MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 2498

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012686	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	237802434
2	NC_012686	GTTC	2	8	109	116	0 %	50 %	25 %	25 %	237802434
3	NC_012686	GCGT	2	8	294	301	0 %	25 %	50 %	25 %	237802434
4	NC_012686	AGTG	2	8	541	548	25 %	25 %	50 %	0 %	237802434
5	NC_012686	TGGC	2	8	575	582	0 %	25 %	50 %	25 %	237802434
6	NC_012686	AATG	2	8	1060	1067	50 %	25 %	25 %	0 %	237802434
7	NC_012686	CTAT	2	8	1394	1401	25 %	50 %	0 %	25 %	237802434
8	NC_012686	AGTA	2	8	2083	2090	50 %	25 %	25 %	0 %	237802435
9	NC_012686	ATGA	2	8	2487	2494	50 %	25 %	25 %	0 %	237802436
10	NC_012686	GATA	2	8	2525	2532	50 %	25 %	25 %	0 %	237802436
11	NC_012686	TTTC	2	8	2822	2829	0 %	75 %	0 %	25 %	237802437
12	NC_012686	CATG	2	8	3703	3710	25 %	25 %	25 %	25 %	237802437
13	NC_012686	TTCC	2	8	4008	4015	0 %	50 %	0 %	50 %	237802437
14	NC_012686	TTTA	2	8	4406	4413	25 %	75 %	0 %	0 %	237802438
15	NC_012686	ATCC	2	8	4706	4713	25 %	25 %	0 %	50 %	237802438
16	NC_012686	GACG	2	8	5453	5460	25 %	0 %	50 %	25 %	237802438
17	NC_012686	TTGG	2	8	5556	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	237802438
18	NC_012686	TGGA	2	8	5917	5924	25 %	25 %	50 %	0 %	237802439
19	NC_012686	CTTT	2	8	6294	6301	0 %	75 %	0 %	25 %	237802439
20	NC_012686	GGGA	2	8	6809	6816	25 %	0 %	75 %	0 %	237802439
21	NC_012686	GGTG	2	8	7112	7119	0 %	25 %	75 %	0 %	237802440
22	NC_012686	AAAT	2	8	7178	7185	75 %	25 %	0 %	0 %	237802440
23	NC_012686	AAGC	2	8	8416	8423	50 %	0 %	25 %	25 %	237802441
24	NC_012686	ATTG	2	8	8814	8821	25 %	50 %	25 %	0 %	237802442
25	NC_012686	AGCG	2	8	9281	9288	25 %	0 %	50 %	25 %	237802442
26	NC_012686	AAAG	2	8	9302	9309	75 %	0 %	25 %	0 %	237802442
27	NC_012686	CTTT	2	8	9642	9649	0 %	75 %	0 %	25 %	237802442
28	NC_012686	TTCG	2	8	10014	10021	0 %	50 %	25 %	25 %	237802443
29	NC_012686	AATT	2	8	10119	10126	50 %	50 %	0 %	0 %	237802443
30	NC_012686	ATGG	2	8	10178	10185	25 %	25 %	50 %	0 %	237802443
31	NC_012686	CTTT	2	8	10803	10810	0 %	75 %	0 %	25 %	237802444
32	NC_012686	GCAA	2	8	11020	11027	50 %	0 %	25 %	25 %	237802444
33	NC_012686	AGCC	2	8	11250	11257	25 %	0 %	25 %	50 %	237802444
34	NC_012686	GAAA	2	8	11393	11400	75 %	0 %	25 %	0 %	237802444
35	NC_012686	AATG	2	8	12135	12142	50 %	25 %	25 %	0 %	237802445
36	NC_012686	GTTT	2	8	13167	13174	0 %	75 %	25 %	0 %	237802446
37	NC_012686	ATGC	2	8	13597	13604	25 %	25 %	25 %	25 %	237802446
38	NC_012686	TTGT	2	8	14633	14640	0 %	75 %	25 %	0 %	237802447
39	NC_012686	TTCT	2	8	14804	14811	0 %	75 %	0 %	25 %	237802447
40	NC_012686	ATTT	2	8	15010	15017	25 %	75 %	0 %	0 %	237802447
41	NC_012686	TTTC	2	8	15672	15679	0 %	75 %	0 %	25 %	237802448
42	NC_012686	AAAT	2	8	16154	16161	75 %	25 %	0 %	0 %	237802448
43	NC_012686	GTAA	2	8	16996	17003	50 %	25 %	25 %	0 %	237802449
44	NC_012686	CTAA	2	8	17189	17196	50 %	25 %	0 %	25 %	237802449
45	NC_012686	AGAA	2	8	17452	17459	75 %	0 %	25 %	0 %	237802449
46	NC_012686	ATTT	2	8	17598	17605	25 %	75 %	0 %	0 %	237802449
