MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT chromosome

Total Repeats: 14160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012687	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804349
2	NC_012687	GAA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804349
3	NC_012687	GTA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804349
4	NC_012687	AGT	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804349
5	NC_012687	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804349
6	NC_012687	CAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804349
7	NC_012687	AGT	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804349
8	NC_012687	GTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804349
9	NC_012687	CAG	2	6	404	409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804349
10	NC_012687	GCC	2	6	592	597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	237804349
11	NC_012687	TGC	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804349
12	NC_012687	ATT	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804349
13	NC_012687	CGA	2	6	685	690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804349
14	NC_012687	TAT	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804349
15	NC_012687	GAA	2	6	874	879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804349
16	NC_012687	AGA	2	6	903	908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804349
17	NC_012687	AGA	2	6	957	962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804349
18	NC_012687	CAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804349
19	NC_012687	TTG	2	6	1173	1178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804349
20	NC_012687	CTC	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804349
21	NC_012687	GAT	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804349
22	NC_012687	GAT	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804349
23	NC_012687	ATG	2	6	1381	1386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804349
24	NC_012687	CCT	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804349
25	NC_012687	CTT	2	6	1601	1606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804349
26	NC_012687	CAG	2	6	1666	1671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804349
27	NC_012687	TGA	2	6	1727	1732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804349
28	NC_012687	AAG	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012687	TGG	2	6	1824	1829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012687	CTT	2	6	1831	1836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012687	ATG	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804350
32	NC_012687	GTG	2	6	1930	1935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804350
33	NC_012687	TCC	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804350
34	NC_012687	AGC	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804350
35	NC_012687	AGC	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804350
36	NC_012687	AAG	2	6	1991	1996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804350
37	NC_012687	TAC	2	6	2029	2034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804350
38	NC_012687	GCT	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804350
39	NC_012687	AAC	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804350
40	NC_012687	AGA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804350
41	NC_012687	TAA	2	6	2239	2244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012687	AGA	2	6	2405	2410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804351
43	NC_012687	ATC	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804351
44	NC_012687	TGC	2	6	2432	2437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804351
45	NC_012687	CAT	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804351
46	NC_012687	AGA	2	6	2585	2590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804351
47	NC_012687	AAG	2	6	2614	2619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804351
48	NC_012687	GGA	2	6	2649	2654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804351
49	NC_012687	ATC	2	6	2778	2783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804352
50	NC_012687	ATA	2	6	2928	2933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804352
51	NC_012687	AAC	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804352
52	NC_012687	GGT	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804352
53	NC_012687	AAT	2	6	3113	3118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804352
54	NC_012687	TTC	2	6	3148	3153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804352
55	NC_012687	GCA	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804352
56	NC_012687	GGA	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804352
57	NC_012687	CAG	2	6	3234	3239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804352
58	NC_012687	GTT	2	6	3251	3256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804352
59	NC_012687	GGT	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804352
60	NC_012687	AAG	2	6	3501	3506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804352
61	NC_012687	ATT	2	6	3563	3568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804352
62	NC_012687	TTG	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804352
63	NC_012687	AAG	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804352
64	NC_012687	AAG	2	6	3741	3746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804352
65	NC_012687	CAG	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804352
66	NC_012687	GCT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804352
67	NC_012687	AAG	2	6	4020	4025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804352
68	NC_012687	CAG	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804352
69	NC_012687	GGA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804352
70	NC_012687	AAT	2	6	4167	4172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804352
71	NC_012687	ATT	2	6	4247	4252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804353
72	NC_012687	TGA	2	6	4277	4282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804353
73	NC_012687	GTA	2	6	4509	4514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804353
74	NC_012687	AGA	2	6	4556	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804353
75	NC_012687	GAA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804353
76	NC_012687	CGT	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804353
77	NC_012687	GTT	2	6	4923	4928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804353
78	NC_012687	TGA	2	6	5060	5065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804353
79	NC_012687	TTG	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804353
80	NC_012687	TTC	2	6	5296	5301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804353
81	NC_012687	TCT	2	6	5388	5393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804353
82	NC_012687	AGA	2	6	5408	5413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804353
83	NC_012687	GTT	2	6	5435	5440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804353
84	NC_012687	GGT	2	6	5483	5488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804353
85	NC_012687	CTC	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804353
86	NC_012687	AGC	2	6	5618	5623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804353
87	NC_012687	GCA	2	6	5643	5648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012687	AGA	2	6	5670	5675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012687	ATT	2	6	5737	5742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804354
90	NC_012687	TCT	2	6	5755	5760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804354
91	NC_012687	GCT	2	6	5801	5806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804354
92	NC_012687	GAT	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804354
93	NC_012687	ACG	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804354
94	NC_012687	GAA	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804354
95	NC_012687	AGA	3	9	5975	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804354
96	NC_012687	GCT	2	6	5984	5989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804354
97	NC_012687	AGA	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804354
98	NC_012687	TGG	2	6	6029	6034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804354
99	NC_012687	AGA	3	9	6047	6055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804354
100	NC_012687	GGA	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804354
101	NC_012687	TCA	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804354
102	NC_012687	GGA	2	6	6278	6283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804354
103	NC_012687	CTT	2	6	6338	6343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804354
104	NC_012687	CTG	2	6	6344	6349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804354
105	NC_012687	CAG	2	6	6499	6504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804354
106	NC_012687	CTT	2	6	6950	6955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012687	AGG	2	6	7028	7033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804355
108	NC_012687	GAA	2	6	7072	7077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804355
109	NC_012687	GCA	2	6	7336	7341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804355
110	NC_012687	AAG	2	6	7377	7382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804355
111	NC_012687	TGC	2	6	7410	7415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804355
112	NC_012687	TTA	2	6	7742	7747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012687	GAA	2	6	7791	7796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012687	ATG	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012687	TCC	2	6	7947	7952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804356
116	NC_012687	GTT	2	6	8055	8060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804356
117	NC_012687	TTA	2	6	8425	8430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804356
118	NC_012687	TTC	2	6	8748	8753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804356
119	NC_012687	GAA	2	6	8892	8897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804357
120	NC_012687	ACC	2	6	9020	9025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237804357
121	NC_012687	CTT	2	6	9073	9078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804357
122	NC_012687	GAG	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804357
123	NC_012687	ATA	2	6	9170	9175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804357
124	NC_012687	AGG	2	6	9194	9199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804357
125	NC_012687	GAA	2	6	9374	9379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804357
126	NC_012687	CAG	2	6	9390	9395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804357
127	NC_012687	TGT	2	6	9461	9466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804357
128	NC_012687	GAG	2	6	9476	9481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804357
129	NC_012687	TAC	2	6	9544	9549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804357
130	NC_012687	GTT	2	6	9648	9653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804357
131	NC_012687	AAG	2	6	9672	9677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804357
132	NC_012687	GAG	2	6	9698	9703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804357
133	NC_012687	TTC	3	9	9765	9773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012687	ATC	2	6	9781	9786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012687	GAA	2	6	9819	9824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012687	CCT	2	6	9920	9925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_012687	TTA	2	6	9986	9991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804358
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164	NC_012687	CTT	2	6	11831	11836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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194	NC_012687	AAG	2	6	14038	14043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_012687	GAA	2	6	18962	18967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
250	NC_012687	AAT	3	9	19026	19034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_012687	TCT	2	6	19054	19059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_012687	TGC	2	6	19182	19187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804366
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256	NC_012687	TGT	2	6	19512	19517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804366
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258	NC_012687	GAA	2	6	19602	19607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804366
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