MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_1p

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012723	ATCTC	2	10	1491	1500	20 %	40 %	0 %	40 %	238025583
2	NC_012723	GTGCC	2	10	5897	5906	0 %	20 %	40 %	40 %	238025587
3	NC_012723	GGCGG	2	10	6727	6736	0 %	0 %	80 %	20 %	238025587
4	NC_012723	GCATG	2	10	7471	7480	20 %	20 %	40 %	20 %	238025589
5	NC_012723	GCGCT	2	10	9241	9250	0 %	20 %	40 %	40 %	238025590
6	NC_012723	ATCGC	2	10	10206	10215	20 %	20 %	20 %	40 %	238025591
7	NC_012723	TGCGC	2	10	10304	10313	0 %	20 %	40 %	40 %	238025592
8	NC_012723	GAACG	2	10	11728	11737	40 %	0 %	40 %	20 %	238025593
9	NC_012723	CCGAC	2	10	12634	12643	20 %	0 %	20 %	60 %	238025595
10	NC_012723	GCGCC	2	10	12679	12688	0 %	0 %	40 %	60 %	238025595
11	NC_012723	GCGCC	2	10	12976	12985	0 %	0 %	40 %	60 %	238025595
12	NC_012723	GCCGG	2	10	13084	13093	0 %	0 %	60 %	40 %	238025595
13	NC_012723	TCCGG	2	10	13297	13306	0 %	20 %	40 %	40 %	238025595
14	NC_012723	CCCCG	2	10	13561	13570	0 %	0 %	20 %	80 %	238025595
15	NC_012723	CGAGC	2	10	13961	13970	20 %	0 %	40 %	40 %	238025595
16	NC_012723	CATCG	2	10	17069	17078	20 %	20 %	20 %	40 %	238025596
17	NC_012723	ACGCC	2	10	21276	21285	20 %	0 %	20 %	60 %	238025599
18	NC_012723	ACGCC	2	10	21495	21504	20 %	0 %	20 %	60 %	238025599
19	NC_012723	ACGCC	2	10	21714	21723	20 %	0 %	20 %	60 %	238025599
20	NC_012723	TAATT	2	10	23158	23167	40 %	60 %	0 %	0 %	238025599
21	NC_012723	CTTCG	2	10	24128	24137	0 %	40 %	20 %	40 %	238025600
22	NC_012723	ATTCG	2	10	25158	25167	20 %	40 %	20 %	20 %	238025600
23	NC_012723	CGGCC	2	10	25971	25980	0 %	0 %	40 %	60 %	238025601
24	NC_012723	AACTG	2	10	27693	27702	40 %	20 %	20 %	20 %	238025602
25	NC_012723	CCAGA	2	10	30356	30365	40 %	0 %	20 %	40 %	238025603
26	NC_012723	TTCGA	2	10	31098	31107	20 %	40 %	20 %	20 %	238025603
27	NC_012723	CAGGG	2	10	40220	40229	20 %	0 %	60 %	20 %	238025611
28	NC_012723	CTCGC	2	10	41867	41876	0 %	20 %	20 %	60 %	238025613
29	NC_012723	TCAGA	2	10	43647	43656	40 %	20 %	20 %	20 %	238025616
30	NC_012723	GCGCC	2	10	48704	48713	0 %	0 %	40 %	60 %	238025621
31	NC_012723	GCCGG	2	10	48812	48821	0 %	0 %	60 %	40 %	238025621
32	NC_012723	TCCGG	2	10	49025	49034	0 %	20 %	40 %	40 %	238025621
33	NC_012723	CCCCG	2	10	49289	49298	0 %	0 %	20 %	80 %	238025621
34	NC_012723	CGAGC	2	10	49689	49698	20 %	0 %	40 %	40 %	238025621
35	NC_012723	GATGA	2	10	51510	51519	40 %	20 %	40 %	0 %	238025623
36	NC_012723	GGCGT	2	10	53039	53048	0 %	20 %	60 %	20 %	238025625
37	NC_012723	CCCGA	2	10	53082	53091	20 %	0 %	20 %	60 %	238025625
38	NC_012723	CGGCG	2	10	53846	53855	0 %	0 %	60 %	40 %	238025625
39	NC_012723	CGGCG	2	10	54092	54101	0 %	0 %	60 %	40 %	238025625
