MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei MSHR346 chromosome I

Total Repeats: 3937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012695	CACGT	2	10	92	101	20 %	20 %	20 %	40 %	237810279
2	NC_012695	GCGCC	2	10	2191	2200	0 %	0 %	40 %	60 %	237810283
3	NC_012695	ACGTC	2	10	2356	2365	20 %	20 %	20 %	40 %	237810283
4	NC_012695	GCGCG	2	10	2963	2972	0 %	0 %	60 %	40 %	237810283
5	NC_012695	CATTT	2	10	4147	4156	20 %	60 %	0 %	20 %	237810286
6	NC_012695	TCCGA	2	10	4189	4198	20 %	20 %	20 %	40 %	237810287
7	NC_012695	CGCGG	2	10	6028	6037	0 %	0 %	60 %	40 %	237810288
8	NC_012695	ACGCG	2	10	8572	8581	20 %	0 %	40 %	40 %	237810289
9	NC_012695	CGTGA	2	10	10715	10724	20 %	20 %	40 %	20 %	237810290
10	NC_012695	GCCGC	2	10	12790	12799	0 %	0 %	40 %	60 %	237810295
11	NC_012695	CAGAT	2	10	20540	20549	40 %	20 %	20 %	20 %	237810303
12	NC_012695	GCGCC	2	10	24256	24265	0 %	0 %	40 %	60 %	237810308
13	NC_012695	GCGCC	2	10	26116	26125	0 %	0 %	40 %	60 %	237810311
14	NC_012695	TGCGT	2	10	27665	27674	0 %	40 %	40 %	20 %	237810312
15	NC_012695	GCGCC	2	10	28293	28302	0 %	0 %	40 %	60 %	237810313
16	NC_012695	CTCGG	2	10	29200	29209	0 %	20 %	40 %	40 %	237810315
17	NC_012695	CGATC	2	10	31098	31107	20 %	20 %	20 %	40 %	237810316
18	NC_012695	GCGCG	2	10	31596	31605	0 %	0 %	60 %	40 %	237810316
19	NC_012695	CGGCG	2	10	31807	31816	0 %	0 %	60 %	40 %	237810316
20	NC_012695	CGCGG	2	10	36013	36022	0 %	0 %	60 %	40 %	237810321
21	NC_012695	TGCGC	2	10	36136	36145	0 %	20 %	40 %	40 %	237810321
22	NC_012695	GCACG	2	10	36479	36488	20 %	0 %	40 %	40 %	237810322
23	NC_012695	CGCGC	2	10	37473	37482	0 %	0 %	40 %	60 %	237810322
24	NC_012695	GGCGA	2	10	38269	38278	20 %	0 %	60 %	20 %	237810323
25	NC_012695	CTTCA	2	10	45238	45247	20 %	40 %	0 %	40 %	237810332
26	NC_012695	AGCGC	2	10	50752	50761	20 %	0 %	40 %	40 %	237810336
27	NC_012695	GCGTC	2	10	51058	51067	0 %	20 %	40 %	40 %	237810336
28	NC_012695	TCCCG	2	10	52325	52334	0 %	20 %	20 %	60 %	237810339
29	NC_012695	GGCGC	3	15	52618	52632	0 %	0 %	60 %	40 %	237810339
30	NC_012695	CGTGG	2	10	53852	53861	0 %	20 %	60 %	20 %	237810341
31	NC_012695	GCGCC	2	10	55457	55466	0 %	0 %	40 %	60 %	237810344
32	NC_012695	GCCCG	2	10	56011	56020	0 %	0 %	40 %	60 %	237810344
33	NC_012695	CAAGA	2	10	59776	59785	60 %	0 %	20 %	20 %	237810346
34	NC_012695	GCGCC	2	10	60856	60865	0 %	0 %	40 %	60 %	237810348
35	NC_012695	GCTCG	2	10	61203	61212	0 %	20 %	40 %	40 %	237810349
36	NC_012695	TGCGG	2	10	63645	63654	0 %	20 %	60 %	20 %	237810354
37	NC_012695	CGCGC	2	10	66851	66860	0 %	0 %	40 %	60 %	237810357
38	NC_012695	GTCGC	2	10	68816	68825	0 %	20 %	40 %	40 %	237810358
39	NC_012695	ACGCC	2	10	69227	69236	20 %	0 %	20 %	60 %	237810359
40	NC_012695	GCACG	2	10	71293	71302	20 %	0 %	40 %	40 %	237810361
41	NC_012695	GCTTC	2	10	71460	71469	0 %	40 %	20 %	40 %	237810361
42	NC_012695	CGTGC	2	10	73758	73767	0 %	20 %	40 %	40 %	237810363
43	NC_012695	CGCGG	2	10	74073	74082	0 %	0 %	60 %	40 %	237810364
44	NC_012695	ATCAG	2	10	74185	74194	40 %	20 %	20 %	20 %	237810364
45	NC_012695	TGCGA	2	10	74517	74526	20 %	20 %	40 %	20 %	237810364
