MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_2p

Total Repeats: 353

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012718	TC	3	6	1225	1230	0 %	50 %	0 %	50 %	238023297
2	NC_012718	CG	3	6	1406	1411	0 %	0 %	50 %	50 %	238023298
3	NC_012718	GT	3	6	1822	1827	0 %	50 %	50 %	0 %	238023298
4	NC_012718	AC	3	6	2246	2251	50 %	0 %	0 %	50 %	238023298
5	NC_012718	GC	4	8	2336	2343	0 %	0 %	50 %	50 %	238023298
6	NC_012718	GC	3	6	2375	2380	0 %	0 %	50 %	50 %	238023298
7	NC_012718	CG	3	6	2882	2887	0 %	0 %	50 %	50 %	238023299
8	NC_012718	TC	3	6	3025	3030	0 %	50 %	0 %	50 %	238023299
9	NC_012718	GC	3	6	3202	3207	0 %	0 %	50 %	50 %	238023299
10	NC_012718	GC	3	6	3946	3951	0 %	0 %	50 %	50 %	238023299
11	NC_012718	GC	3	6	4021	4026	0 %	0 %	50 %	50 %	238023299
12	NC_012718	GC	3	6	5481	5486	0 %	0 %	50 %	50 %	238023300
13	NC_012718	CG	5	10	5599	5608	0 %	0 %	50 %	50 %	238023300
14	NC_012718	CG	3	6	5693	5698	0 %	0 %	50 %	50 %	238023300
15	NC_012718	GC	3	6	5770	5775	0 %	0 %	50 %	50 %	238023300
16	NC_012718	CG	3	6	6147	6152	0 %	0 %	50 %	50 %	238023301
17	NC_012718	CG	3	6	6320	6325	0 %	0 %	50 %	50 %	238023301
18	NC_012718	GC	5	10	8721	8730	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
19	NC_012718	CG	3	6	8997	9002	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
20	NC_012718	CG	3	6	9236	9241	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
21	NC_012718	GC	3	6	9414	9419	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
22	NC_012718	GC	3	6	9642	9647	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
23	NC_012718	GC	3	6	9783	9788	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
24	NC_012718	GC	3	6	9801	9806	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
25	NC_012718	CG	3	6	10175	10180	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
26	NC_012718	CG	3	6	10196	10201	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
27	NC_012718	GC	3	6	10456	10461	0 %	0 %	50 %	50 %	238023303
28	NC_012718	CG	3	6	10723	10728	0 %	0 %	50 %	50 %	238023304
29	NC_012718	CG	4	8	10931	10938	0 %	0 %	50 %	50 %	238023304
30	NC_012718	GC	3	6	10978	10983	0 %	0 %	50 %	50 %	238023304
31	NC_012718	CG	3	6	11213	11218	0 %	0 %	50 %	50 %	238023304
32	NC_012718	CG	3	6	11690	11695	0 %	0 %	50 %	50 %	238023305
33	NC_012718	CG	3	6	11771	11776	0 %	0 %	50 %	50 %	238023305
34	NC_012718	GC	3	6	11858	11863	0 %	0 %	50 %	50 %	238023305
35	NC_012718	GC	3	6	13598	13603	0 %	0 %	50 %	50 %	238023307
36	NC_012718	GC	3	6	15798	15803	0 %	0 %	50 %	50 %	238023310
37	NC_012718	CT	3	6	15934	15939	0 %	50 %	0 %	50 %	238023310
38	NC_012718	GC	3	6	16046	16051	0 %	0 %	50 %	50 %	238023310
39	NC_012718	GC	3	6	16361	16366	0 %	0 %	50 %	50 %	238023310
40	NC_012718	CG	3	6	16701	16706	0 %	0 %	50 %	50 %	238023310
41	NC_012718	GC	3	6	16941	16946	0 %	0 %	50 %	50 %	238023310
42	NC_012718	TG	3	6	17501	17506	0 %	50 %	50 %	0 %	238023311
43	NC_012718	GC	3	6	19010	19015	0 %	0 %	50 %	50 %	238023312
44	NC_012718	GC	3	6	20155	20160	0 %	0 %	50 %	50 %	238023313
45	NC_012718	CG	3	6	20167	20172	0 %	0 %	50 %	50 %	238023313
46	NC_012718	GC	4	8	20258	20265	0 %	0 %	50 %	50 %	238023313
47	NC_012718	GC	4	8	21480	21487	0 %	0 %	50 %	50 %	238023314
48	NC_012718	CG	3	6	22436	22441	0 %	0 %	50 %	50 %	238023314
49	NC_012718	CA	4	8	22565	22572	50 %	0 %	0 %	50 %	238023314
