MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 4307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012668	ATG	2	6	41	46	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012668	AAC	2	6	3433	3438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012668	ACT	2	6	3485	3490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012668	GGC	2	6	3505	3510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012668	TGT	2	6	5488	5493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012668	TTG	2	6	5561	5566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012668	ATT	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012668	TGG	2	6	6907	6912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012668	AAT	2	6	7009	7014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012668	AAT	2	6	7104	7109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012668	GCA	2	6	7781	7786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012668	TAA	2	6	7841	7846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012668	CGG	2	6	7876	7881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012668	AGA	2	6	7975	7980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012668	TGA	2	6	13484	13489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012668	GCA	2	6	13510	13515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012668	AAC	2	6	16306	16311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012668	TAA	3	9	17286	17294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012668	TCA	2	6	17353	17358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012668	CTA	2	6	18617	18622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012668	AAC	2	6	18744	18749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012668	GAG	2	6	19321	19326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012668	CGA	2	6	21966	21971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012668	TAC	2	6	22031	22036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012668	TAC	2	6	23785	23790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012668	TAA	2	6	23798	23803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012668	GCG	2	6	25692	25697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012668	CAC	2	6	28664	28669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_012668	GGT	2	6	30274	30279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012668	CGC	2	6	30290	30295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_012668	AGC	2	6	30315	30320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012668	ATC	2	6	38132	38137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012668	GCT	2	6	38177	38182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012668	TCT	2	6	39016	39021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012668	CAC	2	6	39142	39147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012668	AGA	2	6	39159	39164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012668	AGG	2	6	39287	39292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012668	AAC	2	6	39440	39445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012668	TTC	2	6	39541	39546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012668	TAT	2	6	39793	39798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012668	CCG	2	6	40994	40999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_012668	TCT	2	6	43886	43891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012668	TAA	2	6	43957	43962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012668	AAG	2	6	44504	44509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012668	TCA	2	6	44527	44532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012668	TAT	2	6	45723	45728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012668	TGC	2	6	50424	50429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012668	AAT	2	6	50482	50487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012668	CTG	2	6	50531	50536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012668	CGC	2	6	50549	50554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012668	GTC	2	6	50564	50569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012668	GCG	2	6	51746	51751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012668	TGA	2	6	51758	51763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012668	TCA	2	6	51773	51778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012668	ACA	2	6	54549	54554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012668	TGC	2	6	60619	60624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012668	TCA	2	6	63172	63177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012668	TCG	2	6	64147	64152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012668	TGC	2	6	65357	65362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012668	TCA	2	6	65368	65373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012668	CCA	2	6	70148	70153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_012668	TCT	2	6	70159	70164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012668	TGG	2	6	70307	70312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012668	TAA	2	6	71564	71569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012668	ATT	2	6	71584	71589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012668	AAT	2	6	71859	71864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012668	TTA	2	6	71917	71922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012668	GCA	2	6	73183	73188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012668	AAT	2	6	73203	73208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012668	CAA	2	6	73274	73279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012668	TAT	2	6	75999	76004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012668	CAA	2	6	76064	76069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012668	AAT	2	6	76155	76160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012668	AAC	2	6	76161	76166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012668	TTA	2	6	76210	76215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012668	ATA	2	6	76225	76230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012668	ATT	2	6	76258	76263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012668	ATT	2	6	76346	76351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012668	AGT	2	6	76458	76463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012668	ATA	2	6	76747	76752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012668	AAC	2	6	76798	76803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012668	GCA	2	6	76878	76883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012668	TCG	2	6	76981	76986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012668	GAT	2	6	77090	77095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012668	TGA	2	6	77389	77394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012668	TAA	2	6	79038	79043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012668	TGG	3	9	79081	79089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012668	ATA	3	9	79143	79151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012668	CAT	2	6	79290	79295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012668	AAG	2	6	79353	79358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012668	TGG	2	6	79369	79374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012668	CCT	2	6	79388	79393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_012668	TGA	2	6	79540	79545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012668	TCT	2	6	79584	79589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012668	TCA	2	6	79705	79710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012668	TAG	2	6	79798	79803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012668	CTA	2	6	79937	79942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012668	GAA	2	6	79943	79948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012668	TAG	2	6	80007	80012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012668	CAT	2	6	80134	80139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012668	GCA	2	6	80176	80181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012668	TCA	2	6	80291	80296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012668	AGG	2	6	81280	81285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012668	TTC	2	6	83529	83534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012668	ACA	2	6	83540	83545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012668	AAT	2	6	84936	84941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012668	AGC	2	6	85079	85084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012668	ACC	2	6	85378	85383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_012668	TTC	2	6	85393	85398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012668	CCT	2	6	85424	85429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_012668	TTG	2	6	85452	85457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012668	ATT	2	6	85525	85530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012668	ATG	2	6	85577	85582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012668	TGC	2	6	85691	85696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012668	GAA	2	6	85899	85904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012668	ACT	2	6	86046	86051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012668	TGA	2	6	86129	86134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012668	TTG	2	6	86365	86370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012668	ACT	2	6	86427	86432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012668	CCT	2	6	86443	86448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_012668	TTG	2	6	86456	86461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012668	CAA	2	6	87485	87490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012668	CCT	2	6	87495	87500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_012668	TGA	2	6	87524	87529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012668	GCA	2	6	87649	87654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012668	ATA	2	6	87749	87754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012668	ACC	2	6	87779	87784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_012668	TCA	2	6	87857	87862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012668	AGC	2	6	87990	87995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012668	AGC	2	6	88032	88037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012668	GAA	3	9	88175	88183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012668	GAA	2	6	88197	88202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012668	AAC	2	6	88254	88259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012668	GCA	2	6	88329	88334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012668	AAG	2	6	88404	88409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012668	CTG	2	6	88431	88436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012668	ATT	2	6	88513	88518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012668	ATC	2	6	88545	88550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012668	TGT	2	6	88687	88692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_012668	ATT	2	6	165543	165548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_012668	AAT	2	6	165997	166002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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