MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Beutenbergia cavernae DSM 12333 chromosome

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012669	TGTGAG	2	12	24935	24946	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012669	GGCCCA	2	12	63161	63172	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012669	GCACCT	2	12	67712	67723	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012669	GTCGCC	2	12	94731	94742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012669	AGCACC	2	12	102232	102243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012669	GGGAGG	2	12	157044	157055	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012669	GGGAGG	2	12	157109	157120	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012669	CGCGAC	2	12	221900	221911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012669	GGGGTT	2	12	230895	230906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012669	CCGACA	2	12	230943	230954	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012669	ACGTTG	2	12	231765	231776	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012669	GCCGCG	2	12	249083	249094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012669	GGCGAC	2	12	269248	269259	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012669	CCAGGT	2	12	269289	269300	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012669	TGCGGG	2	12	280965	280976	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012669	GGGGTG	2	12	297935	297946	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012669	GGGGTG	2	12	298187	298198	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012669	GGGGTG	2	12	298249	298260	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012669	GCCGGC	3	18	303653	303670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012669	CCGACC	2	12	331736	331747	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012669	TGCCGG	2	12	368936	368947	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012669	TGGGTG	2	12	374474	374485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012669	TCCGGC	2	12	407078	407089	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012669	GCTCGG	2	12	430145	430156	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012669	GGCCGA	2	12	459078	459089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012669	AGCTCG	2	12	465348	465359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012669	CGCACT	2	12	491581	491592	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012669	CGGCGA	2	12	499460	499471	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012669	CGGCGA	2	12	505845	505856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012669	CCTCGC	2	12	515721	515732	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_012669	CGGCCA	2	12	518834	518845	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012669	CGGCGC	2	12	561696	561707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012669	TGGCGC	2	12	566535	566546	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012669	CGCCGG	2	12	573676	573687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012669	CGGCCG	2	12	669335	669346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012669	CGTGGC	2	12	689190	689201	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012669	CGGGCG	2	12	689271	689282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012669	CTGGTG	6	36	689552	689587	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012669	CCCGCT	2	12	715239	715250	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012669	CACGCC	2	12	724930	724941	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012669	CGGGCG	2	12	742881	742892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012669	ACGGCG	2	12	750539	750550	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012669	GGCGTG	2	12	751022	751033	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012669	GGAATA	2	12	796865	796876	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012669	CGGCCC	2	12	816996	817007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012669	GGCGCC	2	12	817015	817026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012669	GGTGCG	3	18	822956	822973	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012669	GCCCGG	2	12	859929	859940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012669	GGTCCG	2	12	873614	873625	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012669	GCCGAT	2	12	916636	916647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012669	ATCGGG	2	12	960925	960936	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012669	GCTCCG	2	12	972854	972865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012669	CGGATG	2	12	1008728	1008739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012669	GCCCTG	2	12	1088754	1088765	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012669	CGTCGG	2	12	1118984	1118995	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012669	GCCACG	2	12	1163583	1163594	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012669	CCGGCC	2	12	1163856	1163867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012669	CGGCAC	2	12	1164369	1164380	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012669	CGGGCG	2	12	1237993	1238004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012669	ACCCGC	2	12	1339039	1339050	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_012669	GTCGAC	2	12	1339106	1339117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012669	CCGACG	2	12	1379915	1379926	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012669	TCGCTG	3	18	1391037	1391054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012669	GAGGTG	2	12	1399689	1399700	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012669	GAGGTG	2	12	1400935	1400946	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012669	GAGGTG	2	12	1401120	1401131	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012669	GCGGAG	2	12	1423191	1423202	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012669	CTTGCG	2	12	1437378	1437389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012669	CCTGGT	2	12	1467640	1467651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012669	GGCACA	2	12	1485408	1485419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012669	GGTCGC	2	12	1506277	1506288	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012669	GCGAGC	2	12	1518741	1518752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012669	GGAGCA	2	12	1527205	1527216	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012669	TCGCCG	2	12	1598789	1598800	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012669	GCCACG	2	12	1610770	1610781	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012669	TGGCGA	2	12	1684261	1684272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012669	CGGGCT	2	12	1686578	1686589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012669	GGCGCG	2	12	1711940	1711951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012669	CCCGGA	2	12	1715306	1715317	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012669	CGGCGT	2	12	1824770	1824781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012669	GCGGGT	2	12	1848348	1848359	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012669	CCCGGC	2	12	1889758	1889769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_012669	GCTCCC	2	12	1949979	1949990	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012669	ACGGGC	2	12	2069927	2069938	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012669	CCCGGT	2	12	2071268	2071279	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012669	