MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_3p

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012720	GAGC	2	8	564	571	25 %	0 %	50 %	25 %	238023395
2	NC_012720	GCAT	2	8	1469	1476	25 %	25 %	25 %	25 %	238023396
3	NC_012720	GTTG	2	8	1525	1532	0 %	50 %	50 %	0 %	238023396
4	NC_012720	AAGC	2	8	1602	1609	50 %	0 %	25 %	25 %	238023396
5	NC_012720	GGGC	2	8	1960	1967	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012720	GGCG	2	8	2036	2043	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012720	AGTG	2	8	2058	2065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012720	GACC	2	8	2095	2102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012720	GACC	2	8	2128	2135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012720	GAAG	2	8	2485	2492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012720	AGCG	3	12	2583	2594	25 %	0 %	50 %	25 %	238023397
12	NC_012720	CTTC	2	8	2813	2820	0 %	50 %	0 %	50 %	238023397
13	NC_012720	CGAG	2	8	3288	3295	25 %	0 %	50 %	25 %	238023397
14	NC_012720	TACC	2	8	3575	3582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012720	CAAG	2	8	3763	3770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012720	GCCC	2	8	4293	4300	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_012720	TAGA	2	8	4332	4339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012720	GCCT	2	8	4424	4431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012720	GCTG	2	8	4585	4592	0 %	25 %	50 %	25 %	238023398
20	NC_012720	TTTC	2	8	4636	4643	0 %	75 %	0 %	25 %	238023398
21	NC_012720	CGGC	2	8	4976	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
22	NC_012720	GGCC	2	8	5044	5051	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
23	NC_012720	GCAC	2	8	5145	5152	25 %	0 %	25 %	50 %	238023398
24	NC_012720	GCCG	2	8	5568	5575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012720	GTCA	2	8	5636	5643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012720	CGGC	2	8	6138	6145	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
27	NC_012720	GGTC	2	8	6666	6673	0 %	25 %	50 %	25 %	238023399
28	NC_012720	GCCG	2	8	6697	6704	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
29	NC_012720	TGCC	2	8	6747	6754	0 %	25 %	25 %	50 %	238023399
30	NC_012720	AGGC	2	8	6776	6783	25 %	0 %	50 %	25 %	238023399
31	NC_012720	CGGC	2	8	7146	7153	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
32	NC_012720	GCGA	2	8	7384	7391	25 %	0 %	50 %	25 %	238023400
33	NC_012720	GTTG	2	8	7622	7629	0 %	50 %	50 %	0 %	238023400
34	NC_012720	GGCT	2	8	7711	7718	0 %	25 %	50 %	25 %	238023401
35	NC_012720	GCAC	2	8	7848	7855	25 %	0 %	25 %	50 %	238023401
36	NC_012720	GCCG	2	8	7895	7902	0 %	0 %	50 %	50 %	238023401
37	NC_012720	GCCG	2	8	8343	8350	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
38	NC_012720	GGGC	2	8	8483	8490	0 %	0 %	75 %	25 %	238023402
39	NC_012720	GCTC	2	8	8815	8822	0 %	25 %	25 %	50 %	238023402
40	NC_012720	TGGT	2	8	9022	9029	0 %	50 %	50 %	0 %	238023402
41	NC_012720	GCCG	2	8	9066	9073	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
42	NC_012720	GCCG	2	8	9378	9385	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
43	NC_012720	GGCC	2	8	9392	9399	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
44	NC_012720	TGGT	2	8	9415	9422	0 %	50 %	50 %	0 %	238023402
45	NC_012720	CGCT	2	8	9740	9747	0 %	25 %	25 %	50 %	238023402
46	NC_012720	GGCG	2	8	10736	10743	0 %	0 %	75 %	25 %	238023402
47	NC_012720	GCGA	2	8	11392	11399	25 %	0 %	50 %	25 %	238023402
48	NC_012720	CCTG	2	8	11921	11928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012720	TGCC	2	8	12369	12376	0 %	25 %	25 %	50 %	238023403
50	NC_012720	GCAT	2	8	12823	12830	25 %	25 %	25 %	25 %	238023404
51	NC_012720	AGGT	2	8	12868	12875	25 %	25 %	50 %	0 %	238023404