40	NC_012723	CATCG	2	10	55420	55429	20 %	20 %	20 %	40 %	238025626
41	NC_012723	GCGCT	2	10	59481	59490	0 %	20 %	40 %	40 %	238025629
42	NC_012723	CGAAG	2	10	61716	61725	40 %	0 %	40 %	20 %	238025630
43	NC_012723	GGCAG	2	10	62549	62558	20 %	0 %	60 %	20 %	238025630
44	NC_012723	GCGCA	2	10	62797	62806	20 %	0 %	40 %	40 %	238025630
45	NC_012723	AATGT	2	10	63444	63453	40 %	40 %	20 %	0 %	238025631
46	NC_012723	CCGCG	3	15	65047	65061	0 %	0 %	40 %	60 %	238025631
47	NC_012723	AGGAT	2	10	68347	68356	40 %	20 %	40 %	0 %	238025633
48	NC_012723	TCGAA	2	10	68438	68447	40 %	20 %	20 %	20 %	238025633
49	NC_012723	CCGCG	2	10	68706	68715	0 %	0 %	40 %	60 %	238025633
50	NC_012723	ATCGA	2	10	69687	69696	40 %	20 %	20 %	20 %	238025633
51	NC_012723	TGCGC	2	10	71699	71708	0 %	20 %	40 %	40 %	238025636
52	NC_012723	TCTGG	2	10	73097	73106	0 %	40 %	40 %	20 %	238025636
53	NC_012723	GGTTG	2	10	76788	76797	0 %	40 %	60 %	0 %	238025638
54	NC_012723	AATTG	2	10	83664	83673	40 %	40 %	20 %	0 %	238025643
55	NC_012723	AGGTC	2	10	88914	88923	20 %	20 %	40 %	20 %	238025647
56	NC_012723	AAGGC	2	10	89573	89582	40 %	0 %	40 %	20 %	238025647
57	NC_012723	GCCAG	2	10	91081	91090	20 %	0 %	40 %	40 %	238025648
58	NC_012723	GGCGT	2	10	92055	92064	0 %	20 %	60 %	20 %	238025649
59	NC_012723	CGCGC	2	10	95194	95203	0 %	0 %	40 %	60 %	238025654
60	NC_012723	GCGCG	2	10	97035	97044	0 %	0 %	60 %	40 %	238025655
61	NC_012723	GCTCG	2	10	99563	99572	0 %	20 %	40 %	40 %	238025656
62	NC_012723	TGCGC	2	10	103528	103537	0 %	20 %	40 %	40 %	238025660
63	NC_012723	TCTGG	2	10	104926	104935	0 %	40 %	40 %	20 %	238025660
64	NC_012723	TCAGA	2	10	107401	107410	40 %	20 %	20 %	20 %	238025662
65	NC_012723	GCGCA	2	10	108634	108643	20 %	0 %	40 %	40 %	238025663
66	NC_012723	ATCTG	2	10	109846	109855	20 %	40 %	20 %	20 %	238025664
67	NC_012723	AGCGC	2	10	110919	110928	20 %	0 %	40 %	40 %	238025666
68	NC_012723	GCTGC	2	10	117557	117566	0 %	20 %	40 %	40 %	238025669
69	NC_012723	TCGCG	2	10	117739	117748	0 %	20 %	40 %	40 %	238025669
70	NC_012723	CTGGC	2	10	119578	119587	0 %	20 %	40 %	40 %	238025671
71	NC_012723	CGAGC	2	10	119670	119679	20 %	0 %	40 %	40 %	238025671
72	NC_012723	CCTGA	2	10	120665	120674	20 %	20 %	20 %	40 %	238025672
73	NC_012723	ATCCC	2	10	121827	121836	20 %	20 %	0 %	60 %	238025673
74	NC_012723	GCCCG	2	10	122291	122300	0 %	0 %	40 %	60 %	238025673
75	NC_012723	GGTCC	2	10	123093	123102	0 %	20 %	40 %	40 %	238025673
76	NC_012723	CCACG	2	10	126058	126067	20 %	0 %	20 %	60 %	238025677
77	NC_012723	GCGCG	2	10	130567	130576	0 %	0 %	60 %	40 %	238025681

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.