46	NC_012695	CGAAG	2	10	75176	75185	40 %	0 %	40 %	20 %	237810364
47	NC_012695	GCGCC	2	10	78035	78044	0 %	0 %	40 %	60 %	237810367
48	NC_012695	TGCGC	2	10	80741	80750	0 %	20 %	40 %	40 %	237810369
49	NC_012695	TCGGC	2	10	80972	80981	0 %	20 %	40 %	40 %	237810369
50	NC_012695	GCGCG	2	10	81047	81056	0 %	0 %	60 %	40 %	237810369
51	NC_012695	GCCGC	2	10	82084	82093	0 %	0 %	40 %	60 %	237810370
52	NC_012695	CGACT	2	10	83360	83369	20 %	20 %	20 %	40 %	237810372
53	NC_012695	GCCGC	2	10	83504	83513	0 %	0 %	40 %	60 %	237810372
54	NC_012695	AGGCG	2	10	85924	85933	20 %	0 %	60 %	20 %	237810374
55	NC_012695	GCGCA	2	10	86910	86919	20 %	0 %	40 %	40 %	237810375
56	NC_012695	CGGGC	2	10	88510	88519	0 %	0 %	60 %	40 %	237810378
57	NC_012695	CGGCG	2	10	88546	88555	0 %	0 %	60 %	40 %	237810378
58	NC_012695	TGGCC	2	10	91008	91017	0 %	20 %	40 %	40 %	237810380
59	NC_012695	TGCGC	2	10	94488	94497	0 %	20 %	40 %	40 %	237810384
60	NC_012695	GCCGC	2	10	94943	94952	0 %	0 %	40 %	60 %	237810384
61	NC_012695	GCCGC	2	10	96591	96600	0 %	0 %	40 %	60 %	237810386
62	NC_012695	CGCGC	2	10	97378	97387	0 %	0 %	40 %	60 %	237810387
63	NC_012695	CGTGA	2	10	97410	97419	20 %	20 %	40 %	20 %	237810387
64	NC_012695	TCGCG	2	10	100111	100120	0 %	20 %	40 %	40 %	237810389
65	NC_012695	GCCGA	2	10	100155	100164	20 %	0 %	40 %	40 %	237810389
66	NC_012695	AGCGC	2	10	100716	100725	20 %	0 %	40 %	40 %	237810390
67	NC_012695	GGCCC	2	10	103035	103044	0 %	0 %	40 %	60 %	237810393
68	NC_012695	CGGCG	2	10	104603	104612	0 %	0 %	60 %	40 %	237810395
69	NC_012695	GCCGC	2	10	104691	104700	0 %	0 %	40 %	60 %	237810395
70	NC_012695	CGCGG	2	10	106090	106099	0 %	0 %	60 %	40 %	237810397
71	NC_012695	TTCGC	2	10	107727	107736	0 %	40 %	20 %	40 %	237810401
72	NC_012695	GCCGC	2	10	110790	110799	0 %	0 %	40 %	60 %	237810404
73	NC_012695	GCGCC	2	10	113725	113734	0 %	0 %	40 %	60 %	237810406
74	NC_012695	TCGCG	2	10	114222	114231	0 %	20 %	40 %	40 %	237810407
75	NC_012695	CGGCG	2	10	115404	115413	0 %	0 %	60 %	40 %	237810407
76	NC_012695	CGAGC	2	10	115670	115679	20 %	0 %	40 %	40 %	237810408
77	NC_012695	CTTCA	2	10	116731	116740	20 %	40 %	0 %	40 %	237810409
78	NC_012695	GCGTC	2	10	117626	117635	0 %	20 %	40 %	40 %	237810410
79	NC_012695	GGCCT	2	10	117993	118002	0 %	20 %	40 %	40 %	237810410
80	NC_012695	GGCCG	2	10	119903	119912	0 %	0 %	60 %	40 %	237810412
81	NC_012695	GCGCC	2	10	120817	120826	0 %	0 %	40 %	60 %	237810412
82	NC_012695	CGGCG	2	10	121376	121385	0 %	0 %	60 %	40 %	237810413
83	NC_012695	GGCGA	2	10	121903	121912	20 %	0 %	60 %	20 %	237810414
84	NC_012695	GCGCC	2	10	122858	122867	0 %	0 %	40 %	60 %	237810416
85	NC_012695	GCGCG	2	10	123827	123836	0 %	0 %	60 %	40 %	237810416
86	NC_012695	CCGCG	2	10	124213	124222	0 %	0 %	40 %	60 %	237810417
87	NC_012695	ACGCG	2	10	124409	124418	20 %	0 %	40 %	40 %	237810417
88	NC_012695	CGTGG	2	10	125070	125079	0 %	20 %	60 %	20 %	237810418
89	NC_012695	CGCGC	2	10	125718	125727	0 %	0 %	40 %	60 %	237810419
90	NC_012695	CGAGC	2	10	125743	125752	20 %	0 %	40 %	40 %	237810419