52	NC_012720	AGAT	2	8	13532	13539	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012720	CTGT	2	8	13581	13588	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012720	ATCG	2	8	13679	13686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012720	GCAC	2	8	13733	13740	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012720	GAAA	2	8	13995	14002	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012720	TCGA	2	8	14921	14928	25 %	25 %	25 %	25 %	238023408
58	NC_012720	CCGG	2	8	15435	15442	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
59	NC_012720	ACCG	2	8	15728	15735	25 %	0 %	25 %	50 %	238023408
60	NC_012720	GCCG	2	8	15915	15922	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
61	NC_012720	CGGC	2	8	16116	16123	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
62	NC_012720	CACG	2	8	16209	16216	25 %	0 %	25 %	50 %	238023408
63	NC_012720	GCCC	2	8	16714	16721	0 %	0 %	25 %	75 %	238023408
64	NC_012720	GCCG	2	8	16726	16733	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
65	NC_012720	GGCC	2	8	16746	16753	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
66	NC_012720	GGCG	2	8	16866	16873	0 %	0 %	75 %	25 %	238023408
67	NC_012720	GGCA	2	8	17240	17247	25 %	0 %	50 %	25 %	238023409
68	NC_012720	GGGC	2	8	17294	17301	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012720	GCTC	2	8	17779	17786	0 %	25 %	25 %	50 %	238023410
70	NC_012720	GACG	2	8	17840	17847	25 %	0 %	50 %	25 %	238023410
71	NC_012720	CTTT	2	8	18215	18222	0 %	75 %	0 %	25 %	238023411
72	NC_012720	ATTG	2	8	18478	18485	25 %	50 %	25 %	0 %	238023411
73	NC_012720	CCGA	2	8	18704	18711	25 %	0 %	25 %	50 %	238023412
74	NC_012720	CCGG	2	8	18803	18810	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
75	NC_012720	CGGG	2	8	18940	18947	0 %	0 %	75 %	25 %	238023412
76	NC_012720	CCTG	2	8	19127	19134	0 %	25 %	25 %	50 %	238023412
77	NC_012720	CCGA	2	8	19304	19311	25 %	0 %	25 %	50 %	238023412
78	NC_012720	GCCG	2	8	20067	20074	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
79	NC_012720	ATCA	2	8	20205	20212	50 %	25 %	0 %	25 %	238023412
80	NC_012720	CCTG	2	8	20857	20864	0 %	25 %	25 %	50 %	238023412
81	NC_012720	CAGG	2	8	22465	22472	25 %	0 %	50 %	25 %	238023413
82	NC_012720	CAGC	2	8	22510	22517	25 %	0 %	25 %	50 %	238023413
83	NC_012720	CGTC	2	8	22957	22964	0 %	25 %	25 %	50 %	238023413
84	NC_012720	TCGG	2	8	24041	24048	0 %	25 %	50 %	25 %	238023414
85	NC_012720	GCGA	2	8	25065	25072	25 %	0 %	50 %	25 %	238023415
86	NC_012720	GCCG	2	8	26287	26294	0 %	0 %	50 %	50 %	238023416
87	NC_012720	TGAT	2	8	26482	26489	25 %	50 %	25 %	0 %	238023417
88	NC_012720	GCCA	2	8	26751	26758	25 %	0 %	25 %	50 %	238023417
89	NC_012720	GCAC	2	8	27631	27638	25 %	0 %	25 %	50 %	238023417
90	NC_012720	CGCC	2	8	28364	28371	0 %	0 %	25 %	75 %	238023418
91	NC_012720	GCAG	2	8	30061	30068	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012720	TGAT	2	8	30479	30486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012720	CGGC	2	8	30521	30528	0 %	0 %	50 %	50 %	238023420
94	NC_012720	GTTG	2	8	30545	30552	0 %	50 %	50 %	0 %	238023420
95	NC_012720	GCTG	2	8	30557	30564	0 %	25 %	50 %	25 %	238023420
96	NC_012720	ACCG	2	8	31127	31134	25 %	0 %	25 %	50 %	238023420
97	NC_012720	GTGC	2	8	31135	31142	0 %	25 %	50 %	25 %	238023420
98	NC_012720	GCCA	2	8	31309	31316	25 %	0 %	25 %	50 %	238023421
99	NC_012720	GCAC	2	8	31485	31492	25 %	0 %	25 %	50 %	238023421
100	NC_012720	GAGC	2	8	32051	32058	25 %	0 %	50 %	25 %	238023423
101	NC_012720	TCGA	2	8	32271	32278	25 %	25 %	25 %	25 %	238023423
102	NC_012720	TCGT	2	8	32544	32551	0 %	50 %	25 %	25 %	238023423
103	NC_012720	ACCG	2	8	33075	33082	25 %	0 %	25 %	50 %	238023423
104	NC_012720	TCAT	2	8	33099	33106	25 %	50 %	0 %	25 %	238023423
105	NC_012720	GATC	2	8	33175	33182	25 %	25 %	25 %	25 %	238023423
106	NC_012720	CGGT	2	8	34516	34523	0 %	25 %	50 %	25 %	238023423
