MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT chromosome

Total Repeats: 2885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012687	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	237804349
2	NC_012687	GTTC	2	8	109	116	0 %	50 %	25 %	25 %	237804349
3	NC_012687	GCGT	2	8	294	301	0 %	25 %	50 %	25 %	237804349
4	NC_012687	AGTG	2	8	535	542	25 %	25 %	50 %	0 %	237804349
5	NC_012687	TGGC	2	8	569	576	0 %	25 %	50 %	25 %	237804349
6	NC_012687	AATG	2	8	1054	1061	50 %	25 %	25 %	0 %	237804349
7	NC_012687	CTAT	2	8	1388	1395	25 %	50 %	0 %	25 %	237804349
8	NC_012687	AAGG	2	8	1897	1904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012687	AGTA	2	8	2077	2084	50 %	25 %	25 %	0 %	237804350
10	NC_012687	ATGA	2	8	2481	2488	50 %	25 %	25 %	0 %	237804351
11	NC_012687	GATA	2	8	2519	2526	50 %	25 %	25 %	0 %	237804351
12	NC_012687	TTTC	2	8	2816	2823	0 %	75 %	0 %	25 %	237804352
13	NC_012687	CATG	2	8	3697	3704	25 %	25 %	25 %	25 %	237804352
14	NC_012687	TTCC	2	8	4002	4009	0 %	50 %	0 %	50 %	237804352
15	NC_012687	TTTA	2	8	4400	4407	25 %	75 %	0 %	0 %	237804353
16	NC_012687	ATCC	2	8	4700	4707	25 %	25 %	0 %	50 %	237804353
17	NC_012687	GACG	2	8	5447	5454	25 %	0 %	50 %	25 %	237804353
18	NC_012687	TTGG	2	8	5550	5557	0 %	50 %	50 %	0 %	237804353
19	NC_012687	TGGA	2	8	5911	5918	25 %	25 %	50 %	0 %	237804354
20	NC_012687	CTTT	2	8	6288	6295	0 %	75 %	0 %	25 %	237804354
21	NC_012687	GGGA	2	8	6803	6810	25 %	0 %	75 %	0 %	237804354
22	NC_012687	GGAG	2	8	6894	6901	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012687	GGTG	2	8	7106	7113	0 %	25 %	75 %	0 %	237804355
24	NC_012687	AAAT	2	8	7172	7179	75 %	25 %	0 %	0 %	237804355
25	NC_012687	TATG	2	8	7543	7550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012687	ATTT	2	8	7684	7691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012687	TTTG	2	8	7776	7783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012687	AAGC	2	8	8410	8417	50 %	0 %	25 %	25 %	237804356
29	NC_012687	ATTG	2	8	8808	8815	25 %	50 %	25 %	0 %	237804357
30	NC_012687	AGCG	2	8	9275	9282	25 %	0 %	50 %	25 %	237804357
31	NC_012687	AAAG	2	8	9296	9303	75 %	0 %	25 %	0 %	237804357
32	NC_012687	CTTT	2	8	9636	9643	0 %	75 %	0 %	25 %	237804357
33	NC_012687	TATT	2	8	9899	9906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012687	TTCG	2	8	10008	10015	0 %	50 %	25 %	25 %	237804358
35	NC_012687	AATT	2	8	10113	10120	50 %	50 %	0 %	0 %	237804358
36	NC_012687	ATGG	2	8	10172	10179	25 %	25 %	50 %	0 %	237804358
37	NC_012687	CTTT	2	8	10797	10804	0 %	75 %	0 %	25 %	237804359
38	NC_012687	GCAA	2	8	11014	11021	50 %	0 %	25 %	25 %	237804359
39	NC_012687	AGCC	2	8	11244	11251	25 %	0 %	25 %	50 %	237804359
40	NC_012687	GAAA	2	8	11387	11394	75 %	0 %	25 %	0 %	237804359
41	NC_012687	AGAA	2	8	11791	11798	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012687	AATG	2	8	12129	12136	50 %	25 %	25 %	0 %	237804360
43	NC_012687	GTTT	2	8	13161	13168	0 %	75 %	25 %	0 %	237804361
44	NC_012687	ATGC	2	8	13591	13598	25 %	25 %	25 %	25 %	237804361
45	NC_012687	AAGG	2	8	14026	14033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012687	TTGT	2	8	14627	14634	0 %	75 %	25 %	0 %	237804362
47	NC_012687	TTCT	2	8	14798	14805	0 %	75 %	0 %	25 %	237804362
