MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 2191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012668	GATGA	2	10	3257	3266	40 %	20 %	40 %	0 %	229606126
2	NC_012668	GCCAA	2	10	3976	3985	40 %	0 %	20 %	40 %	229606127
3	NC_012668	GCAGT	2	10	6181	6190	20 %	20 %	40 %	20 %	229606128
4	NC_012668	GAGTG	2	10	7509	7518	20 %	20 %	60 %	0 %	229606130
5	NC_012668	TGCTT	2	10	8400	8409	0 %	60 %	20 %	20 %	229606131
6	NC_012668	GCAAA	2	10	8657	8666	60 %	0 %	20 %	20 %	229606131
7	NC_012668	CATCA	2	10	8861	8870	40 %	20 %	0 %	40 %	229606132
8	NC_012668	TGATT	2	10	11634	11643	20 %	60 %	20 %	0 %	229606134
9	NC_012668	CAACT	2	10	13308	13317	40 %	20 %	0 %	40 %	229606137
10	NC_012668	ATCGA	2	10	14775	14784	40 %	20 %	20 %	20 %	229606139
11	NC_012668	GCAAA	2	10	14965	14974	60 %	0 %	20 %	20 %	229606139
12	NC_012668	CCTAG	2	10	19444	19453	20 %	20 %	20 %	40 %	229606145
13	NC_012668	CCATC	2	10	20066	20075	20 %	20 %	0 %	60 %	229606145
14	NC_012668	GTGAA	2	10	20117	20126	40 %	20 %	40 %	0 %	229606145
15	NC_012668	AAAAT	2	10	24073	24082	80 %	20 %	0 %	0 %	229606150
16	NC_012668	GCACA	2	10	27951	27960	40 %	0 %	20 %	40 %	229606153
17	NC_012668	CAAAT	2	10	28518	28527	60 %	20 %	0 %	20 %	229606154
18	NC_012668	CATCT	2	10	28794	28803	20 %	40 %	0 %	40 %	229606155
19	NC_012668	CGCTT	2	10	30259	30268	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_012668	CACTA	2	10	31836	31845	40 %	20 %	0 %	40 %	229606156
21	NC_012668	CACCC	2	10	34981	34990	20 %	0 %	0 %	80 %	229606159
22	NC_012668	TGTGG	2	10	46543	46552	0 %	40 %	60 %	0 %	229606169
23	NC_012668	CGCGT	2	10	46777	46786	0 %	20 %	40 %	40 %	229606169
24	NC_012668	CAAAC	2	10	49047	49056	60 %	0 %	0 %	40 %	229606171
25	NC_012668	TAGAA	2	10	50743	50752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012668	GCTGA	2	10	51090	51099	20 %	20 %	40 %	20 %	229606174
27	NC_012668	AGGTA	2	10	51170	51179	40 %	20 %	40 %	0 %	229606174
28	NC_012668	TCAAT	2	10	51185	51194	40 %	40 %	0 %	20 %	229606174
29	NC_012668	GCCAT	2	10	53044	53053	20 %	20 %	20 %	40 %	229606175
30	NC_012668	AAGCC	2	10	54360	54369	40 %	0 %	20 %	40 %	229606175
31	NC_012668	GATCA	2	10	56403	56412	40 %	20 %	20 %	20 %	229606177
32	NC_012668	GGGCA	2	10	57089	57098	20 %	0 %	60 %	20 %	229606178
33	NC_012668	GATAT	2	10	62397	62406	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012668	AATCC	2	10	64647	64656	40 %	20 %	0 %	40 %	229606189
35	NC_012668	CCCAA	2	10	66106	66115	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_012668	CTCGA	2	10	66237	66246	20 %	20 %	20 %	40 %	229606192
37	NC_012668	TGAGC	2	10	69961	69970	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012668	CTTTT	2	10	69975	69984	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012668	TAAAA	2	10	71782	71791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012668	ACTAT	2	10	71944	71953	40 %	40 %	0 %	20 %	229606195
41	NC_012668	CAAGT	2	10	72325	72334	40 %	20 %	20 %	20 %	229606195
42	NC_012668	ACCAA	2	10	74316	74325	60 %	0 %	0 %	40 %	229606196
43	NC_012668	TTGCA	2	10	74369	74378	20 %	40 %	20 %	20 %	229606196
44	NC_012668	CCTTT	2	10	74473	74482	0 %	60 %	0 %	40 %	229606196
45	NC_012668	TTACC	2	10	74551	74560	20 %	40 %	0 %	40 %	229606196
46	NC_012668	AAACC	2	10	74859	74868	60 %	0 %	0 %	40 %	229606196
47	NC_012668	GTTAT	2	10	76182	76191	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012668	TTAAT	2	10	76283	76292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012668	GCAAA	2	10	78310	78319	60 %	0 %	20 %	20 %	229606198
50	NC_012668	TGGCT	2	10	78645	78654	0 %	40 %	40 %	20 %	229606198
51	NC_012668	GCCTT	2	10	82679	82688	0 %	40 %	20 %	40 %	229606204
52	NC_012668	AAAAG	2	10	83451	83460	80 %	0 %	20 %	0 %	229606206