107	NC_012720	CCAC	2	8	34600	34607	25 %	0 %	0 %	75 %	238023423
108	NC_012720	GATC	2	8	34613	34620	25 %	25 %	25 %	25 %	238023423
109	NC_012720	GGCG	2	8	34728	34735	0 %	0 %	75 %	25 %	238023424
110	NC_012720	GGCC	2	8	35533	35540	0 %	0 %	50 %	50 %	238023425
111	NC_012720	CATG	2	8	35598	35605	25 %	25 %	25 %	25 %	238023425
112	NC_012720	GTGG	2	8	35662	35669	0 %	25 %	75 %	0 %	238023425
113	NC_012720	GGCG	2	8	35984	35991	0 %	0 %	75 %	25 %	238023425
114	NC_012720	GACG	2	8	36536	36543	25 %	0 %	50 %	25 %	238023426
115	NC_012720	GCCG	2	8	36649	36656	0 %	0 %	50 %	50 %	238023426
116	NC_012720	TCGA	2	8	36908	36915	25 %	25 %	25 %	25 %	238023426
117	NC_012720	GTCG	2	8	37414	37421	0 %	25 %	50 %	25 %	238023426
118	NC_012720	CGGT	2	8	37843	37850	0 %	25 %	50 %	25 %	238023427
119	NC_012720	CGTG	2	8	37937	37944	0 %	25 %	50 %	25 %	238023427
120	NC_012720	CGAA	2	8	38248	38255	50 %	0 %	25 %	25 %	238023427
121	NC_012720	CTCC	2	8	38990	38997	0 %	25 %	0 %	75 %	238023428
122	NC_012720	CGCT	2	8	39094	39101	0 %	25 %	25 %	50 %	238023428
123	NC_012720	CGGT	2	8	39230	39237	0 %	25 %	50 %	25 %	238023428
124	NC_012720	GCTT	2	8	39334	39341	0 %	50 %	25 %	25 %	238023428
125	NC_012720	GTCA	2	8	39930	39937	25 %	25 %	25 %	25 %	238023428
126	NC_012720	CTCG	2	8	39945	39952	0 %	25 %	25 %	50 %	238023429
127	NC_012720	GACG	2	8	40168	40175	25 %	0 %	50 %	25 %	238023429
128	NC_012720	GGCG	2	8	40279	40286	0 %	0 %	75 %	25 %	238023429
129	NC_012720	CGGC	2	8	40305	40312	0 %	0 %	50 %	50 %	238023429
130	NC_012720	CGGT	2	8	40458	40465	0 %	25 %	50 %	25 %	238023429
131	NC_012720	GCCG	2	8	40482	40489	0 %	0 %	50 %	50 %	238023429
132	NC_012720	CGGC	2	8	41120	41127	0 %	0 %	50 %	50 %	238023430
133	NC_012720	GGCC	2	8	41333	41340	0 %	0 %	50 %	50 %	238023431
134	NC_012720	CTTA	2	8	42108	42115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012720	TGCG	2	8	42280	42287	0 %	25 %	50 %	25 %	238023433
136	NC_012720	GATG	2	8	42813	42820	25 %	25 %	50 %	0 %	238023434
137	NC_012720	GGAC	2	8	43407	43414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012720	AATA	2	8	43662	43669	75 %	25 %	0 %	0 %	238023435
139	NC_012720	CTTC	2	8	43808	43815	0 %	50 %	0 %	50 %	238023435
140	NC_012720	GACG	2	8	44506	44513	25 %	0 %	50 %	25 %	238023436
141	NC_012720	GCGA	2	8	44527	44534	25 %	0 %	50 %	25 %	238023436
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143	NC_012720	GGTG	2	8	46124	46131	0 %	25 %	75 %	0 %	339717137
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424	NC_012720	CCAC	2	8	134404	134411	25 %	0 %	0 %	75 %	238023496
425	NC_012720	GCCA	2	8	134417	134424	25 %	0 %	25 %	50 %	238023496
426	NC_012720	CCAG	2	8	134440	134447	25 %	0 %	25 %	50 %	238023496
427	NC_012720	GCTG	2	8	134482	134489	0 %	25 %	50 %	25 %	238023496
428	NC_012720	GCAC	2	8	134644	134651	25 %	0 %	25 %	50 %	238023496
429	NC_012720	GCCG	2	8	135146	135153	0 %	0 %	50 %	50 %	238023496
430	NC_012720	GGAC	2	8	135235	135242	25 %	0 %	50 %	25 %	238023496
431	NC_012720	GCCC	2	8	136834	136841	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
432	NC_012720	CCCG	2	8	136870	136877	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
433	NC_012720	TGGA	2	8	137880	137887	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012720	CGCC	2	8	137977	137984	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
435	NC_012720	TTCG	2	8	138407	138414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
436	NC_012720	TGCG	2	8	138997	139004	0 %	25 %	50 %	25 %	238023500
437	NC_012720	GGGC	2	8	139063	139070	0 %	0 %	75 %	25 %	238023500
438	NC_012720	TCGC	2	8	139894	139901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
439	NC_012720	CCGC	2	8	140151	140158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
440	NC_012720	ATCC	2	8	140809	140816	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.