MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 2384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012686	GA	3	6	206	211	50 %	0 %	50 %	0 %	237802434
2	NC_012686	TC	3	6	819	824	0 %	50 %	0 %	50 %	237802434
3	NC_012686	AG	3	6	841	846	50 %	0 %	50 %	0 %	237802434
4	NC_012686	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012686	AG	3	6	2747	2752	50 %	0 %	50 %	0 %	237802437
6	NC_012686	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	237802437
7	NC_012686	AT	3	6	5108	5113	50 %	50 %	0 %	0 %	237802438
8	NC_012686	TC	3	6	5858	5863	0 %	50 %	0 %	50 %	237802439
9	NC_012686	GA	3	6	5869	5874	50 %	0 %	50 %	0 %	237802439
10	NC_012686	AT	3	6	5973	5978	50 %	50 %	0 %	0 %	237802439
11	NC_012686	TG	3	6	6126	6131	0 %	50 %	50 %	0 %	237802439
12	NC_012686	AG	3	6	6534	6539	50 %	0 %	50 %	0 %	237802439
13	NC_012686	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012686	AC	3	6	8243	8248	50 %	0 %	0 %	50 %	237802441
15	NC_012686	AG	3	6	8986	8991	50 %	0 %	50 %	0 %	237802442
16	NC_012686	CT	4	8	9105	9112	0 %	50 %	0 %	50 %	237802442
17	NC_012686	GT	3	6	9187	9192	0 %	50 %	50 %	0 %	237802442
18	NC_012686	GA	3	6	10461	10466	50 %	0 %	50 %	0 %	237802444
19	NC_012686	AG	3	6	10678	10683	50 %	0 %	50 %	0 %	237802444
20	NC_012686	TA	3	6	11843	11848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012686	AG	3	6	11903	11908	50 %	0 %	50 %	0 %	237802445
22	NC_012686	TA	3	6	12463	12468	50 %	50 %	0 %	0 %	237802445
23	NC_012686	TG	3	6	13366	13371	0 %	50 %	50 %	0 %	237802446
24	NC_012686	AG	3	6	13515	13520	50 %	0 %	50 %	0 %	237802446
25	NC_012686	TC	3	6	13649	13654	0 %	50 %	0 %	50 %	237802446
26	NC_012686	AG	4	8	13671	13678	50 %	0 %	50 %	0 %	237802446
27	NC_012686	TA	3	6	13933	13938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012686	TA	4	8	14157	14164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012686	AC	3	6	15000	15005	50 %	0 %	0 %	50 %	237802447
30	NC_012686	AG	3	6	16339	16344	50 %	0 %	50 %	0 %	237802448
31	NC_012686	TC	3	6	16379	16384	0 %	50 %	0 %	50 %	237802448
32	NC_012686	GA	3	6	16908	16913	50 %	0 %	50 %	0 %	237802449
33	NC_012686	AG	3	6	16979	16984	50 %	0 %	50 %	0 %	237802449
34	NC_012686	GA	3	6	17763	17768	50 %	0 %	50 %	0 %	237802449
35	NC_012686	AG	3	6	18109	18114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012686	GA	3	6	18122	18127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012686	GA	3	6	18366	18371	50 %	0 %	50 %	0 %	237802450
38	NC_012686	TC	3	6	18816	18821	0 %	50 %	0 %	50 %	237802450
39	NC_012686	CT	3	6	19044	19049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012686	TC	3	6	19244	19249	0 %	50 %	0 %	50 %	237802451
41	NC_012686	GA	3	6	19259	19264	50 %	0 %	50 %	0 %	237802451
42	NC_012686	GA	3	6	19358	19363	50 %	0 %	50 %	0 %	237802451
43	NC_012686	AG	3	6	19824	19829	50 %	0 %	50 %	0 %	237802451
44	NC_012686	AG	4	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	237802451
45	NC_012686	GT	3	6	20373	20378	0 %	50 %	50 %	0 %	237802451
46	NC_012686	AG	3	6	20601	20606	50 %	0 %	50 %	0 %	237802452
47	NC_012686	TG	3	6	20714	20719	0 %	50 %	50 %	0 %	237802452