53	NC_012668	TCCGT	2	10	84038	84047	0 %	40 %	20 %	40 %	229606207
54	NC_012668	GTGTT	2	10	84260	84269	0 %	60 %	40 %	0 %	229606207
55	NC_012668	ATCTT	2	10	84338	84347	20 %	60 %	0 %	20 %	229606207
56	NC_012668	TGTTA	2	10	84944	84953	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012668	ACAAA	2	10	86546	86555	80 %	0 %	0 %	20 %	229606208
58	NC_012668	ACAAT	2	10	86565	86574	60 %	20 %	0 %	20 %	229606208
59	NC_012668	CAAAA	2	10	86847	86856	80 %	0 %	0 %	20 %	229606208
60	NC_012668	ATCAA	2	10	88875	88884	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012668	AACTC	2	10	89316	89325	40 %	20 %	0 %	40 %	229606210
62	NC_012668	GTTGA	2	10	91311	91320	20 %	40 %	40 %	0 %	229606213
63	NC_012668	ATGGT	2	10	95425	95434	20 %	40 %	40 %	0 %	229606216
64	NC_012668	AAAAC	2	10	95444	95453	80 %	0 %	0 %	20 %	229606216
65	NC_012668	CTCTT	2	10	96262	96271	0 %	60 %	0 %	40 %	229606216
66	NC_012668	CAAGT	2	10	96918	96927	40 %	20 %	20 %	20 %	229606216
67	NC_012668	TTTTC	2	10	97354	97363	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012668	AAAAT	2	10	99761	99770	80 %	20 %	0 %	0 %	229606218
69	NC_012668	GCATG	2	10	100670	100679	20 %	20 %	40 %	20 %	229606219
70	NC_012668	GCCAA	2	10	100896	100905	40 %	0 %	20 %	40 %	229606219
71	NC_012668	ATGCA	2	10	101615	101624	40 %	20 %	20 %	20 %	229606220
72	NC_012668	CCACT	2	10	102533	102542	20 %	20 %	0 %	60 %	229606220
73	NC_012668	CAGCT	2	10	103100	103109	20 %	20 %	20 %	40 %	229606221
74	NC_012668	ATTCA	2	10	103552	103561	40 %	40 %	0 %	20 %	229606221
75	NC_012668	CTCAC	2	10	103697	103706	20 %	20 %	0 %	60 %	229606221
76	NC_012668	TTTCG	2	10	103754	103763	0 %	60 %	20 %	20 %	229606221
77	NC_012668	GAAAA	2	10	103933	103942	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012668	TCGCT	2	10	106974	106983	0 %	40 %	20 %	40 %	229606224
79	NC_012668	GGCTA	2	10	107521	107530	20 %	20 %	40 %	20 %	229606224
80	NC_012668	GGAAT	2	10	108734	108743	40 %	20 %	40 %	0 %	229606226
81	NC_012668	CGTGA	2	10	109001	109010	20 %	20 %	40 %	20 %	229606226
82	NC_012668	TCAGA	2	10	109878	109887	40 %	20 %	20 %	20 %	229606228
83	NC_012668	TTTTC	2	10	111893	111902	0 %	80 %	0 %	20 %	229606229
84	NC_012668	GTTCA	2	10	111948	111957	20 %	40 %	20 %	20 %	229606229
85	NC_012668	CTGCG	2	10	117054	117063	0 %	20 %	40 %	40 %	229606234
86	NC_012668	CGATG	2	10	117577	117586	20 %	20 %	40 %	20 %	229606234
87	NC_012668	CCCAA	2	10	117810	117819	40 %	0 %	0 %	60 %	229606234
88	NC_012668	AAGTG	2	10	118200	118209	40 %	20 %	40 %	0 %	229606234
89	NC_012668	TCGTT	2	10	120918	120927	0 %	60 %	20 %	20 %	229606237
90	NC_012668	GGCAA	2	10	121058	121067	40 %	0 %	40 %	20 %	229606237
91	NC_012668	GTGAA	2	10	121280	121289	40 %	20 %	40 %	0 %	229606237
92	NC_012668	TGCCA	2	10	123503	123512	20 %	20 %	20 %	40 %	229606240
93	NC_012668	CTTGG	2	10	126218	126227	0 %	40 %	40 %	20 %	229606243
94	NC_012668	AAAGC	2	10	126858	126867	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012668	TTCGC	2	10	127787	127796	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_012668	CTTGC	2	10	127815	127824	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_012668	AGCCA	2	10	131509	131518	40 %	0 %	20 %	40 %	229606248
98	NC_012668	TCAAC	2	10	131701	131710	40 %	20 %	0 %	40 %	229606249
99	NC_012668	CAGCG	2	10	132435	132444	20 %	0 %	40 %	40 %	229606250
100	NC_012668	ACCTT	2	10	137110	137119	20 %	40 %	0 %	40 %	229606254
101	NC_012668	GATCT	2	10	138196	138205	20 %	40 %	20 %	20 %	229606256
102	NC_012668	AGCCC	2	10	138338	138347	20 %	0 %	20 %	60 %	229606256
103	NC_012668	CGCAG	2	10	140084	140093	20 %	0 %	40 %	40 %	229606257
104	NC_012668	GTGCA	2	10	140163	140172	20 %	20 %	40 %	20 %	229606257
