MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_2p

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012718	TC	3	6	1225	1230	0 %	50 %	0 %	50 %	238023297
2	NC_012718	CG	3	6	1406	1411	0 %	0 %	50 %	50 %	238023298
3	NC_012718	GT	3	6	1822	1827	0 %	50 %	50 %	0 %	238023298
4	NC_012718	AC	3	6	2246	2251	50 %	0 %	0 %	50 %	238023298
5	NC_012718	GC	4	8	2336	2343	0 %	0 %	50 %	50 %	238023298
6	NC_012718	GC	3	6	2375	2380	0 %	0 %	50 %	50 %	238023298
7	NC_012718	CG	3	6	2882	2887	0 %	0 %	50 %	50 %	238023299
8	NC_012718	TC	3	6	3025	3030	0 %	50 %	0 %	50 %	238023299
9	NC_012718	GC	3	6	3202	3207	0 %	0 %	50 %	50 %	238023299
10	NC_012718	GC	3	6	3946	3951	0 %	0 %	50 %	50 %	238023299
11	NC_012718	GC	3	6	4021	4026	0 %	0 %	50 %	50 %	238023299
12	NC_012718	CG	3	6	4299	4304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012718	GC	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012718	GC	3	6	5481	5486	0 %	0 %	50 %	50 %	238023300
15	NC_012718	CG	5	10	5599	5608	0 %	0 %	50 %	50 %	238023300
16	NC_012718	CG	3	6	5693	5698	0 %	0 %	50 %	50 %	238023300
17	NC_012718	GC	3	6	5770	5775	0 %	0 %	50 %	50 %	238023300
18	NC_012718	CG	3	6	6147	6152	0 %	0 %	50 %	50 %	238023301
19	NC_012718	CG	3	6	6320	6325	0 %	0 %	50 %	50 %	238023301
20	NC_012718	GC	3	6	6387	6392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012718	GC	3	6	6445	6450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012718	GC	3	6	7491	7496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012718	CA	3	6	7801	7806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012718	CG	3	6	8183	8188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012718	CG	3	6	8259	8264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012718	GC	5	10	8721	8730	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
27	NC_012718	CG	3	6	8997	9002	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
28	NC_012718	CG	3	6	9236	9241	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
29	NC_012718	GC	3	6	9414	9419	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
30	NC_012718	GC	3	6	9642	9647	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
31	NC_012718	GC	3	6	9783	9788	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
32	NC_012718	GC	3	6	9801	9806	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
33	NC_012718	CG	3	6	10175	10180	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
34	NC_012718	CG	3	6	10196	10201	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
35	NC_012718	GC	3	6	10456	10461	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
36	NC_012718	CG	3	6	10723	10728	0 %	0 %	50 %	50 %	238023304
37	NC_012718	CG	4	8	10931	10938	0 %	0 %	50 %	50 %	238023304
38	NC_012718	GC	3	6	10978	10983	0 %	0 %	50 %	50 %	238023304
39	NC_012718	CG	3	6	11213	11218	0 %	0 %	50 %	50 %	238023304
40	NC_012718	GC	3	6	11414	11419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012718	CG	3	6	11690	11695	0 %	0 %	50 %	50 %	238023305
42	NC_012718	CG	3	6	11771	11776	0 %	0 %	50 %	50 %	238023305
43	NC_012718	GC	3	6	11858	11863	0 %	0 %	50 %	50 %	238023305
44	NC_012718	AT	3	6	13232	13237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012718	GC	3	6	13598	13603	0 %	0 %	50 %	50 %	238023307
46	NC_012718	GA	3	6	15576	15581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012718	GC	3	6	15798	15803	0 %	0 %	50 %	50 %	238023310
48	NC_012718	CT	3	6	15934	15939	0 %	50 %	0 %	50 %	238023310
49	NC_012718	GC	3	6	16046	16051	0 %	0 %	50 %	50 %	238023310
50	NC_012718	GC	3	6	16361	16366	0 %	0 %	50 %	50 %	238023310
51	NC_012718	CG	3	6	16701	16706	0 %	0 %	50 %	50 %	238023310
52	NC_012718	GC	3	6	16941	16946	0 %	0 %	50 %	50 %	238023310
53	NC_012718	TC	3	6	17062	17067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012718	CG	4	8	17368	17375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012718	CT	3	6	17385	17390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012718	TG	3	6	17501	17506	0 %	50 %	50 %	0 %	238023311
57	NC_012718	GC	4	8	17967	17974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012718	GC	3	6	19010	19015	0 %	0 %	50 %	50 %	238023312
59	NC_012718	GC	3	6	20155	20160	0 %	0 %	50 %	50 %	238023313
60	NC_012718	CG	3	6	20167	20172	0 %	0 %	50 %	50 %	238023313
61	NC_012718	GC	4	8	20258	20265	0 %	0 %	50 %	50 %	238023313
62	NC_012718	GC	4	8	21480	21487	0 %	0 %	50 %	50 %	238023314
63	NC_012718	CG	3	6	22436	22441	0 %	0 %	50 %	50 %	238023314
64	NC_012718	CA	4	8	22565	22572	50 %	0 %	0 %	50 %	238023314
65	NC_012718	AG	3	6	22774	22779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012718	GC	3	6	23529	23534	0 %	0 %	50 %	50 %	238023315
67	NC_012718	GA	3	6	23639	23644	50 %	0 %	50 %	0 %	238023315
68	NC_012718	GC	3	6	23732	23737	0 %	0 %	50 %	50 %	238023315
69	NC_012718	TC	3	6	24177	24182	0 %	50 %	0 %	50 %	238023315
70	NC_012718	GC	3	6	24944	24949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012718	CA	3	6	25273	25278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012718	CA	3	6	25353	25358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012718	GC	3	6	25804	25809	0 %	0 %	50 %	50 %	238023316
74	NC_012718	CG	3	6	26014	26019	0 %	0 %	50 %	50 %	238023316
75	NC_012718	CG	5	10	26537	26546	0 %	0 %	50 %	50 %	238023316
