MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_3p

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012720	AG	3	6	591	596	50 %	0 %	50 %	0 %	238023395
2	NC_012720	GC	3	6	1247	1252	0 %	0 %	50 %	50 %	238023396
3	NC_012720	CG	3	6	2945	2950	0 %	0 %	50 %	50 %	238023397
4	NC_012720	GA	3	6	4579	4584	50 %	0 %	50 %	0 %	238023398
5	NC_012720	CG	3	6	4593	4598	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
6	NC_012720	GC	3	6	4668	4673	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
7	NC_012720	CG	3	6	4711	4716	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
8	NC_012720	GC	4	8	4846	4853	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
9	NC_012720	GC	3	6	4994	4999	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
10	NC_012720	CG	3	6	5018	5023	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
11	NC_012720	GC	3	6	5028	5033	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
12	NC_012720	CG	3	6	5361	5366	0 %	0 %	50 %	50 %	238023398
13	NC_012720	GC	3	6	6514	6519	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
14	NC_012720	GC	3	6	6589	6594	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
15	NC_012720	CG	3	6	6604	6609	0 %	0 %	50 %	50 %	238023399
16	NC_012720	CG	3	6	7262	7267	0 %	0 %	50 %	50 %	238023400
17	NC_012720	GC	3	6	7280	7285	0 %	0 %	50 %	50 %	238023400
18	NC_012720	CG	3	6	7343	7348	0 %	0 %	50 %	50 %	238023400
19	NC_012720	CG	3	6	7581	7586	0 %	0 %	50 %	50 %	238023400
20	NC_012720	CG	3	6	7687	7692	0 %	0 %	50 %	50 %	238023401
21	NC_012720	TG	3	6	7808	7813	0 %	50 %	50 %	0 %	238023401
22	NC_012720	CG	3	6	7922	7927	0 %	0 %	50 %	50 %	238023401
23	NC_012720	GA	3	6	8018	8023	50 %	0 %	50 %	0 %	238023401
24	NC_012720	CG	3	6	8131	8136	0 %	0 %	50 %	50 %	238023401
25	NC_012720	GC	3	6	8156	8161	0 %	0 %	50 %	50 %	238023401
26	NC_012720	TG	3	6	8302	8307	0 %	50 %	50 %	0 %	238023401
27	NC_012720	CG	3	6	8360	8365	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
28	NC_012720	GA	3	6	8805	8810	50 %	0 %	50 %	0 %	238023402
29	NC_012720	GC	3	6	9077	9082	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
30	NC_012720	CG	3	6	9527	9532	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
31	NC_012720	CG	3	6	9661	9666	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
32	NC_012720	GA	3	6	9840	9845	50 %	0 %	50 %	0 %	238023402
33	NC_012720	GC	3	6	10307	10312	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
34	NC_012720	GC	3	6	10868	10873	0 %	0 %	50 %	50 %	238023402
35	NC_012720	CG	3	6	12198	12203	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
36	NC_012720	GC	3	6	12227	12232	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
37	NC_012720	GC	4	8	12337	12344	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
38	NC_012720	CG	3	6	12406	12411	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
39	NC_012720	CG	3	6	12496	12501	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
40	NC_012720	CG	4	8	12590	12597	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
41	NC_012720	GC	3	6	12620	12625	0 %	0 %	50 %	50 %	238023403
42	NC_012720	CG	4	8	12854	12861	0 %	0 %	50 %	50 %	238023404
43	NC_012720	GA	3	6	12956	12961	50 %	0 %	50 %	0 %	238023404
44	NC_012720	CG	3	6	14499	14504	0 %	0 %	50 %	50 %	238023407
45	NC_012720	GC	5	10	14820	14829	0 %	0 %	50 %	50 %	238023407
46	NC_012720	CG	3	6	14876	14881	0 %	0 %	50 %	50 %	238023407
