MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Tolumonas auensis DSM 9187 chromosome

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012691	TGCAA	2	10	25233	25242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012691	AGCAA	2	10	26017	26026	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012691	TAAGT	2	10	26057	26066	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012691	TCGTG	2	10	27356	27365	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012691	AGTCG	2	10	29357	29366	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012691	AGCAA	2	10	43552	43561	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012691	GCGAA	2	10	46181	46190	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012691	TGTGT	2	10	113517	113526	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012691	TGATC	2	10	136687	136696	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012691	AATAA	2	10	168464	168473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012691	TCGTG	2	10	169858	169867	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012691	AGTCG	2	10	171859	171868	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012691	TGCCA	2	10	173446	173455	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012691	AAACC	2	10	180201	180210	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_012691	AATGA	2	10	184094	184103	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012691	TCGTG	2	10	206535	206544	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012691	AGTCG	2	10	208359	208368	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012691	TGTGA	2	10	210661	210670	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012691	AGCTA	2	10	210748	210757	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012691	GCAGA	2	10	211912	211921	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012691	TGACG	2	10	234056	234065	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012691	AAATA	2	10	258746	258755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012691	TTTAA	2	10	274030	274039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012691	TCTGT	2	10	274055	274064	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012691	AGAAA	2	10	278943	278952	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012691	AACAA	2	10	298651	298660	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012691	GATTG	2	10	338506	338515	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012691	TCGAA	2	10	340099	340108	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012691	TCGTG	2	10	366550	366559	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012691	AGTCG	2	10	368374	368383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012691	CCTGG	2	10	381532	381541	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_012691	AATAA	2	10	382274	382283	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012691	AGTGT	2	10	392453	392462	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012691	TCAAA	2	10	419605	419614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012691	GTTTT	2	10	426540	426549	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012691	GAAAA	2	10	434108	434117	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012691	CTGCA	2	10	451778	451787	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_012691	ATCAT	2	10	465706	465715	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012691	CAGGG	2	10	482518	482527	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_012691	CTTAT	2	10	503810	503819	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012691	CGAGG	2	10	516324	516333	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012691	ATGAA	2	10	518237	518246	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012691	GCGAC	2	10	519204	519213	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012691	ATGGG	2	10	531953	531962	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012691	GGGGT	2	10	541910	541919	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012691	ATCTG	2	10	545084	545093	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012691	TTGAT	2	10	570428	570437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012691	ATGCT	2	10	598720	598729	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012691	TTTTA	2	10	630289	630298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012691	GTTTG	2	10	630494	630503	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012691	ACGAG	2	10	636065	636074	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012691	CAAAA	2	10	667135	667144	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012691	TTGAA	2	10	668371	668380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012691	TGTGT	2	10	680040	680049	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012691	AATTA	2	10	681892	681901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012691	GCATG	2	10	690928	690937	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012691	TCAGA	2	10	690985	690994	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012691	GCATG	2	10	691040	691049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012691	ATAAA	2	10	707759	707768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012691	AAGGG	2	10	740481	740490	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012691	AGAAA	2	10	768021	768030	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012691	AAGGA	2	10	778945	778954	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012691	AATAA	2	10	780951	780960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012691	CTTAA	2	10	789680	789689	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012691	GGTAC	2	10	789718	789727	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_012691	GTGCG	2	10	792762	792771	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012691	CTGAA	2	10	832164	832173	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012691	CCAGG	2	10	890996	891005	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_012691	TGCCA	2	10	891097	891106	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_012691	TCGTG	2	10	911275	911284	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012691	AGTCG	2	10	913100	913109	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012691	AAATA	2	10	920421	920430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012691	AGAAC	2	10	924014	924023	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_012691	ATAAA	2	10	938444	938453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012691	AATTA	2	10	966817	966826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012691	AAAGT	2	10	981808	981817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012691	AAAAC	2	10	992408	992417	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012691	CGGGC	2	10	1009815	1009824	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_012691	GGAAA	2	10	1019345	1019354	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012691	ATCTG	2	10	1092735	1092744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012691	TGAGC	2	10	1093312	1093321	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012691	CCTTT	2	10	1094012	1094021	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_012691	AGGGA	2	10	1096056	1096065	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012691	CGCAT	2	10	1103248	1103257	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_012691	GTGTT	2	10	1108947	1108956	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012691	AGGCC	2	10	1129285	1129294	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_012691	CTTTG	2	10	1158547	1158556	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012691	TATTT	2	10	1170319	1170328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012691	CATTT	2	10	1194873	1194882	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012691	TGAAA	2	10	1202432	1202441	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012691	TTCTC	2	10	1212553	1212562	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_012691	GAACA	2	10	1215456	1215465	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012691	TAAAT	2	10	1221503	1221512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012691	AAAAG	2	10	1242725	1242734	