MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_3p

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012720	GAGC	2	8	564	571	25 %	0 %	50 %	25 %	238023395
2	NC_012720	GCAT	2	8	1469	1476	25 %	25 %	25 %	25 %	238023396
3	NC_012720	GTTG	2	8	1525	1532	0 %	50 %	50 %	0 %	238023396
4	NC_012720	AAGC	2	8	1602	1609	50 %	0 %	25 %	25 %	238023396
5	NC_012720	AGCG	3	12	2583	2594	25 %	0 %	50 %	25 %	238023397
6	NC_012720	CTTC	2	8	2813	2820	0 %	50 %	0 %	50 %	238023397
7	NC_012720	CGAG	2	8	3288	3295	25 %	0 %	50 %	25 %	238023397
8	NC_012720	GCTG	2	8	4585	4592	0 %	25 %	50 %	25 %	238023398
9	NC_012720	TTTC	2	8	4636	4643	0 %	75 %	0 %	25 %	238023398
10	NC_012720	CGGC	2	8	4976	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
11	NC_012720	GGCC	2	8	5044	5051	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
12	NC_012720	GCAC	2	8	5145	5152	25 %	0 %	25 %	50 %	238023398
13	NC_012720	CGGC	2	8	6138	6145	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
14	NC_012720	GGTC	2	8	6666	6673	0 %	25 %	50 %	25 %	238023399
15	NC_012720	GCCG	2	8	6697	6704	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
16	NC_012720	TGCC	2	8	6747	6754	0 %	25 %	25 %	50 %	238023399
17	NC_012720	AGGC	2	8	6776	6783	25 %	0 %	50 %	25 %	238023399
18	NC_012720	CGGC	2	8	7146	7153	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
19	NC_012720	GCGA	2	8	7384	7391	25 %	0 %	50 %	25 %	238023400
20	NC_012720	GTTG	2	8	7622	7629	0 %	50 %	50 %	0 %	238023400
21	NC_012720	GGCT	2	8	7711	7718	0 %	25 %	50 %	25 %	238023401
22	NC_012720	GCAC	2	8	7848	7855	25 %	0 %	25 %	50 %	238023401
23	NC_012720	GCCG	2	8	7895	7902	0 %	0 %	50 %	50 %	238023401
24	NC_012720	GCCG	2	8	8343	8350	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
25	NC_012720	GGGC	2	8	8483	8490	0 %	0 %	75 %	25 %	238023402
26	NC_012720	GCTC	2	8	8815	8822	0 %	25 %	25 %	50 %	238023402
27	NC_012720	TGGT	2	8	9022	9029	0 %	50 %	50 %	0 %	238023402
28	NC_012720	GCCG	2	8	9066	9073	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
29	NC_012720	GCCG	2	8	9378	9385	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
30	NC_012720	GGCC	2	8	9392	9399	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
31	NC_012720	TGGT	2	8	9415	9422	0 %	50 %	50 %	0 %	238023402
32	NC_012720	CGCT	2	8	9740	9747	0 %	25 %	25 %	50 %	238023402
33	NC_012720	GGCG	2	8	10736	10743	0 %	0 %	75 %	25 %	238023402
34	NC_012720	GCGA	2	8	11392	11399	25 %	0 %	50 %	25 %	238023402
35	NC_012720	TGCC	2	8	12369	12376	0 %	25 %	25 %	50 %	238023403
36	NC_012720	GCAT	2	8	12823	12830	25 %	25 %	25 %	25 %	238023404
37	NC_012720	AGGT	2	8	12868	12875	25 %	25 %	50 %	0 %	238023404
38	NC_012720	TCGA	2	8	14921	14928	25 %	25 %	25 %	25 %	238023408
39	NC_012720	CCGG	2	8	15435	15442	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
40	NC_012720	ACCG	2	8	15728	15735	25 %	0 %	25 %	50 %	238023408
41	NC_012720	GCCG	2	8	15915	15922	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
42	NC_012720	CGGC	2	8	16116	16123	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
43	NC_012720	CACG	2	8	16209	16216	25 %	0 %	25 %	50 %	238023408
44	NC_012720	GCCC	2	8	16714	16721	0 %	0 %	25 %	75 %	238023408
45	NC_012720	GCCG	2	8	16726	16733	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