47	NC_012720	GA	3	6	15048	15053	50 %	0 %	50 %	0 %	238023408
48	NC_012720	CG	3	6	15060	15065	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
49	NC_012720	CG	4	8	15183	15190	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
50	NC_012720	CG	3	6	15237	15242	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
51	NC_012720	GC	3	6	15361	15366	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
52	NC_012720	GC	4	8	15449	15456	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
53	NC_012720	GC	3	6	15587	15592	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
54	NC_012720	CG	4	8	15742	15749	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
55	NC_012720	CG	4	8	15981	15988	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
56	NC_012720	CG	3	6	16026	16031	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
57	NC_012720	GC	3	6	16049	16054	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
58	NC_012720	GC	4	8	16071	16078	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
59	NC_012720	CG	4	8	16233	16240	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
60	NC_012720	CG	3	6	16689	16694	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
61	NC_012720	CG	4	8	16915	16922	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
62	NC_012720	CG	4	8	16965	16972	0 %	0 %	50 %	50 %	238023408
63	NC_012720	GC	4	8	17690	17697	0 %	0 %	50 %	50 %	238023410
64	NC_012720	GA	3	6	17796	17801	50 %	0 %	50 %	0 %	238023410
65	NC_012720	AG	3	6	18903	18908	50 %	0 %	50 %	0 %	238023412
66	NC_012720	GC	3	6	19059	19064	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
67	NC_012720	CG	4	8	19613	19620	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
68	NC_012720	GC	3	6	20111	20116	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
69	NC_012720	GT	3	6	20196	20201	0 %	50 %	50 %	0 %	238023412
70	NC_012720	GC	3	6	20479	20484	0 %	0 %	50 %	50 %	238023412
71	NC_012720	CG	3	6	22228	22233	0 %	0 %	50 %	50 %	238023413
72	NC_012720	GC	3	6	22316	22321	0 %	0 %	50 %	50 %	238023413
73	NC_012720	CG	3	6	22325	22330	0 %	0 %	50 %	50 %	238023413
74	NC_012720	CG	3	6	23386	23391	0 %	0 %	50 %	50 %	238023413
75	NC_012720	AG	3	6	23637	23642	50 %	0 %	50 %	0 %	238023414
76	NC_012720	GA	3	6	23725	23730	50 %	0 %	50 %	0 %	238023414
77	NC_012720	GC	4	8	23847	23854	0 %	0 %	50 %	50 %	238023414
78	NC_012720	CG	3	6	23877	23882	0 %	0 %	50 %	50 %	238023414
79	NC_012720	CG	3	6	24085	24090	0 %	0 %	50 %	50 %	238023414
80	NC_012720	GC	3	6	24255	24260	0 %	0 %	50 %	50 %	238023414
81	NC_012720	CG	4	8	24923	24930	0 %	0 %	50 %	50 %	238023415
82	NC_012720	GC	3	6	25018	25023	0 %	0 %	50 %	50 %	238023415
83	NC_012720	GC	3	6	26031	26036	0 %	0 %	50 %	50 %	238023416
84	NC_012720	AC	3	6	26703	26708	50 %	0 %	0 %	50 %	238023417
85	NC_012720	GC	3	6	27681	27686	0 %	0 %	50 %	50 %	238023417
86	NC_012720	GC	3	6	27724	27729	0 %	0 %	50 %	50 %	238023418
87	NC_012720	CG	3	6	27904	27909	0 %	0 %	50 %	50 %	238023418
88	NC_012720	GC	3	6	28280	28285	0 %	0 %	50 %	50 %	238023418
89	NC_012720	GC	3	6	28331	28336	0 %	0 %	50 %	50 %	238023418
90	NC_012720	AG	3	6	28602	28607	50 %	0 %	50 %	0 %	238023419
91	NC_012720	CG	3	6	30714	30719	0 %	0 %	50 %	50 %	238023420
92	NC_012720	CG	3	6	30945	30950	0 %	0 %	50 %	50 %	238023420
93	NC_012720	CG	4	8	30955	30962	0 %	0 %	50 %	50 %	238023420
94	NC_012720	GC	3	6	32426	32431	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
