MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 365

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012686	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012686	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012686	TA	3	6	11843	11848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012686	TA	3	6	13933	13938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012686	TA	4	8	14157	14164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012686	AG	3	6	18109	18114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012686	GA	3	6	18122	18127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012686	CT	3	6	19044	19049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012686	AG	3	6	21110	21115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012686	GA	3	6	21268	21273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012686	AG	3	6	21785	21790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012686	CT	3	6	21854	21859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012686	GA	3	6	27106	27111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012686	CT	3	6	27113	27118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012686	TC	3	6	28481	28486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012686	AG	3	6	28564	28569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012686	GA	3	6	36977	36982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012686	AT	3	6	37079	37084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012686	CT	3	6	39346	39351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012686	CT	3	6	40716	40721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012686	AG	3	6	42842	42847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012686	TC	3	6	44400	44405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012686	AG	3	6	48635	48640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012686	TG	4	8	51981	51988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012686	GA	3	6	56163	56168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012686	GA	3	6	61361	61366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012686	AG	4	8	65383	65390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012686	CT	3	6	68595	68600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012686	TA	3	6	69714	69719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012686	CT	3	6	72450	72455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012686	GA	3	6	82261	82266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012686	GA	3	6	83152	83157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012686	GA	3	6	83472	83477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012686	TA	3	6	85810	85815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012686	GA	3	6	91163	91168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012686	CT	3	6	93513	93518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012686	GA	3	6	93999	94004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012686	GA	3	6	94041	94046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012686	TA	3	6	94658	94663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012686	TC	3	6	100540	100545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012686	AT	3	6	100591	100596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012686	TA	3	6	107270	107275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012686	TG	3	6	116513	116518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012686	AG	4	8	119100	119107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012686	GA	3	6	120922	120927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012686	TG	3	6	121181	121186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012686	CT	3	6	121806	121811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012686	TC	3	6	122718	122723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012686	GA	3	6	123048	123053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012686	TA	3	6	123156	123161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012686	GT	3	6	124146	124151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012686	CT	3	6	128680	128685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012686	TC	3	6	131002	131007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012686	AG	3	6	131079	131084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012686	AG	3	6	131104	131109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012686	TG	3	6	133911	133916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012686	AG	3	6	138749	138754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012686	GA	3	6	138812	138817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012686	AT	3	6	143044	143049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012686	AG	3	6	153397	153402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012686	AG	3	6	153823	153828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012686	AG	3	6	157848	157853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012686	TC	3	6	172312	172317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012686	AG	3	6	172444	172449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012686	CT	3	6	172462	172467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012686	TG	3	6	178951	178956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012686	TA	3	6	180675	180680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012686	AG	3	6	181036	181041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012686	CT	3	6	183661	183666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012686	GA	4	8	183703	183710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012686	GA	3	6	183907	183912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012686	TA	3	6	184150	184155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012686	GA	3	6	184263	184268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012686	GA	3	6	184366	184371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012686	TC	3	6	184773	184778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012686	GA	3	6	185004	185009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012686	AG	3	6	185700	185705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012686	AT	3	6	194416	194421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012686	TA	3	6	196548	196553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012686	GT	3	6	196623	196628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012686	GA	3	6	196803	196808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012686	AT	3	6	197587	197592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012686	AG	3	6	198884	198889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012686	TC	3	6	201875	201880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012686	AG	3	6	203707	203712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012686	CT	3	6	203719	203724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012686	CT	3	6	205633	205638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012686	GA	4	8	208692	208699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012686	CT	4	8	208740	208747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012686	AG	4	8	220010	220017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012686	TA	3	6	221564	221569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012686	CT	3	6	223205	223210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012686	TC	3	6	226206	226211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012686	AG	3	6	226237	226242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012686	TC	3	6	240437	240442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012686	AG	3	6	240463	240468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012686	CA	3	6	245389	245394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012686	GT	3	6	245606	245611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012686	GA	3	6	252470	252475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012686	TG	3	6	252580	252585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012686	AG	3	6	253382	253387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012686	AG	3	6	254391	254396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012686	TA	3	6	256191	256196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012686	CA	3	6	257293	257298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012686	AG	3	6	258470	258475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012686	TC	3	6	258496	258501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012686	AG	3	6	259973	259978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012686	TA	3	6	266336	266341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012686	CA	3	6	268143	268148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012686	TC	3	6	270043	270048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_012686	TA	3	6	275596	275601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012686	AT	4	8	286154	286161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012686	CT	3	6	287006	287011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012686	TC	4	8	287097	287104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012686	TC	3	6	288788	288793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012686	TC	3	6	288845	288850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012686	CT	3	6	289318	289323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012686	AT	3	6	301334	301339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012686	CA	3	6	303663	303668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012686	GA	3	6	308394	308399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012686	AG	3	6	317600	317605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012686	CT	3	6	349549	349554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012686	CT	3	6	352620	352625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012686	TC	3	6	356846	356851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012686	TC	3	6	360676	360681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012686	CT	3	6	360762	360767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012686	AC	3	6	364095	364100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012686	GA	3	6	366005	366010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012686	TC	3	6	366083	366088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012686	TA	3	6	366284	366289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012686	GC	3	6	367813	367818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012686	TC	3	6	368117	368122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012686	TA	3	6	368187	368192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012686	AC	3	6	368924	368929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012686	CT	4	8	369096	369103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012686	CT	3	6	369329	369334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012686	CA	3	6	369338	369343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012686	GT	3	6	369662	369667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012686	CT	4	8	383430	383437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012686	GA	3	6	388137	388142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012686	CG	3	6	393268	393273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012686	CA	3	6	394318	394323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012686	TC	3	6	396865	396870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012686	CT	3	6	397355	397360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012686	GA	3	6	397485	397490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012686	GA	3	6	397616	397621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012686	CT	3	6	411711	411716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012686	CT	3	6	412695	412700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_012686	TC	3	6	429429	429434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_012686	AT	3	6	429481	429486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012686	CT	3	6	429972	429977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012686	AG	4	8	430183	430190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012686	CT	3	6	431422	431427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_012686	CT	3	6	432445	432450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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156	NC_012686	GA	3	6	434487	434492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.