TCGTGC	2	12	2078695	2078706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012669	CGCCGA	2	12	2082455	2082466	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012669	TCCGCG	2	12	2088896	2088907	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012669	ACCTCG	2	12	2105384	2105395	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012669	GCCGTC	2	12	2209141	2209152	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012669	CCGTTC	2	12	2219606	2219617	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012669	ACGAGC	2	12	2243317	2243328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012669	CGTGGC	2	12	2245446	2245457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012669	ACCGCG	2	12	2258436	2258447	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012669	CCGGCG	2	12	2294486	2294497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012669	GGACCC	2	12	2357469	2357480	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012669	CGTGGA	3	18	2357609	2357626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012669	TCCTCG	2	12	2389273	2389284	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012669	GGCGAG	2	12	2408604	2408615	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012669	CCCCCG	2	12	2414308	2414319	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
101	NC_012669	GCCGTC	2	12	2459502	2459513	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012669	GCGAGC	2	12	2479194	2479205	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012669	CCGCGA	2	12	2479360	2479371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012669	CGCGGC	2	12	2549628	2549639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012669	GAGCGT	2	12	2625763	2625774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012669	CCGGGC	2	12	2773078	2773089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012669	GAGCGC	2	12	2806954	2806965	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012669	GCACGG	2	12	2807098	2807109	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012669	CGGACT	2	12	2807424	2807435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012669	CCTCAC	2	12	2810807	2810818	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_012669	ACGCGC	2	12	2817885	2817896	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012669	CCTCCA	2	12	2820408	2820419	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_012669	GATGCC	2	12	2850824	2850835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012669	GATCTC	2	12	2850836	2850847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012669	TCGGCG	2	12	2851107	2851118	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012669	GCCGAC	2	12	2851274	2851285	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012669	ACGCCG	2	12	2891104	2891115	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012669	CGCGGC	2	12	2915016	2915027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012669	GGCTCC	2	12	2949494	2949505	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012669	GTGCGC	2	12	2965672	2965683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012669	ACCGGC	2	12	2969521	2969532	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012669	CGGCGT	2	12	2977110	2977121	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012669	CGCGAG	2	12	2977211	2977222	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012669	CCCACC	2	12	2990429	2990440	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
125	NC_012669	CCTGGC	2	12	3024899	3024910	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012669	CGGGCG	2	12	3057806	3057817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012669	CGTCCG	2	12	3153900	3153911	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012669	CTCCGC	2	12	3194775	3194786	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_012669	GGAAGC	2	12	3222032	3222043	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_012669	GGTCGG	2	12	3222070	3222081	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_012669	GAGCCG	2	12	3244966	3244977	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012669	CGCCAG	2	12	3246927	3246938	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012669	CCGGCG	2	12	3340288	3340299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012669	GCGGGC	2	12	3386518	3386529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012669	CGACGC	2	12	3437279	3437290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012669	CGACGC	2	12	3437342	3437353	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012669	CCGGCG	2	12	3470233	3470244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012669	CGCCAG	2	12	3482865	3482876	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012669	TCGCAC	2	12	3495621	3495632	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012669	GCGGGG	2	12	3539462	3539473	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_012669	GCGACG	2	12	3557994	3558005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_012669	GCGACG	2	12	3562163	3562174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012669	TCCGCA	2	12	3588810	3588821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
144	NC_012669	ACGACC	2	12	3667511	3667522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012669	ATCCGA	2	12	3717756	3717767	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_012669	GCACCG	2	12	3718296	3718307	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012669	CAGGAC	2	12	3734501	3734512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_012669	TTGACG	2	12	3741879	3741890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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151	NC_012669	CGAACC	2	12	3745649	3745660	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012669	CGACCC	2	12	3745752	3745763	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_012669	CCGGGC	2	12	3786925	3786936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_012669	ACGGCG	2	12	3793376	3793387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_012669	GCCGGA	2	12	3824337	3824348	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_012669	GGCCAC	2	12	3868639	3868650	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
157	NC_012669	TGCGGC	2	12	3874373	3874384	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_012669	GACCCG	3	18	3878525	3878542	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
159	NC_012669	GACCCG	2	12	3878549	3878560	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
160	NC_012669	CCGGGA	7	42	3944805	3944846	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_012669	CCCGGC	2	12	3967366	3967377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_012669	CACCGG	2	12	3996550	3996561	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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164	NC_012669	GACCCG	2	12	4046610	4046621	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
165	NC_012669	GCGTCC	2	12	4069115	4069126	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
166	NC_012669	ACGTCA	2	12	4111333	4111344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_012669	GGTGGG	2	12	4155648	4155659	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_012669	CCGCAC	2	12	4661584	4661595	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_012669	CCACAC	2	12	4661596	4661607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_012669	CCGCAC	2	12	4661608	4661619	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_012669	CACCGG	9	54	4661621	4661674	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.