105	NC_012668	TCAGT	2	10	141055	141064	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_012668	ACTGA	2	10	141081	141090	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012668	CTTGC	2	10	141753	141762	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_012668	GTTTT	2	10	141965	141974	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012668	GTTCA	2	10	143421	143430	20 %	40 %	20 %	20 %	229606259
110	NC_012668	TCAAA	2	10	143942	143951	60 %	20 %	0 %	20 %	229606259
111	NC_012668	CAGCT	2	10	144255	144264	20 %	20 %	20 %	40 %	229606259
112	NC_012668	TGACC	2	10	145181	145190	20 %	20 %	20 %	40 %	229606259
113	NC_012668	CGGAT	2	10	145766	145775	20 %	20 %	40 %	20 %	229606260
114	NC_012668	AGCTG	2	10	145995	146004	20 %	20 %	40 %	20 %	229606260
115	NC_012668	GATCA	2	10	146239	146248	40 %	20 %	20 %	20 %	229606260
116	NC_012668	CCTAC	2	10	147473	147482	20 %	20 %	0 %	60 %	229606261
117	NC_012668	GCGAT	2	10	148069	148078	20 %	20 %	40 %	20 %	229606262
118	NC_012668	CTTAC	2	10	148136	148145	20 %	40 %	0 %	40 %	229606262
119	NC_012668	ATGCA	2	10	149652	149661	40 %	20 %	20 %	20 %	229606264
120	NC_012668	CTGCC	2	10	151731	151740	0 %	20 %	20 %	60 %	229606267
121	NC_012668	TTCCT	2	10	151784	151793	0 %	60 %	0 %	40 %	229606267
122	NC_012668	ACTGT	2	10	152266	152275	20 %	40 %	20 %	20 %	229606268
123	NC_012668	AACGA	2	10	154212	154221	60 %	0 %	20 %	20 %	229606271
124	NC_012668	CTCAA	2	10	154228	154237	40 %	20 %	0 %	40 %	229606271
125	NC_012668	TCACA	2	10	154350	154359	40 %	20 %	0 %	40 %	229606271
126	NC_012668	CCTAC	2	10	154866	154875	20 %	20 %	0 %	60 %	229606271
127	NC_012668	GCTTT	2	10	155388	155397	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012668	ATCTT	2	10	155735	155744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012668	TGACC	2	10	156081	156090	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_012668	CGGTT	2	10	159313	159322	0 %	40 %	40 %	20 %	229606274
131	NC_012668	TTTAC	2	10	160830	160839	20 %	60 %	0 %	20 %	229606275
132	NC_012668	TGGTG	2	10	161702	161711	0 %	40 %	60 %	0 %	229606275
133	NC_012668	CAGCC	2	10	162765	162774	20 %	0 %	20 %	60 %	229606275
134	NC_012668	GCAAA	2	10	163975	163984	60 %	0 %	20 %	20 %	229606278
135	NC_012668	ATTCC	2	10	165657	165666	20 %	40 %	0 %	40 %	229606281
136	NC_012668	TCTTT	2	10	166095	166104	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012668	CTGAA	2	10	171334	171343	40 %	20 %	20 %	20 %	229606286
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139	NC_012668	ATTTT	2	10	178417	178426	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012668	AAGTG	2	10	184563	184572	40 %	20 %	40 %	0 %	229606294
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172	NC_012668	GTTTC	2	10	233189	233198	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_012668	TCTAA	2	10	236901	236910	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_012668	TGGCG	2	10	344176	344185	0 %	20 %	60 %	20 %	229606429
266	NC_012668	GATTG	2	10	347473	347482	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_012668	TGCAC	2	10	353177	353186	20 %	20 %	20 %	40 %	229606433
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271	NC_012668	CCCTC	2	10	355163	355172	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
272	NC_012668	CTTGC	2	10	355468	355477	0 %	40 %	20 %	40 %	229606435
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282	NC_012668	ATCCA	2	10	364456	364465	40 %	20 %	0 %	40 %	229606444
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396	NC_012668	AAGCG	2	10	522530	522539	40 %	0 %	40 %	20 %	229606574
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399	NC_012668	GCTAA	2	10	526042	526051	40 %	20 %	20 %	20 %	229606578
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