MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_2p

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012718	GAGC	2	8	4344	4351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012718	GCAC	2	8	4528	4535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012718	CGGT	2	8	4645	4652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012718	CGAA	2	8	4853	4860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012718	GGCG	2	8	5251	5258	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012718	TCAT	2	8	6463	6470	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012718	AATG	2	8	6899	6906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012718	AGGC	2	8	6989	6996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012718	CCGC	2	8	7014	7021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_012718	GCCG	2	8	7029	7036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012718	GCGA	2	8	7083	7090	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012718	CGGG	2	8	7227	7234	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012718	AGCG	2	8	11402	11409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012718	GTCT	2	8	11959	11966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012718	TGGT	2	8	13167	13174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012718	CAAT	2	8	13197	13204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012718	TCAT	2	8	15646	15653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012718	GTTC	2	8	17321	17328	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012718	ACCC	2	8	18478	18485	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_012718	CGCA	2	8	24990	24997	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012718	GATC	2	8	25173	25180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012718	TGGC	2	8	32059	32066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012718	GATG	2	8	32387	32394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012718	AGCC	2	8	32576	32583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012718	AGCG	2	8	32586	32593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012718	CACC	2	8	33067	33074	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_012718	GAAG	2	8	33245	33252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012718	AAGG	2	8	34543	34550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012718	AGCG	2	8	36542	36549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012718	CGTG	2	8	36773	36780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012718	ACTT	2	8	37375	37382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012718	CAGT	2	8	37572	37579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012718	AAAG	2	8	37904	37911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012718	GCGG	2	8	37948	37955	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012718	AATT	2	8	38220	38227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012718	GTTT	2	8	38436	38443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012718	CGAA	2	8	38784	38791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012718	CATG	2	8	39455	39462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012718	GTCG	2	8	39537	39544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012718	CGAG	2	8	39841	39848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012718	GCCG	2	8	39862	39869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012718	GCAC	2	8	39875	39882	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012718	TTTC	2	8	39915	39922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012718	GCCG	2	8	41681	41688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012718	TCGT	2	8	41713	41720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012718	CGAC	2	8	41799	41806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012718	ACGA	2	8	41881	41888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012718	TCGA	2	8	47280	47287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012718	CTCG	2	8	49965	49972	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012718	CCTG	2	8	50165	50172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012718	GCGG	2	8	50450	50457	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012718	TGGC	2	8	50704	50711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012718	CCTG	2	8	50834	50841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012718	CCTT	2	8	54955	54962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012718	ATCA	2	8	56222	56229	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012718	CGAT	2	8	58133	58140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012718	GGAT	2	8	84796	84803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012718	CCGT	2	8	85373	85380	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012718	GGCG	2	8	85387	85394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012718	GCTG	2	8	90049	90056	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012718	TCCG	2	8	90332	90339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012718	TGGA	2	8	90366	90373	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012718	CAGC	2	8	99963	99970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012718	CAAG	2	8	99972	99979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012718	TCCT	2	8	100570	100577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012718	ATCA	2	8	100723	100730	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_012718	CTGT	2	8	103699	103706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012718	CGTT	2	8	106194	106201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012718	CGAA	2	8	106284	106291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012718	ATCG	2	8	106368	106375	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012718	CGGA	2	8	106933	106940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012718	TTCG	2	8	107458	107465	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012718	TGGT	2	8	109486	109493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012718	CTGT	2	8	111148	111155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012718	GAAG	2	8	113881	113888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012718	ACGC	2	8	120539	120546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012718	CGTC	2	8	133304	133311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012718	GGCG	2	8	135664	135671	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012718	TGTT	2	8	136003	136010	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012718	TCCA	2	8	136156	136163	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012718	CCGC	2	8	136525	136532	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_012718	TGGC	2	8	136643	136650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012718	GCCA	2	8	136772	136779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012718	CAGC	2	8	136786	136793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012718	CTCG	2	8	136825	136832	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012718	AGCC	2	8	137082	137089	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012718	GCAA	2	8	138207	138214	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012718	ACGC	2	8	138557	138564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012718	CAGC	2	8	139503	139510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012718	GGCC	2	8	139539	139546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012718	CATG	2	8	139740	139747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_012718	CCTG	2	8	140366	140373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012718	CAGC	2	8	141007	141014	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012718	AGGC	2	8	141167	141174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012718	GGGC	2	8	141298	141305	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_012718	CGAA	2	8	141313	141320	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012718	AAAC	2	8	141542	141549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.