MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Tolumonas auensis DSM 9187 chromosome

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012691	CAAAAG	2	12	25354	25365	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012691	GCAAGT	2	12	29423	29434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012691	TTGATC	2	12	100574	100585	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012691	TGATTT	2	12	112138	112149	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012691	GCAAGT	2	12	171925	171936	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012691	TTTTTG	2	12	174241	174252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012691	CTGAAT	2	12	200545	200556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012691	TCGGAA	2	12	205066	205077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012691	GCAAGT	2	12	208425	208436	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012691	AAAAAT	2	12	211470	211481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012691	ACAAAT	2	12	236790	236801	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012691	AAATAT	2	12	274175	274186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012691	TATTTT	2	12	363123	363134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012691	GCAAGT	2	12	368440	368451	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012691	TTGATA	2	12	418225	418236	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012691	TTTTAT	2	12	468737	468748	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012691	GCTATA	2	12	495016	495027	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012691	GAACCG	2	12	575610	575621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012691	TTAATT	2	12	582710	582721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012691	GTGTTT	2	12	630607	630618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012691	CTTTTT	2	12	637692	637703	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012691	ACCTTG	2	12	658208	658219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012691	CTGTTT	2	12	667049	667060	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012691	ACGTCA	2	12	736302	736313	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012691	CTAATC	2	12	752798	752809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012691	CTTTTT	2	12	832201	832212	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012691	GGCGCT	2	12	895569	895580	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012691	GCAAGT	2	12	913166	913177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012691	GAAAGA	2	12	994767	994778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012691	AGAAAA	2	12	1000051	1000062	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012691	CCTGAA	2	12	1000860	1000871	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012691	AGTTGT	2	12	1033404	1033415	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012691	CTATAT	2	12	1106003	1106014	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012691	CGAAAG	2	12	1173182	1173193	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012691	TTTCTG	2	12	1195880	1195891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012691	GCAGGA	2	12	1202405	1202416	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012691	AAGGGG	2	12	1216138	1216149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012691	GTATCT	2	12	1223013	1223024	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012691	CAATAC	2	12	1249295	1249306	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012691	AAATAA	2	12	1269746	1269757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012691	TTTATT	2	12	1269806	1269817	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012691	TTCAAT	2	12	1275361	1275372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012691	ACCTTA	2	12	1279838	1279849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012691	CATCTG	2	12	1298693	1298704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012691	AATATT	2	12	1314566	1314577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012691	GATCAG	2	12	1462077	1462088	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012691	GCTAAT	2	12	1519735	1519746	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012691	TTTTCA	2	12	1526659	1526670	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012691	ATATCA	2	12	1661670	1661681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012691	ATTTAA	2	12	1698942	1698953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012691	TAAAAA	2	12	1718901	1718912	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012691	ACTGTT	2	12	1750620	1750631	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012691	ACGTTC	2	12	1770591	1770602	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012691	TAAACA	2	12	1810834	1810845	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012691	ATGATA	2	12	1883915	1883926	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012691	ATTTAT	2	12	1922573	1922584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012691	CGTAAA	2	12	1967741	1967752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012691	TATGAA	2	12	1975662	1975673	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012691	AAGAGA	2	12	2005326	2005337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012691	GGAAGA	2	12	2019788	2019799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012691	GGTAGC	2	12	2030592	2030603	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012691	TATATT	2	12	2050251	2050262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012691	GATTTC	2	12	2052879	2052890	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012691	ATTAAA	2	12	2059481	2059492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012691	GAAAGG	2	12	2065157	2065168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012691	TTTTTG	2	12	2112433	2112444	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012691	AACGGC	3	18	2112508	2112525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012691	CAAAAA	2	12	2119759	2119770	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012691	TTTTGA	2	12	2283354	2283365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012691	TGCTTT	2	12	2428533	2428544	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012691	TAGCAA	2	12	2507122	2507133	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012691	AAAATC	2	12	2531274	2531285	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012691	ATTCCC	2	12	2568441	2568452	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012691	ATTCGT	2	12	2575106	2575117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012691	TACCTG	2	12	2620075	2620086	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012691	GCCGAT	2	12	2637339	2637350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012691	ACCGGG	2	12	2702037	2702048	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012691	GAATAT	2	12	2776358	2776369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012691	ACTCCC	2	12	2795027	2795038	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_012691	AATACA	2	12	2888385	2888396	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012691	GTTTGG	2	12	2930422	2930433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012691	CACTTG	2	12	2941738	2941749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012691	GAAAAT	2	12	3022788	3022799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012691	TCAGCT	2	12	3030405	3030416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012691	CACTTG	2	12	3038138	3038149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012691	TAAAAA	2	12	3062686	3062697	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012691	AAAACA	2	12	3101187	3101198	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012691	CATTAA	2	12	3161667	3161678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012691	GCTGGC	2	12	3205693	3205704	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012691	AATCAG	2	12	3233987	3233998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012691	ATGAGA	2	12	3241897	3241908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012691	CACTTG	2	12	3253698	3253709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012691	CTGTGG	2	12	3286474	3286485	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_012691	TTTTAT	2	12	3337431	3337442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012691	ACCAGA	2	12	3357557	3357568	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012691	TCAAAT	2	12	3398749	3398760	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012691	CATTAA	2	12	3403745	3403756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012691	TCTTTC	2	12	3451048	3451059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012691	AGCAAA	2	12	3462641	3462652	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.