	50 %	25 %	238618500
60	NC_012726	TTAC	2	8	20503	20510	25 %	50 %	0 %	25 %	238618500
61	NC_012726	AATT	2	8	20525	20532	50 %	50 %	0 %	0 %	238618500
62	NC_012726	TATG	2	8	20704	20711	25 %	50 %	25 %	0 %	238618501
63	NC_012726	AAGG	2	8	21087	21094	50 %	0 %	50 %	0 %	238618501
64	NC_012726	AGGG	2	8	21218	21225	25 %	0 %	75 %	0 %	238618501
65	NC_012726	GAAA	2	8	21279	21286	75 %	0 %	25 %	0 %	238618501
66	NC_012726	TTGA	2	8	21456	21463	25 %	50 %	25 %	0 %	238618502
67	NC_012726	ATGT	2	8	21833	21840	25 %	50 %	25 %	0 %	238618502
68	NC_012726	ATCT	2	8	23134	23141	25 %	50 %	0 %	25 %	238618504
69	NC_012726	TCAT	2	8	23192	23199	25 %	50 %	0 %	25 %	238618504
70	NC_012726	TAGA	2	8	23921	23928	50 %	25 %	25 %	0 %	238618505
71	NC_012726	TAGA	2	8	24636	24643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012726	TCCA	2	8	24880	24887	25 %	25 %	0 %	50 %	238618506
73	NC_012726	CTGA	2	8	25837	25844	25 %	25 %	25 %	25 %	238618507
74	NC_012726	AAGG	2	8	25863	25870	50 %	0 %	50 %	0 %	238618507
75	NC_012726	ATTT	2	8	26621	26628	25 %	75 %	0 %	0 %	238618508
76	NC_012726	AAGA	2	8	26755	26762	75 %	0 %	25 %	0 %	238618508
77	NC_012726	GTCA	2	8	26825	26832	25 %	25 %	25 %	25 %	238618508
78	NC_012726	CTCC	2	8	27286	27293	0 %	25 %	0 %	75 %	238618509
79	NC_012726	TGCT	2	8	27355	27362	0 %	50 %	25 %	25 %	238618509
80	NC_012726	CTGC	2	8	27918	27925	0 %	25 %	25 %	50 %	238618509
81	NC_012726	TTTA	2	8	28166	28173	25 %	75 %	0 %	0 %	238618509
82	NC_012726	ATAA	2	8	28222	28229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012726	AATA	2	8	28573	28580	75 %	25 %	0 %	0 %	238618510
84	NC_012726	TCAA	2	8	28877	28884	50 %	25 %	0 %	25 %	238618511
85	NC_012726	CTTT	2	8	29367	29374	0 %	75 %	0 %	25 %	238618511
86	NC_012726	TAAA	2	8	29674	29681	75 %	25 %	0 %	0 %	238618511
87	NC_012726	TTCC	2	8	30013	30020	0 %	50 %	0 %	50 %	238618512
88	NC_012726	ATCT	2	8	30577	30584	25 %	50 %	0 %	25 %	238618512
89	NC_012726	ATCC	2	8	30666	30673	25 %	25 %	0 %	50 %	238618512
90	NC_012726	TACT	2	8	30991	30998	25 %	50 %	0 %	25 %	238618512
91	NC_012726	GTTT	2	8	33460	33467	0 %	75 %	25 %	0 %	238618515
92	NC_012726	GAAT	2	8	33745	33752	50 %	25 %	25 %	0 %	238618515
93	NC_012726	GTTA	2	8	33836	33843	25 %	50 %	25 %	0 %	238618515
94	NC_012726	ATAA	2	8	34128	34135	75 %	25 %	0 %	0 %	238618516
95	NC_012726	AATG	2	8	34525	34532	50 %	25 %	25 %	0 %	238618517
96	NC_012726	GAAA	2	8	34709	34716	75 %	0 %	25 %	0 %	238618517
97	NC_012726	AACT	2	8	35088	35095	50 %	25 %	0 %	25 %	238618517
98	NC_012726	GATA	2	8	35787	35794	50 %	25 %	25 %	0 %	238618518
99	NC_012726	TAAA	2	8	36251	36258	75 %	25 %	0 %	0 %	238618519
100	NC_012726	TTCA	2	8	36599	36606	25 %	50 %	0 %	25 %	238618520
101	NC_012726	CCTT	2	8	36902	36909	0 %	50 %	0 %	50 %	238618521