48	NC_012686	AG	3	6	21110	21115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012686	GA	3	6	21268	21273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012686	AG	3	6	21785	21790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012686	CT	3	6	21854	21859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012686	CT	4	8	22511	22518	0 %	50 %	0 %	50 %	237802453
53	NC_012686	AT	3	6	22781	22786	50 %	50 %	0 %	0 %	237802453
54	NC_012686	AT	3	6	23105	23110	50 %	50 %	0 %	0 %	237802453
55	NC_012686	GA	3	6	24424	24429	50 %	0 %	50 %	0 %	237802453
56	NC_012686	GA	3	6	24516	24521	50 %	0 %	50 %	0 %	237802453
57	NC_012686	AG	3	6	24897	24902	50 %	0 %	50 %	0 %	237802453
58	NC_012686	GA	3	6	26314	26319	50 %	0 %	50 %	0 %	237802454
59	NC_012686	GT	3	6	26334	26339	0 %	50 %	50 %	0 %	237802454
60	NC_012686	TA	3	6	26536	26541	50 %	50 %	0 %	0 %	237802454
61	NC_012686	GA	3	6	26982	26987	50 %	0 %	50 %	0 %	237802454
62	NC_012686	GA	3	6	27106	27111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012686	CT	3	6	27113	27118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012686	AT	3	6	27399	27404	50 %	50 %	0 %	0 %	237802455
65	NC_012686	GA	3	6	27613	27618	50 %	0 %	50 %	0 %	237802455
66	NC_012686	TC	3	6	28481	28486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012686	AG	3	6	28564	28569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012686	TG	3	6	28987	28992	0 %	50 %	50 %	0 %	237802457
69	NC_012686	TC	3	6	29040	29045	0 %	50 %	0 %	50 %	237802457
70	NC_012686	GC	4	8	29454	29461	0 %	0 %	50 %	50 %	237802457
71	NC_012686	TA	3	6	29576	29581	50 %	50 %	0 %	0 %	237802457
72	NC_012686	GA	3	6	30527	30532	50 %	0 %	50 %	0 %	237802458
73	NC_012686	AG	3	6	30625	30630	50 %	0 %	50 %	0 %	237802459
74	NC_012686	TC	3	6	30734	30739	0 %	50 %	0 %	50 %	237802459
75	NC_012686	GA	3	6	31355	31360	50 %	0 %	50 %	0 %	237802459
76	NC_012686	GA	3	6	31823	31828	50 %	0 %	50 %	0 %	237802459
77	NC_012686	AT	3	6	31964	31969	50 %	50 %	0 %	0 %	237802460
78	NC_012686	TC	3	6	32249	32254	0 %	50 %	0 %	50 %	237802461
79	NC_012686	GC	3	6	32679	32684	0 %	0 %	50 %	50 %	237802461
80	NC_012686	CT	3	6	32729	32734	0 %	50 %	0 %	50 %	237802461
81	NC_012686	AG	3	6	32861	32866	50 %	0 %	50 %	0 %	237802461
82	NC_012686	TC	3	6	34357	34362	0 %	50 %	0 %	50 %	237802463
83	NC_012686	AG	3	6	34370	34375	50 %	0 %	50 %	0 %	237802463
84	NC_012686	AG	3	6	34508	34513	50 %	0 %	50 %	0 %	237802464
85	NC_012686	GA	4	8	35200	35207	50 %	0 %	50 %	0 %	237802465
86	NC_012686	GA	4	8	35224	35231	50 %	0 %	50 %	0 %	237802465
87	NC_012686	GT	3	6	36623	36628	0 %	50 %	50 %	0 %	237802466
88	NC_012686	GA	3	6	36977	36982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012686	AT	3	6	37079	37084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012686	GA	3	6	37127	37132	50 %	0 %	50 %	0 %	237802467
91	NC_012686	CT	3	6	37611	37616	0 %	50 %	0 %	50 %	237802467
92	NC_012686	AG	3	6	38122	38127	50 %	0 %	50 %	0 %	237802467
93	NC_012686	AG	3	6	38668	38673	50 %	0 %	50 %	0 %	237802467
94	NC_012686	AG	3	6	39195	39200	50 %	0 %	50 %	0 %	237802467
95	NC_012686	CT	3	6	39346	39351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012686	GA	3	6	39979	39984	50 %	0 %	50 %	0 %	237802468
97	NC_012686	AG	3	6	40116	40121	50 %	0 %	50 %	0 %	237802468
