MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_1p

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012723	GCTC	2	8	284	291	0 %	25 %	25 %	50 %	238025582
2	NC_012723	ACTC	2	8	527	534	25 %	25 %	0 %	50 %	238025582
3	NC_012723	CGAT	2	8	706	713	25 %	25 %	25 %	25 %	238025582
4	NC_012723	GCCA	2	8	1186	1193	25 %	0 %	25 %	50 %	238025583
5	NC_012723	GGAA	2	8	1275	1282	50 %	0 %	50 %	0 %	238025583
6	NC_012723	CAAG	2	8	1383	1390	50 %	0 %	25 %	25 %	238025583
7	NC_012723	TCTT	2	8	2758	2765	0 %	75 %	0 %	25 %	238025584
8	NC_012723	GCAG	2	8	2900	2907	25 %	0 %	50 %	25 %	238025584
9	NC_012723	GGAA	2	8	2977	2984	50 %	0 %	50 %	0 %	238025584
10	NC_012723	TCCG	2	8	3168	3175	0 %	25 %	25 %	50 %	238025584
11	NC_012723	CGTG	2	8	3314	3321	0 %	25 %	50 %	25 %	238025584
12	NC_012723	GCTG	2	8	3714	3721	0 %	25 %	50 %	25 %	238025585
13	NC_012723	CTGG	2	8	4096	4103	0 %	25 %	50 %	25 %	238025585
14	NC_012723	CCCA	2	8	4112	4119	25 %	0 %	0 %	75 %	238025585
15	NC_012723	GACG	2	8	5023	5030	25 %	0 %	50 %	25 %	238025586
16	NC_012723	AGGC	2	8	5786	5793	25 %	0 %	50 %	25 %	238025586
17	NC_012723	ACCG	2	8	6086	6093	25 %	0 %	25 %	50 %	238025587
18	NC_012723	CCGC	2	8	6774	6781	0 %	0 %	25 %	75 %	238025587
19	NC_012723	CACG	2	8	6878	6885	25 %	0 %	25 %	50 %	238025587
20	NC_012723	CACC	2	8	7319	7326	25 %	0 %	0 %	75 %	238025588
21	NC_012723	GCCG	2	8	7371	7378	0 %	0 %	50 %	50 %	238025588
22	NC_012723	GAGC	2	8	7693	7700	25 %	0 %	50 %	25 %	238025589
23	NC_012723	ATTG	2	8	8524	8531	25 %	50 %	25 %	0 %	238025590
24	NC_012723	CCAG	2	8	8593	8600	25 %	0 %	25 %	50 %	238025590
25	NC_012723	CTGG	2	8	8920	8927	0 %	25 %	50 %	25 %	238025590
26	NC_012723	CGGC	2	8	9493	9500	0 %	0 %	50 %	50 %	238025590
27	NC_012723	TCGC	2	8	10129	10136	0 %	25 %	25 %	50 %	238025591
28	NC_012723	GAAA	2	8	10683	10690	75 %	0 %	25 %	0 %	238025592
29	NC_012723	AGGC	2	8	12119	12126	25 %	0 %	50 %	25 %	238025594
30	NC_012723	TGGC	2	8	12227	12234	0 %	25 %	50 %	25 %	238025594
31	NC_012723	GCCC	2	8	12562	12569	0 %	0 %	25 %	75 %	238025595
32	NC_012723	GTGG	2	8	12761	12768	0 %	25 %	75 %	0 %	238025595
33	NC_012723	GTGC	2	8	12863	12870	0 %	25 %	50 %	25 %	238025595
34	NC_012723	CGGC	2	8	13015	13022	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
35	NC_012723	GCGT	2	8	13365	13372	0 %	25 %	50 %	25 %	238025595
36	NC_012723	CGGC	2	8	13585	13592	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
37	NC_012723	CGGC	2	8	13843	13850	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
38	NC_012723	CGCT	2	8	14307	14314	0 %	25 %	25 %	50 %	238025595
39	NC_012723	CGGC	2	8	14413	14420	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
40	NC_012723	GTAG	2	8	16460	16467	25 %	25 %	50 %	0 %	238025596
41	NC_012723	TCTT	2	8	16725	16732	0 %	75 %	0 %	25 %	238025596
42	NC_012723	TGCT	2	8	16994	17001	0 %	50 %	25 %	25 %	238025596
43	NC_012723	TGCC	2	8	18504	18511	0 %	25 %	25 %	50 %	238025597
44	NC_012723	CGGT	2	8	18789	18796	0 %	25 %	50 %	25 %	238025598
45	NC_012723	CCAC	2	8	19125	19132	25 %	0 %	0 %	75 %	238025598