95	NC_012720	GC	3	6	32888	32893	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
96	NC_012720	CG	3	6	33424	33429	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
97	NC_012720	GC	3	6	33779	33784	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
98	NC_012720	CG	4	8	33853	33860	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
99	NC_012720	GC	4	8	34589	34596	0 %	0 %	50 %	50 %	238023423
100	NC_012720	GC	3	6	34848	34853	0 %	0 %	50 %	50 %	238023424
101	NC_012720	CG	3	6	34964	34969	0 %	0 %	50 %	50 %	238023424
102	NC_012720	CG	3	6	35067	35072	0 %	0 %	50 %	50 %	238023424
103	NC_012720	CG	3	6	35503	35508	0 %	0 %	50 %	50 %	238023425
104	NC_012720	CG	4	8	36110	36117	0 %	0 %	50 %	50 %	238023425
105	NC_012720	CG	4	8	36594	36601	0 %	0 %	50 %	50 %	238023426
106	NC_012720	CG	3	6	36931	36936	0 %	0 %	50 %	50 %	238023426
107	NC_012720	AC	3	6	37179	37184	50 %	0 %	0 %	50 %	238023426
108	NC_012720	CG	3	6	37556	37561	0 %	0 %	50 %	50 %	238023427
109	NC_012720	GT	3	6	37640	37645	0 %	50 %	50 %	0 %	238023427
110	NC_012720	CG	3	6	37819	37824	0 %	0 %	50 %	50 %	238023427
111	NC_012720	CG	3	6	38220	38225	0 %	0 %	50 %	50 %	238023427
112	NC_012720	GC	3	6	38470	38475	0 %	0 %	50 %	50 %	238023427
113	NC_012720	CG	3	6	39466	39471	0 %	0 %	50 %	50 %	238023428
114	NC_012720	GC	3	6	39548	39553	0 %	0 %	50 %	50 %	238023428
115	NC_012720	GC	3	6	40253	40258	0 %	0 %	50 %	50 %	238023429
116	NC_012720	GC	3	6	40260	40265	0 %	0 %	50 %	50 %	238023429
117	NC_012720	CG	3	6	40634	40639	0 %	0 %	50 %	50 %	238023429
118	NC_012720	GC	3	6	41091	41096	0 %	0 %	50 %	50 %	238023430
119	NC_012720	GT	3	6	41359	41364	0 %	50 %	50 %	0 %	238023431
120	NC_012720	CG	3	6	41810	41815	0 %	0 %	50 %	50 %	238023432
121	NC_012720	GC	3	6	42454	42459	0 %	0 %	50 %	50 %	238023433
122	NC_012720	AC	3	6	43564	43569	50 %	0 %	0 %	50 %	238023435
123	NC_012720	CG	3	6	44181	44186	0 %	0 %	50 %	50 %	238023436
124	NC_012720	TC	3	6	44283	44288	0 %	50 %	0 %	50 %	238023436
125	NC_012720	GA	3	6	44325	44330	50 %	0 %	50 %	0 %	238023436
126	NC_012720	GT	3	6	44641	44646	0 %	50 %	50 %	0 %	238023436
127	NC_012720	GC	3	6	44931	44936	0 %	0 %	50 %	50 %	238023436
128	NC_012720	GA	3	6	44988	44993	50 %	0 %	50 %	0 %	238023436
129	NC_012720	TC	3	6	45812	45817	0 %	50 %	0 %	50 %	339717137
130	NC_012720	GC	3	6	47090	47095	0 %	0 %	50 %	50 %	339717137
131	NC_012720	GA	3	6	47377	47382	50 %	0 %	50 %	0 %	339717137
132	NC_012720	AC	3	6	47906	47911	50 %	0 %	0 %	50 %	238023439
133	NC_012720	GC	3	6	48089	48094	0 %	0 %	50 %	50 %	238023439
134	NC_012720	AT	3	6	48689	48694	50 %	50 %	0 %	0 %	238023440
135	NC_012720	CG	3	6	48969	48974	0 %	0 %	50 %	50 %	238023440
136	NC_012720	GA	4	8	49189	49196	50 %	0 %	50 %	0 %	238023440
137	NC_012720	CG	3	6	49843	49848	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
138	NC_012720	CG	3	6	49904	49909	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
139	NC_012720	GC	3	6	50141	50146	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
140	NC_012720	GC	3	6	50379	50384	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
141	NC_012720	CG	4	8	51262	51269	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
142	NC_012720	GC	3	6	51482	51487	0 %	0 %	50 %	50 %	238023441
143	NC_012720	GA	3	6	51880	51885	50 %	0 %	50 %	0 %	238023441
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.