50	NC_012718	GC	3	6	23529	23534	0 %	0 %	50 %	50 %	238023315
51	NC_012718	GA	3	6	23639	23644	50 %	0 %	50 %	0 %	238023315
52	NC_012718	GC	3	6	23732	23737	0 %	0 %	50 %	50 %	238023315
53	NC_012718	TC	3	6	24177	24182	0 %	50 %	0 %	50 %	238023315
54	NC_012718	GC	3	6	25804	25809	0 %	0 %	50 %	50 %	238023316
55	NC_012718	CG	3	6	26014	26019	0 %	0 %	50 %	50 %	238023316
56	NC_012718	CG	5	10	26537	26546	0 %	0 %	50 %	50 %	238023316
57	NC_012718	GC	3	6	27113	27118	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
58	NC_012718	GC	3	6	27365	27370	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
59	NC_012718	GC	3	6	27372	27377	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
60	NC_012718	CG	4	8	27392	27399	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
61	NC_012718	GC	3	6	27768	27773	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
62	NC_012718	CG	3	6	27785	27790	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
63	NC_012718	CG	3	6	27926	27931	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
64	NC_012718	CG	3	6	28154	28159	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
65	NC_012718	CG	3	6	28333	28338	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
66	NC_012718	GC	3	6	28571	28576	0 %	0 %	50 %	50 %	238023317
67	NC_012718	CG	3	6	28984	28989	0 %	0 %	50 %	50 %	238023318
68	NC_012718	CG	3	6	29189	29194	0 %	0 %	50 %	50 %	238023318
69	NC_012718	GC	3	6	29290	29295	0 %	0 %	50 %	50 %	238023318
70	NC_012718	GC	3	6	29321	29326	0 %	0 %	50 %	50 %	238023318
71	NC_012718	TG	3	6	29378	29383	0 %	50 %	50 %	0 %	238023318
72	NC_012718	GC	3	6	30203	30208	0 %	0 %	50 %	50 %	238023318
73	NC_012718	TG	3	6	30860	30865	0 %	50 %	50 %	0 %	238023319
74	NC_012718	CG	3	6	31028	31033	0 %	0 %	50 %	50 %	238023319
75	NC_012718	AT	3	6	31843	31848	50 %	50 %	0 %	0 %	238023320
76	NC_012718	CG	3	6	33779	33784	0 %	0 %	50 %	50 %	238023321
77	NC_012718	GC	3	6	34014	34019	0 %	0 %	50 %	50 %	238023321
78	NC_012718	CG	4	8	34059	34066	0 %	0 %	50 %	50 %	238023321
79	NC_012718	CG	3	6	34269	34274	0 %	0 %	50 %	50 %	238023321
80	NC_012718	CG	3	6	35118	35123	0 %	0 %	50 %	50 %	238023322
81	NC_012718	CG	3	6	39321	39326	0 %	0 %	50 %	50 %	238023323
82	NC_012718	TG	3	6	40187	40192	0 %	50 %	50 %	0 %	238023324
83	NC_012718	CG	3	6	42991	42996	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
84	NC_012718	GC	3	6	43761	43766	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
85	NC_012718	GC	3	6	44296	44301	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
86	NC_012718	GC	3	6	45243	45248	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
87	NC_012718	CG	3	6	45462	45467	0 %	0 %	50 %	50 %	238023325
88	NC_012718	CG	4	8	48236	48243	0 %	0 %	50 %	50 %	238023326
89	NC_012718	GC	3	6	48806	48811	0 %	0 %	50 %	50 %	238023326
90	NC_012718	GC	3	6	48995	49000	0 %	0 %	50 %	50 %	238023327
91	NC_012718	GC	3	6	49487	49492	0 %	0 %	50 %	50 %	238023328
92	NC_012718	CG	3	6	51754	51759	0 %	0 %	50 %	50 %	238023329
93	NC_012718	GA	3	6	52020	52025	50 %	0 %	50 %	0 %	238023330
94	NC_012718	CG	4	8	52284	52291	0 %	0 %	50 %	50 %	238023330
95	NC_012718	CG	3	6	52823	52828	0 %	0 %	50 %	50 %	238023330
96	NC_012718	CG	3	6	53290	53295	0 %	0 %	50 %	50 %	238023330
97	NC_012718	GC	3	6	55760	55765	0 %	0 %	50 %	50 %	238023332
98	NC_012718	GC	3	6	55826	55831	0 %	0 %	50 %	50 %	238023332