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012691	AAAAG	2	10	1242936	1242945	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012691	GGGGC	2	10	1242959	1242968	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012691	ACAGC	2	10	1251186	1251195	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_012691	TCACA	2	10	1275350	1275359	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_012691	ACTGC	2	10	1281131	1281140	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_012691	TTTGT	2	10	1299772	1299781	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012691	TTAAG	2	10	1339983	1339992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012691	TTTCT	2	10	1372382	1372391	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012691	AGAGC	2	10	1426174	1426183	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012691	AGGGG	2	10	1436046	1436055	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012691	TTCAC	2	10	1453196	1453205	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_012691	ATTAA	2	10	1455467	1455476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012691	AACTG	2	10	1474528	1474537	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_012691	ACTGA	2	10	1474582	1474591	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012691	TAAAA	2	10	1475786	1475795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012691	ATTTT	2	10	1475857	1475866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012691	TGTCT	2	10	1476922	1476931	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012691	TCACT	2	10	1500895	1500904	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_012691	TCAGT	2	10	1504887	1504896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_012691	TCCAT	2	10	1540892	1540901	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_012691	AAAAG	2	10	1552040	1552049	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012691	ATACT	2	10	1579279	1579288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012691	CAGAA	2	10	1606211	1606220	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_012691	TGAGT	2	10	1620382	1620391	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012691	TGACC	2	10	1634690	1634699	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_012691	ATGAA	2	10	1654599	1654608	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012691	ATCTC	2	10	1663949	1663958	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_012691	ATCAG	2	10	1664240	1664249	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_012691	AGCAT	2	10	1668020	1668029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_012691	ATATG	2	10	1673824	1673833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012691	CGTCC	2	10	1675975	1675984	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_012691	AGCCA	2	10	1680001	1680010	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_012691	ATACT	2	10	1682897	1682906	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012691	CCCTG	2	10	1689450	1689459	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_012691	ATGAC	2	10	1718802	1718811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012691	TTAAT	2	10	1749364	1749373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012691	CATAG	2	10	1776330	1776339	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012691	AACTG	2	10	1788575	1788584	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012691	CACAT	2	10	1814451	1814460	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_012691	TTGTT	2	10	1851603	1851612	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012691	ACAGA	2	10	1908476	1908485	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012691	TCTGT	2	10	1908500	1908509	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012691	AACAT	2	10	1910093	1910102	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012691	CGTTT	2	10	1917730	1917739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012691	TGAAG	2	10	1919315	1919324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012691	TCTTG	2	10	1935762	1935771	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_012691	TTACC	2	10	1979403	1979412	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_012691	TTCAG	2	10	1986446	1986455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_012691	CAGAG	2	10	1994475	1994484	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_012691	ATAAA	2	10	2025441	2025450	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012691	TTTAA	2	10	2025461	2025470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012691	ATCTT	2	10	2030159	2030168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_012691	CCATT	2	10	2030281	2030290	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_012691	GAATT	2	10	2031189	2031198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012691	TTGAT	2	10	2042425	2042434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_012691	ATTTC	2	10	2050324	2050333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_012691	TTAAA	2	10	2059523	2059532	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_012691	GGATA	2	10	2080473	2080482	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_012691	CACGA	2	10	2943675	2943684	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
233	NC_012691	CATAG	2	10	2952233	2952242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
234	NC_012691	TGACC	2	10	2962461	2962470	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
235	NC_012691	TGACT	2	10	2962533	2962542	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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246	NC_012691	TCTGT	2	10	3062701	3062710	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
247	NC_012691	TTAAT	2	10	3087005	3087014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_012691	ACAGC	2	10	3089398	3089407	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
249	NC_012691	TTCGC	2	10	3125919	3125928	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
250	NC_012691	CATCA	2	10	3138134	3138143	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
251	NC_012691	AAAAT	2	10	3142238	3142247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_012691	TCTTA	2	10	3160098	3160107	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
253	NC_012691	CAGAC	2	10	3165735	3165744	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
254	NC_012691	TAAAA	2	10	3166781	3166790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_012691	GTTAT	2	10	3202890	3202899	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
256	NC_012691	AAAAC	2	10	3208308	3208317	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
257	NC_012691	CGACT	2	10	3253767	3253776	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
258	NC_012691	TAAGG	2	10	3255120	3255129	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
259	NC_012691	CACGA	2	10	3255591	3255600	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
260	NC_012691	GCTGA	2	10	3292091	3292100	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
261	NC_012691	CCGGT	2	10	3297053	3297062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_012691	TTTTA	2	10	3311067	3311076	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_012691	TTCAC	2	10	3327193	3327202	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
264	NC_012691	GAATT	2	10	3334546	3334555	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
265	NC_012691	AAACC	2	10	3345877	3345886	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
266	NC_012691	TTTAT	2	10	3357343	3357352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_012691	TGGTT	2	10	3360717	3360726	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
268	NC_012691	TTGTT	2	10	3372921	3372930	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_012691	TGCGC	2	10	3392921	3392930	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
270	NC_012691	GACAT	2	10	3413216	3413225	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
271	NC_012691	ATAAA	2	10	3446669	3446678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012691	GTGAT	2	10	3461776	3461785	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
273	NC_012691	TAAAT	2	10	3461896	3461905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.