MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 1635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012725	CCA	2	6	152	157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238028978
2	NC_012725	GGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238028978
3	NC_012725	GCA	2	6	280	285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028978
4	NC_012725	TCA	3	9	353	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028978
5	NC_012725	CGG	2	6	386	391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028978
6	NC_012725	CTC	2	6	406	411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238028978
7	NC_012725	ACG	2	6	509	514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028978
8	NC_012725	CCG	2	6	554	559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028978
9	NC_012725	TGC	2	6	671	676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028978
10	NC_012725	GAA	2	6	720	725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238028978
11	NC_012725	GAA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238028979
12	NC_012725	CTG	2	6	876	881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028979
13	NC_012725	AGC	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028979
14	NC_012725	GGT	2	6	915	920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028979
15	NC_012725	ACG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028979
16	NC_012725	CGA	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028979
17	NC_012725	ACG	3	9	1030	1038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028979
18	NC_012725	TGC	2	6	1084	1089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028979
19	NC_012725	GAA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238028979
20	NC_012725	GGC	2	6	1231	1236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028979
21	NC_012725	TGG	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028979
22	NC_012725	CAA	2	6	1376	1381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238028979
23	NC_012725	TCA	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028979
24	NC_012725	GAA	2	6	3027	3032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238028980
25	NC_012725	ATC	2	6	3177	3182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028980
26	NC_012725	CTA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028980
27	NC_012725	GCT	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028980
28	NC_012725	GAT	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238028980
29	NC_012725	GTT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238028980
30	NC_012725	TGG	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028980
31	NC_012725	TTC	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238028980
32	NC_012725	CTG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028980
33	NC_012725	CGA	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028980
34	NC_012725	ACG	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028981
35	NC_012725	GCA	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028981
36	NC_012725	GCA	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028981
37	NC_012725	GCC	2	6	4369	4374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028981
38	NC_012725	TGA	2	6	4996	5001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238028982
39	NC_012725	GCA	2	6	5216	5221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028982
40	NC_012725	GCG	2	6	5225	5230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028982
41	NC_012725	CAG	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028982
42	NC_012725	TTG	2	6	5331	5336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238028982
43	NC_012725	GAG	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238028982
44	NC_012725	TGA	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238028982
45	NC_012725	GCC	2	6	5658	5663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028982
46	NC_012725	GCG	2	6	5706	5711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028982
47	NC_012725	GCA	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028982
48	NC_012725	ATC	2	6	6811	6816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028983
49	NC_012725	CCG	2	6	6850	6855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028983
50	NC_012725	TCG	2	6	6859	6864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028983
51	NC_012725	GCT	2	6	6908	6913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028983
52	NC_012725	AGC	2	6	6916	6921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028983
53	NC_012725	CGG	2	6	6932	6937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028983
54	NC_012725	GCG	2	6	6967	6972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028983
55	NC_012725	TCG	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028983
56	NC_012725	GCT	2	6	7337	7342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028983
57	NC_012725	GCC	2	6	7343	7348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028983
58	NC_012725	CGC	2	6	7359	7364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028983
59	NC_012725	GCA	2	6	7430	7435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028983
60	NC_012725	CCG	2	6	7472	7477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028983
61	NC_012725	CGC	2	6	7527	7532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028983
62	NC_012725	CGG	2	6	7533	7538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028983
63	NC_012725	CGT	2	6	7550	7555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028983
64	NC_012725	GGC	2	6	7575	7580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028983
65	NC_012725	TCG	2	6	8066	8071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
66	NC_012725	GGC	2	6	8120	8125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028984
67	NC_012725	GCC	4	12	8159	8170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028984
68	NC_012725	TGA	2	6	8253	8258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238028984
69	NC_012725	GGC	2	6	8268	8273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028984
70	NC_012725	ACG	2	6	8280	8285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028984
71	NC_012725	CAG	2	6	8338	8343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028984
72	NC_012725	GTG	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028984
73	NC_012725	GCC	2	6	8366	8371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028984
