MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 12732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012686	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802434
2	NC_012686	GAA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802434
3	NC_012686	GTA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802434
4	NC_012686	AGT	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802434
5	NC_012686	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802434
6	NC_012686	CAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802434
7	NC_012686	AGT	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802434
8	NC_012686	GTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802434
9	NC_012686	CAG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802434
10	NC_012686	GCC	2	6	598	603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	237802434
11	NC_012686	TGC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802434
12	NC_012686	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802434
13	NC_012686	CGA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802434
14	NC_012686	TAT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802434
15	NC_012686	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802434
16	NC_012686	AGA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802434
17	NC_012686	AGA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802434
18	NC_012686	CAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802434
19	NC_012686	TTG	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802434
20	NC_012686	CTC	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802434
21	NC_012686	GAT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802434
22	NC_012686	GAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802434
23	NC_012686	ATG	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802434
24	NC_012686	CCT	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802434
25	NC_012686	CTT	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802434
26	NC_012686	CAG	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802434
27	NC_012686	TGA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802434
28	NC_012686	ATG	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802435
29	NC_012686	GTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802435
30	NC_012686	TCC	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802435
31	NC_012686	AGC	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802435
32	NC_012686	AGC	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802435
33	NC_012686	AAG	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802435
34	NC_012686	TAC	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802435
35	NC_012686	GCT	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802435
36	NC_012686	AAC	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802435
37	NC_012686	AGA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802435
38	NC_012686	AGA	2	6	2411	2416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802436
39	NC_012686	ATC	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802436
40	NC_012686	TGC	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802436
41	NC_012686	CAT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802436
42	NC_012686	AGA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802436
43	NC_012686	AAG	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802436
44	NC_012686	GGA	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802436
45	NC_012686	ATC	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802437
46	NC_012686	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802437
47	NC_012686	AAC	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802437
48	NC_012686	GGT	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802437
49	NC_012686	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802437
50	NC_012686	TTC	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802437
51	NC_012686	GCA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802437
52	NC_012686	GGA	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802437
53	NC_012686	CAG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802437
54	NC_012686	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802437
55	NC_012686	GGT	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802437
56	NC_012686	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802437
57	NC_012686	ATT	2	6	3569	3574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802437
58	NC_012686	TTG	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802437
59	NC_012686	AAG	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802437
60	NC_012686	AAG	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802437
61	NC_012686	CAG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802437
62	NC_012686	GCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802437
63	NC_012686	AAG	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802437
64	NC_012686	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802437
65	NC_012686	GGA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802437
66	NC_012686	AAT	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802437
67	NC_012686	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802438
68	NC_012686	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802438
69	NC_012686	GTA	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802438
70	NC_012686	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802438
71	NC_012686	GAA	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802438
72	NC_012686	CGT	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802438
73	NC_012686	GTT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802438
74	NC_012686	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802438
75	NC_012686	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802438
76	NC_012686	TTC	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802438
77	NC_012686	TCT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802438
78	NC_012686	AGA	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802438
79	NC_012686	GTT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802438
80	NC_012686	GGT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802438
81	NC_012686	CTC	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802438
82	NC_012686	AGC	2	6	5624	5629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802438
83	NC_012686	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802439
84	NC_012686	TCT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802439
85	NC_012686	GCT	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802439
86	NC_012686	GAT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802439
87	NC_012686	ACG	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802439
88	NC_012686	GAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802439
89	NC_012686	AGA	3	9	5981	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802439
90	NC_012686	GCT	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802439
91	NC_012686	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802439
92	NC_012686	TGG	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802439
93	NC_012686	AGA	3	9	6053	6061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802439
94	NC_012686	GGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802439
95	NC_012686	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802439
96	NC_012686	GGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802439
97	NC_012686	CTT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802439
98	NC_012686	CTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802439
99	NC_012686	CAG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802439
100	NC_012686	AGG	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802440
101	NC_012686	GAA	2	6	7078	7083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802440
102	NC_012686	GCA	2	6	7342	7347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802440
103	NC_012686	AAG	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802440
104	NC_012686	TGC	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802440
105	NC_012686	TCC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802441
106	NC_012686	GTT	2	6	8061	8066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802441
107	NC_012686	TTA	2	6	8431	8436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802441
108	NC_012686	TTC	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802441
109	NC_012686	GAA	2	6	8898	8903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802442
110	NC_012686	ACC	2	6	9026	9031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237802442
111	NC_012686	CTT	2	6	9079	9084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802442
112	NC_012686	GAG	2	6	9159	9164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802442
113	NC_012686	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802442
114	NC_012686	AGG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802442
115	NC_012686	GAA	2	6	9380	9385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802442
116	NC_012686	CAG	2	6	9396	9401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802442
117	NC_012686	TGT	2	6	9467	9472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802442
118	NC_012686	GAG	2	6	9482	9487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802442
119	NC_012686	TAC	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802442
120	NC_012686	GTT	2	6	9654	9659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802442
121	NC_012686	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802442
122	NC_012686	GAG	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802442
123	NC_012686	TTA	2	6	9992	9997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802443
124	NC_012686	AGA	2	6	10027	10032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802443
125	NC_012686	TGC	2	6	10257	10262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802443
126	NC_012686	GAA	2	6	10284	10289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802443
127	NC_012686	TCG	2	6	10344	10349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802443
128	NC_012686	TGG	2	6	10367	10372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802443
129	NC_012686	GTA	2	6	10418	10423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802444
130	NC_012686	AGC	2	6	10578	10583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802444
131	NC_012686	CTT	2	6	10592	10597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802444
132	NC_012686	ATG	2	6	10753	10758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802444
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134	NC_012686	GAC	2	6	10950	10955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802444
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139	NC_012686	CGA	2	6	11224	11229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802444
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242	NC_012686	GAG	2	6	20557	20562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802452
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244	NC_012686	TCC	2	6	20798	20803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802452
245	NC_012686	ACG	2	6	20912	20917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802452
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250	NC_012686	TGG	2	6	22497	22502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802453
251	NC_012686	AGT	2	6	22550	22555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802453
252	NC_012686	GAC	2	6	22623	22628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802453
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