MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_2p

Total Repeats: 450

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012718	GCAA	2	8	216	223	50 %	0 %	25 %	25 %	238023297
2	NC_012718	AGCG	2	8	1258	1265	25 %	0 %	50 %	25 %	238023297
3	NC_012718	GGGA	2	8	2112	2119	25 %	0 %	75 %	0 %	238023298
4	NC_012718	CAAG	2	8	2209	2216	50 %	0 %	25 %	25 %	238023298
5	NC_012718	ATCT	2	8	3137	3144	25 %	50 %	0 %	25 %	238023299
6	NC_012718	CCGA	2	8	3617	3624	25 %	0 %	25 %	50 %	238023299
7	NC_012718	CCGC	2	8	3654	3661	0 %	0 %	25 %	75 %	238023299
8	NC_012718	GCAC	2	8	3670	3677	25 %	0 %	25 %	50 %	238023299
9	NC_012718	GGAC	2	8	3775	3782	25 %	0 %	50 %	25 %	238023299
10	NC_012718	GAGC	2	8	4344	4351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012718	GCAC	2	8	4528	4535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012718	CGGT	2	8	4645	4652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012718	CGAA	2	8	4853	4860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012718	GGCG	2	8	5251	5258	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012718	CAGC	2	8	5616	5623	25 %	0 %	25 %	50 %	238023300
16	NC_012718	GGCG	2	8	5809	5816	0 %	0 %	75 %	25 %	238023300
17	NC_012718	GCAT	2	8	5861	5868	25 %	25 %	25 %	25 %	238023301
18	NC_012718	CGGC	2	8	6305	6312	0 %	0 %	50 %	50 %	238023301
19	NC_012718	TCAT	2	8	6463	6470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012718	AATG	2	8	6899	6906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012718	AGGC	2	8	6989	6996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012718	CCGC	2	8	7014	7021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_012718	GCCG	2	8	7029	7036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012718	GCGA	2	8	7083	7090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012718	CGGG	2	8	7227	7234	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012718	TCGC	2	8	8455	8462	0 %	25 %	25 %	50 %	238023302
27	NC_012718	CGTC	2	8	8861	8868	0 %	25 %	25 %	50 %	238023303
28	NC_012718	GTCG	2	8	9124	9131	0 %	25 %	50 %	25 %	238023303
29	NC_012718	GTGC	2	8	9453	9460	0 %	25 %	50 %	25 %	238023303
30	NC_012718	CAGC	2	8	9615	9622	25 %	0 %	25 %	50 %	238023303
31	NC_012718	CTGG	2	8	9657	9664	0 %	25 %	50 %	25 %	238023303
32	NC_012718	CTGG	2	8	9679	9686	0 %	25 %	50 %	25 %	238023303
33	NC_012718	GTGG	2	8	9693	9700	0 %	25 %	75 %	0 %	238023303
34	NC_012718	GCGT	2	8	9846	9853	0 %	25 %	50 %	25 %	238023303
35	NC_012718	CGGC	2	8	10337	10344	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
36	NC_012718	GAGC	2	8	10537	10544	25 %	0 %	50 %	25 %	238023304
37	NC_012718	CGCC	2	8	10964	10971	0 %	0 %	25 %	75 %	238023304
38	NC_012718	GGCC	2	8	11024	11031	0 %	0 %	50 %	50 %	238023304
39	NC_012718	AGCG	2	8	11402	11409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012718	GAGG	2	8	11745	11752	25 %	0 %	75 %	0 %	238023305
41	NC_012718	GTCT	2	8	11959	11966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012718	CGAC	2	8	12456	12463	25 %	0 %	25 %	50 %	238023306
43	NC_012718	GGCA	2	8	12743	12750	25 %	0 %	50 %	25 %	238023306
44	NC_012718	TGGT	2	8	13167	13174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012718	CAAT	2	8	13197	13204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012718	TGGC	2	8	13807	13814	0 %	25 %	50 %	25 %	238023307
47	NC_012718	GCAA	2	8	13877	13884	50 %	0 %	25 %	25 %	238023307
48	NC_012718	GCCG	2	8	14354	14361	0 %	0 %	50 %	50 %	238023308
49	NC_012718	GGCG	2	8	14881	14888	0 %	0 %	75 %	25 %	238023309