99	NC_012718	GC	3	6	57309	57314	0 %	0 %	50 %	50 %	238023333
100	NC_012718	CG	3	6	57321	57326	0 %	0 %	50 %	50 %	238023333
101	NC_012718	CG	4	8	57674	57681	0 %	0 %	50 %	50 %	238023333
102	NC_012718	GC	3	6	58721	58726	0 %	0 %	50 %	50 %	238023334
103	NC_012718	GC	3	6	59208	59213	0 %	0 %	50 %	50 %	238023334
104	NC_012718	GC	3	6	59708	59713	0 %	0 %	50 %	50 %	238023335
105	NC_012718	GC	3	6	59721	59726	0 %	0 %	50 %	50 %	238023335
106	NC_012718	GC	3	6	59873	59878	0 %	0 %	50 %	50 %	238023335
107	NC_012718	GC	3	6	60016	60021	0 %	0 %	50 %	50 %	238023335
108	NC_012718	CG	3	6	60056	60061	0 %	0 %	50 %	50 %	238023335
109	NC_012718	CG	3	6	60209	60214	0 %	0 %	50 %	50 %	238023335
110	NC_012718	GC	3	6	60376	60381	0 %	0 %	50 %	50 %	238023336
111	NC_012718	AC	3	6	60428	60433	50 %	0 %	0 %	50 %	238023336
112	NC_012718	GA	3	6	60435	60440	50 %	0 %	50 %	0 %	238023336
113	NC_012718	CG	3	6	60720	60725	0 %	0 %	50 %	50 %	238023336
114	NC_012718	GT	3	6	60741	60746	0 %	50 %	50 %	0 %	238023336
115	NC_012718	CG	3	6	61709	61714	0 %	0 %	50 %	50 %	238023337
116	NC_012718	CG	3	6	62174	62179	0 %	0 %	50 %	50 %	238023337
117	NC_012718	GC	4	8	62328	62335	0 %	0 %	50 %	50 %	238023337
118	NC_012718	GC	3	6	62478	62483	0 %	0 %	50 %	50 %	238023337
119	NC_012718	GC	3	6	62615	62620	0 %	0 %	50 %	50 %	238023337
120	NC_012718	CG	4	8	62688	62695	0 %	0 %	50 %	50 %	238023337
121	NC_012718	CG	3	6	62745	62750	0 %	0 %	50 %	50 %	238023337
122	NC_012718	CG	3	6	63696	63701	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
123	NC_012718	GC	3	6	63916	63921	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
124	NC_012718	GC	3	6	64007	64012	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
125	NC_012718	CG	3	6	64026	64031	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
126	NC_012718	GC	3	6	64102	64107	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
127	NC_012718	GC	3	6	64167	64172	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
128	NC_012718	GC	3	6	64234	64239	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
129	NC_012718	CG	3	6	64389	64394	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
130	NC_012718	GC	3	6	64867	64872	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
131	NC_012718	TA	3	6	64900	64905	50 %	50 %	0 %	0 %	238023338
132	NC_012718	CG	3	6	64992	64997	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
133	NC_012718	CG	3	6	65060	65065	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
134	NC_012718	CG	3	6	65373	65378	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
135	NC_012718	CG	3	6	65554	65559	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
136	NC_012718	CG	4	8	65618	65625	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
137	NC_012718	CG	3	6	65859	65864	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
138	NC_012718	CG	3	6	65920	65925	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
139	NC_012718	CG	3	6	66591	66596	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
140	NC_012718	GC	3	6	66881	66886	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
141	NC_012718	GC	3	6	67012	67017	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
142	NC_012718	GC	3	6	67035	67040	0 %	0 %	50 %	50 %	238023338
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.