76	NC_012718	GC	3	6	27113	27118	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
77	NC_012718	GC	3	6	27365	27370	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
78	NC_012718	GC	3	6	27372	27377	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
79	NC_012718	CG	4	8	27392	27399	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
80	NC_012718	GC	3	6	27768	27773	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
81	NC_012718	CG	3	6	27785	27790	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
82	NC_012718	CG	3	6	27926	27931	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
83	NC_012718	CG	3	6	28154	28159	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
84	NC_012718	CG	3	6	28333	28338	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
85	NC_012718	GC	3	6	28571	28576	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
86	NC_012718	CG	3	6	28984	28989	0 %	0 %	50 %	50 %	238023318
87	NC_012718	CG	3	6	29189	29194	0 %	0 %	50 %	50 %	238023318
88	NC_012718	GC	3	6	29290	29295	0 %	0 %	50 %	50 %	238023318
89	NC_012718	GC	3	6	29321	29326	0 %	0 %	50 %	50 %	238023318
90	NC_012718	TG	3	6	29378	29383	0 %	50 %	50 %	0 %	238023318
91	NC_012718	GC	3	6	30203	30208	0 %	0 %	50 %	50 %	238023318
92	NC_012718	TG	3	6	30860	30865	0 %	50 %	50 %	0 %	238023319
93	NC_012718	CG	3	6	31028	31033	0 %	0 %	50 %	50 %	238023319
94	NC_012718	AT	3	6	31843	31848	50 %	50 %	0 %	0 %	238023320
95	NC_012718	CG	3	6	32280	32285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012718	GC	3	6	32317	32322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012718	CG	4	8	32825	32832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012718	GC	3	6	32980	32985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012718	CG	3	6	33147	33152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012718	CG	3	6	33274	33279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012718	CG	3	6	33779	33784	0 %	0 %	50 %	50 %	238023321
102	NC_012718	GC	3	6	34014	34019	0 %	0 %	50 %	50 %	238023321
103	NC_012718	CG	4	8	34059	34066	0 %	0 %	50 %	50 %	238023321
104	NC_012718	CG	3	6	34269	34274	0 %	0 %	50 %	50 %	238023321
105	NC_012718	CG	3	6	35118	35123	0 %	0 %	50 %	50 %	238023322
106	NC_012718	GT	3	6	37998	38003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012718	CG	3	6	39321	39326	0 %	0 %	50 %	50 %	238023323
108	NC_012718	CG	3	6	39716	39721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012718	CG	4	8	39832	39839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012718	GT	3	6	40015	40020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012718	TC	3	6	40121	40126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012718	TG	3	6	40187	40192	0 %	50 %	50 %	0 %	238023324
113	NC_012718	AG	3	6	41958	41963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012718	GA	3	6	41994	41999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012718	CG	3	6	42991	42996	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
116	NC_012718	GC	3	6	43761	43766	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
117	NC_012718	GC	3	6	44296	44301	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
118	NC_012718	GC	3	6	45243	45248	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
119	NC_012718	CG	3	6	45462	45467	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
120	NC_012718	GC	4	8	46656	46663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012718	AT	3	6	47154	47159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012718	CG	4	8	48236	48243	0 %	0 %	50 %	50 %	238023326
123	NC_012718	GC	3	6	48806	48811	0 %	0 %	50 %	50 %	238023326
124	NC_012718	CG	4	8	48934	48941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012718	GC	3	6	48995	49000	0 %	0 %	50 %	50 %	238023327
126	NC_012718	GC	3	6	49487	49492	0 %	0 %	50 %	50 %	238023328
127	NC_012718	GC	3	6	49821	49826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012718	CG	3	6	50066	50071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012718	CG	3	6	51754	51759	0 %	0 %	50 %	50 %	238023329
130	NC_012718	GA	3	6	52020	52025	50 %	0 %	50 %	0 %	238023330
131	NC_012718	CG	4	8	52284	52291	0 %	0 %	50 %	50 %	238023330
132	NC_012718	CG	3	6	52823	52828	0 %	0 %	50 %	50 %	238023330
133	NC_012718	CG	3	6	53290	53295	0 %	0 %	50 %	50 %	238023330
134	NC_012718	GC	3	6	55760	55765	0 %	0 %	50 %	50 %	238023332
135	NC_012718	GC	3	6	55826	55831	0 %	0 %	50 %	50 %	238023332
136	NC_012718	TC	3	6	56121	56126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012718	CA	3	6	56539	56544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012718	AG	3	6	56875	56880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012718	GC	3	6	57309	57314	0 %	0 %	50 %	50 %	238023333
140	NC_012718	CG	3	6	57321	57326	0 %	0 %	50 %	50 %	238023333
141	NC_012718	CG	4	8	57674	57681	0 %	0 %	50 %	50 %	238023333
142	NC_012718	GC	3	6	58721	58726	0 %	0 %	50 %	50 %	238023334
143	NC_012718	GC	3	6	59208	59213	0 %	0 %	50 %	50 %	238023334
144	NC_012718	GC	3	6	59708	59713	0 %	0 %	50 %	50 %	238023335
145	NC_012718	GC	3	6	59721	59726	0 %	0 %	50 %	50 %	238023335
146	NC_012718	GC	3	6	59873	59878	0 %	0 %	50 %	50 %	238023335
147	NC_012718	GC	3	6	60016	60021	0 %	0 %	50 %	50 %	238023335
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.