MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012725	CATCG	2	10	2230	2239	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012725	AAAGC	2	10	2661	2670	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012725	AGGGG	2	10	4918	4927	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012725	GCAAC	2	10	6234	6243	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012725	TGCGG	2	10	40924	40933	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012725	TGCGC	2	10	47724	47733	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_012725	GACCG	2	10	65310	65319	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012725	CAGCG	2	10	65847	65856	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_012725	AAGCG	2	10	68800	68809	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012725	CGGCG	2	10	69123	69132	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_012725	GGGAT	2	10	71611	71620	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012725	GGTTG	2	10	75871	75880	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012725	GCCGA	2	10	76129	76138	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012725	GCCCG	2	10	76407	76416	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_012725	GGCGC	2	10	113844	113853	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_012725	GAATC	2	10	119394	119403	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012725	GAAAT	2	10	120614	120623	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012725	TGCGC	2	10	120744	120753	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_012725	GCGAT	2	10	120776	120785	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012725	ATCGG	2	10	121722	121731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012725	TCAGA	2	10	121911	121920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012725	GCGTC	2	10	124708	124717	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_012725	GCGCG	2	10	127651	127660	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012725	TGCGC	2	10	127798	127807	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012725	CGGTG	2	10	128399	128408	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012725	TGACG	2	10	129064	129073	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012725	ACCAA	2	10	131342	131351	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_012725	TTCTC	2	10	131689	131698	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_012725	CTCAA	2	10	131741	131750	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012725	CTCTT	2	10	132682	132691	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.