MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 32224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012726	TAT	2	6	539	544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618480
2	NC_012726	TAT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618480
3	NC_012726	ATT	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618480
4	NC_012726	GTT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618480
5	NC_012726	GTT	2	6	650	655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618480
6	NC_012726	CTT	2	6	675	680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618480
7	NC_012726	GGT	2	6	869	874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
8	NC_012726	TGC	2	6	964	969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238618481
9	NC_012726	GAG	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618481
10	NC_012726	TGG	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
11	NC_012726	TAT	2	6	1167	1172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618481
12	NC_012726	ATA	2	6	1277	1282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
13	NC_012726	TTA	2	6	1371	1376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618481
14	NC_012726	ATC	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618481
15	NC_012726	ACG	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618481
16	NC_012726	AAC	2	6	1470	1475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618481
17	NC_012726	TAA	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
18	NC_012726	ATG	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618481
19	NC_012726	AGC	2	6	1612	1617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618481
20	NC_012726	TGG	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
21	NC_012726	AAG	2	6	1741	1746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
22	NC_012726	AGA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
23	NC_012726	TAA	2	6	1801	1806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
24	NC_012726	AGA	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
25	NC_012726	ATA	2	6	1847	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
26	NC_012726	TGG	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
27	NC_012726	AAG	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
28	NC_012726	TGA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618481
29	NC_012726	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
30	NC_012726	AGA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
31	NC_012726	CTA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618482
32	NC_012726	GGA	2	6	2162	2167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618482
33	NC_012726	AAG	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
34	NC_012726	AAG	3	9	2243	2251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
35	NC_012726	GAA	2	6	2271	2276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
36	NC_012726	AAG	2	6	2277	2282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
37	NC_012726	ATT	2	6	2292	2297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618482
38	NC_012726	ATT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618482
39	NC_012726	ATT	2	6	2323	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618482
40	NC_012726	ATA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
41	NC_012726	TAT	2	6	2468	2473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618483
42	NC_012726	TAA	2	6	2503	2508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
43	NC_012726	TAA	2	6	2512	2517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
44	NC_012726	AGA	2	6	2582	2587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618483
45	NC_012726	AGC	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618483
46	NC_012726	ATT	2	6	2716	2721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618483
47	NC_012726	GAT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618483
48	NC_012726	TAA	2	6	2830	2835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
49	NC_012726	TGC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238618483
50	NC_012726	AAT	2	6	2876	2881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
51	NC_012726	TGC	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238618483
52	NC_012726	GCA	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618483
53	NC_012726	TAC	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618483
54	NC_012726	AAT	2	6	3131	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
55	NC_012726	GAA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618484
56	NC_012726	AAG	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618484
57	NC_012726	ATC	3	9	3438	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618484
58	NC_012726	TAT	2	6	3461	3466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618484
59	NC_012726	AAC	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618484
60	NC_012726	GGA	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618484
61	NC_012726	TGA	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618484
62	NC_012726	AAG	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618485
63	NC_012726	CCA	2	6	3682	3687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238618485
64	NC_012726	TCC	2	6	3814	3819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618485
65	NC_012726	TTA	2	6	3872	3877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618485
66	NC_012726	TTG	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618485
67	NC_012726	TAT	3	9	3957	3965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618485
68	NC_012726	TAA	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618485
69	NC_012726	TAG	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618485
70	NC_012726	TCC	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618485
71	NC_012726	CTT	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618485
72	NC_012726	AAG	2	6	4536	4541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618486
73	NC_012726	CCA	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238618486
74	NC_012726	AAT	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618486
75	NC_012726	AGG	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618486
76	NC_012726	TCT	2	6	4950	4955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618487
77	NC_012726	CTT	2	6	5047	5052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618487
78	NC_012726	TAA	2	6	5054	5059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618487
79	NC_012726	CCT	2	6	5149	5154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618487
80	NC_012726	CAT	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618487
81	NC_012726	TCT	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618487
82	NC_012726	ATC	2	6	5408	5413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618487
83	NC_012726	TAA	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618487
84	NC_012726	TCA	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618488
85	NC_012726	ATC	2	6	6330	6335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618488
86	NC_012726	TTA	2	6	6416	6421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618488
87	NC_012726	GTT	2	6	6425	6430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618488
88	NC_012726	GAA	2	6	6458	6463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618488
89	NC_012726	TAT	2	6	6486	6491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618488
90	NC_012726	TCT	2	6	6502	6507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618488
91	NC_012726	TCT	2	6	6620	6625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618488
92	NC_012726	TCT	2	6	6697	6702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618488
93	NC_012726	TGT	2	6	6731	6736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618488
94	NC_012726	TCA	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618488
95	NC_012726	CTA	2	6	6992	6997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618488
96	NC_012726	GAT	2	6	6998	7003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618488
97	NC_012726	GTA	2	6	7145	7150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618489
98	NC_012726	TCC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618489
99	NC_012726	CTT	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618489
100	NC_012726	TGG	2	6	7235	7240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618489
101	NC_012726	TTC	2	6	7259	7264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618489
102	NC_012726	CTG	2	6	7324	7329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238618489
103	NC_012726	CTT	2	6	7347	7352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618490
104	NC_012726	ACT	3	9	7384	7392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618490
105	NC_012726	CTA	2	6	7448	7453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618490
106	NC_012726	CTT	2	6	7463	7468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618490
107	NC_012726	ATC	2	6	7482	7487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618490
108	NC_012726	TTC	2	6	7526	7531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618490
109	NC_012726	AAC	2	6	7545	7550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618490
110	NC_012726	TAA	2	6	7553	7558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618490
111	NC_012726	TAG	2	6	7578	7583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618490
112	NC_012726	TAT	2	6	7602	7607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618490
113	NC_012726	ATA	2	6	7745	7750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618491
114	NC_012726	TTG	2	6	7757	7762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618491
115	NC_012726	CTT	2	6	7803	7808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618491
116	NC_012726	GGA	2	6	7925	7930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618491
117	NC_012726	ACT	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618491
118	NC_012726	TCA	2	6	8014	8019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618491
119	NC_012726	ATA	2	6	8028	8033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618491
120	NC_012726	ACA	2	6	8090	8095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618491
121	NC_012726	GAA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618491
122	NC_012726	GGT	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618491
123	NC_012726	GGA	2	6	8330	8335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618491
124	NC_012726	GGT	2	6	8339	8344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618491
125	NC_012726	AGT	2	6	8369	8374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618491
126	NC_012726	TAT	2	6	8387	8392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618491
127	NC_012726	GGC	2	6	8455	8460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238618491
128	NC_012726	TAT	2	6	8544	8549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618491
129	NC_012726	TAA	2	6	8617	8622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618491
130	NC_012726	AGT	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618491
131	NC_012726	TCT	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618491
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