50	NC_012718	TCAT	2	8	15646	15653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012718	CCCT	2	8	15696	15703	0 %	25 %	0 %	75 %	238023310
52	NC_012718	CGCC	2	8	15872	15879	0 %	0 %	25 %	75 %	238023310
53	NC_012718	CAGC	2	8	16088	16095	25 %	0 %	25 %	50 %	238023310
54	NC_012718	GATC	2	8	16313	16320	25 %	25 %	25 %	25 %	238023310
55	NC_012718	CGTG	2	8	16414	16421	0 %	25 %	50 %	25 %	238023310
56	NC_012718	TGGG	2	8	16447	16454	0 %	25 %	75 %	0 %	238023310
57	NC_012718	GTTC	2	8	17321	17328	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012718	ACCC	2	8	18478	18485	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_012718	GCTC	2	8	19031	19038	0 %	25 %	25 %	50 %	238023312
60	NC_012718	AGCG	2	8	19112	19119	25 %	0 %	50 %	25 %	238023312
61	NC_012718	TGGG	2	8	20294	20301	0 %	25 %	75 %	0 %	238023313
62	NC_012718	CCAG	2	8	20310	20317	25 %	0 %	25 %	50 %	238023313
63	NC_012718	CAGC	2	8	20692	20699	25 %	0 %	25 %	50 %	238023313
64	NC_012718	CTTC	2	8	21313	21320	0 %	50 %	0 %	50 %	238023314
65	NC_012718	CGAC	2	8	21370	21377	25 %	0 %	25 %	50 %	238023314
66	NC_012718	CGCC	2	8	21442	21449	0 %	0 %	25 %	75 %	238023314
67	NC_012718	CGCT	3	12	21572	21583	0 %	25 %	25 %	50 %	238023314
68	NC_012718	GCTG	2	8	22100	22107	0 %	25 %	50 %	25 %	238023314
69	NC_012718	CAGC	2	8	22857	22864	25 %	0 %	25 %	50 %	238023315
70	NC_012718	GCCA	2	8	24029	24036	25 %	0 %	25 %	50 %	238023315
71	NC_012718	GCCA	2	8	24082	24089	25 %	0 %	25 %	50 %	238023315
72	NC_012718	CCTG	2	8	24252	24259	0 %	25 %	25 %	50 %	238023315
73	NC_012718	GGCG	2	8	24489	24496	0 %	0 %	75 %	25 %	238023315
74	NC_012718	CGCA	2	8	24990	24997	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012718	GATC	2	8	25173	25180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012718	GGCC	2	8	25628	25635	0 %	0 %	50 %	50 %	238023316
77	NC_012718	TGCG	2	8	26375	26382	0 %	25 %	50 %	25 %	238023316
78	NC_012718	GGCG	2	8	26576	26583	0 %	0 %	75 %	25 %	238023316
79	NC_012718	CGGG	2	8	26688	26695	0 %	0 %	75 %	25 %	238023316
80	NC_012718	GCCG	2	8	27230	27237	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
81	NC_012718	GCCG	2	8	27386	27393	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
82	NC_012718	GCCC	2	8	27655	27662	0 %	0 %	25 %	75 %	238023317
83	NC_012718	ACGC	2	8	27721	27728	25 %	0 %	25 %	50 %	238023317
84	NC_012718	GGTC	2	8	27862	27869	0 %	25 %	50 %	25 %	238023317
85	NC_012718	CCAC	2	8	27874	27881	25 %	0 %	0 %	75 %	238023317
86	NC_012718	GCCA	2	8	27887	27894	25 %	0 %	25 %	50 %	238023317
87	NC_012718	CCAG	2	8	27910	27917	25 %	0 %	25 %	50 %	238023317
88	NC_012718	GCTG	2	8	27952	27959	0 %	25 %	50 %	25 %	238023317
89	NC_012718	GCAC	2	8	28114	28121	25 %	0 %	25 %	50 %	238023317
90	NC_012718	GCCG	2	8	28616	28623	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
91	NC_012718	TGTT	2	8	29150	29157	0 %	75 %	25 %	0 %	238023318
92	NC_012718	CCGA	2	8	29501	29508	25 %	0 %	25 %	50 %	238023318
93	NC_012718	TCGC	2	8	29965	29972	0 %	25 %	25 %	50 %	238023318
94	NC_012718	TACC	2	8	30833	30840	25 %	25 %	0 %	50 %	238023319
95	NC_012718	AGCC	2	8	30905	30912	25 %	0 %	25 %	50 %	238023319
96	NC_012718	CGAT	2	8	31075	31082	25 %	25 %	25 %	25 %	238023319
97	NC_012718	CCGA	2	8	31152	31159	25 %	0 %	25 %	50 %	238023319
98	NC_012718	ACGG	2	8	31477	31484	25 %	0 %	50 %	25 %	238023319
99	NC_012718	ACGC	2	8	31762	31769	25 %	0 %	25 %	50 %	238023320