48	NC_012687	ATTT	2	8	15004	15011	25 %	75 %	0 %	0 %	237804362
49	NC_012687	TTTC	2	8	15666	15673	0 %	75 %	0 %	25 %	237804363
50	NC_012687	AAAT	2	8	16148	16155	75 %	25 %	0 %	0 %	237804363
51	NC_012687	CAAA	2	8	16660	16667	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012687	GTAA	2	8	16990	16997	50 %	25 %	25 %	0 %	237804364
53	NC_012687	CTAA	2	8	17183	17190	50 %	25 %	0 %	25 %	237804364
54	NC_012687	AGAA	2	8	17446	17453	75 %	0 %	25 %	0 %	237804364
55	NC_012687	ATTT	2	8	17592	17599	25 %	75 %	0 %	0 %	237804364
56	NC_012687	TCAT	2	8	18796	18803	25 %	50 %	0 %	25 %	237804365
57	NC_012687	TGCG	2	8	19114	19121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012687	GAAG	2	8	20098	20105	50 %	0 %	50 %	0 %	237804366
59	NC_012687	TTTG	2	8	20124	20131	0 %	75 %	25 %	0 %	237804366
60	NC_012687	TGTA	2	8	20816	20823	25 %	50 %	25 %	0 %	237804367
61	NC_012687	CGCT	2	8	21856	21863	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012687	TTAA	2	8	21877	21884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012687	GTTA	2	8	21914	21921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012687	GATC	2	8	21969	21976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012687	GATG	2	8	22232	22239	25 %	25 %	50 %	0 %	237804368
66	NC_012687	TTCT	2	8	22930	22937	0 %	75 %	0 %	25 %	237804368
67	NC_012687	CATT	2	8	23291	23298	25 %	50 %	0 %	25 %	237804368
68	NC_012687	GCTT	2	8	23634	23641	0 %	50 %	25 %	25 %	237804368
69	NC_012687	GGTT	2	8	23682	23689	0 %	50 %	50 %	0 %	237804368
70	NC_012687	TTCT	2	8	24052	24059	0 %	75 %	0 %	25 %	237804368
71	NC_012687	TAAC	2	8	24154	24161	50 %	25 %	0 %	25 %	237804368
72	NC_012687	CATT	2	8	24277	24284	25 %	50 %	0 %	25 %	237804368
73	NC_012687	GGTA	2	8	24647	24654	25 %	25 %	50 %	0 %	237804368
74	NC_012687	TTGA	2	8	25643	25650	25 %	50 %	25 %	0 %	237804369
75	NC_012687	TTCG	2	8	25788	25795	0 %	50 %	25 %	25 %	237804369
76	NC_012687	TAGG	2	8	25867	25874	25 %	25 %	50 %	0 %	237804369
77	NC_012687	TTCC	2	8	25991	25998	0 %	50 %	0 %	50 %	237804369
78	NC_012687	TAGG	2	8	26105	26112	25 %	25 %	50 %	0 %	237804369
79	NC_012687	GCTT	2	8	26877	26884	0 %	50 %	25 %	25 %	237804369
80	NC_012687	GGAA	2	8	27460	27467	50 %	0 %	50 %	0 %	237804370
81	NC_012687	TTAA	2	8	27533	27540	50 %	50 %	0 %	0 %	237804370
82	NC_012687	AAAG	2	8	27583	27590	75 %	0 %	25 %	0 %	237804370
83	NC_012687	GGGC	2	8	27863	27870	0 %	0 %	75 %	25 %	237804370
84	NC_012687	CAGA	2	8	28168	28175	50 %	0 %	25 %	25 %	237804371
85	NC_012687	ATTG	2	8	28527	28534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012687	CTTT	2	8	30140	30147	0 %	75 %	0 %	25 %	237804373
87	NC_012687	TTTG	2	8	30155	30162	0 %	75 %	25 %	0 %	237804373
88	NC_012687	TTGT	2	8	30190	30197	0 %	75 %	25 %	0 %	237804373
89	NC_012687	TGGC	2	8	30353	30360	0 %	25 %	50 %	25 %	237804373
90	NC_012687	AAAG	2	8	30913	30920	75 %	0 %	25 %	0 %	237804374
91	NC_012687	AAAC	2	8	30983	30990	75 %	0 %	0 %	25 %	237804374
92	NC_012687	GATG	2	8	31126	31133	25 %	25 %	50 %	0 %	237804374
93	NC_012687	GATA	2	8	32235	32242	50 %	25 %	25 %	0 %	237804376
94	NC_012687	TGAT	2	8	34729	34736	25 %	50 %	25 %	0 %	237804379
95	NC_012687	AAGA	3	12	34857	34868	75 %	0 %	25 %	0 %	237804379