102	NC_012726	AGCT	2	8	36921	36928	25 %	25 %	25 %	25 %	238618521
103	NC_012726	ATGA	2	8	38300	38307	50 %	25 %	25 %	0 %	238618524
104	NC_012726	ATTT	2	8	38509	38516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012726	AAAT	2	8	38520	38527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012726	AAAT	2	8	38585	38592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012726	AATA	2	8	38995	39002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012726	GATT	2	8	39050	39057	25 %	50 %	25 %	0 %	238618525
109	NC_012726	AAAT	2	8	39239	39246	75 %	25 %	0 %	0 %	238618525
110	NC_012726	ACTC	2	8	39422	39429	25 %	25 %	0 %	50 %	238618525
111	NC_012726	TAAT	2	8	39677	39684	50 %	50 %	0 %	0 %	238618525
112	NC_012726	TCTT	2	8	40032	40039	0 %	75 %	0 %	25 %	238618526
113	NC_012726	TGTA	2	8	40571	40578	25 %	50 %	25 %	0 %	238618526
114	NC_012726	CTTT	2	8	40617	40624	0 %	75 %	0 %	25 %	238618526
115	NC_012726	TAAT	2	8	41316	41323	50 %	50 %	0 %	0 %	238618527
116	NC_012726	CTAT	2	8	41644	41651	25 %	50 %	0 %	25 %	238618528
117	NC_012726	TTTA	2	8	41922	41929	25 %	75 %	0 %	0 %	238618528
118	NC_012726	TCAT	2	8	42451	42458	25 %	50 %	0 %	25 %	238618529
119	NC_012726	GTAG	2	8	42533	42540	25 %	25 %	50 %	0 %	238618530
120	NC_012726	TAGG	2	8	43236	43243	25 %	25 %	50 %	0 %	238618530
121	NC_012726	GTAA	2	8	43295	43302	50 %	25 %	25 %	0 %	238618530
122	NC_012726	TTAC	2	8	43668	43675	25 %	50 %	0 %	25 %	238618531
123	NC_012726	CTAT	2	8	44179	44186	25 %	50 %	0 %	25 %	238618532
124	NC_012726	TTTA	2	8	44328	44335	25 %	75 %	0 %	0 %	238618532
125	NC_012726	TTCC	2	8	44601	44608	0 %	50 %	0 %	50 %	238618532
126	NC_012726	AACA	2	8	44819	44826	75 %	0 %	0 %	25 %	238618533
127	NC_012726	TAAG	2	8	45417	45424	50 %	25 %	25 %	0 %	238618533
128	NC_012726	TAGC	2	8	45777	45784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012726	CTTT	2	8	47156	47163	0 %	75 %	0 %	25 %	238618535
130	NC_012726	ATTT	2	8	47314	47321	25 %	75 %	0 %	0 %	238618535
131	NC_012726	TCTT	2	8	47432	47439	0 %	75 %	0 %	25 %	238618535
132	NC_012726	ATTT	2	8	47464	47471	25 %	75 %	0 %	0 %	238618535
133	NC_012726	ATTT	2	8	47686	47693	25 %	75 %	0 %	0 %	238618535
134	NC_012726	TCAA	2	8	48196	48203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012726	TTGC	2	8	48340	48347	0 %	50 %	25 %	25 %	238618536
136	NC_012726	TTTA	2	8	48464	48471	25 %	75 %	0 %	0 %	238618536
137	NC_012726	AAGA	2	8	48708	48715	75 %	0 %	25 %	0 %	238618536
138	NC_012726	AAAG	2	8	50361	50368	75 %	0 %	25 %	0 %	238618539
139	NC_012726	GTTT	2	8	50454	50461	0 %	75 %	25 %	0 %	238618539
140	NC_012726	AAAG	2	8	50508	50515	75 %	0 %	25 %	0 %	238618539
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