MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012725	CTTC	2	8	2438	2445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012725	GCAA	2	8	2490	2497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012725	TAAG	2	8	2644	2651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012725	GAGC	2	8	2920	2927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012725	CCTC	2	8	3955	3962	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_012725	CAGC	2	8	4028	4035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012725	CGCC	2	8	6331	6338	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_012725	TTCG	2	8	6430	6437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012725	GCCC	2	8	6445	6452	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_012725	TAGA	2	8	6484	6491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012725	GCCT	2	8	6576	6583	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012725	CAGC	2	8	6647	6654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012725	GTCA	2	8	7791	7798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012725	CCTG	2	8	15214	15221	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012725	AGAT	2	8	16825	16832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012725	CTGT	2	8	16874	16881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012725	ATCG	2	8	16972	16979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012725	GCAC	2	8	17026	17033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012725	GGCT	2	8	17034	17041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012725	GGGC	2	8	20589	20596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012725	GACC	2	8	29212	29219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012725	TGAT	2	8	35053	35060	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012725	CTTA	2	8	46682	46689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012725	GGAC	2	8	47981	47988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012725	GCCG	2	8	48110	48117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012725	TTCC	2	8	48434	48441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012725	TCGT	2	8	48535	48542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012725	TTCG	2	8	48589	48596	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012725	AGAC	2	8	48614	48621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012725	TAGG	2	8	50617	50624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012725	AGGT	2	8	50663	50670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012725	ACCG	2	8	50959	50966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012725	CAAT	2	8	51285	51292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012725	CGTT	2	8	51371	51378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012725	TGCC	2	8	51526	51533	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012725	TCGG	2	8	52510	52517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012725	GCTG	2	8	58730	58737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012725	GGTG	2	8	64887	64894	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012725	GCCG	2	8	64946	64953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012725	CAGC	2	8	65351	65358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012725	GGTT	2	8	65753	65760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012725	CTGG	2	8	66047	66054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012725	GCCG	2	8	66093	66100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012725	GCCG	2	8	66273	66280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012725	GCCG	2	8	66453	66460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012725	CTGG	2	8	66587	66594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012725	GCAC	2	8	66619	66626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012725	GGGA	2	8	66732	66739	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012725	AGCG	2	8	67766	67773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012725	CGGC	2	8	68577	68584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012725	GCCG	2	8	69101	69108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012725	CGGC	2	8	72341	72348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012725	CGGC	2	8	72603	72610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012725	CGGG	2	8	74038	74045	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012725	CGGC	2	8	74156	74163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012725	GCCG	2	8	74192	74199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012725	TGCC	2	8	75814	75821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012725	TTCG	2	8	75913	75920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012725	CGAA	2	8	77017	77024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012725	GGGC	2	8	79073	79080	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012725	GCCC	2	8	79096	79103	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_012725	AGGG	2	8	79450	79457	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012725	GTAG	2	8	83962	83969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012725	GACA	2	8	84175	84182	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012725	TGCG	2	8	84431	84438	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012725	ATCG	2	8	84582	84589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012725	GACG	2	8	84690	84697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012725	CTAC	2	8	84887	84894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012725	CTGC	2	8	87015	87022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012725	CGGC	2	8	87141	87148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012725	GAAC	2	8	87160	87167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012725	GCCC	2	8	87286	87293	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_012725	CAGG	2	8	88031	88038	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012725	CGGG	2	8	88064	88071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012725	GAAC	2	8	88179	88186	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012725	CGTT	2	8	88284	88291	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012725	ATGC	2	8	88321	88328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012725	GCAC	2	8	97671	97678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012725	ACGC	2	8	98236	98243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012725	GTAT	2	8	98286	98293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012725	CGCC	2	8	103925	103932	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_012725	CCTA	2	8	104086	104093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012725	CTGA	2	8	104287	104294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012725	AGCA	2	8	109960	109967	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_012725	AAGC	2	8	116618	116625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012725	TCGC	2	8	117754	117761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012725	ACGG	2	8	117875	117882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012725	AACA	2	8	117942	117949	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012725	CGCC	2	8	118204	118211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_012725	GAAG	2	8	118464	118471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012725	CCCG	2	8	118612	118619	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_012725	CGAC	2	8	118834	118841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012725	CCGG	2	8	119184	119191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012725	CCTT	2	8	119192	119199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012725	TGGC	2	8	120787	120794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012725	GACG	2	8	121194	121201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012725	GATC	2	8	121237	121244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_012725	CTTC	2	8	121870	121877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012725	ATTT	2	8	122011	122018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012725	AAGC	2	8	122343	122350	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012725	GATG	2	8	124445	124452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012725	TCAA	2	8	124604	124611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012725	CATC	2	8	125441	125448	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012725	CTTT	2	8	125457	125464	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012725	CGAT	2	8	128101	128108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012725	CGCC	2	8	128449	128456	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_012725	GCCG	2	8	128602	128609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012725	CGGT	2	8	128844	128851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012725	GGCC	2	8	129222	129229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012725	GCGT	2	8	129400	129407	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012725	TGGT	2	8	130042	130049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012725	CGAC	2	8	130612	130619	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012725	CCTC	2	8	130655	130662	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_012725	GATC	2	8	130673	130680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012725	CTGG	2	8	130940	130947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012725	ACGC	2	8	130956	130963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012725	ATTT	2	8	131725	131732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012725	TCCA	2	8	131797	131804	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012725	ATTC	2	8	132265	132272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_012725	GGTA	2	8	132749	132756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012725	TCAT	2	8	132970	132977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012725	CGTG	2	8	133138	133145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012725	GTCG	2	8	133488	133495	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012725	TCGT	2	8	133736	133743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.