96	NC_012687	AAGC	2	8	35077	35084	50 %	0 %	25 %	25 %	237804380
97	NC_012687	GTTC	2	8	35110	35117	0 %	50 %	25 %	25 %	237804380
98	NC_012687	GGCA	2	8	35489	35496	25 %	0 %	50 %	25 %	237804381
99	NC_012687	TCGA	2	8	35746	35753	25 %	25 %	25 %	25 %	237804381
100	NC_012687	TGCT	2	8	35899	35906	0 %	50 %	25 %	25 %	237804381
101	NC_012687	TATG	2	8	36042	36049	25 %	50 %	25 %	0 %	237804381
102	NC_012687	TTGG	2	8	36131	36138	0 %	50 %	50 %	0 %	237804381
103	NC_012687	AGAT	2	8	36851	36858	50 %	25 %	25 %	0 %	237804381
104	NC_012687	CTTT	2	8	37224	37231	0 %	75 %	0 %	25 %	237804382
105	NC_012687	ATGA	2	8	37714	37721	50 %	25 %	25 %	0 %	237804382
106	NC_012687	TAGG	2	8	37873	37880	25 %	25 %	50 %	0 %	237804382
107	NC_012687	CAAT	2	8	38057	38064	50 %	25 %	0 %	25 %	237804382
108	NC_012687	AATG	2	8	38844	38851	50 %	25 %	25 %	0 %	237804382
109	NC_012687	AGAA	2	8	39681	39688	75 %	0 %	25 %	0 %	237804383
110	NC_012687	AAGA	2	8	39733	39740	75 %	0 %	25 %	0 %	237804383
111	NC_012687	ATCC	2	8	39741	39748	25 %	25 %	0 %	50 %	237804383
112	NC_012687	TAAT	2	8	39952	39959	50 %	50 %	0 %	0 %	237804383
113	NC_012687	GTGC	2	8	42041	42048	0 %	25 %	50 %	25 %	237804385
114	NC_012687	AGAA	2	8	42460	42467	75 %	0 %	25 %	0 %	237804385
115	NC_012687	GGAT	2	8	42612	42619	25 %	25 %	50 %	0 %	237804385
116	NC_012687	AAAC	2	8	43821	43828	75 %	0 %	0 %	25 %	237804388
117	NC_012687	CAAT	2	8	44025	44032	50 %	25 %	0 %	25 %	237804388
118	NC_012687	TGTT	2	8	44405	44412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012687	AATA	2	8	44644	44651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012687	ATTT	2	8	44782	44789	25 %	75 %	0 %	0 %	237804390
121	NC_012687	GCTC	2	8	45090	45097	0 %	25 %	25 %	50 %	237804390
122	NC_012687	TTCT	2	8	45232	45239	0 %	75 %	0 %	25 %	237804390
123	NC_012687	TTGA	2	8	45832	45839	25 %	50 %	25 %	0 %	237804391
124	NC_012687	TGTT	2	8	46004	46011	0 %	75 %	25 %	0 %	237804391
125	NC_012687	CTAT	2	8	46034	46041	25 %	50 %	0 %	25 %	237804391
126	NC_012687	TGTT	2	8	46063	46070	0 %	75 %	25 %	0 %	237804391
127	NC_012687	CTAT	2	8	46359	46366	25 %	50 %	0 %	25 %	237804391
128	NC_012687	AAGA	2	8	46854	46861	75 %	0 %	25 %	0 %	237804392
129	NC_012687	AAGA	2	8	46911	46918	75 %	0 %	25 %	0 %	237804392
130	NC_012687	AAAG	2	8	46951	46958	75 %	0 %	25 %	0 %	237804392
131	NC_012687	AAGA	2	8	47066	47073	75 %	0 %	25 %	0 %	237804392
132	NC_012687	ACTT	2	8	47327	47334	25 %	50 %	0 %	25 %	237804392
133	NC_012687	ATGG	2	8	47953	47960	25 %	25 %	50 %	0 %	237804392
134	NC_012687	AGGA	2	8	47984	47991	50 %	0 %	50 %	0 %	237804392
135	NC_012687	GAAC	2	8	48531	48538	50 %	0 %	25 %	25 %	237804392
136	NC_012687	AAGT	2	8	48566	48573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012687	AACA	2	8	48775	48782	75 %	0 %	0 %	25 %	237804393
138	NC_012687	CTTT	2	8	48971	48978	0 %	75 %	0 %	25 %	237804393
139	NC_012687	CTTT	2	8	49856	49863	0 %	75 %	0 %	25 %	237804394
140	NC_012687	GTAG	2	8	49874	49881	25 %	25 %	50 %	0 %	237804394
141	NC_012687	GAAG	2	8	51302	51309	50 %	0 %	50 %	0 %	237804395
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143	NC_012687	TATT	2	8	52658	52665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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