MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_2p

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012718	AACGGA	2	12	356	367	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238023297
2	NC_012718	TGACTA	2	12	1338	1349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238023297
3	NC_012718	ATGCCA	2	12	3897	3908	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238023299
4	NC_012718	CCACGA	2	12	4256	4267	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012718	CGGCGC	2	12	4684	4695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012718	GGCGCG	2	12	4914	4925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012718	CACGTC	2	12	16233	16244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238023310
8	NC_012718	ATGCCG	2	12	22017	22028	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023314
9	NC_012718	AACCCG	2	12	24470	24481	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	238023315
10	NC_012718	GATCAC	2	12	25973	25984	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238023316
11	NC_012718	GCGCCC	2	12	28432	28443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238023317
12	NC_012718	CGATCG	2	12	33166	33177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012718	GGCGGT	2	12	34941	34952	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	238023322
14	NC_012718	TTCCGA	2	12	36301	36312	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012718	TCGCGA	2	12	38565	38576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012718	CGGCGA	2	12	41815	41826	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012718	ACGATC	2	12	42454	42465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238023325
18	NC_012718	GGATCT	2	12	44100	44111	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238023325
19	NC_012718	AACGCG	2	12	48636	48647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023326
20	NC_012718	TTGGCC	2	12	49993	50004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012718	GGTGAT	2	12	50979	50990	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012718	CGACCT	2	12	52596	52607	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238023330
23	NC_012718	GCCAGT	2	12	54107	54118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023331
24	NC_012718	ATCTCA	2	12	57039	57050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238023333
25	NC_012718	GTCGGT	2	12	59553	59564	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	238023335
26	NC_012718	GCACGC	2	12	60903	60914	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238023336
27	NC_012718	GCCGAC	2	12	61103	61114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238023336
28	NC_012718	CGATCC	2	12	62124	62135	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238023337
29	NC_012718	CGCTGG	2	12	64561	64572	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023338
30	NC_012718	GCGAGC	2	12	65031	65042	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238023338
31	NC_012718	GGCGGG	2	12	67979	67990	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	238023338
32	NC_012718	GCACTC	2	12	69657	69668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238023338
33	NC_012718	CGATCC	2	12	71445	71456	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238023339
34	NC_012718	GGCGGG	2	12	73584	73595	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	238023339
35	NC_012718	GCTGCG	2	12	75423	75434	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023339
36	NC_012718	CGCTGG	2	12	75518	75529	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023339
37	NC_012718	GATGGC	2	12	75723	75734	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238023339
38	NC_012718	CGAGCG	2	12	77699	77710	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238023340
39	NC_012718	CGATCG	2	12	77719	77730	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023340
40	NC_012718	ACGCGC	2	12	78958	78969	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238023340
41	NC_012718	TCGCGG	2	12	79168	79179	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023340
42	NC_012718	CGGTCG	2	12	79489	79500	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	238023340
43	NC_012718	TCGATC	2	12	81712	81723	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238023340
44	NC_012718	CGATCG	2	12	83071	83082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023340
45	NC_012718	GTCCGC	2	12	84931	84942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238023341
46	NC_012718	CGGCAT	2	12	86029	86040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023342
47	NC_012718	CGATGA	2	12	87844	87855	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238023344
48	NC_012718	TGATCG	2	12	92176	92187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238023346
49	NC_012718	AAGCGA	2	12	93394	93405	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238023348
50	NC_012718	CGGCAT	2	12	97527	97538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023351
51	NC_012718	CTCGTT	2	12	97665	97676	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238023351
52	NC_012718	TTGAAG	2	12	100583	100594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012718	GAGCGT	2	12	103983	103994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238023354
54	NC_012718	CGGCAG	2	12	108760	108771	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238023360
55	NC_012718	GCCGCG	2	12	109733	109744	0 %	0 %	50 %	50 %	238023362
56	NC_012718	CGACTT	2	12	117441	117452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238023372
57	NC_012718	GACGCG	2	12	119404	119415	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	238023374
58	NC_012718	GCCGAA	2	12	126393	126404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238023382
59	NC_012718	AACGTG	2	12	126646	126657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238023382
60	NC_012718	GCACTG	2	12	132156	132167	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238023389
61	NC_012718	ACCGAA	2	12	138044	138055	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012718	TCGCGC	2	12	138582	138593	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012718	GTCGGG	2	12	141212	141223	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012718	CTATCT	2	12	141254	141265	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.