74	NC_012725	GTC	2	6	8465	8470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
75	NC_012725	CAT	2	6	8473	8478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028984
76	NC_012725	TGG	2	6	8607	8612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028984
77	NC_012725	TCG	2	6	8615	8620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
78	NC_012725	GCT	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
79	NC_012725	CTT	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238028984
80	NC_012725	CGC	2	6	8879	8884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028984
81	NC_012725	CTT	2	6	8980	8985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238028984
82	NC_012725	CGA	2	6	9102	9107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028984
83	NC_012725	CCG	2	6	9144	9149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028984
84	NC_012725	TGC	2	6	9185	9190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
85	NC_012725	TCT	2	6	9288	9293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238028984
86	NC_012725	CGT	2	6	9294	9299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028984
87	NC_012725	CGG	2	6	9529	9534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028985
88	NC_012725	CAG	2	6	9609	9614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028985
89	NC_012725	GGC	2	6	9656	9661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028985
90	NC_012725	TCG	2	6	9689	9694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028985
91	NC_012725	TCG	2	6	9734	9739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028985
92	NC_012725	CGT	2	6	9747	9752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028985
93	NC_012725	GCG	2	6	9874	9879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028986
94	NC_012725	CAG	2	6	9888	9893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028986
95	NC_012725	CGG	2	6	9995	10000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028986
96	NC_012725	CGC	2	6	10065	10070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028986
97	NC_012725	CGC	2	6	10084	10089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028986
98	NC_012725	CGG	2	6	10160	10165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028986
99	NC_012725	GTC	2	6	10251	10256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028986
100	NC_012725	TCC	2	6	10288	10293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238028986
101	NC_012725	CGC	2	6	10439	10444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028986
102	NC_012725	TCG	2	6	10540	10545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028987
103	NC_012725	GCC	3	9	10622	10630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028987
104	NC_012725	GCC	2	6	10689	10694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028987
105	NC_012725	GCC	2	6	10700	10705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028987
106	NC_012725	GCT	2	6	10765	10770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028987
107	NC_012725	GGC	2	6	10961	10966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028987
108	NC_012725	GGC	2	6	11072	11077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028987
109	NC_012725	CGC	2	6	11168	11173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028987
110	NC_012725	GCC	2	6	11213	11218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028987
111	NC_012725	CGG	2	6	11278	11283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028987
112	NC_012725	GCC	2	6	11297	11302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028987
113	NC_012725	CGT	2	6	11329	11334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028987
114	NC_012725	GCT	2	6	11377	11382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028987
115	NC_012725	CGG	2	6	11422	11427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028987
116	NC_012725	CGG	2	6	11482	11487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028987
117	NC_012725	GGC	2	6	11507	11512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028987
118	NC_012725	GTG	2	6	11514	11519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238028987
119	NC_012725	CCG	2	6	11520	11525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028987
120	NC_012725	GGC	2	6	11605	11610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028987
121	NC_012725	GCG	2	6	11643	11648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028987
122	NC_012725	GCC	2	6	11684	11689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028987
123	NC_012725	CGT	3	9	11713	11721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028987
124	NC_012725	CGT	2	6	11764	11769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028987
125	NC_012725	GCT	2	6	11773	11778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028987
126	NC_012725	CGG	2	6	11809	11814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028987
127	NC_012725	CGG	2	6	11839	11844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028987
128	NC_012725	GCC	2	6	11867	11872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028987
129	NC_012725	CGA	2	6	12038	12043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028987
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252	NC_012725	CCG	3	9	20442	20450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028994
253	NC_012725	TGC	2	6	20474	20479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238028994
254	NC_012725	ATC	2	6	20561	20566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238028994
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256	NC_012725	CGC	2	6	20661	20666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238028995
257	NC_012725	CGG	2	6	20831	20836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028995
258	NC_012725	ACG	2	6	20890	20895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238028995
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261	NC_012725	CGG	2	6	21068	21073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238028995
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498	NC_012725	ACC	2	6	35598	35603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238029007
499	NC_012725	CGT	2	6	35605	35610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029007
500	NC_012725	CGG	2	6	35665	35670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238029007

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