MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012725	CGCCGG	2	12	7449	7460	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
2	NC_012725	CGATCA	2	12	8529	8540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238028984
3	NC_012725	GGGCGA	2	12	9587	9598	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	238028985
4	NC_012725	AGTCCG	2	12	9809	9820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238028986
5	NC_012725	TCGCCA	2	12	10675	10686	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238028987
6	NC_012725	GCCGGC	2	12	11732	11743	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
7	NC_012725	CGCGCT	2	12	12806	12817	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238028987
8	NC_012725	GCCGTG	2	12	14868	14879	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238028987
9	NC_012725	GCGATC	2	12	15156	15167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238028987
10	NC_012725	CAGCGG	2	12	18853	18864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238028993
11	NC_012725	CGGCGC	2	12	19355	19366	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
12	NC_012725	GCGCTC	2	12	19601	19612	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238028993
13	NC_012725	TGCCGG	2	12	20179	20190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238028993
14	NC_012725	GGCGCG	2	12	20910	20921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028995
15	NC_012725	CACGAT	2	12	24328	24339	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238028997
16	NC_012725	GAGAAC	2	12	30133	30144	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238029002
17	NC_012725	TGCCGG	2	12	31987	31998	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238029003
18	NC_012725	GACACG	2	12	32360	32371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029004
19	NC_012725	TTCCCT	2	12	34692	34703	0 %	50 %	0 %	50 %	238029006
20	NC_012725	AGCGTG	2	12	38045	38056	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238029010
21	NC_012725	TCGGCC	2	12	41539	41550	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238029013
22	NC_012725	CATCGC	2	12	46257	46268	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238029019
23	NC_012725	CCGACG	2	12	47555	47566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238029021
24	NC_012725	CGGCTG	3	18	56525	56542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238029025
25	NC_012725	CTGCAG	2	12	60538	60549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238029029
26	NC_012725	GCGGCA	2	12	62405	62416	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238029030
27	NC_012725	CGTGGA	2	12	62440	62451	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238029030
28	NC_012725	GGCCGG	2	12	62557	62568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238029030
29	NC_012725	TCGCCG	2	12	70095	70106	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238029035
30	NC_012725	TCGTCA	2	12	72130	72141	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238029036
31	NC_012725	GCGTGA	2	12	74864	74875	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238029039
32	NC_012725	GAGCGC	2	12	75293	75304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238029040
33	NC_012725	CCGGCA	2	12	79589	79600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238029044
34	NC_012725	CGGGCA	2	12	80446	80457	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238029044
35	NC_012725	GCCGTC	2	12	87429	87440	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238029047
36	NC_012725	CGGTGC	2	12	97727	97738	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238029056
37	NC_012725	GCTCGC	2	12	98791	98802	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238029057
38	NC_012725	GCGATC	2	12	99891	99902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238029058
39	NC_012725	GGCCGC	2	12	99926	99937	0 %	0 %	50 %	50 %	238029058
40	NC_012725	CGCCGG	2	12	100039	100050	0 %	0 %	50 %	50 %	238029058
41	NC_012725	CCGGCG	2	12	100116	100127	0 %	0 %	50 %	50 %	238029058
42	NC_012725	GGCCCG	2	12	102271	102282	0 %	0 %	50 %	50 %	238029059
43	NC_012725	CGGCGC	2	12	103102	103113	0 %	0 %	50 %	50 %	238029059
44	NC_012725	GTTCCG	2	12	104456	104467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029061
45	NC_012725	CGTCAA	2	12	108180	108191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238029064
46	NC_012725	CTGATC	2	12	111094	111105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238029069
47	NC_012725	TCGCCG	2	12	126057	126068	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238029078
48	NC_012725	AGCGCG	2	12	127149	127160	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238029078
49	NC_012725	CCGTGA	2	12	130262	130273	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238029079

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.