MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_1p

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012723	AACGCG	2	12	9564	9575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025590
2	NC_012723	CCCGCG	2	12	14394	14405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025595
3	NC_012723	GCCAGT	2	12	16571	16582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238025596
4	NC_012723	TGCAAT	2	12	20095	20106	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238025599
5	NC_012723	CCGGCA	2	12	20640	20651	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238025599
6	NC_012723	GTTAAT	2	12	21851	21862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238025599
7	NC_012723	CAACGG	2	12	22078	22089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238025599
8	NC_012723	ATAACA	2	12	22347	22358	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238025599
9	NC_012723	TCCGGT	2	12	25174	25185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025600
10	NC_012723	TGATCG	2	12	31946	31957	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238025604
11	NC_012723	GCTGAC	2	12	35250	35261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238025607
12	NC_012723	ATCGTC	2	12	37906	37917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238025608
13	NC_012723	TCACCG	2	12	38732	38743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238025609
14	NC_012723	GCCGAT	2	12	39625	39636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238025610
15	NC_012723	CGCCGG	2	12	48835	48846	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
16	NC_012723	GCCGCG	2	12	49135	49146	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
17	NC_012723	CGCTGG	2	12	53269	53280	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238025625
18	NC_012723	ACCGCC	2	12	55367	55378	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	238025626
19	NC_012723	CGCGGC	2	12	60032	60043	0 %	0 %	50 %	50 %	238025629
20	NC_012723	GTGATC	2	12	60108	60119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238025629
21	NC_012723	TTGGCC	2	12	60449	60460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025629
22	NC_012723	CGGGTT	2	12	61611	61622	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	238025630
23	NC_012723	CGTCGG	2	12	62957	62968	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238025630
24	NC_012723	CGGTGG	2	12	64048	64059	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	238025631
25	NC_012723	TGCGCC	2	12	68776	68787	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238025633
26	NC_012723	TCGCGG	2	12	68905	68916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238025633
27	NC_012723	ACGATC	2	12	71504	71515	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238025635
28	NC_012723	GACCGC	2	12	75315	75326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238025637
29	NC_012723	CGCCAG	2	12	76227	76238	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238025637
30	NC_012723	TGCCTT	2	12	83774	83785	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238025643
31	NC_012723	CGCGGG	3	18	87680	87697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238025646
32	NC_012723	GCGGCC	2	12	88139	88150	0 %	0 %	50 %	50 %	238025647
33	NC_012723	GTTCCA	2	12	93136	93147	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238025651
34	NC_012723	TCGCGC	2	12	95693	95704	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238025655
35	NC_012723	CGGCGA	2	12	96786	96797	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238025655
36	NC_012723	ACGATC	2	12	103333	103344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238025659
37	NC_012723	CGCGTT	2	12	110594	110605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238025666
38	NC_012723	AAGTTG	2	12	114124	114135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238025668
39	NC_012723	CGCACC	2	12	118167	118178	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	238025669
40	NC_012723	CGGGTG	2	12	120403	120414	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	238025672
41	NC_012723	GACTCA	2	12	125163	125174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238025675
42	NC_012723	GCGCCC	2	12	127578	127589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238025678
43	NC_012723	TCGGCC	2	12	131745	131756	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238025682

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.