MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 442

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012725	CGC	2	6	1921	1926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_012725	GGC	2	6	1983	1988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012725	TGG	2	6	2151	2156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012725	AAG	2	6	2423	2428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012725	TCT	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012725	CTC	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012725	GCC	2	6	2736	2741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_012725	ACC	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012725	CTG	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012725	GCG	2	6	4620	4625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012725	TGT	2	6	4627	4632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012725	TGA	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012725	CGG	2	6	4698	4703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012725	TGC	2	6	4770	4775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012725	GCC	2	6	4777	4782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_012725	GCG	2	6	4808	4813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012725	CCG	2	6	4821	4826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_012725	GCG	2	6	4856	4861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012725	ATG	2	6	4888	4893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012725	TCA	2	6	4906	4911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012725	ATG	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012725	GTG	2	6	6055	6060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012725	CCG	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_012725	TCA	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012725	GCT	2	6	6284	6289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012725	ACC	2	6	6308	6313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_012725	GGA	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012725	GCG	2	6	7707	7712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012725	GGC	2	6	7869	7874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012725	CCT	2	6	7955	7960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_012725	CAA	2	6	7975	7980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012725	TCC	2	6	15293	15298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_012725	GGT	2	6	15320	15325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012725	CGC	2	6	16790	16795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012725	GCA	2	6	16805	16810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012725	GCA	2	6	16844	16849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012725	TTC	2	6	16966	16971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012725	AGC	2	6	17131	17136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012725	GGT	2	6	17235	17240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012725	CCG	2	6	17274	17279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012725	TGC	2	6	17770	17775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012725	TGA	2	6	20581	20586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012725	CAC	2	6	21280	21285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012725	CGG	2	6	21368	21373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012725	AAT	2	6	21465	21470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012725	GCA	2	6	28735	28740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012725	GTA	2	6	28901	28906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012725	GCG	2	6	28932	28937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012725	CGG	2	6	28985	28990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012725	ACC	2	6	29010	29015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012725	CGG	2	6	29065	29070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012725	GCG	2	6	29121	29126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012725	TGA	2	6	40803	40808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012725	GTG	2	6	40914	40919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012725	TCC	2	6	42011	42016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_012725	GGC	2	6	42076	42081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012725	GGC	2	6	46608	46613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012725	TCC	2	6	46696	46701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_012725	CGG	2	6	47647	47652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012725	CGA	2	6	47685	47690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012725	GCC	2	6	47742	47747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_012725	CAC	2	6	47942	47947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_012725	CTG	2	6	48146	48151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012725	GTT	2	6	48158	48163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012725	CTT	2	6	48290	48295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012725	GTC	2	6	48296	48301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012725	CAC	2	6	48577	48582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012725	ATC	2	6	48583	48588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012725	ACA	2	6	49143	49148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012725	GAA	2	6	49294	49299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012725	AGA	2	6	49300	49305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012725	CGA	2	6	49387	49392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012725	AAG	2	6	49401	49406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012725	AAC	2	6	49690	49695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012725	GAC	2	6	49726	49731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012725	AAG	2	6	50582	50587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012725	TAG	2	6	50693	50698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012725	CGA	2	6	50725	50730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012725	GGT	2	6	50818	50823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012725	TCG	2	6	50828	50833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012725	AGC	2	6	50858	50863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012725	GCC	2	6	50990	50995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_012725	CCG	2	6	51056	51061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012725	ACG	2	6	51149	51154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012725	GCC	2	6	51211	51216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_012725	AGA	2	6	51225	51230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012725	GGT	2	6	51496	51501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012725	AGG	2	6	51564	51569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012725	TCG	2	6	52529	52534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012725	GTC	2	6	58532	58537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012725	GGC	2	6	58539	58544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012725	TGC	2	6	58639	58644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012725	GCC	2	6	59313	59318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_012725	GTT	2	6	64975	64980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012725	TTG	2	6	65020	65025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012725	GCA	2	6	65101	65106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012725	GTG	2	6	65216	65221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012725	GGC	2	6	65297	65302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012725	CAG	2	6	65326	65331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012725	GGT	2	6	65561	65566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012725	CGC	2	6	65609	65614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_012725	ACG	2	6	65657	65662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012725	TGT	2	6	65668	65673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012725	GCG	2	6	65768	65773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012725	GGC	2	6	65827	65832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012725	CGG	2	6	65881	65886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012725	GCC	2	6	65911	65916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_012725	CGC	2	6	65917	65922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_012725	CGG	2	6	65961	65966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012725	GCC	2	6	65980	65985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_012725	GGC	2	6	66068	66073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012725	GCG	2	6	66118	66123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012725	GCC	2	6	66160	66165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_012725	TCA	2	6	66183	66188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012725	AGC	2	6	66209	66214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012725	GGC	2	6	66248	66253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012725	GCG	2	6	66298	66303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012725	GCC	2	6	66340	66345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_012725	AGC	2	6	66389	66394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012725	GGC	2	6	66428	66433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012725	CCG	2	6	66500	66505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_012725	GCC	2	6	66520	66525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_012725	TCA	2	6	66543	66548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012725	AGC	2	6	66569	66574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012725	CCG	2	6	66647	66652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012725	GGC	2	6	66682	66687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012725	AGG	2	6	67160	67165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012725	CCG	2	6	67197	67202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_012725	AGT	2	6	67283	67288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012725	CGG	2	6	67346	67351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012725	CTA	2	6	67352	67357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012725	GTC	2	6	67360	67365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012725	ATG	2	6	67449	67454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012725	TGG	2	6	67469	67474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012725	GCG	2	6	67510	67515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012725	GAT	2	6	67551	67556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012725	GCG	2	6	67606	67611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012725	CGA	2	6	67655	67660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012725	GCG	2	6	67666	67671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012725	CGA	2	6	67760	67765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_012725	CGG	2	6	67799	67804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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409	NC_012725	AAT	2	6	131436	131441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_012725	TCC	2	6	131506	131511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
411	NC_012725	TTA	2	6	131578	131583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_012725	CGA	2	6	131626	131631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_012725	CGG	2	6	131675	131680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_012725	AAG	2	6	131767	131772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
415	NC_012725	AGG	2	6	131822	131827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
416	NC_012725	ATT	2	6	132008	132013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_012725	ATA	2	6	132111	132116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_012725	GGT	2	6	132144	132149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
419	NC_012725	CAA	2	6	132162	132167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_012725	TGA	2	6	132200	132205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
421	NC_012725	GAG	2	6	132276	132281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
422	NC_012725	TGG	2	6	132304	132309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
423	NC_012725	CTC	3	9	132382	132390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
424	NC_012725	GCA	2	6	132414	132419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_012725	GCC	2	6	132499	132504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
426	NC_012725	CGG	2	6	132696	132701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_012725	CGT	2	6	133010	133015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_012725	ATC	2	6	133089	133094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_012725	AAC	2	6	133102	133107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_012725	CCT	2	6	133184	133189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_012725	GGC	2	6	133254	133259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_012725	TTC	2	6	133323	133328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_012725	TCC	2	6	133672	133677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
440	NC_012725	CAT	2	6	133752	133757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_012725	TCG	2	6	134242	134247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.