46	NC_012720	GGCC	2	8	16746	16753	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
47	NC_012720	GGCG	2	8	16866	16873	0 %	0 %	75 %	25 %	238023408
48	NC_012720	GGCA	2	8	17240	17247	25 %	0 %	50 %	25 %	238023409
49	NC_012720	GCTC	2	8	17779	17786	0 %	25 %	25 %	50 %	238023410
50	NC_012720	GACG	2	8	17840	17847	25 %	0 %	50 %	25 %	238023410
51	NC_012720	CTTT	2	8	18215	18222	0 %	75 %	0 %	25 %	238023411
52	NC_012720	ATTG	2	8	18478	18485	25 %	50 %	25 %	0 %	238023411
53	NC_012720	CCGA	2	8	18704	18711	25 %	0 %	25 %	50 %	238023412
54	NC_012720	CCGG	2	8	18803	18810	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
55	NC_012720	CGGG	2	8	18940	18947	0 %	0 %	75 %	25 %	238023412
56	NC_012720	CCTG	2	8	19127	19134	0 %	25 %	25 %	50 %	238023412
57	NC_012720	CCGA	2	8	19304	19311	25 %	0 %	25 %	50 %	238023412
58	NC_012720	GCCG	2	8	20067	20074	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
59	NC_012720	ATCA	2	8	20205	20212	50 %	25 %	0 %	25 %	238023412
60	NC_012720	CCTG	2	8	20857	20864	0 %	25 %	25 %	50 %	238023412
61	NC_012720	CAGG	2	8	22465	22472	25 %	0 %	50 %	25 %	238023413
62	NC_012720	CAGC	2	8	22510	22517	25 %	0 %	25 %	50 %	238023413
63	NC_012720	CGTC	2	8	22957	22964	0 %	25 %	25 %	50 %	238023413
64	NC_012720	TCGG	2	8	24041	24048	0 %	25 %	50 %	25 %	238023414
65	NC_012720	GCGA	2	8	25065	25072	25 %	0 %	50 %	25 %	238023415
66	NC_012720	GCCG	2	8	26287	26294	0 %	0 %	50 %	50 %	238023416
67	NC_012720	TGAT	2	8	26482	26489	25 %	50 %	25 %	0 %	238023417
68	NC_012720	GCCA	2	8	26751	26758	25 %	0 %	25 %	50 %	238023417
69	NC_012720	GCAC	2	8	27631	27638	25 %	0 %	25 %	50 %	238023417
70	NC_012720	CGCC	2	8	28364	28371	0 %	0 %	25 %	75 %	238023418
71	NC_012720	CGGC	2	8	30521	30528	0 %	0 %	50 %	50 %	238023420
72	NC_012720	GTTG	2	8	30545	30552	0 %	50 %	50 %	0 %	238023420
73	NC_012720	GCTG	2	8	30557	30564	0 %	25 %	50 %	25 %	238023420
74	NC_012720	ACCG	2	8	31127	31134	25 %	0 %	25 %	50 %	238023420
75	NC_012720	GTGC	2	8	31135	31142	0 %	25 %	50 %	25 %	238023420
76	NC_012720	GCCA	2	8	31309	31316	25 %	0 %	25 %	50 %	238023421
77	NC_012720	GCAC	2	8	31485	31492	25 %	0 %	25 %	50 %	238023421
78	NC_012720	GAGC	2	8	32051	32058	25 %	0 %	50 %	25 %	238023423
79	NC_012720	TCGA	2	8	32271	32278	25 %	25 %	25 %	25 %	238023423
80	NC_012720	TCGT	2	8	32544	32551	0 %	50 %	25 %	25 %	238023423
81	NC_012720	ACCG	2	8	33075	33082	25 %	0 %	25 %	50 %	238023423
82	NC_012720	TCAT	2	8	33099	33106	25 %	50 %	0 %	25 %	238023423
83	NC_012720	GATC	2	8	33175	33182	25 %	25 %	25 %	25 %	238023423
84	NC_012720	CGGT	2	8	34516	34523	0 %	25 %	50 %	25 %	238023423
85	NC_012720	CCAC	2	8	34600	34607	25 %	0 %	0 %	75 %	238023423
86	NC_012720	GATC	2	8	34613	34620	25 %	25 %	25 %	25 %	238023423
87	NC_012720	GGCG	2	8	34728	34735	0 %	0 %	75 %	25 %	238023424
88	NC_012720	GGCC	2	8	35533	35540	0 %	0 %	50 %	50 %	238023425
89	NC_012720	CATG	2	8	35598	35605	25 %	25 %	25 %	25 %	238023425
90	NC_012720	GTGG	2	8	35662	35669	0 %	25 %	75 %	0 %	238023425
91	NC_012720	GGCG	2	8	35984	35991	0 %	0 %	75 %	25 %	238023425
92	NC_012720	GACG	2	8	36536	36543	25 %	0 %	50 %	25 %	238023426
93	NC_012720	GCCG	2	8	36649	36656	0 %	0 %	50 %	50 %	238023426
94	NC_012720	TCGA	2	8	36908	36915	25 %	25 %	25 %	25 %	238023426
