MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_3p

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012720	CGCCGG	2	12	5297	5308	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
2	NC_012720	CGATCA	2	12	6372	6383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238023399
3	NC_012720	GGGCGA	2	12	7430	7441	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	238023400
4	NC_012720	TCGCCA	2	12	8504	8515	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238023402
5	NC_012720	GCCGGC	2	12	9561	9572	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
6	NC_012720	GTGCTG	2	12	10240	10251	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	238023402
7	NC_012720	GCCGTG	2	12	11575	11586	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023402
8	NC_012720	GCGATC	2	12	11863	11874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023402
9	NC_012720	GCGCTC	2	12	16306	16317	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238023408
10	NC_012720	TGCCGG	2	12	16884	16895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023408
11	NC_012720	GGCGCG	2	12	17615	17626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023410
12	NC_012720	CACGAT	2	12	21018	21029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238023412
13	NC_012720	TGAAGC	2	12	23236	23247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238023413
14	NC_012720	GAGAAC	2	12	25586	25597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238023416
15	NC_012720	TGCCGG	2	12	27440	27451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023417
16	NC_012720	TGGCGT	2	12	35168	35179	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	238023424
17	NC_012720	TCGGCC	2	12	36965	36976	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238023426
18	NC_012720	CATCGC	2	12	41683	41694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238023432
19	NC_012720	CGCGGC	2	12	42946	42957	0 %	0 %	50 %	50 %	238023434
20	NC_012720	CCGACG	2	12	42981	42992	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238023434
21	NC_012720	CGGCTG	3	18	53601	53618	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023441
22	NC_012720	CTGCAG	2	12	57615	57626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023445
23	NC_012720	GCGGCA	2	12	59482	59493	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238023446
24	NC_012720	CGTGGA	2	12	59517	59528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238023446
25	NC_012720	GGCCGG	2	12	59634	59645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238023446
26	NC_012720	GGAAAG	2	12	61732	61743	50 %	0 %	50 %	0 %	238023447
27	NC_012720	GAGCGC	2	12	72268	72279	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238023454
28	NC_012720	GCGTGA	2	12	74251	74262	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238023456
29	NC_012720	GAGCGC	2	12	74680	74691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238023457
30	NC_012720	ACGATG	2	12	81860	81871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238023463
31	NC_012720	GATCGC	2	12	86308	86319	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023465
32	NC_012720	CCACCG	2	12	88552	88563	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	238023466
33	NC_012720	CGACCT	2	12	91130	91141	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238023468
34	NC_012720	GCCAGT	2	12	92641	92652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023469
35	NC_012720	GAGACC	2	12	104237	104248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023473
36	NC_012720	CGCGTT	2	12	108692	108703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238023477
37	NC_012720	CATCGT	2	12	124041	124052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238023489
38	NC_012720	GCGCCC	2	12	134962	134973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023496
39	NC_012720	GTCCCC	2	12	137223	137234	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	238023498

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.