MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Beutenbergia cavernae DSM 12333 chromosome

Total Repeats: 508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012669	CGCGG	2	10	6172	6181	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012669	CGCCC	2	10	6184	6193	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_012669	TCGGC	2	10	21671	21680	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_012669	GGCCG	2	10	21722	21731	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012669	GGTGC	2	10	33854	33863	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012669	GGGTG	2	10	34054	34063	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012669	GCCGC	2	10	46547	46556	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_012669	CGCGC	2	10	49170	49179	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_012669	CGGGC	2	10	49196	49205	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012669	GCGGT	2	10	53535	53544	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012669	CCGCA	2	10	56416	56425	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_012669	ACGCC	2	10	56450	56459	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_012669	ACGCC	2	10	56489	56498	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_012669	ACGCC	2	10	56509	56518	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_012669	CGGCG	2	10	68408	68417	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_012669	CGAGA	2	10	84158	84167	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012669	CGGAG	2	10	84524	84533	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012669	TCGCC	2	10	86091	86100	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_012669	CGGGC	2	10	98313	98322	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_012669	AGGCG	2	10	106756	106765	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012669	TGGTC	2	10	109309	109318	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012669	TCGAT	2	10	109341	109350	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012669	TCCGC	2	10	120195	120204	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_012669	AGGAC	2	10	132418	132427	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012669	CACCT	2	10	142691	142700	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_012669	GACGC	2	10	150869	150878	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_012669	CGAAG	2	10	159134	159143	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012669	GCGAC	2	10	174383	174392	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_012669	GCCGG	2	10	182930	182939	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012669	TGACG	2	10	199359	199368	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012669	CGCGC	2	10	206426	206435	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_012669	AGCCC	2	10	212926	212935	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_012669	TGCGC	2	10	215930	215939	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_012669	CCCCG	2	10	228807	228816	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
35	NC_012669	CGCTC	2	10	237954	237963	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_012669	CCGCC	2	10	238046	238055	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_012669	CGGCG	2	10	264441	264450	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_012669	GCCGA	2	10	270440	270449	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_012669	GCAGG	3	15	275678	275692	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_012669	CGGCC	2	10	285363	285372	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_012669	GGCGC	2	10	306669	306678	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012669	CGGCA	2	10	312184	312193	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_012669	GGGAG	2	10	312939	312948	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012669	GGCCG	2	10	320814	320823	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012669	GGTCG	2	10	321353	321362	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012669	GAAGC	2	10	368867	368876	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012669	GGGCG	2	10	368918	368927	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012669	GGGGT	2	10	374504	374513	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012669	GCGCC	2	10	397461	397470	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_012669	CCGCG	2	10	401220	401229	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_012669	CGGGA	2	10	412898	412907	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012669	GGTCC	2	10	436425	436434	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_012669	CGGTC	2	10	437885	437894	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_012669	GCGGT	2	10	442354	442363	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012669	GCGTC	2	10	452692	452701	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_012669	CGATC	2	10	455195	455204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_012669	GCTCG	2	10	463732	463741	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_012669	GGTCG	2	10	464240	464249	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012669	AGCCG	2	10	464303	464312	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_012669	CTCGC	2	10	488708	488717	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_012669	CGGCG	2	10	491380	491389	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_012669	GGTGG	2	10	491443	491452	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012669	GTGCG	2	10	491514	491523	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012669	CGCAC	2	10	491546	491555	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_012669	CGCAC	2	10	491625	491634	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_012669	GGTCC	2	10	495952	495961	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_012669	GGGTG	2	10	499398	499407	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012669	CTCGC	2	10	504179	504188	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_012669	GCCGG	2	10	505217	505226	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_012669	CGCCC	2	10	515669	515678	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
71	NC_012669	GCCCC	2	10	515680	515689	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
72	NC_012669	CGCCC	2	10	515694	515703	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
73	NC_012669	GCCCC	3	15	515705	515719	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
74	NC_012669	CCCGC	2	10	515734	515743	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
75	NC_012669	CCGCC	2	10	550554	550563	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
76	NC_012669	GCAAT	2	10	554040	554049	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012669	GACCT	2	10	581751	581760	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_012669	CGTCC	2	10	583696	583705	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_012669	ACCCG	2	10	589089	589098	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_012669	GCGCC	2	10	598356	598365	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_012669	GGCCG	2	10	603540	603549	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_012669	GCCGA	2	10	613992	614001	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_012669	ACCCG	2	10	619754	619763	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_012669	GGGGC	2	10	624882	624891	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012669	TCAAG	2	10	634768	634777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012669	CGGCT	2	10	640121	640130	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_012669	GGGGC	2	10	653929	653938	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012669	CACCC	2	10	658432	658441	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