47	NC_012686	GAAG	2	8	20104	20111	50 %	0 %	50 %	0 %	237802451
48	NC_012686	TTTG	2	8	20130	20137	0 %	75 %	25 %	0 %	237802451
49	NC_012686	GATG	2	8	22238	22245	25 %	25 %	50 %	0 %	237802453
50	NC_012686	CATT	2	8	23297	23304	25 %	50 %	0 %	25 %	237802453
51	NC_012686	GCTT	2	8	23640	23647	0 %	50 %	25 %	25 %	237802453
52	NC_012686	GGTT	2	8	23688	23695	0 %	50 %	50 %	0 %	237802453
53	NC_012686	TTCT	2	8	24058	24065	0 %	75 %	0 %	25 %	237802453
54	NC_012686	TAAC	2	8	24160	24167	50 %	25 %	0 %	25 %	237802453
55	NC_012686	CATT	2	8	24283	24290	25 %	50 %	0 %	25 %	237802453
56	NC_012686	GGTA	2	8	24653	24660	25 %	25 %	50 %	0 %	237802453
57	NC_012686	TTGA	2	8	25648	25655	25 %	50 %	25 %	0 %	237802454
58	NC_012686	TTCG	2	8	25793	25800	0 %	50 %	25 %	25 %	237802454
59	NC_012686	TAGG	2	8	25872	25879	25 %	25 %	50 %	0 %	237802454
60	NC_012686	TTCC	2	8	25996	26003	0 %	50 %	0 %	50 %	237802454
61	NC_012686	TAGG	2	8	26110	26117	25 %	25 %	50 %	0 %	237802454
62	NC_012686	GCTT	2	8	26882	26889	0 %	50 %	25 %	25 %	237802454
63	NC_012686	GGAA	2	8	27465	27472	50 %	0 %	50 %	0 %	237802455
64	NC_012686	TTAA	2	8	27538	27545	50 %	50 %	0 %	0 %	237802455
65	NC_012686	AAAG	2	8	27588	27595	75 %	0 %	25 %	0 %	237802455
66	NC_012686	GGGC	2	8	27868	27875	0 %	0 %	75 %	25 %	237802455
67	NC_012686	CAGA	2	8	28173	28180	50 %	0 %	25 %	25 %	237802456
68	NC_012686	CTTT	2	8	30145	30152	0 %	75 %	0 %	25 %	237802458
69	NC_012686	TTTG	2	8	30160	30167	0 %	75 %	25 %	0 %	237802458
70	NC_012686	TTGT	2	8	30195	30202	0 %	75 %	25 %	0 %	237802458
71	NC_012686	TGGC	2	8	30358	30365	0 %	25 %	50 %	25 %	237802458
72	NC_012686	AAAG	2	8	30918	30925	75 %	0 %	25 %	0 %	237802459
73	NC_012686	AAAC	2	8	30988	30995	75 %	0 %	0 %	25 %	237802459
74	NC_012686	GATG	2	8	31131	31138	25 %	25 %	50 %	0 %	237802459
75	NC_012686	GATA	2	8	32240	32247	50 %	25 %	25 %	0 %	237802461
76	NC_012686	AATT	2	8	33940	33947	50 %	50 %	0 %	0 %	237802463
77	NC_012686	TGAT	2	8	34734	34741	25 %	50 %	25 %	0 %	237802464
78	NC_012686	AAGA	3	12	34862	34873	75 %	0 %	25 %	0 %	237802464
79	NC_012686	AAGC	2	8	35082	35089	50 %	0 %	25 %	25 %	237802465
80	NC_012686	GTTC	2	8	35115	35122	0 %	50 %	25 %	25 %	237802465
81	NC_012686	GGCA	2	8	35494	35501	25 %	0 %	50 %	25 %	237802466
82	NC_012686	TCGA	2	8	35751	35758	25 %	25 %	25 %	25 %	237802466
83	NC_012686	TGCT	2	8	35904	35911	0 %	50 %	25 %	25 %	237802466
84	NC_012686	TATG	2	8	36047	36054	25 %	50 %	25 %	0 %	237802466
85	NC_012686	TTGG	2	8	36136	36143	0 %	50 %	50 %	0 %	237802466
86	NC_012686	AGAT	2	8	36856	36863	50 %	25 %	25 %	0 %	237802466
87	NC_012686	CTTT	2	8	37229	37236	0 %	75 %	0 %	25 %	237802467
88	NC_012686	ATGA	2	8	37719	37726	50 %	25 %	25 %	0 %	237802467
89	NC_012686	TAGG	2	8	37878	37885	25 %	25 %	50 %	0 %	237802467
90	NC_012686	CAAT	2	8	38062	38069	50 %	25 %	0 %	25 %	237802467
91	NC_012686	AATG	2	8	38849	38856	50 %	25 %	25 %	0 %	237802467
92	NC_012686	AGAA	2	8	39686	39693	75 %	0 %	25 %	0 %	237802468
93	NC_012686	AAGA	2	8	39738	39745	75 %	0 %	25 %	0 %	237802468