46	NC_012723	AAAT	2	8	20430	20437	75 %	25 %	0 %	0 %	238025599
47	NC_012723	GCAA	2	8	20741	20748	50 %	0 %	25 %	25 %	238025599
48	NC_012723	TTCG	2	8	21130	21137	0 %	50 %	25 %	25 %	238025599
49	NC_012723	TTCG	2	8	21349	21356	0 %	50 %	25 %	25 %	238025599
50	NC_012723	TTCG	2	8	21568	21575	0 %	50 %	25 %	25 %	238025599
51	NC_012723	ATTC	2	8	21786	21793	25 %	50 %	0 %	25 %	238025599
52	NC_012723	TTGG	2	8	22048	22055	0 %	50 %	50 %	0 %	238025599
53	NC_012723	GCAA	2	8	22066	22073	50 %	0 %	25 %	25 %	238025599
54	NC_012723	TGGA	2	8	22390	22397	25 %	25 %	50 %	0 %	238025599
55	NC_012723	GCTG	2	8	23179	23186	0 %	25 %	50 %	25 %	238025599
56	NC_012723	CCGC	2	8	23908	23915	0 %	0 %	25 %	75 %	238025600
57	NC_012723	GTCG	2	8	24794	24801	0 %	25 %	50 %	25 %	238025600
58	NC_012723	GCAC	2	8	25810	25817	25 %	0 %	25 %	50 %	238025600
59	NC_012723	GCAA	2	8	27227	27234	50 %	0 %	25 %	25 %	238025601
60	NC_012723	GCAT	2	8	27284	27291	25 %	25 %	25 %	25 %	238025601
61	NC_012723	GGAT	2	8	27320	27327	25 %	25 %	50 %	0 %	238025602
62	NC_012723	CAGC	2	8	27402	27409	25 %	0 %	25 %	50 %	238025602
63	NC_012723	CGAG	2	8	27484	27491	25 %	0 %	50 %	25 %	238025602
64	NC_012723	ATCG	2	8	28120	28127	25 %	25 %	25 %	25 %	238025602
65	NC_012723	AGCA	2	8	28539	28546	50 %	0 %	25 %	25 %	238025602
66	NC_012723	GCTG	2	8	28651	28658	0 %	25 %	50 %	25 %	238025602
67	NC_012723	AGCG	2	8	30332	30339	25 %	0 %	50 %	25 %	238025603
68	NC_012723	CAGC	2	8	30458	30465	25 %	0 %	25 %	50 %	238025603
69	NC_012723	ACGG	2	8	30990	30997	25 %	0 %	50 %	25 %	238025603
70	NC_012723	CTCG	2	8	31664	31671	0 %	25 %	25 %	50 %	238025603
71	NC_012723	CCGT	2	8	32597	32604	0 %	25 %	25 %	50 %	238025605
72	NC_012723	GGAA	2	8	35265	35272	50 %	0 %	50 %	0 %	238025607
73	NC_012723	GTTG	2	8	35387	35394	0 %	50 %	50 %	0 %	238025607
74	NC_012723	GCTG	2	8	35669	35676	0 %	25 %	50 %	25 %	238025607
75	NC_012723	GCGA	2	8	35794	35801	25 %	0 %	50 %	25 %	238025607
76	NC_012723	GAGT	2	8	36967	36974	25 %	25 %	50 %	0 %	238025608
77	NC_012723	GCCA	2	8	37201	37208	25 %	0 %	25 %	50 %	238025608
78	NC_012723	GACG	2	8	37656	37663	25 %	0 %	50 %	25 %	238025608
79	NC_012723	TTCG	2	8	39172	39179	0 %	50 %	25 %	25 %	238025610
80	NC_012723	TTGA	2	8	39981	39988	25 %	50 %	25 %	0 %	238025611
81	NC_012723	AAAC	2	8	40167	40174	75 %	0 %	0 %	25 %	238025611
82	NC_012723	GCTG	2	8	41555	41562	0 %	25 %	50 %	25 %	238025613
83	NC_012723	CAGT	2	8	42219	42226	25 %	25 %	25 %	25 %	238025614
84	NC_012723	GTTG	2	8	42537	42544	0 %	50 %	50 %	0 %	238025615
85	NC_012723	GGAT	2	8	42753	42760	25 %	25 %	50 %	0 %	238025615
86	NC_012723	TCGC	2	8	43749	43756	0 %	25 %	25 %	50 %	238025616
87	NC_012723	CTTT	2	8	44250	44257	0 %	75 %	0 %	25 %	238025616
88	NC_012723	CGAA	2	8	44367	44374	50 %	0 %	25 %	25 %	238025616
89	NC_012723	GGGC	2	8	44438	44445	0 %	0 %	75 %	25 %	238025616
90	NC_012723	CATC	2	8	46272	46279	25 %	25 %	0 %	50 %	238025617
91	NC_012723	CTTG	2	8	46958	46965	0 %	50 %	25 %	25 %	238025619
92	NC_012723	CTTG	2	8	47534	47541	0 %	50 %	25 %	25 %	238025620
93	NC_012723	GTGG	2	8	48489	48496	0 %	25 %	75 %	0 %	238025621