89	NC_012669	CGGCG	2	10	679734	679743	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_012669	ACCGG	2	10	682299	682308	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_012669	GCCGG	2	10	692020	692029	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_012669	TGACC	2	10	695409	695418	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_012669	TGACC	2	10	695420	695429	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_012669	GAGGT	2	10	735147	735156	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012669	CCGGC	2	10	737422	737431	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_012669	AGGGC	2	10	742466	742475	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012669	GCGAC	2	10	742895	742904	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_012669	ACTCG	2	10	744016	744025	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_012669	CCGCG	2	10	744500	744509	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_012669	CGCGC	2	10	754507	754516	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_012669	GCTCC	2	10	758378	758387	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_012669	GAGAC	2	10	759361	759370	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012669	CACCG	2	10	771939	771948	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_012669	CCGCG	2	10	776460	776469	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_012669	CCGAG	2	10	786754	786763	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_012669	GTCGC	2	10	807959	807968	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_012669	GTCCC	2	10	813922	813931	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_012669	GTGGG	2	10	817106	817115	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012669	GTGGC	2	10	817158	817167	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012669	TGCGG	2	10	818453	818462	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_012669	GGGCA	2	10	822992	823001	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012669	GCCCC	2	10	891560	891569	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
113	NC_012669	GACGC	2	10	892648	892657	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_012669	TCGCC	2	10	906194	906203	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_012669	CGGCG	2	10	907458	907467	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_012669	GGGTC	2	10	909367	909376	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012669	CGCGA	2	10	909417	909426	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_012669	GCGAC	2	10	916540	916549	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_012669	GCCCG	2	10	918587	918596	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_012669	CGACC	2	10	921075	921084	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_012669	GCCGG	2	10	936090	936099	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_012669	CGCCT	2	10	963632	963641	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_012669	CCCCG	2	10	984604	984613	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
124	NC_012669	CACCT	2	10	998677	998686	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_012669	TTCGC	2	10	1015383	1015392	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_012669	CGACC	2	10	1022290	1022299	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_012669	GCAGG	2	10	1062308	1062317	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012669	CGGGA	2	10	1064287	1064296	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012669	CGAAG	2	10	1098454	1098463	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012669	GTAGC	2	10	1101170	1101179	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_012669	ACGTC	2	10	1122540	1122549	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_012669	CCCCG	2	10	1145929	1145938	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
133	NC_012669	GCCTC	2	10	1152249	1152258	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_012669	GCGCC	2	10	1163834	1163843	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
135	NC_012669	GGGGC	2	10	1167427	1167436	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012669	GCCGC	2	10	1174570	1174579	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_012669	GTCGC	2	10	1194695	1194704	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_012669	GGGCG	2	10	1194707	1194716	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012669	CTCCG	2	10	1214022	1214031	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_012669	CCGCC	2	10	1243383	1243392	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
141	NC_012669	GTCGA	2	10	1247399	1247408	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_012669	GGACG	2	10	1277667	1277676	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_012669	GCGCC	2	10	1280696	1280705	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_012669	GTCGG	2	10	1295232	1295241	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012669	CTGAC	2	10	1303066	1303075	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_012669	GGCCC	2	10	1303219	1303228	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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286	NC_012669	GCGCC	2	10	2670894	2670903	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
287	NC_012669	CGGCA	2	10	2684062	2684071	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
288	NC_012669	CTGGC	2	10	2738688	2738697	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
289	NC_012669	ATCCG	2	10	2751486	2751495	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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292	NC_012669	GCGCG	2	10	2773394	2773403	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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298	NC_012669	GCTGG	2	10	2818651	2818660	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
299	NC_012669	CTTGA	2	10	2820216	2820225	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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302	NC_012669	CGCGG	2	10	2822846	2822855	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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307	NC_012669	CTAGG	2	10	2872165	2872174	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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321	NC_012669	GCTCT	2	10	3052138	3052147	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
322	NC_012669	GCTCC	2	10	3055351	3055360	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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326	NC_012669	CGCGG	2	10	3076742	3076751	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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328	NC_012669	TCGCC	2	10	3090689	3090698	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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331	NC_012669	CGGTC	2	10	3174876	3174885	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
332	NC_012669	GTGCG	2	10	3195872	3195881	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
333	NC_012669	GATGG	2	10	3195945	3195954	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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347	NC_012669	CGGCG	2	10	3319542	3319551	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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350	NC_012669	GGCCG	2	10	3335404	3335413	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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406	NC_012669	CGAGA	2	10	3889032	3889041	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
407	NC_012669	GGCAC	2	10	3897772	3897781	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
408	NC_012669	CCACC	2	10	3899630	3899639	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
409	NC_012669	CGCGG	2	10	3905331	3905340	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
410	NC_012669	CACCC	2	10	3905355	3905364	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
411	NC_012669	CGGCG	2	10	3914641	3914650	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
412	NC_012669	CCCGT	2	10	3922430	3922439	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
413	NC_012669	GCCGC	3	15	3938876	3938890	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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415	NC_012669	GACGT	2	10	3967445	3967454	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
416	NC_012669	TCGTG	2	10	3980547	3980556	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
417	NC_012669	CACCC	2	10	3992888	3992897	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
418	NC_012669	CGGCA	2	10	3993357	3993366	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
419	NC_012669	GCGAC	2	10	3998772	3998781	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
420	NC_012669	CCATC	2	10	4033937	4033946	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
421	NC_012669	GCCGC	2	10	4034015	4034024	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
422	NC_012669	CCATC	2	10	4035573	4035582	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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