94	NC_012686	ATCC	2	8	39746	39753	25 %	25 %	0 %	50 %	237802468
95	NC_012686	TAAT	2	8	39957	39964	50 %	50 %	0 %	0 %	237802468
96	NC_012686	GTGC	2	8	42045	42052	0 %	25 %	50 %	25 %	237802470
97	NC_012686	AGAA	2	8	42464	42471	75 %	0 %	25 %	0 %	237802470
98	NC_012686	GGAT	2	8	42616	42623	25 %	25 %	50 %	0 %	237802470
99	NC_012686	AAAC	2	8	43825	43832	75 %	0 %	0 %	25 %	237802473
100	NC_012686	CAAT	2	8	44029	44036	50 %	25 %	0 %	25 %	237802473
101	NC_012686	ATTT	2	8	44786	44793	25 %	75 %	0 %	0 %	237802475
102	NC_012686	GCTC	2	8	45094	45101	0 %	25 %	25 %	50 %	237802475
103	NC_012686	TTCT	2	8	45236	45243	0 %	75 %	0 %	25 %	237802475
104	NC_012686	TTGA	2	8	45836	45843	25 %	50 %	25 %	0 %	237802476
105	NC_012686	TGTT	2	8	46008	46015	0 %	75 %	25 %	0 %	237802476
106	NC_012686	CTAT	2	8	46038	46045	25 %	50 %	0 %	25 %	237802476
107	NC_012686	TGTT	2	8	46067	46074	0 %	75 %	25 %	0 %	237802476
108	NC_012686	CTAT	2	8	46363	46370	25 %	50 %	0 %	25 %	237802476
109	NC_012686	AAGA	2	8	46858	46865	75 %	0 %	25 %	0 %	237802477
110	NC_012686	AAGA	2	8	46915	46922	75 %	0 %	25 %	0 %	237802477
111	NC_012686	AAAG	2	8	46955	46962	75 %	0 %	25 %	0 %	237802477
112	NC_012686	AAGA	2	8	47070	47077	75 %	0 %	25 %	0 %	237802477
113	NC_012686	ACTT	2	8	47331	47338	25 %	50 %	0 %	25 %	237802477
114	NC_012686	ATGG	2	8	47957	47964	25 %	25 %	50 %	0 %	237802477
115	NC_012686	AGGA	2	8	47988	47995	50 %	0 %	50 %	0 %	237802477
116	NC_012686	GAAC	2	8	48535	48542	50 %	0 %	25 %	25 %	237802477
117	NC_012686	AACA	2	8	48779	48786	75 %	0 %	0 %	25 %	237802478
118	NC_012686	CTTT	2	8	48975	48982	0 %	75 %	0 %	25 %	237802478
119	NC_012686	CTTT	2	8	49859	49866	0 %	75 %	0 %	25 %	237802479
120	NC_012686	GTAG	2	8	49877	49884	25 %	25 %	50 %	0 %	237802479
121	NC_012686	GAAG	2	8	51305	51312	50 %	0 %	50 %	0 %	237802480
122	NC_012686	TTCA	2	8	51727	51734	25 %	50 %	0 %	25 %	237802480
123	NC_012686	GGAA	2	8	52973	52980	50 %	0 %	50 %	0 %	237802482
124	NC_012686	TTAA	2	8	53714	53721	50 %	50 %	0 %	0 %	237802482
125	NC_012686	CCTT	2	8	53921	53928	0 %	50 %	0 %	50 %	237802483
126	NC_012686	TTTA	2	8	54088	54095	25 %	75 %	0 %	0 %	237802483
127	NC_012686	AAAG	2	8	54312	54319	75 %	0 %	25 %	0 %	237802483
128	NC_012686	GATT	2	8	54449	54456	25 %	50 %	25 %	0 %	237802483
129	NC_012686	AATC	2	8	54504	54511	50 %	25 %	0 %	25 %	237802483
130	NC_012686	TATT	2	8	54565	54572	25 %	75 %	0 %	0 %	237802483
131	NC_012686	TCGA	2	8	54953	54960	25 %	25 %	25 %	25 %	237802484
132	NC_012686	CTTC	2	8	55047	55054	0 %	50 %	0 %	50 %	237802484
133	NC_012686	GAAT	2	8	55082	55089	50 %	25 %	25 %	0 %	237802484
134	NC_012686	TTGA	2	8	55152	55159	25 %	50 %	25 %	0 %	237802484
135	NC_012686	GGAA	2	8	55508	55515	50 %	0 %	50 %	0 %	237802484
136	NC_012686	TTGC	2	8	56547	56554	0 %	50 %	25 %	25 %	237802485
137	NC_012686	AGCT	2	8	57043	57050	25 %	25 %	25 %	25 %	237802485
138	NC_012686	TTTG	2	8	57349	57356	0 %	75 %	25 %	0 %	237802485
139	NC_012686	GGTT	2	8	57809	57816	0 %	50 %	50 %	0 %	237802485
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