91	NC_012695	CGGCG	2	10	127681	127690	0 %	0 %	60 %	40 %	237810420
92	NC_012695	CCGGC	2	10	127953	127962	0 %	0 %	40 %	60 %	237810420
93	NC_012695	GCGAG	2	10	129126	129135	20 %	0 %	60 %	20 %	237810422
94	NC_012695	GCGCC	2	10	131299	131308	0 %	0 %	40 %	60 %	237810424
95	NC_012695	TGCCG	2	10	132453	132462	0 %	20 %	40 %	40 %	237810425
96	NC_012695	GCGCC	2	10	132607	132616	0 %	0 %	40 %	60 %	237810425
97	NC_012695	GCGCG	2	10	132876	132885	0 %	0 %	60 %	40 %	237810426
98	NC_012695	CGGCG	2	10	134610	134619	0 %	0 %	60 %	40 %	237810428
99	NC_012695	CGCGC	2	10	134643	134652	0 %	0 %	40 %	60 %	237810428
100	NC_012695	CGCGG	2	10	137030	137039	0 %	0 %	60 %	40 %	237810431
101	NC_012695	ACGAT	2	10	139593	139602	40 %	20 %	20 %	20 %	237810434
102	NC_012695	TGCGC	2	10	140785	140794	0 %	20 %	40 %	40 %	237810435
103	NC_012695	CGCGG	2	10	141238	141247	0 %	0 %	60 %	40 %	237810436
104	NC_012695	CGCGC	2	10	142909	142918	0 %	0 %	40 %	60 %	237810437
105	NC_012695	GCCGC	2	10	144254	144263	0 %	0 %	40 %	60 %	237810439
106	NC_012695	AGCGC	2	10	147332	147341	20 %	0 %	40 %	40 %	237810441
107	NC_012695	TCGCG	2	10	147785	147794	0 %	20 %	40 %	40 %	237810442
108	NC_012695	CGAGC	2	10	149522	149531	20 %	0 %	40 %	40 %	237810444
109	NC_012695	CGGCG	2	10	150046	150055	0 %	0 %	60 %	40 %	237810445
110	NC_012695	GCGCG	2	10	150120	150129	0 %	0 %	60 %	40 %	237810445
111	NC_012695	ATCGT	2	10	150750	150759	20 %	40 %	20 %	20 %	237810446
112	NC_012695	AGCCG	2	10	151654	151663	20 %	0 %	40 %	40 %	237810447
113	NC_012695	ATCGC	2	10	151869	151878	20 %	20 %	20 %	40 %	237810447
114	NC_012695	GCGCG	2	10	151922	151931	0 %	0 %	60 %	40 %	237810447
115	NC_012695	CGACG	2	10	152836	152845	20 %	0 %	40 %	40 %	237810448
116	NC_012695	CGACG	2	10	154796	154805	20 %	0 %	40 %	40 %	237810449
117	NC_012695	TCGCT	2	10	154987	154996	0 %	40 %	20 %	40 %	237810449
118	NC_012695	GCGCT	2	10	155094	155103	0 %	20 %	40 %	40 %	237810449
119	NC_012695	GTGCC	2	10	155355	155364	0 %	20 %	40 %	40 %	237810450
120	NC_012695	CGATG	2	10	155675	155684	20 %	20 %	40 %	20 %	237810450
121	NC_012695	CGCGG	2	10	155750	155759	0 %	0 %	60 %	40 %	237810450
122	NC_012695	TGCGC	2	10	156835	156844	0 %	20 %	40 %	40 %	237810451
123	NC_012695	ATTCG	2	10	160545	160554	20 %	40 %	20 %	20 %	237810457
124	NC_012695	CGCGC	2	10	160761	160770	0 %	0 %	40 %	60 %	237810457
125	NC_012695	GCGCC	2	10	160865	160874	0 %	0 %	40 %	60 %	237810457
126	NC_012695	GGCGA	2	10	167132	167141	20 %	0 %	60 %	20 %	237810465
127	NC_012695	GCGAC	2	10	168102	168111	20 %	0 %	40 %	40 %	237810466
128	NC_012695	CGCGG	2	10	170019	170028	0 %	0 %	60 %	40 %	237810468
129	NC_012695	TCCGA	2	10	170792	170801	20 %	20 %	20 %	40 %	237810468
130	NC_012695	GCTTC	2	10	170967	170976	0 %	40 %	20 %	40 %	237810468
131	NC_012695	TGCCG	2	10	175894	175903	0 %	20 %	40 %	40 %	237810473
132	NC_012695	TCGCG	2	10	176707	176716	0 %	20 %	40 %	40 %	237810474
133	NC_012695	CGCGC	2	10	176717	176726	0 %	0 %	40 %	60 %	237810474
134	NC_012695	GCGCG	2	10	177353	177362	0 %	0 %	60 %	40 %	237810476
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