MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium kroppenstedtii DSM 44385 chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012704	TCAGCG	2	12	56922	56933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012704	AGCTGG	2	12	78058	78069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012704	GGTGGG	2	12	118244	118255	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012704	CCTGGT	2	12	164051	164062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012704	CGGGGT	2	12	191765	191776	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012704	CGTCGC	2	12	208202	208213	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012704	TCATCG	2	12	251560	251571	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012704	ATGTTT	2	12	251586	251597	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012704	ATGGAC	2	12	285114	285125	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012704	CAGTAA	2	12	336457	336468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012704	CCTCGT	2	12	339539	339550	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012704	GCGTAA	2	12	340144	340155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012704	CAGGGG	2	12	376760	376771	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012704	AAGTAT	2	12	389246	389257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012704	GCCATT	2	12	444557	444568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012704	GCAGCG	2	12	447456	447467	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012704	GCACGC	2	12	452296	452307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012704	TGCCCG	2	12	555258	555269	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012704	GGGCCA	2	12	617502	617513	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012704	CGTTTA	2	12	661344	661355	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012704	TCTGTG	2	12	665348	665359	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012704	CTGAGT	2	12	669664	669675	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012704	CGATAG	2	12	885357	885368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012704	CGTCGC	2	12	887638	887649	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012704	TAGTGT	2	12	907243	907254	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012704	TAACGA	2	12	912357	912368	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012704	GGTGGG	2	12	1008469	1008480	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012704	GTCACG	2	12	1090356	1090367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012704	TGACGT	2	12	1239274	1239285	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012704	CCCCCG	2	12	1252788	1252799	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_012704	AAATGA	2	12	1271120	1271131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012704	AACAAG	2	12	1307791	1307802	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012704	GGGCAC	2	12	1334068	1334079	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012704	GCCCCC	2	12	1346582	1346593	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
35	NC_012704	GTCTCG	2	12	1363359	1363370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012704	CCCCGG	2	12	1379510	1379521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_012704	GCAATG	2	12	1405898	1405909	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012704	CGGCCA	2	12	1411721	1411732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012704	TACCCC	2	12	1455061	1455072	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012704	CTACTT	2	12	1463080	1463091	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012704	TCATTT	2	12	1540011	1540022	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012704	CCGAGC	2	12	1567796	1567807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012704	GGTGTT	2	12	1571730	1571741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012704	CGGGCG	2	12	1571776	1571787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012704	GTTGGG	2	12	1616642	1616653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012704	GATGCC	2	12	1635128	1635139	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012704	GGAAAA	2	12	1640318	1640329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012704	GTCATT	2	12	1680931	1680942	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012704	GCAGTG	2	12	1704403	1704414	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012704	AGTTGG	2	12	1707547	1707558	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012704	CGGGGA	2	12	1711132	1711143	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012704	GACAAG	2	12	1726894	1726905	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012704	GCCATG	2	12	1766664	1766675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012704	GGGGGT	2	12	1780535	1780546	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012704	TCCGAG	2	12	1791076	1791087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012704	CGGGCA	2	12	1821454	1821465	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012704	CCCCAG	2	12	1852910	1852921	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012704	TGGGGT	2	12	1982691	1982702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012704	GATTCG	2	12	1983892	1983903	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012704	TAACAG	2	12	1990265	1990276	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012704	CCCACG	2	12	1995039	1995050	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_012704	ACGGCA	2	12	2018715	2018726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012704	GCCGCT	2	12	2031835	2031846	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012704	TAAAGC	2	12	2032169	2032180	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012704	GGCACC	2	12	2116657	2116668	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012704	CCACAG	2	12	2116757	2116768	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012704	AGGATC	2	12	2144273	2144284	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012704	GCGTTC	2	12	2159158	2159169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012704	GCACGA	2	12	2193298	2193309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012704	CACCGA	2	12	2229824	2229835	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012704	GGCTTC	2	12	2277640	2277651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012704	GGAATC	2	12	2284398	2284409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012704	AGCCCG	2	12	2333855	2333866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012704	CCTGAA	2	12	2359001	2359012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012704	ACATCA	2	12	2383778	2383789	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012704	CGTGTC	2	12	2393635	2393646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012704	GCCGAC	2	12	2425511	2425522	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012704	GAAGCC	2	12	2438076	2438087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.