MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012725	ACGCAT	2	12	2292	2303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012725	CCCGAC	2	12	6527	6538	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_012725	CGCCGG	2	12	7449	7460	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
4	NC_012725	TTCCAG	2	12	8016	8027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012725	CGATCA	2	12	8529	8540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238028984
6	NC_012725	GGGCGA	2	12	9587	9598	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	238028985
7	NC_012725	AGTCCG	2	12	9809	9820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238028986
8	NC_012725	TCGCCA	2	12	10675	10686	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238028987
9	NC_012725	GCCGGC	2	12	11732	11743	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
10	NC_012725	CGCGCT	2	12	12806	12817	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238028987
11	NC_012725	GCCGTG	2	12	14868	14879	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238028987
12	NC_012725	GCGATC	2	12	15156	15167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238028987
13	NC_012725	CAGCGG	2	12	18853	18864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238028993
14	NC_012725	CGGCGC	2	12	19355	19366	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
15	NC_012725	GCGCTC	2	12	19601	19612	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238028993
16	NC_012725	TGCCGG	2	12	20179	20190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238028993
17	NC_012725	GGCGCG	2	12	20910	20921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028995
18	NC_012725	CACGAT	2	12	24328	24339	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238028997
19	NC_012725	GAGAAC	2	12	30133	30144	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238029002
20	NC_012725	TGCCGG	2	12	31987	31998	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238029003
21	NC_012725	GACACG	2	12	32360	32371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029004
22	NC_012725	TTCCCT	2	12	34692	34703	0 %	50 %	0 %	50 %	238029006
23	NC_012725	AGCGTG	2	12	38045	38056	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238029010
24	NC_012725	TCGGCC	2	12	41539	41550	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238029013
25	NC_012725	CATCGC	2	12	46257	46268	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238029019
26	NC_012725	CCGACG	2	12	47555	47566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238029021
27	NC_012725	CGGCTG	3	18	56525	56542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238029025
28	NC_012725	CTGCAG	2	12	60538	60549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238029029
29	NC_012725	GCGGCA	2	12	62405	62416	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238029030
30	NC_012725	CGTGGA	2	12	62440	62451	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238029030
31	NC_012725	GGCCGG	2	12	62557	62568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238029030
32	NC_012725	CGCCGG	2	12	66141	66152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012725	TCGCCG	2	12	70095	70106	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238029035
34	NC_012725	TCGTCA	2	12	72130	72141	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238029036
35	NC_012725	GCGTGA	2	12	74864	74875	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238029039
36	NC_012725	GAGCGC	2	12	75293	75304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238029040
37	NC_012725	TGCTGT	2	12	78844	78855	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012725	CGCGGT	2	12	79125	79136	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012725	CCGGCA	2	12	79589	79600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238029044
40	NC_012725	CGGGCA	2	12	80446	80457	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238029044
41	NC_012725	ACGATG	2	12	84361	84372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012725	GCCGTC	2	12	87429	87440	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238029047
43	NC_012725	CGGTGC	2	12	97727	97738	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238029056
44	NC_012725	GCTCGC	2	12	98791	98802	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238029057
45	NC_012725	GCGATC	2	12	99891	99902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238029058
46	NC_012725	GGCCGC	2	12	99926	99937	0 %	0 %	50 %	50 %	238029058
47	NC_012725	CGCCGG	2	12	100039	100050	0 %	0 %	50 %	50 %	238029058
48	NC_012725	CCGGCG	2	12	100116	100127	0 %	0 %	50 %	50 %	238029058
49	NC_012725	GGCCCG	2	12	102271	102282	0 %	0 %	50 %	50 %	238029059
50	NC_012725	CGGCGC	2	12	103102	103113	0 %	0 %	50 %	50 %	238029059
51	NC_012725	GTTCCG	2	12	104456	104467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029061
52	NC_012725	CGTCAA	2	12	108180	108191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238029064
53	NC_012725	CAGCGC	2	12	109944	109955	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012725	CTGATC	2	12	111094	111105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238029069
55	NC_012725	CATGAG	2	12	116573	116584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012725	ACGCTC	2	12	118486	118497	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012725	GTCCTG	2	12	118549	118560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012725	CGGCGC	2	12	120848	120859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012725	AGCGAT	2	12	121961	121972	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012725	TCGCCG	2	12	126057	126068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238029078
61	NC_012725	AGCGCG	2	12	127149	127160	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238029078
62	NC_012725	GTCATG	2	12	127733	127744	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012725	CGGCCG	2	12	128941	128952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012725	CCGTGA	2	12	130262	130273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238029079
65	NC_012725	TGGAAG	2	12	132025	132036	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.