95	NC_012720	GTCG	2	8	37414	37421	0 %	25 %	50 %	25 %	238023426
96	NC_012720	CGGT	2	8	37843	37850	0 %	25 %	50 %	25 %	238023427
97	NC_012720	CGTG	2	8	37937	37944	0 %	25 %	50 %	25 %	238023427
98	NC_012720	CGAA	2	8	38248	38255	50 %	0 %	25 %	25 %	238023427
99	NC_012720	CTCC	2	8	38990	38997	0 %	25 %	0 %	75 %	238023428
100	NC_012720	CGCT	2	8	39094	39101	0 %	25 %	25 %	50 %	238023428
101	NC_012720	CGGT	2	8	39230	39237	0 %	25 %	50 %	25 %	238023428
102	NC_012720	GCTT	2	8	39334	39341	0 %	50 %	25 %	25 %	238023428
103	NC_012720	GTCA	2	8	39930	39937	25 %	25 %	25 %	25 %	238023428
104	NC_012720	CTCG	2	8	39945	39952	0 %	25 %	25 %	50 %	238023429
105	NC_012720	GACG	2	8	40168	40175	25 %	0 %	50 %	25 %	238023429
106	NC_012720	GGCG	2	8	40279	40286	0 %	0 %	75 %	25 %	238023429
107	NC_012720	CGGC	2	8	40305	40312	0 %	0 %	50 %	50 %	238023429
108	NC_012720	CGGT	2	8	40458	40465	0 %	25 %	50 %	25 %	238023429
109	NC_012720	GCCG	2	8	40482	40489	0 %	0 %	50 %	50 %	238023429
110	NC_012720	CGGC	2	8	41120	41127	0 %	0 %	50 %	50 %	238023430
111	NC_012720	GGCC	2	8	41333	41340	0 %	0 %	50 %	50 %	238023431
112	NC_012720	TGCG	2	8	42280	42287	0 %	25 %	50 %	25 %	238023433
113	NC_012720	GATG	2	8	42813	42820	25 %	25 %	50 %	0 %	238023434
114	NC_012720	AATA	2	8	43662	43669	75 %	25 %	0 %	0 %	238023435
115	NC_012720	CTTC	2	8	43808	43815	0 %	50 %	0 %	50 %	238023435
116	NC_012720	GACG	2	8	44506	44513	25 %	0 %	50 %	25 %	238023436
117	NC_012720	GCGA	2	8	44527	44534	25 %	0 %	50 %	25 %	238023436
118	NC_012720	GCTC	2	8	45599	45606	0 %	25 %	25 %	50 %	339717137
119	NC_012720	GGTG	2	8	46124	46131	0 %	25 %	75 %	0 %	339717137
120	NC_012720	ACGG	2	8	47159	47166	25 %	0 %	50 %	25 %	339717137
121	NC_012720	ATTG	2	8	47565	47572	25 %	50 %	25 %	0 %	238023439
122	NC_012720	AGCG	2	8	47763	47770	25 %	0 %	50 %	25 %	238023439
123	NC_012720	TGGT	2	8	48731	48738	0 %	50 %	50 %	0 %	238023440
124	NC_012720	TGGA	2	8	48841	48848	25 %	25 %	50 %	0 %	238023440
125	NC_012720	GGCC	2	8	50308	50315	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
126	NC_012720	GGAA	2	8	50412	50419	50 %	0 %	50 %	0 %	238023441
127	NC_012720	GGCT	2	8	50567	50574	0 %	25 %	50 %	25 %	238023441
128	NC_012720	CCGA	2	8	50690	50697	25 %	0 %	25 %	50 %	238023441
129	NC_012720	ACCG	2	8	51428	51435	25 %	0 %	25 %	50 %	238023441
130	NC_012720	TGCG	2	8	51488	51495	0 %	25 %	50 %	25 %	238023441
131	NC_012720	CGAT	2	8	51816	51823	25 %	25 %	25 %	25 %	238023441
132	NC_012720	CGGC	3	12	52047	52058	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
133	NC_012720	CCGG	2	8	52076	52083	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
134	NC_012720	GCCG	2	8	52138	52145	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
135	NC_012720	GACC	2	8	52192	52199	25 %	0 %	25 %	50 %	238023441
136	NC_012720	CGGG	2	8	52233	52240	0 %	0 %	75 %	25 %	238023441
137	NC_012720	CCGG	2	8	52358	52365	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
138	NC_012720	TCGA	2	8	52442	52449	25 %	25 %	25 %	25 %	238023441
139	NC_012720	GGAC	2	8	52457	52464	25 %	0 %	50 %	25 %	238023441
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141	NC_012720	CGGC	2	8	53053	53060	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.