MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 2019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012686	GA	3	6	206	211	50 %	0 %	50 %	0 %	237802434
2	NC_012686	TC	3	6	819	824	0 %	50 %	0 %	50 %	237802434
3	NC_012686	AG	3	6	841	846	50 %	0 %	50 %	0 %	237802434
4	NC_012686	AG	3	6	2747	2752	50 %	0 %	50 %	0 %	237802437
5	NC_012686	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	237802437
6	NC_012686	AT	3	6	5108	5113	50 %	50 %	0 %	0 %	237802438
7	NC_012686	TC	3	6	5858	5863	0 %	50 %	0 %	50 %	237802439
8	NC_012686	GA	3	6	5869	5874	50 %	0 %	50 %	0 %	237802439
9	NC_012686	AT	3	6	5973	5978	50 %	50 %	0 %	0 %	237802439
10	NC_012686	TG	3	6	6126	6131	0 %	50 %	50 %	0 %	237802439
11	NC_012686	AG	3	6	6534	6539	50 %	0 %	50 %	0 %	237802439
12	NC_012686	AC	3	6	8243	8248	50 %	0 %	0 %	50 %	237802441
13	NC_012686	AG	3	6	8986	8991	50 %	0 %	50 %	0 %	237802442
14	NC_012686	CT	4	8	9105	9112	0 %	50 %	0 %	50 %	237802442
15	NC_012686	GT	3	6	9187	9192	0 %	50 %	50 %	0 %	237802442
16	NC_012686	GA	3	6	10461	10466	50 %	0 %	50 %	0 %	237802444
17	NC_012686	AG	3	6	10678	10683	50 %	0 %	50 %	0 %	237802444
18	NC_012686	AG	3	6	11903	11908	50 %	0 %	50 %	0 %	237802445
19	NC_012686	TA	3	6	12463	12468	50 %	50 %	0 %	0 %	237802445
20	NC_012686	TG	3	6	13366	13371	0 %	50 %	50 %	0 %	237802446
21	NC_012686	AG	3	6	13515	13520	50 %	0 %	50 %	0 %	237802446
22	NC_012686	TC	3	6	13649	13654	0 %	50 %	0 %	50 %	237802446
23	NC_012686	AG	4	8	13671	13678	50 %	0 %	50 %	0 %	237802446
24	NC_012686	AC	3	6	15000	15005	50 %	0 %	0 %	50 %	237802447
25	NC_012686	AG	3	6	16339	16344	50 %	0 %	50 %	0 %	237802448
26	NC_012686	TC	3	6	16379	16384	0 %	50 %	0 %	50 %	237802448
27	NC_012686	GA	3	6	16908	16913	50 %	0 %	50 %	0 %	237802449
28	NC_012686	AG	3	6	16979	16984	50 %	0 %	50 %	0 %	237802449
29	NC_012686	GA	3	6	17763	17768	50 %	0 %	50 %	0 %	237802449
30	NC_012686	GA	3	6	18366	18371	50 %	0 %	50 %	0 %	237802450
31	NC_012686	TC	3	6	18816	18821	0 %	50 %	0 %	50 %	237802450
32	NC_012686	TC	3	6	19244	19249	0 %	50 %	0 %	50 %	237802451
33	NC_012686	GA	3	6	19259	19264	50 %	0 %	50 %	0 %	237802451
34	NC_012686	GA	3	6	19358	19363	50 %	0 %	50 %	0 %	237802451
35	NC_012686	AG	3	6	19824	19829	50 %	0 %	50 %	0 %	237802451
36	NC_012686	AG	4	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	237802451
37	NC_012686	GT	3	6	20373	20378	0 %	50 %	50 %	0 %	237802451
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39	NC_012686	TG	3	6	20714	20719	0 %	50 %	50 %	0 %	237802452
40	NC_012686	CT	4	8	22511	22518	0 %	50 %	0 %	50 %	237802453
41	NC_012686	AT	3	6	22781	22786	50 %	50 %	0 %	0 %	237802453
42	NC_012686	AT	3	6	23105	23110	50 %	50 %	0 %	0 %	237802453
43	NC_012686	GA	3	6	24424	24429	50 %	0 %	50 %	0 %	237802453
44	NC_012686	GA	3	6	24516	24521	50 %	0 %	50 %	0 %	237802453
45	NC_012686	AG	3	6	24897	24902	50 %	0 %	50 %	0 %	237802453
46	NC_012686	GA	3	6	26314	26319	50 %	0 %	50 %	0 %	237802454
47	NC_012686	GT	3	6	26334	26339	0 %	50 %	50 %	0 %	237802454
48	NC_012686	TA	3	6	26536	26541	50 %	50 %	0 %	0 %	237802454
49	NC_012686	GA	3	6	26982	26987	50 %	0 %	50 %	0 %	237802454
50	NC_012686	AT	3	6	27399	27404	50 %	50 %	0 %	0 %	237802455
51	NC_012686	GA	3	6	27613	27618	50 %	0 %	50 %	0 %	237802455
52	NC_012686	TG	3	6	28987	28992	0 %	50 %	50 %	0 %	237802457
53	NC_012686	TC	3	6	29040	29045	0 %	50 %	0 %	50 %	237802457
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55	NC_012686	TA	3	6	29576	29581	50 %	50 %	0 %	0 %	237802457
56	NC_012686	GA	3	6	30527	30532	50 %	0 %	50 %	0 %	237802458
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59	NC_012686	GA	3	6	31355	31360	50 %	0 %	50 %	0 %	237802459
60	NC_012686	GA	3	6	31823	31828	50 %	0 %	50 %	0 %	237802459
61	NC_012686	AT	3	6	31964	31969	50 %	50 %	0 %	0 %	237802460
62	NC_012686	TC	3	6	32249	32254	0 %	50 %	0 %	50 %	237802461
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68	NC_012686	AG	3	6	34508	34513	50 %	0 %	50 %	0 %	237802464
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70	NC_012686	GA	4	8	35224	35231	50 %	0 %	50 %	0 %	237802465
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74	NC_012686	AG	3	6	38122	38127	50 %	0 %	50 %	0 %	237802467
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105	NC_012686	CA	3	6	53517	53522	50 %	0 %	0 %	50 %	237802482
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111	NC_012686	CT	3	6	57049	57054	0 %	50 %	0 %	50 %	237802485
112	NC_012686	GT	3	6	57099	57104	0 %	50 %	50 %	0 %	237802485
113	NC_012686	TG	3	6	57800	57805	0 %	50 %	50 %	0 %	237802485
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121	NC_012686	GA	3	6	62158	62163	50 %	0 %	50 %	0 %	237802489
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133	NC_012686	GA	3	6	65876	65881	50 %	0 %	50 %	0 %	237802491
134	NC_012686	CT	3	6	65916	65921	0 %	50 %	0 %	50 %	237802491
135	NC_012686	AG	3	6	66498	66503	50 %	0 %	50 %	0 %	237802492
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138	NC_012686	AG	3	6	67138	67143	50 %	0 %	50 %	0 %	237802492
139	NC_012686	GA	3	6	67511	67516	50 %	0 %	50 %	0 %	237802492
140	NC_012686	AT	3	6	69776	69781	50 %	50 %	0 %	0 %	237802494
141	NC_012686	TC	3	6	70011	70016	0 %	50 %	0 %	50 %	237802494
142	NC_012686	CT	3	6	70328	70333	0 %	50 %	0 %	50 %	237802494
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