98	NC_012686	AG	3	6	40216	40221	50 %	0 %	50 %	0 %	237802468
99	NC_012686	CT	3	6	40716	40721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012686	AG	3	6	41192	41197	50 %	0 %	50 %	0 %	237802469
101	NC_012686	GC	3	6	41241	41246	0 %	0 %	50 %	50 %	237802469
102	NC_012686	GA	3	6	41406	41411	50 %	0 %	50 %	0 %	237802469
103	NC_012686	TC	3	6	41415	41420	0 %	50 %	0 %	50 %	237802469
104	NC_012686	GC	3	6	41480	41485	0 %	0 %	50 %	50 %	237802469
105	NC_012686	GA	3	6	41620	41625	50 %	0 %	50 %	0 %	237802469
106	NC_012686	GT	3	6	42058	42063	0 %	50 %	50 %	0 %	237802470
107	NC_012686	GA	3	6	42596	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	237802470
108	NC_012686	GA	4	8	42606	42613	50 %	0 %	50 %	0 %	237802470
109	NC_012686	AG	3	6	42842	42847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012686	CT	3	6	42908	42913	0 %	50 %	0 %	50 %	237802471
111	NC_012686	GA	5	10	43184	43193	50 %	0 %	50 %	0 %	237802471
112	NC_012686	AC	3	6	44066	44071	50 %	0 %	0 %	50 %	237802473
113	NC_012686	TC	3	6	44235	44240	0 %	50 %	0 %	50 %	237802473
114	NC_012686	TC	3	6	44400	44405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012686	TA	3	6	44553	44558	50 %	50 %	0 %	0 %	237802474
116	NC_012686	TC	3	6	45465	45470	0 %	50 %	0 %	50 %	237802475
117	NC_012686	GA	3	6	45948	45953	50 %	0 %	50 %	0 %	237802476
118	NC_012686	TG	3	6	46166	46171	0 %	50 %	50 %	0 %	237802476
119	NC_012686	AG	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	237802476
120	NC_012686	AG	4	8	46618	46625	50 %	0 %	50 %	0 %	237802477
121	NC_012686	CT	3	6	46809	46814	0 %	50 %	0 %	50 %	237802477
122	NC_012686	TG	3	6	47010	47015	0 %	50 %	50 %	0 %	237802477
123	NC_012686	AG	3	6	47063	47068	50 %	0 %	50 %	0 %	237802477
124	NC_012686	AG	3	6	48635	48640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012686	AG	3	6	49986	49991	50 %	0 %	50 %	0 %	237802479
126	NC_012686	CA	3	6	50652	50657	50 %	0 %	0 %	50 %	237802480
127	NC_012686	TG	4	8	51981	51988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012686	TC	3	6	53466	53471	0 %	50 %	0 %	50 %	237802482
129	NC_012686	CA	3	6	53517	53522	50 %	0 %	0 %	50 %	237802482
130	NC_012686	GA	3	6	53938	53943	50 %	0 %	50 %	0 %	237802483
131	NC_012686	CT	3	6	54255	54260	0 %	50 %	0 %	50 %	237802483
132	NC_012686	CT	3	6	54918	54923	0 %	50 %	0 %	50 %	237802484
133	NC_012686	AT	3	6	56126	56131	50 %	50 %	0 %	0 %	237802484
134	NC_012686	GA	3	6	56163	56168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012686	AG	3	6	56587	56592	50 %	0 %	50 %	0 %	237802485
136	NC_012686	CT	3	6	57049	57054	0 %	50 %	0 %	50 %	237802485
137	NC_012686	GT	3	6	57099	57104	0 %	50 %	50 %	0 %	237802485
138	NC_012686	TG	3	6	57800	57805	0 %	50 %	50 %	0 %	237802485
139	NC_012686	CT	3	6	58687	58692	0 %	50 %	0 %	50 %	237802486
140	NC_012686	GA	3	6	60247	60252	50 %	0 %	50 %	0 %	237802487
141	NC_012686	GT	3	6	60385	60390	0 %	50 %	50 %	0 %	237802487
142	NC_012686	TC	3	6	61133	61138	0 %	50 %	0 %	50 %	237802488
143	NC_012686	GA	3	6	61361	61366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012686	CA	3	6	61759	61764	50 %	0 %	0 %	50 %	237802489
145	NC_012686	AT	3	6	62009	62014	50 %	50 %	0 %	0 %	237802489
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