100	NC_012718	TGGC	2	8	32059	32066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012718	GATG	2	8	32387	32394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012718	AGCC	2	8	32576	32583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012718	AGCG	2	8	32586	32593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012718	CACC	2	8	33067	33074	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_012718	GAAG	2	8	33245	33252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012718	TGCG	2	8	33959	33966	0 %	25 %	50 %	25 %	238023321
107	NC_012718	GGGC	2	8	34025	34032	0 %	0 %	75 %	25 %	238023321
108	NC_012718	AAGG	2	8	34543	34550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012718	AATG	2	8	34626	34633	50 %	25 %	25 %	0 %	238023322
110	NC_012718	CTGG	2	8	34914	34921	0 %	25 %	50 %	25 %	238023322
111	NC_012718	ACCT	2	8	35437	35444	25 %	25 %	0 %	50 %	238023322
112	NC_012718	AGCG	2	8	36542	36549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012718	CGTG	2	8	36773	36780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012718	ACTT	2	8	37375	37382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012718	CAGT	2	8	37572	37579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012718	AAAG	2	8	37904	37911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012718	GCGG	2	8	37948	37955	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012718	AATT	2	8	38220	38227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012718	GTTT	2	8	38436	38443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012718	CGAA	2	8	38784	38791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012718	CATG	2	8	39455	39462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012718	GTCG	2	8	39537	39544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012718	CGAG	2	8	39841	39848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012718	GCCG	2	8	39862	39869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012718	GCAC	2	8	39875	39882	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012718	TTTC	2	8	39915	39922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012718	GCTT	2	8	40678	40685	0 %	50 %	25 %	25 %	238023324
128	NC_012718	ACGA	2	8	40797	40804	50 %	0 %	25 %	25 %	238023324
129	NC_012718	TCGA	2	8	40980	40987	25 %	25 %	25 %	25 %	238023324
130	NC_012718	TCAC	2	8	41014	41021	25 %	25 %	0 %	50 %	238023324
131	NC_012718	ATTT	2	8	41066	41073	25 %	75 %	0 %	0 %	238023324
132	NC_012718	GCCG	2	8	41681	41688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012718	TCGT	2	8	41713	41720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012718	CGAC	2	8	41799	41806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012718	ACGA	2	8	41881	41888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012718	CCAG	2	8	42089	42096	25 %	0 %	25 %	50 %	238023325
137	NC_012718	CACG	2	8	42210	42217	25 %	0 %	25 %	50 %	238023325
138	NC_012718	GCCG	2	8	42445	42452	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
139	NC_012718	GCTG	2	8	42804	42811	0 %	25 %	50 %	25 %	238023325
140	NC_012718	CATT	2	8	42823	42830	25 %	50 %	0 %	25 %	238023325
141	NC_012718	CGCT	2	8	43249	43256	0 %	25 %	25 %	50 %	238023325
142	NC_012718	GCTG	2	8	44013	44020	0 %	25 %	50 %	25 %	238023325
143	NC_012718	GTGG	2	8	44142	44149	0 %	25 %	75 %	0 %	238023325
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438	NC_012718	CTCG	2	8	136825	136832	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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449	NC_012718	CGAA	2	8	141313	141320	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
450	NC_012718	AAAC	2	8	141542	141549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.