94	NC_012723	GTGC	2	8	48591	48598	0 %	25 %	50 %	25 %	238025621
95	NC_012723	CGGC	2	8	48743	48750	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
96	NC_012723	CGAG	2	8	48758	48765	25 %	0 %	50 %	25 %	238025621
97	NC_012723	GCGT	2	8	49093	49100	0 %	25 %	50 %	25 %	238025621
98	NC_012723	CGGC	2	8	49313	49320	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
99	NC_012723	CGCT	2	8	50035	50042	0 %	25 %	25 %	50 %	238025621
100	NC_012723	GGAC	2	8	51134	51141	25 %	0 %	50 %	25 %	238025623
101	NC_012723	CTCG	2	8	51377	51384	0 %	25 %	25 %	50 %	238025623
102	NC_012723	TGCA	2	8	51390	51397	25 %	25 %	25 %	25 %	238025623
103	NC_012723	CTAT	2	8	51655	51662	25 %	50 %	0 %	25 %	238025624
104	NC_012723	ATTC	2	8	51746	51753	25 %	50 %	0 %	25 %	238025624
105	NC_012723	CGAC	2	8	51850	51857	25 %	0 %	25 %	50 %	238025624
106	NC_012723	CAAG	2	8	52115	52122	50 %	0 %	25 %	25 %	238025624
107	NC_012723	TCGC	2	8	54156	54163	0 %	25 %	25 %	50 %	238025625
108	NC_012723	CACC	2	8	54164	54171	25 %	0 %	0 %	75 %	238025625
109	NC_012723	AGGT	2	8	54875	54882	25 %	25 %	50 %	0 %	238025626
110	NC_012723	GCCA	2	8	55397	55404	25 %	0 %	25 %	50 %	238025626
111	NC_012723	CATT	2	8	55686	55693	25 %	50 %	0 %	25 %	238025626
112	NC_012723	TGCG	2	8	56169	56176	0 %	25 %	50 %	25 %	238025627
113	NC_012723	GGGC	2	8	56235	56242	0 %	0 %	75 %	25 %	238025627
114	NC_012723	GGGT	2	8	57121	57128	0 %	25 %	75 %	0 %	238025628
115	NC_012723	ATCC	2	8	57406	57413	25 %	25 %	0 %	50 %	238025628
116	NC_012723	GCCG	2	8	57512	57519	0 %	0 %	50 %	50 %	238025628
117	NC_012723	CGCC	2	8	59395	59402	0 %	0 %	25 %	75 %	238025629
118	NC_012723	CGCC	2	8	59509	59516	0 %	0 %	25 %	75 %	238025629
119	NC_012723	CGCA	2	8	59710	59717	25 %	0 %	25 %	50 %	238025629
120	NC_012723	TCGC	2	8	60556	60563	0 %	25 %	25 %	50 %	238025629
121	NC_012723	CCGC	2	8	61595	61602	0 %	0 %	25 %	75 %	238025630
122	NC_012723	GCAG	2	8	61832	61839	25 %	0 %	50 %	25 %	238025630
123	NC_012723	TGGC	2	8	62003	62010	0 %	25 %	50 %	25 %	238025630
124	NC_012723	TGGC	2	8	62056	62063	0 %	25 %	50 %	25 %	238025630
125	NC_012723	GGCT	2	8	63227	63234	0 %	25 %	50 %	25 %	238025630
126	NC_012723	CAGC	2	8	63985	63992	25 %	0 %	25 %	50 %	238025631
127	NC_012723	AGCG	3	12	64509	64520	25 %	0 %	50 %	25 %	238025631
128	NC_012723	GGCG	2	8	64643	64650	0 %	0 %	75 %	25 %	238025631
129	NC_012723	GTCG	2	8	64715	64722	0 %	25 %	50 %	25 %	238025631
130	NC_012723	GAAG	2	8	64772	64779	50 %	0 %	50 %	0 %	238025631
131	NC_012723	TGCG	2	8	66994	67001	0 %	25 %	50 %	25 %	238025632
132	NC_012723	GGGC	2	8	67060	67067	0 %	0 %	75 %	25 %	238025632
133	NC_012723	GCCA	2	8	68503	68510	25 %	0 %	25 %	50 %	238025633
134	NC_012723	GATC	2	8	69173	69180	25 %	25 %	25 %	25 %	238025633
135	NC_012723	GCGA	2	8	69552	69559	25 %	0 %	50 %	25 %	238025633
136	NC_012723	ATCG	2	8	69725	69732	25 %	25 %	25 %	25 %	238025633
137	NC_012723	GACG	2	8	70857	70864	25 %	0 %	50 %	25 %	238025634
138	NC_012723	CGAG	2	8	71791	71798	25 %	0 %	50 %	25 %	238025636
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.